基因總覽
UBE2E2(ubiquitin conjugating enzyme E2 E2)是蛋白質編碼基因,產物屬於泛素結合酶家族。這類酵素參與蛋白質修飾;就 UBE2E2 而言,來源資料指出其可接收泛素,並促進泛素與其他蛋白質形成共價連接。蛋白質全長 201 個胺基酸,包含 UBC core 結構域;其胺基端第 1 至 55 位被註記為無序區域。這些資訊勾勒出 UBE2E2 的家族歸屬與基本結構,具體催化作用及其條件見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396703 ★ | 23,203,327–23,591,794 | 6 |
| ENST00000425792 | 23,203,015–23,592,847 | 6 |
| ENST00001119298 | 23,203,015–23,346,697 | 4 |
| ENST00001119299 | 23,203,015–23,332,494 | 4 |
| ENST00001119300 | 23,203,015–23,277,209 | 4 |
| ENST00000452894 | 23,203,100–23,532,615 | 6 |
| ENST00001122006 | 23,203,290–23,332,500 | 4 |
| ENST00001143456 | 23,203,290–23,592,847 | 6 |
| ENST00000917313 | 23,203,741–23,592,847 | 6 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE2E2 在泛素轉移反應中接收來自 E1 複合體的泛素,並催化泛素與其他蛋白質形成共價連接。反應描述顯示,泛素先以硫酯鍵連接於 E1 的半胱胺酸,再轉移至 E2 酵素的半胱胺酸;轉移後,E1 回復未攜帶泛素的狀態,而泛素則暫時以硫酯鍵連接於 E2。這項轉移反映 UBE2E2 在泛素化過程中承接活化泛素的角色。
除了泛素轉移,體外實驗顯示 UBE2E2 可催化 Lys-11、Lys-48 與 Lys-63 連結型的多聚泛素化。這些結果限定於體外條件,說明其催化能力涵蓋數種不同的泛素鏈連結方式;來源未進一步交代這些鏈型在特定細胞情境中的作用或對應底物,因此不宜據此推定體內功能。
UBE2E2 也可催化 ISGylation,亦即將 ISG15 共價連接至蛋白質;來源特別指出其底物為 influenza A virus NS1 protein。此項作用與泛素化有所區別,顯示 UBE2E2 的催化對象不限於泛素,但現有資料未描述反應條件或其對病毒蛋白功能的影響。
資料將其功能歸於蛋白質修飾與蛋白質泛素化。整體可確認的功能範圍包括 E1 至 E2 的泛素轉移、體外多種連結型多聚泛素化,以及對 influenza A virus NS1 protein 的 ISGylation;來源並未提供更廣泛的細胞過程或生理效應。
Promoter 與基因調控
>UBE2E2 ENST00000396703 GRCh38 chr3:23202327-23203427 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGAAGGCAGCTTCCCACTCACTCTGACAGTGGTGCACCCTGTACCCCCACCCCTCTCTTCAATACCCCAG GGCTAAACGGCCCGAAGCTCCTCTCTACCGGCTGGTGCGCATTCTGGGCCAGGGCGAGCCAAAAGGCAGA AGGGCCTTCGTGCTGCAGTGTCTGGTGAAGACTCAGGCTTAGCCTGGAAGAAGTTTCCAGGCCAACGTGA AGTTTTCCTGTCTTGGGTACATGCGAGCCCCACGCGTCTGCGAGTTTGGGTTAGTGTGTCAACAGGGTCA GTCCCCGTATCTACTTTGCGAAAGCTTCGAGGCGAGCGTGAAGTCAAGGGCTGCGGTGGATGGGGGTAAA AGGCCTCCTCGTCCCACTGCCTGCACCGTCTTGGGGTAACCCCTAACCCCCAGCCGGCGTTTCCCTTTAA TGCGCGTGCCCGGCAAGGTCCTCGCGTCCCCTCCCCTCAAGCCACCCCGTCAGCCTCGGTTTCCCCCACT TCTCCCCGTCCTTGTCGTTCCTTCCCCGTGGGACGCCCCTCGCTCACCCCCGTCAGAGCCCAGTCTGCGC GCGGGACCCAGCTGTCACTTTACTTTTCCTCGCCGCCTCCCCACCCCCTCTCCCGACCGGCGGGGCAGCC CGCCCGGGCGCGCTCCCGCCCCCGCCCCCTCGCGGCCGCGCGCCGGAGGAGGAGGGGCGGGGGGAGGAGG GAGGCGCGCGGCGCCGCATGGCCGACGTGGGGCTCGCGCTCTCGCGGTCTCTCCCGGGCGGGCGCGCAGG CACGCGCACTCGCGGGTGCGCGCGCGGACGGCCGGGCGGCGGCGGCTCCCGGAGGTGGTGGCTTCACTTT CCAGGACTCAGGGGCAGCCACAGCGACAGCCGCGGGCAGCAGCCTCAGGAGCCGGAGCTGGAACGGCCGG GGGCGGCGGCAGCGGCGGCGCTGAGGGTGAGTCCGGGCGGGCGCGAGCGCGGCGGGGACAGGCGTGGTCG GGTGCGTGGTGCGTGGGTCCGGCTTTCGGTGACTAGACGGTCCGCAGGGGACATCCCGTCCCTGGGGCCT CCCCAGTCTCCCTCCCCCTCGCGCCTGGGCAGCTCTCTCCCAGGGCTTCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE2E2_1 ↗ | 3:23,203,102 | 正股 | 23,203,053–23,203,112 |
| UBE2E2_2 ↗ | 3:23,203,334 | 正股 | 23,203,285–23,203,344 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:201 aa
