基因總覽
UBE2G1 是由蛋白質編碼基因產生的泛素結合酵素,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family。其蛋白質名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 G1,具有 UBC core 結構域。這類酵素的基本角色是接收泛素,並參與將泛素連接至其他蛋白質;UBE2G1 的來源註解亦記載其可催化蛋白質泛素化。其結構與家族歸屬提供了理解此蛋白質分子功能的基本資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396981 ★ | 4,269,259–4,366,675 | 6 |
| ENST00000983771 | 4,269,259–4,366,675 | 5 |
| ENST00000983773 | 4,269,259–4,366,675 | 4 |
| ENST00000983774 | 4,269,259–4,366,675 | 3 |
| ENST00000877982 | 4,269,266–4,366,675 | 6 |
| ENST00000877983 | 4,271,426–4,366,675 | 5 |
| ENST00000572484 | 4,271,980–4,366,628 | 7 |
| ENST00000877984 | 4,272,028–4,366,675 | 6 |
| ENST00000957659 | 4,272,028–4,366,675 | 6 |
| ENST00000877985 | 4,280,337–4,366,675 | 5 |
| ENST00000923588 | 4,280,643–4,366,675 | 6 |
| ENST00001034913 | 4,280,643–4,366,675 | 4 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE2G1 可由 E1 complex 接收泛素,並催化泛素與其他蛋白質形成共價連接。此過程涉及泛素由 E1 ubiquitin-activating enzyme 的半胱胺酸轉移至 E2 ubiquitin-conjugating enzyme 的半胱胺酸;反應後,泛素連接於 E2,E1 則恢復原先未帶泛素的狀態。這項轉移反映 UBE2G1 在蛋白質泛素化過程中的作用。
體外實驗中,UBE2G1 可催化形成以 Lys-48 或 Lys-63 相連的多聚泛素鏈。這些結果說明其催化反應可產生不同連結方式的泛素鏈;來源僅描述體外催化,未提供足以將這些結果延伸為特定細胞情境或生理後果的資訊。
來源指出,UBE2G1 可能參與肌肉特異性蛋白質的降解,措辭保留其可能性,並未將此作用描述為已確立的必然結果。此外,UBE2G1 可介導 CYP3A4 的多聚泛素化。這些資料顯示它可作用於特定蛋白質的泛素化,但未進一步說明此修飾與其後續命運之間的關係。
Promoter 與基因調控
>UBE2G1 ENST00000396981 GRCh38 chr17:4366575-4367675 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCAACACAGAGAGACCTCTGGCCCCCCCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTCTCTCTGT CGGCCATGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACTGCAATCTCTGCCTCCTAGGTTCAAGCAATTC TCCTTTCTCAGCCTCCCTGGTAGCTGGGAGTACAGGCGCCTGCCACCAGGCTGGGCTAATTTTTGTATTT TTAGTAGAGACCAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAACTCGTGACCTCAGGTGATCTGCCCA CCTCGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACCGCGCCCCGTCAAACCCCCCGATCTCTAT AAAGCAAATAAAAAAATAGCAGGGCATGGTGGTGTGTACCTGTAATCCCAGATACTAAGGAGACTCAGAT GGGAGGATCCCTTAAGCCCAGGAGTTCCAAGCTGCAGTGAGCTATGATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGA CAGAGAGAATTGCCGTCCATAAATGATAATAATAACAGGGCCGGTCTCGGTGGCTCAATAATAATAGGGC CGGACGCGGTGGCTTTTTTTGTGCACTCTTCATGTAAAGTGAGTTATCATCATATATTGCCTCTATTTTG ATGTTTGGTTAAAATGGGGCACACCAGTACTAACTTCGGCTTTCTAACAATTCCTACTTCGCACACCATG TGGCAGTGTTAGATGGCTTTTGGGCGCTCGCCAAGGACTAGACATCTACCACTTCTTCTGGCCTCTTCGC TCCTATATCCACTGCTTCAATCCAGAGGCTGTATTTGACCCTCTGCGACCTCTTTGTCATGGCGTCCGCG GGGCGTCTACCAGCGGAGGCTTGGGCTGGCAGCCGGGCGTCGACCTTCCCAAAATGGCGGCGGACGGGAC AACTGCGCTCAAGGGGCGGGGTTCCGCCGCCGGGGGCGGGGCGGGAGGCCGAGGGGTCGGGCTAGCGGGC GGGACGCTTCCCAAGTCGGCAGTCTCAGCGCGCCTGCGCCGAGCGGCCCTGCGCGCAGTGAGGCAGTGGC GGGGGAAGGCACCGGTGGGGCCGACGGGCGGGTTGAAGGAGGGAAGCGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE2G1_2 ↗ | 17:4,366,518 | 負股 | 4,366,508–4,366,567 |
| UBE2G1_1 ↗ | 17:4,366,643 | 負股 | 4,366,633–4,366,692 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_85GHJ · enhancer · 4362297–4362516 · regulatory
ENSR17_CFNR · enhancer · 4364819–4366617 · regulatory
ENSR17_85GL2 · promoter · 4366618–4366808 · regulatory
