基因總覽
UBE2L3 的正式名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 L3，屬於泛素結合酵素家族，產物是 E2 泛素結合酵素。它在泛素化流程中接收由 E1 酵素活化並轉交的泛素，再與特定 E3 泛素蛋白連接酶合作，參與將泛素連接至其他蛋白質。蛋白質全長 154 個胺基酸，具有 UBC core 結構域；這個核心區域涵蓋第 2 至第 149 個胺基酸。其家族身分與核心結構提供了辨識此蛋白質作為 E2 酵素的基本特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000342192 ★ | 21,567,714–21,624,034 | 4 |
| ENST00000458578 | 21,549,447–21,624,034 | 4 |
| ENST00000545681 | 21,567,547–21,624,034 | 3 |
| ENST00001099565 | 21,567,712–21,621,911 | 4 |
| ENST00001099567 | 21,567,712–21,624,034 | 5 |
| ENST00001061162 | 21,567,714–21,616,089 | 4 |
| ENST00000877838 | 21,567,718–21,624,034 | 5 |
| ENST00001099568 | 21,567,719–21,621,873 | 5 |
| ENST00001119171 | 21,567,719–21,622,923 | 5 |
| ENST00001099566 | 21,567,721–21,624,034 | 5 |
| ENST00000920161 | 21,567,733–21,624,034 | 5 |
| ENST00000877839 | 21,567,736–21,624,034 | 4 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE2L3 是 E2 泛素結合酵素，參與把泛素接到其他蛋白質上的反應。反應中，UBE2L3 接受 E1 複合體轉交的泛素，並催化泛素與受體蛋白質形成共價連結。這項作用使它能參與蛋白質泛素化，且其活性依賴與適合的 E3 泛素蛋白連接酶合作。
它特別與 HECT 型及 RBR 家族 E3 酵素作用。相較之下，由於 UBE2L3 缺少不依賴 E3、可直接對 lysine 產生反應的內在活性，因此不能與多數含 RING 結構的 E3 酵素作用；但它能與具有類似 RING-HECT 混合特性的 RBR 酵素合作，例如 PRKN、RNF31 和 ARIH1。UBE2L3 也參與 CUL9-RBX1 複合體介導的泛素化。體外實驗中，它可催化形成以 Lys-11 相連的多聚泛素鏈。
UBE2L3 參與短命及異常蛋白質的選擇性降解，並與細胞週期進程相關：其表現於 S 期下調，且涉及細胞週期進程。此外，它可調節核內荷爾蒙受體的轉錄活性；來源也指出它可能參與髓系細胞生成，但此作用仍以可能性描述。
Promoter 與基因調控
>UBE2L3 ENST00000342192 GRCh38 chr22:21566714-21567814 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCCCACCCTATAATCCTTTTACTCCATTCTGGACACTGAGACAGCCTCATGGTCTTCGCCAGTGCTGCT TCCTCTGCTTGAAACATTCTCCTCCAGTCCTCCCAGCTGTTCCTTCCCATTTTCCAGGTCCCAGCATTGG CTTTGGAGCCAGCAGCCCACCTGTGACAGGAGCCTGGCTCTGCTCCTAGCTGGCCGTGTGACCTTGGGCA AGTCACTGGCTTCTTCTGTGCTTCTGTTTATTGTGAAATGAGGATGTTAATGCTAACGTATCCCAGAGGA TGGTTTCAAGGGTTAAAGAAAATAAAGCACTAGAGAGAGGTCTGGCACTTAGTAGGGCCATTTCCTCAAT TTGGCTTCCTTGACCTCTCAAAGTATGTCCCCACAGTCACTTTCCTATCACCCAGTTTTCTTCACAGAGC TTGGCAGTGTGAAGTAACCTTGGTTATTCAACTTTTTTTTTTTCCCCCAAGACGGAGTCTTCCTCTGTCA CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCAAGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTC CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCAGAGATTACAGGCGCCCGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTT TAGTAGAGACCGAGTTTCACCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCGTGACCGCGTGATCCACCCGCCT CGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCCCCGCGCCTGGTCAACTATTTTATGCAATCAGTA TTTATTATGCTCCTACTATGTGCCAGGCACTGGTTGTAACTGCCATCTGATTGGACGATCCGTAAACGCT GAGGCCCAGTCTGTGCGGTTCACTTGCGTTCCTCCACGCGCCCCCCAGCACAGTGGGAAGCACACAGTAG GTGCTCCGCTCTGCTCCTGTGCCCCGCCCCGCGGCCCCTCCCCCGCTCCAGGAAGTGCGGGGGCTCCAGC CGCCCGGCCGGCCGCGATGCATTCTGGGGAAGGAGCAGCACCAAATCCAAGATGGCGGCCAGCAGGAGGC TGATGAAGGTAAAAGCCATTCTCTGGCAGCGGCCGGGCGTGGGGCGGCGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_9BK5L · promoter · 21567390–21567724 · regulatory
