演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBE2E2UbcH8

ubiquitin conjugating enzyme E2 E2

UBE2E2 是一種 E2 泛素結合酶,能接收泛素並催化其共價連接至其他蛋白質;體外也可催化特定鏈型的多聚泛素化。

Homo sapiens3p24.3UniProt Q96LR5
OFFICIAL SYMBOL
UBE2E2
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q96LR5
PDB / ALPHAFOLD
9LTO
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBE2E2(ubiquitin conjugating enzyme E2 E2)是蛋白質編碼基因,產物屬於泛素結合酶家族。這類酵素參與蛋白質修飾;就 UBE2E2 而言,來源資料指出其可接收泛素,並促進泛素與其他蛋白質形成共價連接。蛋白質全長 201 個胺基酸,包含 UBC core 結構域;其胺基端第 1 至 55 位被註記為無序區域。這些資訊勾勒出 UBE2E2 的家族歸屬與基本結構,具體催化作用及其條件見功能說明。

Official symbol
UBE2E2
Gene name
ubiquitin conjugating enzyme E2 E2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12478
UniProt
Q96LR5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UbcH8FLJ25157

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p24.3
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegUBE2E2pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:23,203,015–23,592,847
Gene span
389,833 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000396703 ★23,203,327–23,591,7946
ENST0000042579223,203,015–23,592,8476
ENST0000111929823,203,015–23,346,6974
ENST0000111929923,203,015–23,332,4944
ENST0000111930023,203,015–23,277,2094
ENST0000045289423,203,100–23,532,6156
ENST0000112200623,203,290–23,332,5004
ENST0000114345623,203,290–23,592,8476
ENST0000091731323,203,741–23,592,8476

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBE2E2 在泛素轉移反應中接收來自 E1 複合體的泛素,並催化泛素與其他蛋白質形成共價連接。反應描述顯示,泛素先以硫酯鍵連接於 E1 的半胱胺酸,再轉移至 E2 酵素的半胱胺酸;轉移後,E1 回復未攜帶泛素的狀態,而泛素則暫時以硫酯鍵連接於 E2。這項轉移反映 UBE2E2 在泛素化過程中承接活化泛素的角色。

除了泛素轉移,體外實驗顯示 UBE2E2 可催化 Lys-11、Lys-48 與 Lys-63 連結型的多聚泛素化。這些結果限定於體外條件,說明其催化能力涵蓋數種不同的泛素鏈連結方式;來源未進一步交代這些鏈型在特定細胞情境中的作用或對應底物,因此不宜據此推定體內功能。

UBE2E2 也可催化 ISGylation,亦即將 ISG15 共價連接至蛋白質;來源特別指出其底物為 influenza A virus NS1 protein。此項作用與泛素化有所區別,顯示 UBE2E2 的催化對象不限於泛素,但現有資料未描述反應條件或其對病毒蛋白功能的影響。

資料將其功能歸於蛋白質修飾與蛋白質泛素化。整體可確認的功能範圍包括 E1 至 E2 的泛素轉移、體外多種連結型多聚泛素化,以及對 influenza A virus NS1 protein 的 ISGylation;來源並未提供更廣泛的細胞過程或生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23203327 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBE2E2 ENST00000396703 GRCh38 chr3:23202327-23203427 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGAAGGCAGCTTCCCACTCACTCTGACAGTGGTGCACCCTGTACCCCCACCCCTCTCTTCAATACCCCAG
GGCTAAACGGCCCGAAGCTCCTCTCTACCGGCTGGTGCGCATTCTGGGCCAGGGCGAGCCAAAAGGCAGA
AGGGCCTTCGTGCTGCAGTGTCTGGTGAAGACTCAGGCTTAGCCTGGAAGAAGTTTCCAGGCCAACGTGA
AGTTTTCCTGTCTTGGGTACATGCGAGCCCCACGCGTCTGCGAGTTTGGGTTAGTGTGTCAACAGGGTCA
GTCCCCGTATCTACTTTGCGAAAGCTTCGAGGCGAGCGTGAAGTCAAGGGCTGCGGTGGATGGGGGTAAA
AGGCCTCCTCGTCCCACTGCCTGCACCGTCTTGGGGTAACCCCTAACCCCCAGCCGGCGTTTCCCTTTAA
TGCGCGTGCCCGGCAAGGTCCTCGCGTCCCCTCCCCTCAAGCCACCCCGTCAGCCTCGGTTTCCCCCACT
TCTCCCCGTCCTTGTCGTTCCTTCCCCGTGGGACGCCCCTCGCTCACCCCCGTCAGAGCCCAGTCTGCGC
GCGGGACCCAGCTGTCACTTTACTTTTCCTCGCCGCCTCCCCACCCCCTCTCCCGACCGGCGGGGCAGCC
CGCCCGGGCGCGCTCCCGCCCCCGCCCCCTCGCGGCCGCGCGCCGGAGGAGGAGGGGCGGGGGGAGGAGG
GAGGCGCGCGGCGCCGCATGGCCGACGTGGGGCTCGCGCTCTCGCGGTCTCTCCCGGGCGGGCGCGCAGG
CACGCGCACTCGCGGGTGCGCGCGCGGACGGCCGGGCGGCGGCGGCTCCCGGAGGTGGTGGCTTCACTTT
CCAGGACTCAGGGGCAGCCACAGCGACAGCCGCGGGCAGCAGCCTCAGGAGCCGGAGCTGGAACGGCCGG
GGGCGGCGGCAGCGGCGGCGCTGAGGGTGAGTCCGGGCGGGCGCGAGCGCGGCGGGGACAGGCGTGGTCG
GGTGCGTGGTGCGTGGGTCCGGCTTTCGGTGACTAGACGGTCCGCAGGGGACATCCCGTCCCTGGGGCCT
CCCCAGTCTCCCTCCCCCTCGCGCCTGGGCAGCTCTCTCCCAGGGCTTCGG
UBE2E2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBE2E2_1 ↗3:23,203,102正股23,203,053–23,203,112
UBE2E2_2 ↗3:23,203,334正股23,203,285–23,203,344

