演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBE2L6UBCH8

ubiquitin conjugating enzyme E2 L6

UBE2L6 是 ubiquitin-conjugating enzyme 家族的蛋白質,可將 ubiquitin 或 ISG15 共價連接至其他蛋白質。

Homo sapiens11q12.1UniProt O14933
OFFICIAL SYMBOL
UBE2L6
CHROMOSOME
11
UNIPROT
O14933
PDB / ALPHAFOLD
8OIF
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBE2L6 的正式名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 L6,屬於蛋白質編碼基因。其產物 Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 歸入 ubiquitin-conjugating enzyme 家族,蛋白質長度為 153 個胺基酸。序列註解指出,蛋白質第 2 至 149 個胺基酸構成 UBC core。來源將其基本角色界定為參與蛋白質修飾,並可處理 ubiquitin 或 ISG15;具體的轉移反應及已知受質作用見功能說明。

Official symbol
UBE2L6
Gene name
ubiquitin conjugating enzyme E2 L6
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12490
UniProt
O14933
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UBCH8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q12.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegUBE2L6pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:57,551,656–57,568,284
Gene span
16,629 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000287156 ★57,551,662–57,567,6724
ENST0000034057357,551,656–57,568,2844
ENST0000100526057,551,656–57,567,6963
ENST0000111974957,551,656–57,567,6963
ENST0000112537657,551,656–57,567,6964
ENST0000114397457,551,656–57,567,6964
ENST0000052702257,552,425–57,567,3264
ENST0000052665957,552,459–57,567,3034

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBE2L6 催化 ubiquitin 或 ISG15 與其他蛋白質形成共價連接,參與蛋白質修飾及 ubiquitination。其 E2 酵素反應涉及 ubiquitin 在 E1 ubiquitin-activating enzyme 與 E2 ubiquitin-conjugating enzyme 之間轉移:ubiquitin 先以硫酯鍵連接於 E1 的半胱胺酸,之後轉接至 E2 的半胱胺酸,使 E1 恢復未攜帶 ubiquitin 的狀態,而 ubiquitin 暫時連接在 E2 上。這項反應描述了 UBE2L6 作為 E2 成員承接 ubiquitin 的化學步驟;來源亦指出它能催化 ubiquitin 或 ISG15 對其他蛋白質的共價連接。

在特定受質作用中,UBE2L6 參與由 E6/E6-AP 誘導的 p53/TP53 ubiquitination。這項描述將 UBE2L6 的作用置於 E6/E6-AP 誘導的反應脈絡中,並未進一步限定其他條件或說明其在此過程中的具體分子步驟。

