演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBE2G1UBC7

ubiquitin conjugating enzyme E2 G1

UBE2G1(ubiquitin conjugating enzyme E2 G1)是泛素結合酵素家族的蛋白質,參與將泛素轉移並共價連接至其他蛋白質。

Homo sapiens17p13.2UniProt P62253
OFFICIAL SYMBOL
UBE2G1
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P62253
PDB / ALPHAFOLD
6D68
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBE2G1 是由蛋白質編碼基因產生的泛素結合酵素,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family。其蛋白質名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 G1,具有 UBC core 結構域。這類酵素的基本角色是接收泛素,並參與將泛素連接至其他蛋白質;UBE2G1 的來源註解亦記載其可催化蛋白質泛素化。其結構與家族歸屬提供了理解此蛋白質分子功能的基本資訊。

Official symbol
UBE2G1
Gene name
ubiquitin conjugating enzyme E2 G1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12482
UniProt
P62253
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UBC7UBE2G

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p13.2
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegUBE2G1pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:4,269,221–4,366,678
Gene span
97,458 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000396981 ★4,269,259–4,366,6756
ENST000009837714,269,259–4,366,6755
ENST000009837734,269,259–4,366,6754
ENST000009837744,269,259–4,366,6753
ENST000008779824,269,266–4,366,6756
ENST000008779834,271,426–4,366,6755
ENST000005724844,271,980–4,366,6287
ENST000008779844,272,028–4,366,6756
ENST000009576594,272,028–4,366,6756
ENST000008779854,280,337–4,366,6755
ENST000009235884,280,643–4,366,6756
ENST000010349134,280,643–4,366,6754

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBE2G1 可由 E1 complex 接收泛素,並催化泛素與其他蛋白質形成共價連接。此過程涉及泛素由 E1 ubiquitin-activating enzyme 的半胱胺酸轉移至 E2 ubiquitin-conjugating enzyme 的半胱胺酸;反應後,泛素連接於 E2,E1 則恢復原先未帶泛素的狀態。這項轉移反映 UBE2G1 在蛋白質泛素化過程中的作用。

體外實驗中,UBE2G1 可催化形成以 Lys-48 或 Lys-63 相連的多聚泛素鏈。這些結果說明其催化反應可產生不同連結方式的泛素鏈;來源僅描述體外催化,未提供足以將這些結果延伸為特定細胞情境或生理後果的資訊。

來源指出,UBE2G1 可能參與肌肉特異性蛋白質的降解,措辭保留其可能性,並未將此作用描述為已確立的必然結果。此外,UBE2G1 可介導 CYP3A4 的多聚泛素化。這些資料顯示它可作用於特定蛋白質的泛素化,但未進一步說明此修飾與其後續命運之間的關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 4366675 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBE2G1 ENST00000396981 GRCh38 chr17:4366575-4367675 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCAACACAGAGAGACCTCTGGCCCCCCCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTCTCTCTGT
CGGCCATGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACTGCAATCTCTGCCTCCTAGGTTCAAGCAATTC
TCCTTTCTCAGCCTCCCTGGTAGCTGGGAGTACAGGCGCCTGCCACCAGGCTGGGCTAATTTTTGTATTT
TTAGTAGAGACCAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAACTCGTGACCTCAGGTGATCTGCCCA
CCTCGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACCGCGCCCCGTCAAACCCCCCGATCTCTAT
AAAGCAAATAAAAAAATAGCAGGGCATGGTGGTGTGTACCTGTAATCCCAGATACTAAGGAGACTCAGAT
GGGAGGATCCCTTAAGCCCAGGAGTTCCAAGCTGCAGTGAGCTATGATCACTGCACTCCAGCCTGGGCGA
CAGAGAGAATTGCCGTCCATAAATGATAATAATAACAGGGCCGGTCTCGGTGGCTCAATAATAATAGGGC
CGGACGCGGTGGCTTTTTTTGTGCACTCTTCATGTAAAGTGAGTTATCATCATATATTGCCTCTATTTTG
ATGTTTGGTTAAAATGGGGCACACCAGTACTAACTTCGGCTTTCTAACAATTCCTACTTCGCACACCATG
TGGCAGTGTTAGATGGCTTTTGGGCGCTCGCCAAGGACTAGACATCTACCACTTCTTCTGGCCTCTTCGC
TCCTATATCCACTGCTTCAATCCAGAGGCTGTATTTGACCCTCTGCGACCTCTTTGTCATGGCGTCCGCG
GGGCGTCTACCAGCGGAGGCTTGGGCTGGCAGCCGGGCGTCGACCTTCCCAAAATGGCGGCGGACGGGAC
AACTGCGCTCAAGGGGCGGGGTTCCGCCGCCGGGGGCGGGGCGGGAGGCCGAGGGGTCGGGCTAGCGGGC
GGGACGCTTCCCAAGTCGGCAGTCTCAGCGCGCCTGCGCCGAGCGGCCCTGCGCGCAGTGAGGCAGTGGC
GGGGGAAGGCACCGGTGGGGCCGACGGGCGGGTTGAAGGAGGGAAGCGGGC
UBE2G1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBE2G1_2 ↗17:4,366,518負股4,366,508–4,366,567
UBE2G1_1 ↗17:4,366,643負股4,366,633–4,366,692

