演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBE2G2UBC7

ubiquitin conjugating enzyme E2 G2

UBE2G2 編碼 ubiquitin conjugating enzyme E2 G2,屬於泛素結合酶家族,參與蛋白質泛素化及內質網相關降解。

Homo sapiens21q22.3UniProt P60604
OFFICIAL SYMBOL
UBE2G2
CHROMOSOME
21
UNIPROT
P60604
PDB / ALPHAFOLD
2CYX
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBE2G2 是一個蛋白質編碼基因,其產物 ubiquitin conjugating enzyme E2 G2 屬於泛素結合酶家族。這類酵素在泛素轉移過程中擔任 E2 角色;UBE2G2 可接收來自 E1 複合體的泛素,並參與將泛素連接至其他蛋白質。來源亦將其功能歸類於蛋白質修飾與蛋白質泛素化。這些基本特性顯示,UBE2G2 的主要分子角色是參與泛素標記,而非作為泛素連接酶本身。

Official symbol
UBE2G2
Gene name
ubiquitin conjugating enzyme E2 G2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12483
UniProt
P60604
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UBC7

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.3
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegUBE2G2pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:44,768,580–44,801,826
Gene span
33,247 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000345496 ★44,768,580–44,801,8206
ENST0000033094244,768,580–44,801,7747
ENST0000090788844,768,580–44,801,8246
ENST0000091495644,768,580–44,801,8246
ENST0000113165844,768,580–44,801,8246
ENST0000103915044,769,046–44,801,8246
ENST0000111644644,775,620–44,801,8245
ENST0000113122344,800,814–44,801,8243

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBE2G2 參與泛素轉移反應:它從 E1 複合體接收泛素,並催化泛素與其他蛋白質形成共價連接。其酵素反應包含泛素由 E1 的半胱胺酸轉移至 E2 的半胱胺酸,完成 E2 的泛素化中間步驟。體外實驗顯示,UBE2G2 可催化形成以 Lys-48 相連的多聚泛素鏈;此結果限定於體外條件,不應直接視為所有細胞情境中的作用方式。

UBE2G2 也參與內質網相關降解(ERAD)。此外,在固醇誘導的反應中,它是 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase 泛素化所必需,並與該蛋白質後續的蛋白酶體降解有關。此處描述的是固醇誘導條件下的特定蛋白質周轉過程。

