演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBE2HUBCH

ubiquitin conjugating enzyme E2 H

UBE2H 編碼 E2 泛素結合酶,能接收泛素並將其轉移至其他蛋白質;體外研究也顯示其可形成特定連結型態的多聚泛素鏈。

Homo sapiens7q32.2UniProt P62256
OFFICIAL SYMBOL
UBE2H
CHROMOSOME
7
UNIPROT
P62256
PDB / ALPHAFOLD
8PJN
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBE2H 是蛋白質編碼基因,產物為 ubiquitin conjugating enzyme E2 H,屬於泛素結合酶家族。它是泛素轉移流程中的 E2 酵素,能接收泛素,並參與將泛素連接至其他蛋白質的反應。來源亦指出,UBE2H 可將泛素轉移至 CTLH E3 泛素蛋白連接酶複合體的核心成分 MAEA。

Official symbol
UBE2H
Gene name
ubiquitin conjugating enzyme E2 H
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12484
UniProt
P62256
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UBCHUBC8GID3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q32.2
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegUBE2Hpq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:129,830,732–129,952,988
Gene span
122,257 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000355621 ★129,830,732–129,952,9607
ENST00000649897129,830,732–129,937,7329
ENST00000871229129,830,732–129,952,9887
ENST00000930649129,830,732–129,952,9887
ENST00000940905129,830,732–129,952,9885
ENST00001136442129,830,732–129,952,9887
ENST00001037786129,830,737–129,952,9887
ENST00001065146129,832,793–129,952,9887
ENST00000473814129,834,937–129,952,6315
ENST00000496698129,834,941–129,951,3277
ENST00000472396129,839,204–129,952,9436
ENST00000490974129,857,548–129,952,7226

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBE2H 參與蛋白質泛素化。它從 E1 泛素活化酵素接收泛素,並催化泛素與自身的 E2 半胱胺酸形成硫酯鍵;此反應使泛素由 E1 轉交至 E2。接著,UBE2H 可促進泛素連接至受體蛋白的離胺酸,形成單泛素化產物。這些反應描述了 UBE2H 在泛素由活化酵素轉移至受體蛋白過程中的作用。

UBE2H 也能將泛素轉移至 MAEA;MAEA 是 CTLH E3 泛素蛋白連接酶複合體的核心成分。此項作用將 UBE2H 的泛素轉移功能與該 E3 複合體聯繫起來。來源支持的是泛素轉移至 MAEA,並未進一步說明此反應對特定蛋白質命運或細胞過程的影響。

體外實驗顯示,UBE2H 可催化以 Lys-11 或 Lys-48 相連的多聚泛素化,也可使 histone H2A 泛素化。這些結果限定於體外條件,不能據此推定其在細胞內的底物範圍或作用效果。資料亦將其功能歸類為蛋白質修飾及蛋白質泛素化;現有來源未提供更多生物學過程或生理意義的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 129952960 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBE2H ENST00000355621 GRCh38 chr7:129952860-129953960 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTATCTTTTGGAAACAGATCTTGCTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCATTG
CGACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCGCGAGTAGTTGGGACTACAGGCGCC
CGCCACCACGCCTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTC
TGGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA
CCGTGCCCGGCTAAATTTAGTCTTTCTTAGTTCACCATTATATCCCTCATGTCCAGCAAGGTGATTAGCA
CGTAGGAGGTGCTAAATAAATATTTATTGGATGAATGAAGTATTTAAGGTTGGTGTAGGAGGTTCACACA
CTTTGCGAAGTTGCCTCATGCTCTGTAGAATAAGGATATTAATACTAAATTATTTCTGACCTTACCACCT
TGCTGCGTCAACTCTAATCTTTGAAATAGTGGCCGTAGACACTGCATACCCTGGTATGCAAGCCTGAGGA
AGCCTTGCTGTGGTCTACAATCCTTGGAAACAAATTCTCTCCAGCCAACGAGGAAGCGGAGTGCAAGGAA
CCTGCTGGTGTGGGGATTTCCAGATTTTGGTGCCTGAGTAATTGCTACCTTGGCCTCCTCCAAATCAAAG
AAATTAACAGCTTGTTAAACAGAGTGTTAAGGGAGGTTCATTACCCTTAAATCCACGAATGTAATAATAT
TGCCATTATTTACTCTTATCGTTTAGGATGATGATAACGACAGTGGCAGTTGAGGGATGAAGTAGGTGGG
GAAGTTGGGGGAGGGGACAGAGGGTGTGAGACAGCCGGAGAAAGAGGAACTACAACTCCCAGAACTCCCC
GGGAAAGCCCACGCCGCGGCGGCGCCCCACCCCTCTCAGCGACCAGACCCGCCCCTCCGATGACGTCACA
GAGGTGACGTCACGGCGCCCAGAGCGAGGCTGGGGTAGGGAGGCCGACTGAGCAGGAGTCGTCCGCTTAT
AGTGGAGGCTGCTAGGAGCCGGTCAGAGGGTGAGTGGGGAGCAGGCGAGCG
UBE2H 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBE2H_2 ↗7:129,952,563負股129,952,553–129,952,612
UBE2H_1 ↗7:129,952,960負股129,952,950–129,953,009

