基因總覽
UBAP2（ubiquitin associated protein 2）是位於人類第 9 號染色體的蛋白質編碼基因，產物為長 1,119 個胺基酸的 Ubiquitin-associated protein 2。其蛋白質含有 UBA 結構域，並有多段被註記為無序的區域。功能資料指出，UBAP2 與泛素化機制及 RNA polymerase II 的處理有關；此外，來源也提及其可能促進 ANXA2 降解。這些資訊將 UBAP2 描述為參與蛋白質降解相關過程的因子，但不提供更廣泛的家族分類或完整分子機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000379238 ★ | 33,921,693–34,048,887 | 29 |
| ENST00000684158 | 33,921,691–34,048,929 | 30 |
| ENST00000360802 | 33,921,691–34,048,953 | 27 |
| ENST00000682239 | 33,921,691–34,049,420 | 29 |
| ENST00000379239 | 33,921,691–34,048,929 | 27 |
| ENST00000862362 | 33,921,691–34,049,420 | 27 |
| ENST00000862365 | 33,921,691–34,049,420 | 27 |
| ENST00000862367 | 33,921,691–34,048,953 | 29 |
| ENST00000862370 | 33,921,691–34,048,929 | 27 |
| ENST00000862372 | 33,921,691–34,048,929 | 30 |
| ENST00000862374 | 33,921,691–34,048,929 | 29 |
| ENST00000862375 | 33,921,691–34,048,929 | 24 |
顯示 12/43 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBAP2 的一項已註記功能與轉錄偶聯核苷酸切除修復（TC-NER）處理 DNA 損傷失敗時的反應有關。在這種條件下，UBAP2 會將泛素化機制招募至 RNA polymerase II，使其發生多泛素化，接著被移除並降解。此描述將 UBAP2 的作用置於修復未能解決損傷之後，並指出其參與受損情境下 RNA polymerase II 的清除流程；來源未進一步說明所招募機制的組成，也未提供此過程的其他步驟或調控條件。
來源另指出，UBAP2 可能促進 ANXA2 的降解。這項敘述以「可能」表達，表示其作用仍保留不確定性；現有資料沒有進一步交代此降解作用發生的細胞條件、分子步驟，或它與 RNA polymerase II 處理途徑之間是否有關聯。因此，這兩項功能應分別理解，不宜據此推論它們構成同一條機制。
Promoter 與基因調控
>UBAP2 ENST00000379238 GRCh38 chr9:34048787-34049887 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGAGTTGACAACAGGTCAGATCCTATTGAGAGGAGGTCATTAATTTTCTAAAGACAGAAAACCTGGGTC TCTTCGGTCAACAAACAACTCTAAGGTTCTTTTTTTAAATCCTTAAATAGGGAAAATCCTGGACTCAAGG AGTTGATTATATGATATAACAGAAATAAACGGCTGACTTGGAGTAGGCGTTCAGTAGATTCTAGTCTTTT CACCCAGAAGGGGCTTGGGAGGGCAAAAGTAAAACCGCACTGAAAAAGACTAAAAGTGGGCGCACCTTCC GCCTTGCCGAGGCTCTCGCTGCTAGCCGTTGGCGTTTTCCCGCGCAGGGGGCAGGGCGCAGAGCGAGCCC AGGAACGTGGGAGCGGAACCCCACCCCCCGCCAGGACTACACCTCCCAGCAGGCACCACGCTCCGCCACA TGGCGGGCGGCATCCAATGGTATTAGTCCTTCAAGCCAGCTTAGTCCGCTTTCCGTCCCGGCCTTCCCTC GGCTCTAAGGTCTCTAGGGGGTTCGTCTAGAAGCCCGCTGGAGAAAGGCTGCGGTAGGGGTCGCCTTGGC TGTGCAGCATGTTGGGAGTCGTGGTCCCCTCGTGCAACATTTGGGAGGCCAGGCTTGCCCTGAGTGGTTG GACCACATCACGTGATGAGCACAGGGCGGCCACAGGGGAGTAACCTGTGGTGCTTTGTGAGGTCATCACG GCGCGACGACGAGCTGCAGTTGTGGGCACCTTGTATGCGGTGGGTAATACTCTCCTGATGACTCCGAGTA CAATACATATTATCAAGTCTCCCTTATTTGTTCCTTTCTGTGGTCCCCACCTCCACGCGGTTGGCTTCGC GGGGTTGGGGTGGAGGTGGTGGCTGGAAGAGGCCGCGCGCCGCCTAGGCTGACTCTGAAGCCGCGCACGA GCGACGTGTTGTGGCTCCTCCTTCGCCCGTGACGCGAGGTCACGTGACGGGTTGGGCAGCCTGTGCCGCC GCCGCCGCTTTGTAAGAGGCACATTGGCAGGTAACGAGCGGCGGCGGCGGCAGCGGGTCTTGGGTCCTCC GAGAGCAGCAGCGGTAATTGCCATCCTCTCCCTCTCCTTCCCTCTTCCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_B8QFR · enhancer · 34046726–34047365 · regulatory
ENSR9_B8QFZ · enhancer · 34047900–34048857 · regulatory
ENSR9_9HHW6 · promoter · 34048858–34049273 · regulatory
ENSR9_7423KX · enhancer · 34049274–34049377 · regulatory
ENSR9_5B28CS · CTCF_binding_site · 34049331–34049352 · regulatory
ENSR9_8322RK · promoter · 34049378–34049573 · regulatory
ENSR9_B8QG7 · enhancer · 34049574–34050345 · regulatory
· motif · 34046098–34046109 · motif
· motif · 34046814–34046826 · motif
· motif · 34048504–34048512 · motif
· motif · 34048930–34048939 · motif
· motif · 34048930–34048939 · motif
· motif · 34048944–34048960 · motif
· motif · 34049064–34049074 · motif
· motif · 34049190–34049203 · motif
· motif · 34049190–34049203 · motif
· motif · 34049193–34049210 · motif
· motif · 34049233–34049249 · motif
· motif · 34049233–34049249 · motif
· motif · 34049242–34049251 · motif
· motif · 34049242–34049251 · motif
· motif · 34049333–34049349 · motif
· motif · 34049376–34049389 · motif
· motif · 34049376–34049389 · motif
· motif · 34049460–34049470 · motif
· motif · 34049510–34049520 · motif
· motif · 34049551–34049561 · motif
· motif · 34049561–34049572 · motif
· motif · 34049603–34049614 · motif
· motif · 34049638–34049646 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1119 aa
