基因總覽
UBE2L6 的正式名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 L6,屬於蛋白質編碼基因。其產物 Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 歸入 ubiquitin-conjugating enzyme 家族,蛋白質長度為 153 個胺基酸。序列註解指出,蛋白質第 2 至 149 個胺基酸構成 UBC core。來源將其基本角色界定為參與蛋白質修飾,並可處理 ubiquitin 或 ISG15;具體的轉移反應及已知受質作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000287156 ★ | 57,551,662–57,567,672 | 4 |
| ENST00000340573 | 57,551,656–57,568,284 | 4 |
| ENST00001005260 | 57,551,656–57,567,696 | 3 |
| ENST00001119749 | 57,551,656–57,567,696 | 3 |
| ENST00001125376 | 57,551,656–57,567,696 | 4 |
| ENST00001143974 | 57,551,656–57,567,696 | 4 |
| ENST00000527022 | 57,552,425–57,567,326 | 4 |
| ENST00000526659 | 57,552,459–57,567,303 | 4 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE2L6 催化 ubiquitin 或 ISG15 與其他蛋白質形成共價連接,參與蛋白質修飾及 ubiquitination。其 E2 酵素反應涉及 ubiquitin 在 E1 ubiquitin-activating enzyme 與 E2 ubiquitin-conjugating enzyme 之間轉移:ubiquitin 先以硫酯鍵連接於 E1 的半胱胺酸,之後轉接至 E2 的半胱胺酸,使 E1 恢復未攜帶 ubiquitin 的狀態,而 ubiquitin 暫時連接在 E2 上。這項反應描述了 UBE2L6 作為 E2 成員承接 ubiquitin 的化學步驟;來源亦指出它能催化 ubiquitin 或 ISG15 對其他蛋白質的共價連接。
在特定受質作用中,UBE2L6 參與由 E6/E6-AP 誘導的 p53/TP53 ubiquitination。這項描述將 UBE2L6 的作用置於 E6/E6-AP 誘導的反應脈絡中,並未進一步限定其他條件或說明其在此過程中的具體分子步驟。
另一項已述功能涉及 FLT3:UBE2L6 促進 FLT3 的 ubiquitination,並促使其後續經蛋白酶體降解。這說明 UBE2L6 介入蛋白質標記與後續降解相連的過程;來源明確支持此一作用方向,但未提供更多關於調控條件或生物學後果的細節。
Promoter 與基因調控
>UBE2L6 ENST00000287156 GRCh38 chr11:57567572-57568672 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCAACAAGTCTCATCTTCCCCAGATGCTGCTTGGTGCTCAGGGGCTGCAAGTACTCTGTCCTTGCACAGA GGGTTGGGGACTCCAGCTGTGCATGGGGGCACACATTAGGCCCACAGCTTGTAATGGACCAGTAGTAAAG TAAGGGAGGGGAAGCAGACTCTCTCTTGGAAAGGAGGCTCCTGAGTCCTTCTTGGGGCTTCCCCCACCAA CTGTTTCCCAAACCAGCATACAGTAGGCACTTAGTAAATACTAAACCTAGTAAAGGACTGAATGATGGTA GACCGAACCCCCAAAGCAAAAGAGAAAGGGTCCAACAGCGCCTCCTTGCGGTGCTCTGCCCCAAGCCACG GGGAGAAACGTTGCAGCCCGCGCCGAACGCCGGGCAGCACAAAGGATCCCCGACTGCCGGGGAGCGGTGC TCGGAGGGCACAGGTCTACGCCATCCCCCACGCAGTTTCGGAGATGGAGCGCTGGGCCCATGGAGGGAAG GCGGCAGGCTCGGCGGCTCCGGCAGCTTGCTGGGGCAGGGGCTCAAGGCGGCAGTCCGATAGTGGAGGCC GCTGAGAACTGTCACGGAGCTGCGTCTGTACAGCGAGCATCCCTTATTTATTCAGGGCGAGTGTGTATTT GGGGCGGCGTGCAGGGGGCTGACAAAGACCGGAGAGCTCCCGGTGCGGCCGCCGGCGGAGCGAAGACTGG AACCCGTATGAGCGCCCCCCAGCGCCCCTGAGCGCTCGCCGCCGGTGCACGGCGCACCCCGCGGGAGGCA GGGATCAGCAAAGCCGTGCGCCCCGAGGCCCGCCCCCGTCTCCGCACAAAGACCGTGAGTCCCGGGTCCG AGCCTTCCGCGCGGGGATCGGGCGGTTGTCCGGCGGGTCGTCCTTCGACGGCCTCCTGGCCTCGCCGGAG CGGGTGCGGGGAGGCCCACGCAGCGACGGCTGGAGGAGGGGTGGGCGGGGCTGCCGGGGGTGGGGTCCCC GGGGCGGGGCGGGGCGCGCTGTGTCGCGGGTCGGAGCTCGGTCCTGCTGGAGGCCACGGGTGCCACACAC TCGGTCCCGACATGATGGCGAGCATGCGAGTGGTGAAGGTAACCGCGTATA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE2L6_1 ↗ | 11:57,567,624 | 負股 | 57,567,614–57,567,673 |
| UBE2L6_3 ↗ | 11:57,567,839 | 負股 | 57,567,829–57,567,888 |
| UBE2L6_2 ↗ | 11:57,568,287 | 負股 | 57,568,277–57,568,336 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_83NNQR · enhancer · 57562694–57562893 · regulatory
ENSR11_5HJK6D · CTCF_binding_site · 57562778–57562799 · regulatory
ENSR11_C7P89 · enhancer · 57565920–57567661 · regulatory
ENSR11_9SSXD · promoter · 57567662–57568162 · regulatory
ENSR11_5HJL3B · CTCF_binding_site · 57567944–57567965 · regulatory
ENSR11_9SSXK · promoter · 57568274–57568774 · regulatory
ENSR11_5HJL55 · CTCF_binding_site · 57568338–57568359 · regulatory
ENSR11_9SSXS · enhancer · 57569259–57569753 · regulatory
· motif · 57562780–57562796 · motif
· motif · 57565922–57565932 · motif
· motif · 57565953–57565963 · motif
· motif · 57566117–57566132 · motif
· motif · 57566325–57566339 · motif
· motif · 57566445–57566456 · motif
· motif · 57567301–57567321 · motif
· motif · 57567307–57567327 · motif
· motif · 57567383–57567400 · motif
· motif · 57567625–57567642 · motif