另一項已述功能涉及 FLT3:UBE2L6 促進 FLT3 的 ubiquitination,並促使其後續經蛋白酶體降解。這說明 UBE2L6 介入蛋白質標記與後續降解相連的過程;來源明確支持此一作用方向,但未提供更多關於調控條件或生物學後果的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57567672 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBE2L6 ENST00000287156 GRCh38 chr11:57567572-57568672 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAACAAGTCTCATCTTCCCCAGATGCTGCTTGGTGCTCAGGGGCTGCAAGTACTCTGTCCTTGCACAGA
GGGTTGGGGACTCCAGCTGTGCATGGGGGCACACATTAGGCCCACAGCTTGTAATGGACCAGTAGTAAAG
TAAGGGAGGGGAAGCAGACTCTCTCTTGGAAAGGAGGCTCCTGAGTCCTTCTTGGGGCTTCCCCCACCAA
CTGTTTCCCAAACCAGCATACAGTAGGCACTTAGTAAATACTAAACCTAGTAAAGGACTGAATGATGGTA
GACCGAACCCCCAAAGCAAAAGAGAAAGGGTCCAACAGCGCCTCCTTGCGGTGCTCTGCCCCAAGCCACG
GGGAGAAACGTTGCAGCCCGCGCCGAACGCCGGGCAGCACAAAGGATCCCCGACTGCCGGGGAGCGGTGC
TCGGAGGGCACAGGTCTACGCCATCCCCCACGCAGTTTCGGAGATGGAGCGCTGGGCCCATGGAGGGAAG
GCGGCAGGCTCGGCGGCTCCGGCAGCTTGCTGGGGCAGGGGCTCAAGGCGGCAGTCCGATAGTGGAGGCC
GCTGAGAACTGTCACGGAGCTGCGTCTGTACAGCGAGCATCCCTTATTTATTCAGGGCGAGTGTGTATTT
GGGGCGGCGTGCAGGGGGCTGACAAAGACCGGAGAGCTCCCGGTGCGGCCGCCGGCGGAGCGAAGACTGG
AACCCGTATGAGCGCCCCCCAGCGCCCCTGAGCGCTCGCCGCCGGTGCACGGCGCACCCCGCGGGAGGCA
GGGATCAGCAAAGCCGTGCGCCCCGAGGCCCGCCCCCGTCTCCGCACAAAGACCGTGAGTCCCGGGTCCG
AGCCTTCCGCGCGGGGATCGGGCGGTTGTCCGGCGGGTCGTCCTTCGACGGCCTCCTGGCCTCGCCGGAG
CGGGTGCGGGGAGGCCCACGCAGCGACGGCTGGAGGAGGGGTGGGCGGGGCTGCCGGGGGTGGGGTCCCC
GGGGCGGGGCGGGGCGCGCTGTGTCGCGGGTCGGAGCTCGGTCCTGCTGGAGGCCACGGGTGCCACACAC
TCGGTCCCGACATGATGGCGAGCATGCGAGTGGTGAAGGTAACCGCGTATA
UBE2L6 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBE2L6_1 ↗11:57,567,624負股57,567,614–57,567,673
UBE2L6_3 ↗11:57,567,839負股57,567,829–57,567,888
UBE2L6_2 ↗11:57,568,287負股57,568,277–57,568,336

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_83NNQR · enhancer · 57562694–57562893 · regulatory

ENSR11_5HJK6D · CTCF_binding_site · 57562778–57562799 · regulatory

ENSR11_C7P89 · enhancer · 57565920–57567661 · regulatory

ENSR11_9SSXD · promoter · 57567662–57568162 · regulatory

ENSR11_5HJL3B · CTCF_binding_site · 57567944–57567965 · regulatory

ENSR11_9SSXK · promoter · 57568274–57568774 · regulatory

ENSR11_5HJL55 · CTCF_binding_site · 57568338–57568359 · regulatory

ENSR11_9SSXS · enhancer · 57569259–57569753 · regulatory

· motif · 57562780–57562796 · motif

· motif · 57565922–57565932 · motif

· motif · 57565953–57565963 · motif

· motif · 57566117–57566132 · motif

· motif · 57566325–57566339 · motif

· motif · 57566445–57566456 · motif

· motif · 57567301–57567321 · motif

· motif · 57567307–57567327 · motif

· motif · 57567383–57567400 · motif

· motif · 57567625–57567642 · motif

· motif · 57567946–57567962 · motif

· motif · 57568340–57568356 · motif

· motif · 57569502–57569516 · motif

· motif · 57569502–57569516 · motif

UBE2L6 的調控資料指出,其表現與 IFNB1/IFN-beta 有關;來源未進一步說明此調控的方向或條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:153 aa

1 aa153 aa結構域
依 O14933 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 長 153 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。其 UBC core 位於第 2 至 149 個胺基酸,涵蓋蛋白質大部分序列;此區域註解來自序列規則資料。