ENSR17_BTDR · enhancer · 4366809–4367376 · regulatory
· motif · 4363556–4363568 · motif
· motif · 4363619–4363631 · motif
· motif · 4363621–4363643 · motif
· motif · 4363621–4363643 · motif
· motif · 4365350–4365361 · motif
· motif · 4365350–4365361 · motif
· motif · 4365414–4365429 · motif
· motif · 4365529–4365540 · motif
· motif · 4365529–4365540 · motif
· motif · 4366523–4366532 · motif
· motif · 4366656–4366667 · motif
· motif · 4366656–4366667 · motif
· motif · 4366706–4366721 · motif
· motif · 4366724–4366734 · motif
· motif · 4366744–4366754 · motif
· motif · 4366774–4366784 · motif
· motif · 4366864–4366871 · motif
· motif · 4367743–4367755 · motif
· motif · 4369034–4369046 · motif
· motif · 4369036–4369043 · motif
· motif · 4369036–4369051 · motif
· motif · 4369162–4369177 · motif
· motif · 4369168–4369180 · motif
· motif · 4369170–4369177 · motif
· motif · 4369170–4369185 · motif
· motif · 4369178–4369185 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:170 aa
UBE2G1 蛋白質長 170 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family。其 UBC core 結構域位於第 5 至第 166 個胺基酸,涵蓋蛋白質大部分序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CCKP06307 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNB2P62879 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LAMP2P13473-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRPF40AO75400-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GLB1Q9Y371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE2G1 可從 E1 complex 接收泛素,並催化泛素與其他蛋白質形成共價連接。體外可催化形成 Lys-48 或 Lys-63 相連的多聚泛素鏈;它可能參與肌肉特異性蛋白質的降解,並可介導 CYP3A4 的多聚泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-48'-, as well as 'Lys-63'-linked polyubiquitination. May be involved in degradation of muscle-specific proteins. Mediates polyubiquitination of CYP3A4 PMID 19103148 ↗ · PMID 20061386 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. PMID 20061386 ↗ |
| 分子活性 | UBE2G1 涉及蛋白質修飾,具體包括蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTCTCAGCGCGCCTGCGCCGAGCGGCCCTGCGCGCAGTG40AGGCAGTGGCGGGGGAAGGCACCGGTGGGGCCGACGGGCG80GGTTGAAGGAGGGAAGCGGGCGAGCGAAGTCCCAGTGCGC120GCCGCGGCAGCCCGGGCACCCTCCCCTTCCGGGCGTGAGT160CGCTGTGAAAAGAGCTGAAGCGAGCGGACTCGCACCGGCA200GCGAGGCGCCGCTCCCGCCGCCTCAGCCCGGCCTTCCTCG240GCTCCGGCGCTCCGGTCGCGGGGCCCGGGTTCCTCGGCAC280ACCCCGCTCCAGCCGCCCCCAGAGCCTGTCCCCAGCCCTT320CGGAAGCCCCGGCGCCAGCCCGGGCCCTCGGCAGGGAGGA360TGACGGAGCTGCAGTCGGCACTGCTACTGCGAAGACAGCT400GGCAGAACTCAACAAAAATCCAGTGGAAGGCTTTTCTGCA440GGTTTAATAGATGACAATGATCTCTACCGATGGGAAGTCC480TTATTATTGGCCCTCCAGATACACTTTATGAAGGTGGTGT520TTTTAAGGCTCATCTTACTTTCCCAAAAGATTATCCCCTC560CGACCTCCTAAAATGAAATTCATTACAGAAATCTGGCACC600CAAATGTTGATAAAAATGGTGATGTGTGCATTTCTATTCT640TCATGAGCCTGGGGAAGATAAGTATGGTTATGAAAAGCCA680GAGGAACGCTGGCTCCCTATCCACACTGTGGAAACCATCA720TGATTAGTGTCATTTCTATGCTGGCAGACCCTAATGGAGA760CTCACCTGCTAATGTTGATGCTGCGAAAGAATGGAGGGAA800GATAGAAATGGAGAATTTAAAAGAAAAGTTGCCCGCTGTG840TAAGAAAAAGCCAAGAGACTGCTTTTGAGTGACATTTATT880TAGCAGCTAGTAACTTCACTTATTTCAGGGTCTCCAATTG920AGAAACATGGCACTGTTTTTCCTGCACTCTACCCACCTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。