· motif · 57567946–57567962 · motif
· motif · 57568340–57568356 · motif
· motif · 57569502–57569516 · motif
· motif · 57569502–57569516 · motif
UBE2L6 的調控資料指出,其表現與 IFNB1/IFN-beta 有關;來源未進一步說明此調控的方向或條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:153 aa
Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 長 153 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。其 UBC core 位於第 2 至 149 個胺基酸,涵蓋蛋白質大部分序列;此區域註解來自序列規則資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- ARIH2O95376 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- DTX3Q8N9I9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GNB2P62879 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LITAFQ99732 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LONRF1Q17RB8 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- MID1O15344 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBCK1Q9BYM8 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- RNF144BQ7Z419 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RNF19BQ6ZMZ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF216Q9NWF9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM62Q9BVG3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM8Q9BZR9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ospGQ99PZ6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Rnf40Q8CJB9 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
UBE2L6 與 RNF19A、RNF19B 及 RNF144B 有交互作用;來源未進一步界定這些交互作用是否代表同一複合體或其功能結果。此外,UBE2L6 也與酪胺酸磷酸化的 FLT3 交互作用。這些資料描述的是交互作用關係,不宜據此推定未記載的結合機制。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE2L6 可催化 ubiquitin 或 ISG15 與其他蛋白質形成共價連接;它也參與 E6/E6-AP 誘導的 p53/TP53 ubiquitination,並促進 FLT3 ubiquitination 及其後續蛋白酶體降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the covalent attachment of ubiquitin or ISG15 to other proteins. Functions in the E6/E6-AP-induced ubiquitination of p53/TP53. Promotes ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of FLT3 PMID 15131269 ↗ · PMID 16427630 ↗ · PMID 16428300 ↗ · PMID 20508617 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. | 推論支持 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. |
| 分子活性 | UBE2L6 涉及蛋白質修飾,所列的修飾類型為蛋白質 ubiquitination;此項資料概述其活動分類,未提供特定受質、條件或實驗結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | UBE2L6 與 RNF19A、RNF19B 及 RNF144B 有交互作用,也與酪胺酸磷酸化的 FLT3 交互作用;資料未進一步說明各交互作用的條件或功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with RNF19A, RNF19B and RNF144B. Interacts with FLT3 (tyrosine phosphorylated) PMID 11237715 ↗ · PMID 16427630 ↗ · PMID 16709802 ↗ · PMID 19928833 ↗ · PMID 20508617 ↗ |
| 調控 | By IFNB1/IFN-beta | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGTCGCGGGTCGGAGCTCGGTCCTGCTGGAGGCCACGGG40TGCCACACACTCGGTCCCGACATGATGGCGAGCATGCGAG80TGGTGAAGGAGCTGGAGGATCTTCAGAAGAAGCCTCCCCC120ATACCTGCGGAACCTGTCCAGCGATGATGCCAATGTCCTG160GTGTGGCACGCTCTCCTCCTACCCGACCAACCTCCCTACC200ACCTGAAAGCCTTCAACCTGCGCATCAGCTTCCCGCCGGA240GTATCCGTTCAAGCCTCCCATGATCAAATTCACAACCAAG280ATCTACCACCCCAACGTGGACGAGAACGGACAGATTTGCC320TGCCCATCATCAGCAGTGAGAACTGGAAGCCTTGCACCAA360GACTTGCCAAGTCCTGGAGGCCCTCAATGTGCTGGTGAAT400AGACCGAATATCAGGGAGCCCCTGCGGATGGACCTCGCTG440ACCTGCTGACACAGAATCCGGAGCTGTTCAGAAAGAATGC480CGAAGAGTTCACCCTCCGATTCGGAGTGGACCGGCCCTCC520TAACTCATGTTCTGACCCTCTGTGCACTGGATCCTCGGCA560TAGCGGACGGACACACCTCATGGACTGAGGCCAGAGCCCC600CTGTGGCCCATTCCCCATTCATTTTTCCCTTCTTAGGTTG640TTAGTCATTAGTTTGTGTGTGTGTGTGGTGGAGGGAAGGG680AGCTATGAGTGTGTGTGTTGTGTATGGACTCACTCCCAGG720TTCACCTGGCCACAGGTGCACCCTTCCCACACCCTTTACA760TTCCCCAGAGCCAAGGGAGTTTAAGTTTGCAGTTACAGGC800CAGTTCTCCAGCTCTCCATCTTAGAGAGACAGGTCACCTT840GCAGGCCTGCTTGCAGGAAATGAATCCAGCAGCCAACTCG880AATCCCCCTAGGGCTCAGGCACTGAGGGCCTGGGGACAGT920GGAGCATATGGGTGGGAGACAGATGGAGGGTACCCTATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。