結構域UBC core2–149 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8OIF…

PDB · 8OIF

EM · 3.50 A · L=1-153

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 14 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UBCH8UBE2L6ARIH2DTX3GNB2LITAFLONRF1MID1RBCK1RNF144BRNF19BRNF216TRIM62TRIM8ospGRnf40
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UBE2L6 與 RNF19A、RNF19B 及 RNF144B 有交互作用;來源未進一步界定這些交互作用是否代表同一複合體或其功能結果。此外,UBE2L6 也與酪胺酸磷酸化的 FLT3 交互作用。這些資料描述的是交互作用關係,不宜據此推定未記載的結合機制。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBE2L6 可催化 ubiquitin 或 ISG15 與其他蛋白質形成共價連接;它也參與 E6/E6-AP 誘導的 p53/TP53 ubiquitination,並促進 FLT3 ubiquitination 及其後續蛋白酶體降解。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the covalent attachment of ubiquitin or ISG15 to other proteins. Functions in the E6/E6-AP-induced ubiquitination of p53/TP53. Promotes ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of FLT3

PMID 15131269 ↗ · PMID 16427630 ↗ · PMID 16428300 ↗ · PMID 20508617 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.推論支持
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UBE2L6 涉及蛋白質修飾,所列的修飾類型為蛋白質 ubiquitination;此項資料概述其活動分類,未提供特定受質、條件或實驗結果。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UBE2L6 與 RNF19A、RNF19B 及 RNF144B 有交互作用,也與酪胺酸磷酸化的 FLT3 交互作用;資料未進一步說明各交互作用的條件或功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RNF19A, RNF19B and RNF144B. Interacts with FLT3 (tyrosine phosphorylated)

PMID 11237715 ↗ · PMID 16427630 ↗ · PMID 16709802 ↗ · PMID 19928833 ↗ · PMID 20508617 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控By IFNB1/IFN-beta含實驗來源
證據與來源

By IFNB1/IFN-beta

PMID 15131269 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000287156 · 1,219 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGTCGCGGGTCGGAGCTCGGTCCTGCTGGAGGCCACGGG40
41TGCCACACACTCGGTCCCGACATGATGGCGAGCATGCGAG80
81TGGTGAAGGAGCTGGAGGATCTTCAGAAGAAGCCTCCCCC120
121ATACCTGCGGAACCTGTCCAGCGATGATGCCAATGTCCTG160
161GTGTGGCACGCTCTCCTCCTACCCGACCAACCTCCCTACC200
201ACCTGAAAGCCTTCAACCTGCGCATCAGCTTCCCGCCGGA240
241GTATCCGTTCAAGCCTCCCATGATCAAATTCACAACCAAG280
281ATCTACCACCCCAACGTGGACGAGAACGGACAGATTTGCC320
321TGCCCATCATCAGCAGTGAGAACTGGAAGCCTTGCACCAA360
361GACTTGCCAAGTCCTGGAGGCCCTCAATGTGCTGGTGAAT400
401AGACCGAATATCAGGGAGCCCCTGCGGATGGACCTCGCTG440
441ACCTGCTGACACAGAATCCGGAGCTGTTCAGAAAGAATGC480
481CGAAGAGTTCACCCTCCGATTCGGAGTGGACCGGCCCTCC520
521TAACTCATGTTCTGACCCTCTGTGCACTGGATCCTCGGCA560
561TAGCGGACGGACACACCTCATGGACTGAGGCCAGAGCCCC600
601CTGTGGCCCATTCCCCATTCATTTTTCCCTTCTTAGGTTG640
641TTAGTCATTAGTTTGTGTGTGTGTGTGGTGGAGGGAAGGG680
681AGCTATGAGTGTGTGTGTTGTGTATGGACTCACTCCCAGG720
721TTCACCTGGCCACAGGTGCACCCTTCCCACACCCTTTACA760
761TTCCCCAGAGCCAAGGGAGTTTAAGTTTGCAGTTACAGGC800
801CAGTTCTCCAGCTCTCCATCTTAGAGAGACAGGTCACCTT840
841GCAGGCCTGCTTGCAGGAAATGAATCCAGCAGCCAACTCG880
881AATCCCCCTAGGGCTCAGGCACTGAGGGCCTGGGGACAGT920
921GGAGCATATGGGTGGGAGACAGATGGAGGGTACCCTATTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。