上述作用反映 UBE2G2 如何將泛素轉移能力連結至蛋白質修飾與降解:它既可參與一般的蛋白質泛素化,也與 ERAD 及特定代謝相關蛋白質的降解過程相連。來源支持其在這些過程中的參與與必要性,但沒有進一步界定所有受影響蛋白質或各細胞情境下的完整作用範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44801820 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBE2G2 ENST00000345496 GRCh38 chr21:44801720-44802820 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAAGGGATCATCTGCAATGCTGGAAAGGAAAAGACAAATGATAGATTATTGCAACAAACAGCCAGGCAA
GAGATGCAAACTTTTTTTGCAAAGGTGTGTGTGTATATACATCCTTGCACCGGACAGCCACGAAGCACCT
ACTGTGCTGTGAAGTCAGTAAGGATGTGGGTTAAAATCGCTCACCTCACAGCGGGTCAATCGGGAAAGCA
CACCCACTCACTACAGCCATTATGGGAAAAAGGGCTCGCCCCTTACAGGATCCTCAACTGTGGAGAGGCC
GGGAGCCCACGCGGGGCGCTGGGGAGTCTCTCAGCACCCCAGGGGTTCGGGCAGGGACCTGAGCCGCGCC
CTCTCTCCCGGGGGTGCCCTGGGGTCGAGGCTGCTCGGCAGAGCCGGCGGTCAGTTCGAGCCGCGGGCCC
GAACAGGGCTCTCCCCGCGGCTCTCTCCCTCGGAGTAGAAGGTGCTGGACCCGAACTCCAGCGGAGCCGC
ACAACACGTGGAGGAAAAGCGCCAGGACAGCTAACCTTCCCACCTTTTCAAACCTGAAACCCGGCCGGCT
GGGGACGGTTGGAATGTTCAGTGCGTACCCGCACCTCAGGCCCCTTGTCTCCAGCCCCAGACCGCCCCGC
GACCATCCTCCCCACCCCCCGACCTCTTATCTCGTCCCCGCCCTGTCTCCCCAACCTCCATCCTCCCCTC
CACAACCCCCGTCCTCCCGCCCTTCGGCCACGCGCGGCTGGCACAGAACAGGCAGTTAGCGCACACACAC
TGGAACAGGCGCCACCGTTCAGGAAGTCTCTACAAGACCAGGACCCTGAGGCCTCTGGAAGTGCCGGGAC
CGAACCAACCCCGCAGAGCGACTAAGGCGAGGGCAGGAGCCAAGAGAATCGTAGCCGCGGTCGCGGGTTG
AGCTCCCACCACCCGGACAGCGCGCCTCGGCGATCGCGCACGCGCCACGCCCCGGAAGAGTTCCTGGGCC
CGCGACGGTGGCCCGGAAGCAGTCCCCGGTGTCGGGGCAGGAGGCACGCGCGCGGCTGAGGCGAGGTCGC
TCGGCGCAGCTGTTGCGGGGCCATGGCGGGGACCGCGCTCAAGAGGCTGAT
UBE2G2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBE2G2_1 ↗21:44,801,804負股44,801,794–44,801,853

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_9MR53 · enhancer · 44800172–44800576 · regulatory

ENSR21_5DJHRQ · CTCF_binding_site · 44800281–44800302 · regulatory

ENSR21_BBW3N · enhancer · 44800893–44801763 · regulatory

ENSR21_83BK8Z · promoter · 44801764–44801916 · regulatory

ENSR21_9MR5M · promoter · 44802087–44802587 · regulatory

ENSR21_BBW3W · enhancer · 44802588–44803131 · regulatory

· motif · 44800283–44800299 · motif

· motif · 44801223–44801236 · motif

· motif · 44801280–44801293 · motif

· motif · 44801789–44801800 · motif

· motif · 44801820–44801829 · motif

· motif · 44801820–44801831 · motif

· motif · 44801865–44801876 · motif

· motif · 44801865–44801876 · motif

· motif · 44802079–44802095 · motif

· motif · 44802285–44802300 · motif

· motif · 44802319–44802328 · motif

· motif · 44802319–44802328 · motif

· motif · 44804687–44804695 · motif

· motif · 44806054–44806068 · motif

· motif · 44806054–44806068 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:165 aa

1 aa165 aa結構域
依 P60604 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UBE2G2 蛋白質長 165 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。其 UBC core 結構域位於第 4 至第 164 個胺基酸,幾乎涵蓋整條蛋白質序列。

結構域UBC core4–164 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2CYX…

PDB · 2CYX

X-ray · 2.56 A · A/B/C=1-165

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum;Lipid droplet

UBE2G2 位於內質網與脂滴。 來源列出這兩處定位,但未提供定位隨條件改變的細節。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Lipid droplet。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UBC7UBE2G2AMFRAUP1PIK3R1UBC
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UBE2G2 透過 C 端與 AUP1 互作;此結合可將 UBE2G2 招募至脂滴。它也與泛素連接酶 AMFR/gp78 和 RNF139/TRC8 互作。AUP1 招募至脂滴後,會促進 UBE2G2 與 AMFR、RNF139 的互作;在固醇誘導條件下,這與 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase 的泛素化及後續蛋白酶體降解相關。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBE2G2 從 E1 複合體接收泛素,並催化其與其他蛋白質形成共價連接;體外可催化形成 Lys-48 相連的多聚泛素鏈。它參與內質網相關降解,且在固醇誘導的 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase 泛素化及其後續蛋白酶體降解中是必要的。含實驗來源
證據與來源

Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Involved in endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD). Required for sterol-induced ubiquitination of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase and its subsequent proteasomal degradation

PMID 20061386 ↗ · PMID 22607976 ↗ · PMID 23223569 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.