UBE2E2 蛋白質長 201 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family。其第 55 至 201 位包含 UBC core 結構域;第 1 至 55 位則被註記為無序區域。這些區域註解描述了蛋白質的基本架構。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- ARRDC3Q96B67 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CHFRQ96EP1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CUEDC1Q9NWM3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAZAP2Q15038 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DZIP3Q86Y13 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MID1O15344 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- MID2Q9UJV3-2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- OTUB1Q96FW1 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- PGPEP1Q9NXJ5-2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RNF115Q9Y4L5 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RNF125Q96EQ8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RNF185Q96GF1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RNF2Q99496 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RNF25Q96BH1 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RNF5Q99942 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- TRIM3O75382 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM39Q9HCM9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 2 筆來源紀錄
- TRIM50Q86XT4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- WWP2O00308 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ospGQ99PZ6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE2E2 可從 E1 複合體接收泛素,並催化泛素共價連接至其他蛋白質。體外條件下,它可催化 Lys-11、Lys-48 與 Lys-63 連結型多聚泛素化;此外,也能催化 ISG15 與 influenza A virus NS1 protein 的連接(ISGylation)。 | 含實驗來源 | 證據與來源Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-11'- and 'Lys-48'-, as well as 'Lys-63'-linked polyubiquitination. Catalyzes the ISGylation of influenza A virus NS1 protein PMID 20061386 ↗ · PMID 20133869 ↗ · PMID 27237050 ↗ · PMID 9371400 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. PMID 20061386 ↗ |
| 分子活性 | UBE2E2 的功能分類包括蛋白質修飾與蛋白質泛素化,表示其催化作用涵蓋蛋白質修飾,並包括將泛素連接至蛋白質的過程。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGCTTTCGGTGACTAGACGGTCCGCAGGGGACATCCCGTC40CCTGGGGCCTCCCCAGTCTCCCTCCCCCTCGCGCCTGGGC80AGCTCTCTCCCAGGGCTTCGGCTCGAGCCTGCGACCTGCA120CGGACACCCCCCCCTCAGGATCTAAAATGTCCACTGAGGC160ACAAAGAGTTGATGACAGTCCAAGCACTAGTGGAGGAAGT200TCCGATGGAGATCAACGTGAAAGTGTTCAGCAAGAACCAG240AAAGAGAACAAGTTCAGCCCAAGAAAAAGGAGGGAAAAAT280ATCCAGCAAAACCGCTGCTAAATTGTCAACTAGTGCTAAA320AGAATTCAGAAGGAACTTGCAGAAATCACATTGGACCCTC360CTCCCAACTGTAGTGCTGGACCCAAAGGAGACAACATTTA400TGAATGGAGGTCAACTATATTGGGACCCCCAGGATCTGTC440TATGAAGGAGGGGTGTTCTTTCTTGACATTACCTTTTCAC480CAGACTATCCGTTTAAACCCCCTAAGGTTACCTTCCGAAC520AAGAATCTATCACTGTAATATTAACAGCCAAGGTGTGATC560TGTCTGGACATCTTAAAGGACAACTGGAGTCCGGCTTTAA600CTATTTCTAAAGTTCTCCTCTCCATCTGCTCACTTCTTAC640AGATTGCAACCCTGCTGACCCTCTGGTGGGCAGCATCGCC680ACACAGTACATGACCAACAGAGCAGAGCATGACCGGATGG720CCAGACAGTGGACCAAGCGGTACGCCACATAGGGGCCTGC760TGCCTGCCGCCCCGCGGGACCTGTGCAAGCACATTCACCA800AGTGCATCGGTAGCCCTGCCCACCCCTCCAGACCTCGGTT840CTTATTTTCCTATTTTTATTAAATTTGGAACCATTTTGTG880ATGGTATGTTGTCCATCTTCCCATCCCAGTTCTTCCTGCC920CCCCTTCCTCTCTCCCACGCTCTCTTTTATCTCTCATTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。