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_85GHJ · enhancer · 4362297–4362516 · regulatory

ENSR17_CFNR · enhancer · 4364819–4366617 · regulatory

ENSR17_85GL2 · promoter · 4366618–4366808 · regulatory

ENSR17_BTDR · enhancer · 4366809–4367376 · regulatory

· motif · 4363556–4363568 · motif

· motif · 4363619–4363631 · motif

· motif · 4363621–4363643 · motif

· motif · 4363621–4363643 · motif

· motif · 4365350–4365361 · motif

· motif · 4365350–4365361 · motif

· motif · 4365414–4365429 · motif

· motif · 4365529–4365540 · motif

· motif · 4365529–4365540 · motif

· motif · 4366523–4366532 · motif

· motif · 4366656–4366667 · motif

· motif · 4366656–4366667 · motif

· motif · 4366706–4366721 · motif

· motif · 4366724–4366734 · motif

· motif · 4366744–4366754 · motif

· motif · 4366774–4366784 · motif

· motif · 4366864–4366871 · motif

· motif · 4367743–4367755 · motif

· motif · 4369034–4369046 · motif

· motif · 4369036–4369043 · motif

· motif · 4369036–4369051 · motif

· motif · 4369162–4369177 · motif

· motif · 4369168–4369180 · motif

· motif · 4369170–4369177 · motif

· motif · 4369170–4369185 · motif

· motif · 4369178–4369185 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:170 aa

1 aa170 aa結構域
依 P62253 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UBE2G1 蛋白質長 170 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family。其 UBC core 結構域位於第 5 至第 166 個胺基酸,涵蓋蛋白質大部分序列。

結構域UBC core5–166 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6D68…

PDB · 6D68

X-ray · 2.36 A · A/B=1-170

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UBC7UBE2G1CCKGNB2LAMP2PRPF40ASH3GLB1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBE2G1 可從 E1 complex 接收泛素,並催化泛素與其他蛋白質形成共價連接。體外可催化形成 Lys-48 或 Lys-63 相連的多聚泛素鏈;它可能參與肌肉特異性蛋白質的降解,並可介導 CYP3A4 的多聚泛素化。含實驗來源
證據與來源

Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-48'-, as well as 'Lys-63'-linked polyubiquitination. May be involved in degradation of muscle-specific proteins. Mediates polyubiquitination of CYP3A4

PMID 19103148 ↗ · PMID 20061386 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.

PMID 20061386 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UBE2G1 涉及蛋白質修飾,具體包括蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000396981 · 4,167 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCTCAGCGCGCCTGCGCCGAGCGGCCCTGCGCGCAGTG40
41AGGCAGTGGCGGGGGAAGGCACCGGTGGGGCCGACGGGCG80
81GGTTGAAGGAGGGAAGCGGGCGAGCGAAGTCCCAGTGCGC120
121GCCGCGGCAGCCCGGGCACCCTCCCCTTCCGGGCGTGAGT160
161CGCTGTGAAAAGAGCTGAAGCGAGCGGACTCGCACCGGCA200
201GCGAGGCGCCGCTCCCGCCGCCTCAGCCCGGCCTTCCTCG240
241GCTCCGGCGCTCCGGTCGCGGGGCCCGGGTTCCTCGGCAC280
281ACCCCGCTCCAGCCGCCCCCAGAGCCTGTCCCCAGCCCTT320
321CGGAAGCCCCGGCGCCAGCCCGGGCCCTCGGCAGGGAGGA360
361TGACGGAGCTGCAGTCGGCACTGCTACTGCGAAGACAGCT400
401GGCAGAACTCAACAAAAATCCAGTGGAAGGCTTTTCTGCA440
441GGTTTAATAGATGACAATGATCTCTACCGATGGGAAGTCC480
481TTATTATTGGCCCTCCAGATACACTTTATGAAGGTGGTGT520
521TTTTAAGGCTCATCTTACTTTCCCAAAAGATTATCCCCTC560
561CGACCTCCTAAAATGAAATTCATTACAGAAATCTGGCACC600
601CAAATGTTGATAAAAATGGTGATGTGTGCATTTCTATTCT640
641TCATGAGCCTGGGGAAGATAAGTATGGTTATGAAAAGCCA680
681GAGGAACGCTGGCTCCCTATCCACACTGTGGAAACCATCA720
721TGATTAGTGTCATTTCTATGCTGGCAGACCCTAATGGAGA760
761CTCACCTGCTAATGTTGATGCTGCGAAAGAATGGAGGGAA800
801GATAGAAATGGAGAATTTAAAAGAAAAGTTGCCCGCTGTG840
841TAAGAAAAAGCCAAGAGACTGCTTTTGAGTGACATTTATT880
881TAGCAGCTAGTAACTTCACTTATTTCAGGGTCTCCAATTG920
921AGAAACATGGCACTGTTTTTCCTGCACTCTACCCACCTAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。