PMID 20061386 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UBE2G2 參與蛋白質修飾,具體涉及蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UBE2G2 透過 C 端與 AUP1 互作,並因此被招募至脂滴;它也與泛素連接酶 AMFR/gp78 和 RNF139/TRC8 互作。AUP1 的脂滴招募促進 UBE2G2 與這兩種連接酶互作,並與固醇誘導的 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase 泛素化及後續蛋白酶體降解相關。含實驗來源
證據與來源

Interacts with AUP1 (via C-terminus); the interaction recruits UBE2G2 to lipid droplets. Interacts with ubiquitin ligases AMFR/gp78 and RNF139/TRC8; recruitment to lipid droplets by AUP1 facilitates interaction of UBE2G2 with AMFR and RNF139, leading to sterol-induced ubiquitination of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase and its subsequent proteasomal degradation

PMID 21127063 ↗ · PMID 21857022 ↗ · PMID 23223569 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UBE2G2 的定位包括內質網與脂滴。含實驗來源
證據與來源

Endoplasmic reticulum; Lipid droplet

PMID 23223569 ↗ · PMID 21127063 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000345496 · 3,367 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCCCGGTGTCGGGGCAGGAGGCACGCGCGCGGCTGAG40
41GCGAGGTCGCTCGGCGCAGCTGTTGCGGGGCCATGGCGGG80
81GACCGCGCTCAAGAGGCTGATGGCCGAGTACAAACAATTA120
121ACACTGAATCCTCCGGAAGGAATTGTAGCAGGCCCCATGA160
161ATGAAGAGAACTTTTTTGAATGGGAGGCATTGATCATGGG200
201CCCAGAAGACACCTGCTTTGAGTTTGGTGTTTTTCCTGCC240
241ATCCTGAGTTTCCCACTTGATTACCCGTTAAGTCCCCCAA280
281AGATGAGATTTACCTGTGAGATGTTTCATCCCAACATCTA320
321CCCTGATGGGAGAGTCTGCATTTCCATCCTCCACGCGCCA360
361GGCGATGACCCCATGGGCTACGAGAGCAGCGCGGAGCGGT400
401GGAGTCCTGTGCAGAGTGTGGAGAAGATCCTGCTGTCGGT440
441GGTGAGCATGCTGGCAGAGCCCAATGACGAAAGTGGAGCT480
481AACGTGGATGCGTCCAAAATGTGGCGCGATGACCGGGAGC520
521AGTTCTATAAGATTGCCAAGCAGATCGTCCAGAAGTCTCT560
561GGGACTGTGAGACCTGGCCTCGCACAGGCGCGCACACACC600
601GCCAAGCAGCTCAGCATTCTCCCCCGGCACACTTAGTGAC640
641AGTGATGCTCTGTGCTGGTACCAAACAAGGCAGACTTGCA680
681AGAACCATGGCATCTTTTTTTTTTTTCAAACCTTTCCTAC720
721TTCAAACAGGCTTCTCTTCTGAAATGATGACTTAATGTCG760
761AATATTGACAGCTTACTGCAGTTTTACAGTATTCCTCACA800
801AAGGGCTTCAGGTAGATTATCAGAGCTGTCAGCACTACCT840
841CTCCCCGCTGAAACCAGCAGTTCATGGCTTCCTGTGGATT880
881CCCTCCCTCCCTGGAGTGTTGAGGGGGTTGTACCTGCCAG920
921ACTTCCAGGGGACGATGGAATACCCAGAACGCTCCTTCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。