演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBE2E1UbcH6

ubiquitin conjugating enzyme E2 E1

UBE2E1 編碼 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族,可將 ubiquitin 接合至其他蛋白質,也能催化 ISG15 的共價接合。

Homo sapiens3p24.2UniProt P51965
OFFICIAL SYMBOL
UBE2E1
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P51965
PDB / ALPHAFOLD
3BZH
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBE2E1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1。其產物 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1 屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族,長 193 個胺基酸。蛋白質序列包含位於第 47 至 193 個胺基酸的 UBC core;N 端第 1 至 45 個胺基酸則被註記為無序區。這些特徵描繪其家族歸屬與基本結構;其分子作用方式與相關功能見下方說明。

Official symbol
UBE2E1
Gene name
ubiquitin conjugating enzyme E2 E1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12477
UniProt
P51965
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UbcH6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p24.2
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegUBE2E1pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:23,805,907–23,892,208
Gene span
86,302 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000306627 ★23,805,955–23,891,6406
ENST0000034685523,805,907–23,892,2085
ENST0000111910623,805,907–23,892,2084
ENST0000111910723,805,907–23,892,2085
ENST0000114433223,805,907–23,892,2086
ENST0000091309023,806,512–23,892,2086
ENST0000085646423,806,749–23,892,2084
ENST0000044267023,807,089–23,889,2164
ENST0000046776623,810,443–23,889,4264
ENST0000042438123,810,443–23,892,2085
ENST0000045201223,811,458–23,891,3165

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBE2E1 的蛋白質產物參與蛋白質修飾,主要涉及 ubiquitin 接合。它從 E1 複合體接受 ubiquitin,先形成與自身半胱胺酸相連的中間狀態,再催化 ubiquitin 共價接合至其他蛋白質。這個轉移過程使 ubiquitin 從 E1 轉交至 E2,也使 UBE2E1 能進一步將其接到受體蛋白上。

UBE2E1 可催化受體蛋白的單泛素化;此反應既可依賴 E3,也可不依賴 E3。因此,其催化受體蛋白接合 ubiquitin 的能力,不限於 E3 參與的情況。來源亦指出,在體外,UBE2E1 可催化以 Lys-48 相連的多聚泛素化;此項結果限定於體外,不應視為已確認的細胞內作用。

除 ubiquitin 外,UBE2E1 也能催化 ISG15 與其他蛋白質形成共價接合。來源並將 UBE2E1 的功能與短壽命及異常蛋白質的選擇性降解相連結,說明其蛋白質修飾作用涉及蛋白質周轉。不過,資料未進一步界定哪些特定受體蛋白或降解途徑參與其中,因此不宜據此推定更細的機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23805955 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBE2E1 ENST00000306627 GRCh38 chr3:23804955-23806055 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGATCATTTCAAAAATATTATTTGCATAGCATTTATAGGTAGCTAAAGAAAGAGAAAAATGGCTTAATAT
TTTAAAAATAATTTGGTCAATTTAGCGATCTGGGGATTCTGCGATCCCCAGAACTTTGCATCCAATTTCC
AAAAACCAAACCTTACATCTAATGTAAAATGACACAAAAAATTCTAAATCCAGTCTAATTCAGTAGTATA
TAGCTTATTCCCAGTGATGTCTCACATTCGCAAGCCCGTTACACGTTGGTTTTACCTGTCACCAAAACCT
TTGTATCACTCTTATAAAAAACCACATCACTTTCTATAAAAAGTGAGTGGAAGAATCTAATATTGTAAAA
CTGCACGTGCCTCGCGTGACCTGAGCAGAAAATTCCTAGTTTGGGATTTTCTCACAGGCATACCTAAACT
GACCTCTGCTCCTAGCAGGTAAATTGCTAGAAGGAGAAGCAAGTGTCAGTCCAAAGAAAACCCTTGTTGT
GTGATTTTTTTTTTCTCTTTAATCGCTTTTTAGGTGGAGTACCCGCTGCATTCTCTAAAGTCTTTGCCAC
CACCAGATTACCAACGTTTTCACCAATTTGCCACCTCCCTACTCCTCTCCTTTCCAAAAGCCCTCATTGG
AAAGAACTTTCTCTCGTGACCCCCCTATTCCATCTAGTTCCAATCACTCCCAGCGCCCCCCATCTCCATC
GGCTTCCCCTCTCCCGCCCAGAATCCAGGTTCCCAAACCACTTAAGAGAAAATTCACAACCCTCGCCCCC
TTCCCGGGCGTCCGGAGGAGGCGCTGGGGTGGGGGTGTCTGTGGGGGACAGGGTTTCCTGGGGTCTCCTG
GGTCTTCCTCGCGCACCCCCAGGAGGTGTTGCAGGGGGAGGGGAGCGCGGGTGGGTGGGACCGGGCCGGG
TGGGGGAGGGGTGAGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGGCGGCGGAGGAGTGGTGTGTGTGCGAGC
GTGTGTGGCTGGGGGAAGCCATTGCCTGTTTAATAGTTGCTGTTGCTGCACTTCCGCTTCTCTCCCAGCG
AGAGAGAGACACGAGTGGCCAGGCCCAGCCGCAGCCGCAGCAGCAGCCGCC
UBE2E1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBE2E1_1 ↗3:23,805,994正股23,805,945–23,806,004