Ubiquitin-associated protein 2 長 1,119 個胺基酸。其序列在第 48–92 位具有 UBA 結構域；另有多段區域被註記為無序，分布於第 1–26、110–202、385–476、622–736、853–905、937–966、982–1020 及 1082–1119 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UBAP2 被註記位於細胞核、染色體及細胞質，並與核染色質相關。 來源未說明這些定位是否隨細胞狀態或其他條件改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 41 個夥伴
- ASB13Q8WXK3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATPAF2Q8N5M1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C10orf55Q5SWW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREMQ03060-25 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAZAP2Q15038 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFHC1Q5JVL4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM168BA1KXE4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FLAD1Q8NFF5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FNDC3BQ53EP0-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOXH1O75593 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IGFN1Q86VF2-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ISXQ2M1V0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JMJD7P0C870 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KANK2Q63ZY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP15-1Q3LI76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCKP06239-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOXA1Q86UR1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NPAS2Q99743 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUTF2P61970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTX1P32242 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLEKHB2Q96CS7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPP2CAP67775 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRSS53Q2L4Q9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
UBAP2 可能與 ANXA2 互作。來源未將此關係描述為特定複合體，也未提供更多關於結合方式或功能關係的資訊。
疾病與遺傳關聯
UBAP2 表現量降低與肝細胞癌腫瘤進展相關。這是相關性描述，並未指出低表現會造成腫瘤進展。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 當轉錄偶聯核苷酸切除修復（TC-NER）機制未能解決 DNA 損傷時，UBAP2 會將泛素化機制招募至 RNA polymerase II，使其發生多泛素化，之後被移除並降解；此外，UBAP2 可能促進 ANXA2 降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Recruits the ubiquitination machinery to RNA polymerase II for polyubiquitination, removal and degradation, when the transcription-coupled nucleotide excision repair (TC-NER) machinery fails to resolve DNA damage. May promote the degradation of ANXA2 PMID 27121050 ↗ · PMID 35633597 ↗ |
| 交互作用 | UBAP2 可能與 ANXA2 互作；此描述未進一步界定互作方式。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | UBAP2 被註記位於細胞核、染色體及細胞質，並與核染色質相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome; Cytoplasm; Associates with nuclear chromatin PMID 35633597 ↗ · PMID 27121050 ↗ |
| 疾病關聯 | UBAP2 表現量降低與肝細胞癌腫瘤進展相關；此為相關性描述，未表明因果關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源Reduced expression of UBAP2 correlates with hepatocellular carcinoma tumor progression PMID 27121050 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACATTGGCAGGTAACGAGCGGCGGCGGCGGCAGCGGGTCT40TGGGTCCTCCGAGAGCAGCAGCGATTTTCTATTTTGTACA80TACATTATTTTGTATATACTGTATATGATGACTTCAGTGA120GCAGTGACCATTGTCGAGGTGCTCGGGAAAAACCACAGAT160TTCAGCAGCACAATCAACGCAACCACAGAAACAAGTGGTA200CAGGCAACAGCTGAACAGATGCGTCTCGCTCAAGTGATCT240TTGATAAGAATGATTCAGATTTTGAAGCTAAAGTTAAGCA280GCTTATGGAAGTGACAGGGAAAAATCAGGATGAATGCATA320GTGGCCCTACATGATTGTAATGGAGATGTGAACAAAGCTA360TCAATATATTGCTGGAAGGGAATTCAGACACAACTTCATG400GGAGACTGTAGGGTGTAAGAAAAAGAATTTTGCAAAAGAA440AATTCAGAAAACAAAGAGAATAGAGAGAAGAAAAGCGAGA480AAGAATCGAGTCGTGGACGTGGAAACAACAACCGGAAAGG520AAGAGGCGGCAATCGTGGCAGAGAATTTAGAGGTGAAGAA560AATGGAATTGATTGCAATCAAGTGGACAAACCTTCAGATC600GTGGCAAGCGAGCCCGGGGTAGAGGATTTGGACGTGGCAG640AGGGAGAGGGGCAGGAAGGTTCTCAACCCAAGGCATGGGG680ACATTTAATCCTGCAGACTATTCAGATTCTACATCTACAG720ATGTGTGTGGGACAAAGCTAGTAGTTTGGGAAGCTGCTCA760GAATGGTGCAGATGAGGGAACTGAACTGGCATCAAATACT800CACAACATAGCTCAGGATCTGTCAAACAAAAGTTCTTATG840GACTCAAAGGGGCTTGGAAGAATTCTGTGGAAGAGTGGAC880AACAGAAGACTGGACTGAAGATCTTTCTGAAACAAAGGTC920TTCACTGCCTCATCTGCTCCAGCAGAGAATCACATCTTAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。