基因總覽
UBA7 是蛋白質編碼基因,產物 ubiquitin like modifier activating enzyme 7 屬於 ubiquitin-activating E1 家族。蛋白質長 1,012 個胺基酸;序列中有兩段註解為重複區域,分別位於胺基酸 23–159 與 423–575,並將 23–575 區段概括標示為約兩個重複單元。這些資料呈現其家族分類與序列組織;其具體分子作用則與 ISG15 接合反應有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000333486 ★ | 49,805,209–49,813,953 | 24 |
| ENST00000905598 | 49,805,205–49,814,151 | 24 |
| ENST00000905599 | 49,805,205–49,814,130 | 25 |
| ENST00000905600 | 49,805,205–49,814,014 | 23 |
| ENST00000905601 | 49,805,205–49,814,014 | 23 |
| ENST00000905602 | 49,805,205–49,814,014 | 23 |
| ENST00000905603 | 49,805,205–49,814,014 | 23 |
| ENST00000905604 | 49,805,205–49,814,014 | 23 |
| ENST00000905605 | 49,805,205–49,814,014 | 24 |
| ENST00000905606 | 49,805,205–49,814,014 | 23 |
| ENST00000905607 | 49,805,205–49,814,014 | 23 |
| ENST00000905608 | 49,805,205–49,814,014 | 24 |
顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBA7 是 E1 活化酶,可催化 ISG15 所產生的 ubiquitin-like 蛋白與其他分子形成共價接合,這項蛋白質修飾稱為 ISGylation。接合標的包括干擾素刺激基因產物(ISGs),也包括 P53 等其他細胞蛋白質。
UBA7 與 ISG15 一同參與抗病毒免疫,並可限制多種病毒的複製;來源列出的病毒包括 rabies virus、influenza virus、sindbis virus、rotavirus 與 human cytomegalovirus。不同病毒蛋白質的 ISGylation 可影響其功能:例如 influenza A 蛋白質 NS1 經 ISG15 修飾後,與 importin-alpha 的關聯受到破壞,進而抑制 NS1 進入細胞核。
在人類巨細胞病毒中,病毒蛋白質 UL26 的 ISGylation 會調節其穩定性,並抑制 UL26 壓制 NF-kappa-B 訊號傳遞的活性。因此,UBA7 所參與的修飾可作用於細胞蛋白質或病毒蛋白質,與限制病毒複製及調節病毒蛋白質功能有關。
Promoter 與基因調控
>UBA7 ENST00000333486 GRCh38 chr3:49813853-49814953 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AATTGTGGTATATACATATAATGGACTATTATTCAGCCATTAAAAGGAATGAAATATTGATACAGGCTAT AAACTCTATGAACATTGAAAACATTCTAAGTGAAAGGAAATAGACATAAGAGGTCACATTTTGCAATTCT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCTCGAT CTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCCGAATTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG ATTACATGTAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAT GTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCAGACCTCAGGTGGTCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGA TTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCGGCCACATGTATGGTAATTATTGAATGTGTTTGGTATGTTCGTTGT GGGTGATGAAATATTTTGGAACTAGATAGACGTGATGGTTGAACAACACTGTGGATGCACTAAATGCCAC TGAATTGTACACTTTAAAATTGTTAACTTTATGTTACATGAATTTCACCTAAATTAACAACAACAACAAA AAAGAACTTAAGACAGCACTTGGTTTGGCTATTACGTAGTTTCGTGACAAACAGTGGTCCATCTCCCAGA GAACTGGCCCCAGGTTCCTAAGAAGGCAAAAGGAGACACAGGACCTCTCTGCACTATTTTTTTTGCAACT TCTTATGAGTCTATAATTATTTCAAAATAAAAGTCTAAAAGGAAAATAAGAACATGTGTGAATGTGGCTG CCCCATGCCTCCCACCCTCAGGTCTGACACTCAGAGACTGATCACCTCTTGAGAGTCCTGGAACTCATCC CAGGTTTTAGACCCTGAATGGCCTGTCTGGGGCTGGCGTCTGGAGGCAGGATCAGGAGCCAGCTCAGAGC ATAGTTTAACTTTCACTTTTCTTTTCTCCAGGAAGAGAGCTGTGACCAGCAGCGTCCCTTATTCGCTTGG CCTTGGTTCCTGTTTGCACTGGCTACAGCAGGGCACTGGCCCCTACTGTCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBA7_1 ↗ | 3:49,813,946 | 負股 | 49,813,936–49,813,995 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_5FPCGP · CTCF_binding_site · 49813851–49813872 · regulatory
ENSR3_9PQSS · promoter · 49813943–49814443 · regulatory
· motif · 49813853–49813869 · motif
· motif · 49814367–49814389 · motif
· motif · 49814367–49814389 · motif
UBA7 受到 DNA 損傷相關調控;在 interferon-alpha 暴露後也有相關調控紀錄。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1012 aa
UBA7 產物長 1,012 個胺基酸,屬於 ubiquitin-activating E1 家族。序列註解列出兩段重複區域:胺基酸 23–159 與 423–575;兩段所在的 23–575 區域另標示為約兩個重複單元。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- ISG15P05161 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- TARDBPQ13148 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