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:193 aa

1 aa193 aa結構域功能區域
依 P51965 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1 長 193 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。其第 47 至 193 個胺基酸構成 UBC core;第 1 至 45 個胺基酸則註記為無序區。

結構域UBC core47–193 aa
功能區域Disordered1–45 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3BZH…

PDB · 3BZH

X-ray · 1.60 A · A=1-193

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

UBE2E1 的細胞內定位註記為細胞核。 來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UbcH6UBE2E1OTUB1PAF1RNF11RNF20RNF25ZNRF1ospG
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UBE2E1 與 RNF14 有交互作用;來源未說明這是直接實體結合,亦未提供兩者形成複合體或其功能關係的細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBE2E1 可從 E1 複合體接受 ubiquitin,並催化其共價接合至其他蛋白質;也能催化 ISG15 與其他蛋白質共價接合。其作用與短壽命及異常蛋白質的選擇性降解相關。在體外,UBE2E1 可催化 Lys-48 相連的多聚泛素化;另可透過依賴或不依賴 E3 的方式催化其他蛋白質單泛素化。含實驗來源
證據與來源

Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. Catalyzes the covalent attachment of ISG15 to other proteins. Mediates the selective degradation of short-lived and abnormal proteins. In vitro also catalyzes 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Catalyzes monoubiquitination of other proteins in both an E3-dependent and E3-independent manner

PMID 16428300 ↗ · PMID 20061386 ↗ · PMID 27237050 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine.

PMID 20061386 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + N(6)-monoubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + N(6)-monoubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.

PMID 17588522 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UBE2E1 的功能註記包括蛋白質修飾,以及蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UBE2E1 與 RNF14 有交互作用;此註記未進一步界定交互作用的性質。資料庫紀錄
證據與來源

Interacts with RNF14

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UBE2E1 的定位註記為細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 18845142 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000306627 · 1,783 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTGCCTGTTTAATAGTTGCTGTTGCTGCACTTCCGCTTC40
41TCTCCCAGCGAGAGAGAGACACGAGTGGCCAGGCCCAGCC80
81GCAGCCGCAGCAGCAGCCGCCGCGGCGGCACGGAGGAGCC120
121AGACACAAAGAGAGGGGCTGTTTGCGGGGTGGGGTGGGGG160
161GTTCGCTATGTCGGATGACGATTCGAGGGCCAGCACCAGC200
201TCCTCCTCATCTTCGTCTTCCAACCAGCAAACCGAGAAAG240
241AAACAAACACCCCCAAGAAGAAGGAGAGTAAAGTCAGCAT280
281GAGCAAAAACTCCAAACTCCTCTCCACCAGCGCCAAGAGA320
321ATTCAGAAGGAGCTGGCGGACATCACTTTAGACCCTCCAC360
361CTAATTGCAGTGCTGGTCCCAAAGGCGATAACATCTATGA400
401ATGGAGATCAACCATTCTAGGGCCTCCAGGATCCGTGTAT440
441GAGGGTGGTGTATTCTTTCTCGATATCACTTTTACACCAG480
481AATATCCCTTCAAGCCTCCAAAGGTTACATTTCGGACAAG520
521AATCTATCATTGTAATATTAACAGTCAAGGTGTTATTTGC560
561TTGGACATATTGAAAGATAATTGGAGTCCAGCACTAACCA600
601TTTCTAAAGTCCTCCTTTCTATCTGCTCACTTCTTACAGA640
641CTGTAATCCTGCCGACCCCTTGGTGGGAAGTATTGCCACT680
681CAGTATATGACCAACAGAGCAGAACATGACAGAATGGCCA720
721GACAGTGGACCAAGAGATACGCTACATAAATTGGGGTTTC760
761ACAATTCTTACATTATTTGTCTGTCACAGAAGAGAGCTGC800
801TTATGATTTTGAAGGGGTCAGGGAGGGTGGGAGTTGGTAA840
841AGAGTAGGGTATTTCTATAACAGATATTATTCAGTCTTAT880
881TTCCTAAGATTTTGTTGTAACTTAAGGTATCTTGCTACAG920
921TAGACAGAATTGGTAATAGCAACTTTTAAAATTGTCATTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。