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:201 aa

1 aa201 aa結構域功能區域
依 Q96LR5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UBE2E2 蛋白質長 201 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family。其第 55 至 201 位包含 UBC core 結構域;第 1 至 55 位則被註記為無序區域。這些區域註解描述了蛋白質的基本架構。

結構域UBC core55–201 aa
功能區域Disordered1–55 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9LTO…

PDB · 9LTO

EM · 2.92 A · A=1-201

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 21 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UbcH8UBE2E2ARRDC3CHFRCUEDC1DAZAP2DZIP3FAM9BMID1MID2OTUB1PGPEP1RNF115RNF125RNF185RNF2RNF25RNF5TRIM3TRIM39TRIM50WWP2ospG
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBE2E2 可從 E1 複合體接收泛素,並催化泛素共價連接至其他蛋白質。體外條件下,它可催化 Lys-11、Lys-48 與 Lys-63 連結型多聚泛素化;此外,也能催化 ISG15 與 influenza A virus NS1 protein 的連接(ISGylation)。含實驗來源
證據與來源

Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-11'- and 'Lys-48'-, as well as 'Lys-63'-linked polyubiquitination. Catalyzes the ISGylation of influenza A virus NS1 protein

PMID 20061386 ↗ · PMID 20133869 ↗ · PMID 27237050 ↗ · PMID 9371400 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.

PMID 20061386 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UBE2E2 的功能分類包括蛋白質修飾與蛋白質泛素化,表示其催化作用涵蓋蛋白質修飾,並包括將泛素連接至蛋白質的過程。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000396703 · 2,715 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCTTTCGGTGACTAGACGGTCCGCAGGGGACATCCCGTC40
41CCTGGGGCCTCCCCAGTCTCCCTCCCCCTCGCGCCTGGGC80
81AGCTCTCTCCCAGGGCTTCGGCTCGAGCCTGCGACCTGCA120
121CGGACACCCCCCCCTCAGGATCTAAAATGTCCACTGAGGC160
161ACAAAGAGTTGATGACAGTCCAAGCACTAGTGGAGGAAGT200
201TCCGATGGAGATCAACGTGAAAGTGTTCAGCAAGAACCAG240
241AAAGAGAACAAGTTCAGCCCAAGAAAAAGGAGGGAAAAAT280
281ATCCAGCAAAACCGCTGCTAAATTGTCAACTAGTGCTAAA320
321AGAATTCAGAAGGAACTTGCAGAAATCACATTGGACCCTC360
361CTCCCAACTGTAGTGCTGGACCCAAAGGAGACAACATTTA400
401TGAATGGAGGTCAACTATATTGGGACCCCCAGGATCTGTC440
441TATGAAGGAGGGGTGTTCTTTCTTGACATTACCTTTTCAC480
481CAGACTATCCGTTTAAACCCCCTAAGGTTACCTTCCGAAC520
521AAGAATCTATCACTGTAATATTAACAGCCAAGGTGTGATC560
561TGTCTGGACATCTTAAAGGACAACTGGAGTCCGGCTTTAA600
601CTATTTCTAAAGTTCTCCTCTCCATCTGCTCACTTCTTAC640
641AGATTGCAACCCTGCTGACCCTCTGGTGGGCAGCATCGCC680
681ACACAGTACATGACCAACAGAGCAGAGCATGACCGGATGG720
721CCAGACAGTGGACCAAGCGGTACGCCACATAGGGGCCTGC760
761TGCCTGCCGCCCCGCGGGACCTGTGCAAGCACATTCACCA800
801AGTGCATCGGTAGCCCTGCCCACCCCTCCAGACCTCGGTT840
841CTTATTTTCCTATTTTTATTAAATTTGGAACCATTTTGTG880
881ATGGTATGTTGTCCATCTTCCCATCCCAGTTCTTCCTGCC920
921CCCCTTCCTCTCTCCCACGCTCTCTTTTATCTCTCATTTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。