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_BXRC3 · promoter · 129952621–129953244 · regulatory

ENSR7_93WKN8 · enhancer · 129953245–129953524 · regulatory

ENSR7_85S6DS · promoter · 129955594–129955822 · regulatory

ENSR7_85S6DX · enhancer · 129955823–129955972 · regulatory

· motif · 129948315–129948337 · motif

· motif · 129948910–129948920 · motif

· motif · 129948992–129949003 · motif

· motif · 129949031–129949048 · motif

· motif · 129949983–129949995 · motif

· motif · 129950361–129950372 · motif

· motif · 129950678–129950690 · motif

· motif · 129950705–129950716 · motif

· motif · 129950849–129950861 · motif

· motif · 129950875–129950890 · motif

· motif · 129950969–129950980 · motif

· motif · 129950986–129951001 · motif

· motif · 129950993–129951001 · motif

· motif · 129951638–129951649 · motif

· motif · 129952659–129952672 · motif

· motif · 129952666–129952683 · motif

· motif · 129952692–129952705 · motif

· motif · 129952966–129952979 · motif

· motif · 129952966–129952979 · motif

· motif · 129952980–129952993 · motif

· motif · 129952980–129952993 · motif

· motif · 129952995–129953005 · motif

· motif · 129953017–129953027 · motif

· motif · 129953034–129953047 · motif

· motif · 129953104–129953114 · motif

· motif · 129956138–129956152 · motif

· motif · 129956138–129956152 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:183 aa

1 aa183 aa結構域功能區域
依 P62256 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UBE2H 蛋白長 183 個胺基酸,屬於泛素結合酶家族。其第 1–150 個胺基酸為 UBC core;第 152–183 個胺基酸區段註記為無序區。

結構域UBC core1–150 aa
功能區域Disordered152–183 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8PJN…

PDB · 8PJN

EM · 3.40 A · 2=1-183

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UBCHUBE2HGNB2HTTMAGEA2BMAGEC2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UBE2H 與 MAEA、WDR26 有交互作用;兩者皆為 CTLH 複合體成分。來源將 CTLH 描述為包含 GID4、RANBP9 和/或 RANBP10、MKLN1、MAEA、RMND5A(或其旁系同源蛋白 RMND5B)、GID8、ARMC8、WDR26 與 YPEL5 的複合體。此處報告的是交互作用,未逐一界定直接結合或複合體中的具體位置。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBE2H 可從 E1 複合體接收泛素,並催化泛素共價連接至其他蛋白質;它也能將泛素轉移至 CTLH E3 泛素蛋白連接酶複合體的核心成分 MAEA。體外實驗顯示,UBE2H 可催化 Lys-11 與 Lys-48 連結型多聚泛素化,也可使 histone H2A 泛素化。含實驗來源
證據與來源

Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. E2 ubiquitin conjugating enzyme that transfers ubiquitin to MAEA, a core component of the CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex. In vitro catalyzes 'Lys-11'- and 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Capable, in vitro, to ubiquitinate histone H2A

PMID 17588522 ↗ · PMID 20061386 ↗ · PMID 29911972 ↗ · PMID 8132613 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.