ENSR22_C45R7 · enhancer · 21567725–21569181 · regulatory
ENSR22_9BK6B · enhancer · 21569801–21570155 · regulatory
ENSR22_9BK6N · enhancer · 21571094–21571474 · regulatory
· motif · 21567173–21567184 · motif
· motif · 21567383–21567398 · motif
· motif · 21567659–21567672 · motif
· motif · 21567669–21567680 · motif
· motif · 21567743–21567753 · motif
· motif · 21568820–21568835 · motif
· motif · 21568959–21568974 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：154 aa
UBE2L3 蛋白質長 154 個胺基酸，屬於泛素結合酵素家族。其 UBC core 結構域位於第 2 至第 149 個胺基酸，涵蓋蛋白質的大部分序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UBE2L3 位於細胞核與細胞質；來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- ARIH1Q9Y4X5 · UniProt INTERACTION · 7 experiments · 2 筆來源紀錄
- ARIH2O95376 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- MID1O15344 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PRKNO60260-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBCK1Q9BYM8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RNF144AP50876 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RNF182Q8N6D2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF19BQ6ZMZ0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RNF216Q9NWF9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STUB1Q9UNE7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ospGQ99PZ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- sopAQ8ZNR3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
UBE2L3 與多種 E3 酵素及其他蛋白質有互作紀錄。它與 PRKN 的互作涉及錯誤摺疊蛋白質的泛素化及降解；並與 ARIH1、ARIH2、CCNB1IP1、CBL、ZAP70、RNF19A、RNF19B 和 RNF144B 互作。UBE3A 也與 UBE2L3 互作；HPV-16 E6 蛋白會利用此關係促使 p53/TP53 泛素化。NCOA1 與 UBE2L3 在調節 progesterone receptor 轉錄活性上具有功能性互作，來源並指出 UBE2L3 可能與 NR3C1 互作。NDFIP1 可透過其 N 端與 UBE2L3 互作，促使 UBE2L3 被招募至 ITCH，並導致 MAP3K7 泛素化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE2L3 是 E2 泛素結合酵素，偏好與 HECT 型及 RBR 家族 E3 酵素合作；由於缺少不依賴 E3 對 lysine 反應的內在活性，不能與多數含 RING 的 E3 酵素作用。它接收 E1 轉交的泛素並促成共價連結，也參與 CUL9-RBX1 介導的泛素化；體外可形成 Lys-11 連結的多聚泛素鏈，並涉及短命或異常蛋白質降解、細胞週期、核內荷爾蒙受體轉錄調節及可能的髓系細胞生成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ubiquitin-conjugating enzyme E2 that specifically acts with HECT-type and RBR family E3 ubiquitin-protein ligases. Does not function with most RING-containing E3 ubiquitin-protein ligases because it lacks intrinsic E3-independent reactivity with lysine; in contrast, it has activity with the RBR family E3 enzymes, such as PRKN, RNF31 and ARIH1, that function like RING-HECT hybrids. Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. Mediates ubiquitination by the CUL9-RBX1 complex. In vitro catalyzes 'Lys-11'-linked polyubiquitination. Involved in the selective degradation of short-lived and abnormal proteins. Down-regulated during the S-phase it is involved in progression through the cell cycle. Regulates nuclear hormone receptors transcriptional activity. May play a role in myelopoiesis PMID 10888878 ↗ · PMID 15367689 ↗ · PMID 17003263 ↗ · PMID 18946090 ↗ · PMID 19340006 ↗ · PMID 20061386 ↗ · PMID 21532592 ↗ · PMID 35294289 ↗ · PMID 38605244 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. PMID 20061386 ↗ · PMID 38605244 ↗ |
| 分子活性 | UBE2L3 參與蛋白質修飾，具體涉及蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | UBE2L3 與 PRKN 互作，涉及錯誤摺疊蛋白質的泛素化與降解；也與 UBE3A、CCNB1IP1、CBL、ZAP70、RNF19A、RNF19B、RNF144B、ARIH1 及 ARIH2 互作。HPV-16 E6 會利用 UBE2L3 與 UBE3A 的互作促進 p53/TP53 泛素化。UBE2L3 與 NCOA1 在調節 progesterone receptor 轉錄活性上有功能性互作，可能與 NR3C1 互作；NDFIP1 經由 N 端互作促進 UBE2L3 招募至 ITCH，並導致 MAP3K7 泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PRKN; involved in ubiquitination and degradation of misfolded proteins. Interacts with UBE3A; used by the papilloma virus HPV-16 E6 protein to ubiquitinate p53/TP53. Interacts with CCNB1IP1, CBL, ZAP70, RNF19A, RNF19B and RNF144B. Interacts with ARIH1. Interacts with ARIH2 (via RING-type 1). Interacts with NCOA1; they functionally interact to regulate progesterone receptor transcriptional activity. May interact with NR3C1. Interacts with NDFIP1 (via N-terminus); the interaction mediates recruitment of UBE2L3 to ITCH and causes MAP3K7 ubiquitination PMID 10558980 ↗ · PMID 10888878 ↗ · PMID 10966114 ↗ · PMID 11237715 ↗ · PMID 11278816 ↗ · PMID 12612082 ↗ · PMID 15367689 ↗ · PMID 16427630 ↗ · PMID 16709802 ↗ · PMID 17003263 ↗ · PMID 19340006 ↗ · PMID 21532592 ↗ · PMID 25632008 ↗ |
| 細胞定位 | UBE2L3 位於細胞核與細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTCTGGGGAAGGAGCAGCACCAAATCCAAGATGGCGGCC40AGCAGGAGGCTGATGAAGGAGCTTGAAGAAATCCGCAAAT80GTGGGATGAAAAACTTCCGTAACATCCAGGTTGATGAAGC120TAATTTATTGACTTGGCAAGGGCTTATTGTTCCTGACAAC160CCTCCATATGATAAGGGAGCCTTCAGAATCGAAATCAACT200TTCCAGCAGAGTACCCATTCAAACCACCGAAGATCACATT240TAAAACAAAGATCTATCACCCAAACATCGACGAAAAGGGG280CAGGTCTGTCTGCCAGTAATTAGTGCCGAAAACTGGAAGC320CAGCAACCAAAACCGACCAAGTAATCCAGTCCCTCATAGC360ACTGGTGAATGACCCCCAGCCTGAGCACCCGCTTCGGGCT400GACCTAGCTGAAGAATACTCTAAGGACCGTAAAAAATTCT440GTAAGAATGCTGAAGAGTTTACAAAGAAATATGGGGAAAA480GCGACCTGTGGACTAAAATCTGCCACGATTGGTTCCAGCA520AGTGTGAGCAGAGACCCCGTGCAGTGCATTCAGACACCCC560GCAAAGCAGGACTCTGTGGAAATTGACACGTGCCACCGCC600TGGCGTTCGCTTGTGGCAGTTACTAACTTTCTACAGTTTT640CTTAATCAAAAGTGGTCTAGGTAACCTGTAAAGAAAGGAT680TAAAAATTTAAGATGTTCTAGTTCTGCTCTCTTTGTTTTA720AAAATCACTGCTTCAATCTACTTCAAAAGAATGGTGTTTC760TTTTCTTGTCCAATTTTATCCAAAATCTTCAAGTTACATT800TAACCCATAAGGTTTAAAAAAAAGGAAAAAAAACGGTTGT840GGTTCCCTTTCTTCCCTACCCTTGCCACTCCCACTTTCTG880GCACCGAGTTTATTTTTCACTTACTTACTTCCCCAGACCC920CGGGCTCGCCTCCACAAAGGAGAAGAGACTGCCCTGGCGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。