UBA7 可與 G1P2/ISG15 結合,並參與其接合反應;單體狀態的註記屬於相似性推定。感染情境下,人類巨細胞病毒蛋白質 NEC2/UL50 與 UL26 可和 UBA7 互作,並抑制 ISGylation、促使 UBA7 發生蛋白酶體降解。Rotavirus 非結構蛋白 NSP5 也與 UBA7 互作,並促進其蛋白酶體降解。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBA7 是 E1 活化酶,催化 ISG15 產物與干擾素刺激基因產物及 P53 等細胞蛋白質形成共價接合,此修飾稱為 ISGylation。UBA7 與 ISG15 共同參與抗病毒免疫,可限制多種病毒複製;來源舉例指出,NS1 的 ISG15 修飾會破壞其與 importin-alpha 的關聯並抑制核輸入,而 UL26 的 ISGylation 會調節其穩定性並抑制其壓制 NF-kappa-B 訊號的活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源E1-activating enzyme that catalyzes the covalent conjugation of the ubiquitin-like protein product of ISG15 to additional interferon stimulated proteins (ISGs) as well as other cellular proteins such as P53 in a process termed protein ISGylation. Plays an essential role in antiviral immunity together with ISG15 by restricting the replication of many viruses including rabies virus, influenza virus, sindbis virus, rotavirus or human cytomegalovirus. For example, ISG15 modification of influenza A protein NS1 disrupts the association of the NS1 with importin-alpha leading to NS1 nuclear import inhibition. ISGylation of human cytomegalovirs protein UL26 regulates its stability and inhibits its activities to suppress NF-kappa-B signaling PMID 16254333 ↗ · PMID 19073728 ↗ · PMID 20133869 ↗ · PMID 27545325 ↗ · PMID 27564865 ↗ · PMID 29056542 ↗ · PMID 29743376 ↗ · PMID 37722521 ↗ |
| 分子活性 | UBA7 的功能註記涵蓋蛋白質修飾與蛋白質泛素化;此項來源未提供更細的反應條件或具體作用標的。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,UBA7 與 human cytomegalovirus 蛋白質 NEC2/UL50 及 UL26 互作。這些互作會抑制 ISGylation,並促使 UBA7 經蛋白酶體降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with human cytomegalovirus proteins NEC2/UL50 and UL26; these interactions inhibit ISGylation and cause proteasomal degradation of UBA7 PMID 27564865 ↗ · PMID 29743376 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,UBA7 與 rotavirus 非結構蛋白 NSP5 互作;此互作會促進 UBA7 經蛋白酶體降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with rotavirus non-structural protein 5 (NSP5); this interaction promotes UBA7 proteasomal degradation PMID 37722521 ↗ |
| 交互作用 | UBA7 註記為單體,此項組態資訊是依相似性推定。UBA7 會結合 G1P2/ISG15,並參與 G1P2/ISG15 的接合反應。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | UBA7 的細胞內定位註記包括細胞質與細胞核;此項資料未進一步描述定位改變的條件或動態。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | UBA7 的調控註記包括 DNA 損傷相關調控,以及暴露於 interferon-alpha 後的調控;來源未進一步說明調控方向或分子機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTTCTCCAGGAAGAGAGCTGTGACCAGCAGCGTCCCTT40ATTCGCTTGGCCTTGGTTCCTGTTTGCACTGGCTACAGCA80GGGCACTGGCCCCTACTGTCACCGCCACCTACACAAAGAC120CCTATCTCTGAGCGCTGCAGCCTACTGTTCAGCCCCAGGT160TTGAGGATGGATGCCCTGGACGCTTCGAAGCTACTGGATG200AGGAGCTGTATTCAAGACAGCTGTATGTGCTGGGCTCACC240TGCCATGCAGAGGATTCAGGGAGCCAGGGTCCTGGTGTCA280GGCCTGCAGGGCCTGGGGGCCGAGGTGGCCAAGAACTTGG320TTCTGATGGGTGTGGGCAGCCTCACTCTGCATGATCCCCA360CCCCACCTGCTGGTCCGACCTGGCTGCCCAGTTTCTCCTC400TCAGAGCAGGACTTGGAAAGGAGCAGAGCCGAGGCCTCTC440AAGAGCTCTTGGCTCAGCTCAACAGAGCTGTCCAGGTCGT480CGTGCACACGGGTGACATCACTGAGGACCTGCTGTTGGAC520TTCCAGGTGGTGGTGCTGACTGCTGCAAAGCTGGAGGAGC560AGCTGAAGGTGGGCACCTTGTGTCATAAGCATGGAGTTTG600CTTTCTGGCGGCTGACACCCGGGGCCTCGTGGGGCAGTTG640TTCTGTGACTTTGGTGAGGACTTCACTGTGCAGGACCCCA680CAGAGGCAGAACCCCTGACAGCTGCCATCCAGCACATCTC720CCAGGGCTCCCCTGGCATTCTCACTCTGAGGAAAGGGGCC760AATACCCACTACTTCCGTGATGGAGACTTGGTGACTTTCT800CGGGAATTGAGGGAATGGTTGAGCTCAACGACTGTGATCC840CCGGTCTATCCACGTGCGGGAGGATGGGTCCCTGGAGATT880GGAGACACAACAACTTTCTCTCGGTACTTGCGTGGTGGGG920CTATCACTGAAGTCAAGAGACCCAAGACTGTGAGACATAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。