PMID 17588522 ↗ · PMID 20061386 ↗ · PMID 22496338 ↗ · PMID 29911972 ↗ · PMID 8132613 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + N(6)-monoubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + N(6)-monoubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.

PMID 17588522 ↗ · PMID 8132613 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UBE2H 參與蛋白質修飾,具體功能類別為蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UBE2H 與 MAEA 及 WDR26 有交互作用,兩者皆為 CTLH 複合體成分。該複合體包含 GID4、RANBP9 和/或 RANBP10、MKLN1、MAEA、RMND5A(或其旁系同源蛋白 RMND5B)、GID8、ARMC8、WDR26 與 YPEL5。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MAEA and WDR26, components of the CTLH complex that contains GID4, RANBP9 and/or RANBP10, MKLN1, MAEA, RMND5A (or alternatively its paralog RMND5B), GID8, ARMC8, WDR26 and YPEL5

PMID 29911972 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000355621 · 5,162 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGCGAGGCTGGGGTAGGGAGGCCGACTGAGCAGGAGTC40
41GTCCGCTTATAGTGGAGGCTGCTAGGAGCCGGTCAGAGGG80
81TGAGTGGGGAGCAGGCGAGCGAGCCACAGCAGGCAGGAGG120
121GAGCGTCGCGCGGCGCAGAGGAGCGCCGGGGCAGGGCCGC160
161GGCGGAACCACAGCCGGAGAGGGGCAGCCCGAGCCGGGCG200
201CCGCAGGGTCCCCACCCCCACCCGGCCGGACAGTGCCCGG240
241TGTTCCCCCGTGCGGGGGGCGGCGGCGGCGGCTGACGGGA280
281CCGCCGGGACCGCGGGGGTGTTGCCACCTCCACCGAGGAG320
321CCGGCGCGGCCGCGGGCTCCTCAGAGCCGGGGCCCCGGGC360
361CCGTGACAGACGGGCCGAGGAAGGGAGAGAGGCGGCGGCG400
401ACACCATGTCATCTCCCAGTCCGGGCAAGAGGCGGATGGA440
441CACGGACGTGGTCAAGCTCATCGAGAGTAAACATGAGGTT480
481ACGATCCTGGGAGGACTTAATGAATTTGTAGTGAAGTTTT520
521ATGGACCACAAGGAACACCATATGAAGGCGGAGTATGGAA560
561AGTTAGAGTGGACCTACCTGATAAATACCCTTTCAAATCT600
601CCATCTATAGGATTCATGAATAAAATTTTCCATCCCAACA640
641TTGATGAAGCGTCAGGAACTGTGTGTCTAGATGTAATTAA680
681TCAAACTTGGACAGCTCTCTATGATCTTACCAATATATTT720
721GAGTCCTTCCTGCCTCAGTTATTGGCCTATCCTAACCCCA760
761TAGATCCTCTCAATGGTGACGCTGCAGCCATGTACCTCCA800
801CCGACCAGAAGAATACAAGCAGAAAATTAAAGAGTACATC840
841CAGAAATACGCCACGGAGGAGGCGCTGAAAGAACAGGAAG880
881AGGGTACCGGGGACAGCTCATCGGAGAGCTCTATGTCTGA920
921CTTTTCCGAAGATGAGGCCCAGGATATGGAGTTGTAGTAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。