演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBA7D8

ubiquitin like modifier activating enzyme 7

UBA7 編碼 ubiquitin like modifier activating enzyme 7,屬於 ubiquitin-activating E1 家族,參與 ISG15 的蛋白質接合反應,與抗病毒免疫相關。

Homo sapiens3p21.31UniProt P41226
OFFICIAL SYMBOL
UBA7
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P41226
PDB / ALPHAFOLD
8OIF
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBA7 是蛋白質編碼基因,產物 ubiquitin like modifier activating enzyme 7 屬於 ubiquitin-activating E1 家族。蛋白質長 1,012 個胺基酸;序列中有兩段註解為重複區域,分別位於胺基酸 23–159 與 423–575,並將 23–575 區段概括標示為約兩個重複單元。這些資料呈現其家族分類與序列組織;其具體分子作用則與 ISG15 接合反應有關。

Official symbol
UBA7
Gene name
ubiquitin like modifier activating enzyme 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12471
UniProt
P41226
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
D8UBE2UBA1BUBE1L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p21.31
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegUBA7pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:49,805,205–49,814,151
Gene span
8,947 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000333486 ★49,805,209–49,813,95324
ENST0000090559849,805,205–49,814,15124
ENST0000090559949,805,205–49,814,13025
ENST0000090560049,805,205–49,814,01423
ENST0000090560149,805,205–49,814,01423
ENST0000090560249,805,205–49,814,01423
ENST0000090560349,805,205–49,814,01423
ENST0000090560449,805,205–49,814,01423
ENST0000090560549,805,205–49,814,01424
ENST0000090560649,805,205–49,814,01423
ENST0000090560749,805,205–49,814,01423
ENST0000090560849,805,205–49,814,01424

顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBA7 是 E1 活化酶,可催化 ISG15 所產生的 ubiquitin-like 蛋白與其他分子形成共價接合,這項蛋白質修飾稱為 ISGylation。接合標的包括干擾素刺激基因產物(ISGs),也包括 P53 等其他細胞蛋白質。

UBA7 與 ISG15 一同參與抗病毒免疫,並可限制多種病毒的複製;來源列出的病毒包括 rabies virus、influenza virus、sindbis virus、rotavirus 與 human cytomegalovirus。不同病毒蛋白質的 ISGylation 可影響其功能:例如 influenza A 蛋白質 NS1 經 ISG15 修飾後,與 importin-alpha 的關聯受到破壞,進而抑制 NS1 進入細胞核。

在人類巨細胞病毒中,病毒蛋白質 UL26 的 ISGylation 會調節其穩定性,並抑制 UL26 壓制 NF-kappa-B 訊號傳遞的活性。因此,UBA7 所參與的修飾可作用於細胞蛋白質或病毒蛋白質,與限制病毒複製及調節病毒蛋白質功能有關。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 49813953 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBA7 ENST00000333486 GRCh38 chr3:49813853-49814953 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATTGTGGTATATACATATAATGGACTATTATTCAGCCATTAAAAGGAATGAAATATTGATACAGGCTAT
AAACTCTATGAACATTGAAAACATTCTAAGTGAAAGGAAATAGACATAAGAGGTCACATTTTGCAATTCT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCTCGAT
CTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCCGAATTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG
ATTACATGTAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAT
GTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCAGACCTCAGGTGGTCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGA
TTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCGGCCACATGTATGGTAATTATTGAATGTGTTTGGTATGTTCGTTGT
GGGTGATGAAATATTTTGGAACTAGATAGACGTGATGGTTGAACAACACTGTGGATGCACTAAATGCCAC
TGAATTGTACACTTTAAAATTGTTAACTTTATGTTACATGAATTTCACCTAAATTAACAACAACAACAAA
AAAGAACTTAAGACAGCACTTGGTTTGGCTATTACGTAGTTTCGTGACAAACAGTGGTCCATCTCCCAGA
GAACTGGCCCCAGGTTCCTAAGAAGGCAAAAGGAGACACAGGACCTCTCTGCACTATTTTTTTTGCAACT
TCTTATGAGTCTATAATTATTTCAAAATAAAAGTCTAAAAGGAAAATAAGAACATGTGTGAATGTGGCTG
CCCCATGCCTCCCACCCTCAGGTCTGACACTCAGAGACTGATCACCTCTTGAGAGTCCTGGAACTCATCC
CAGGTTTTAGACCCTGAATGGCCTGTCTGGGGCTGGCGTCTGGAGGCAGGATCAGGAGCCAGCTCAGAGC
ATAGTTTAACTTTCACTTTTCTTTTCTCCAGGAAGAGAGCTGTGACCAGCAGCGTCCCTTATTCGCTTGG
CCTTGGTTCCTGTTTGCACTGGCTACAGCAGGGCACTGGCCCCTACTGTCA
UBA7 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBA7_1 ↗3:49,813,946負股49,813,936–49,813,995

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_5FPCGP · CTCF_binding_site · 49813851–49813872 · regulatory

ENSR3_9PQSS · promoter · 49813943–49814443 · regulatory

· motif · 49813853–49813869 · motif

· motif · 49814367–49814389 · motif

· motif · 49814367–49814389 · motif

UBA7 受到 DNA 損傷相關調控;在 interferon-alpha 暴露後也有相關調控紀錄。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1012 aa

1 aa1012 aa功能區域重複區
依 P41226 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UBA7 產物長 1,012 個胺基酸,屬於 ubiquitin-activating E1 家族。序列註解列出兩段重複區域:胺基酸 23–159 與 423–575;兩段所在的 23–575 區域另標示為約兩個重複單元。

重複區1-123–159 aa
重複區1-2423–575 aa
功能區域2 approximate repeats23–575 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8OIF…

PDB · 8OIF

EM · 3.50 A · A=1-1012

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
D8UBA7ISG15TARDBP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UBA7 可與 G1P2/ISG15 結合,並參與其接合反應;單體狀態的註記屬於相似性推定。感染情境下,人類巨細胞病毒蛋白質 NEC2/UL50 與 UL26 可和 UBA7 互作,並抑制 ISGylation、促使 UBA7 發生蛋白酶體降解。Rotavirus 非結構蛋白 NSP5 也與 UBA7 互作,並促進其蛋白酶體降解。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBA7 是 E1 活化酶,催化 ISG15 產物與干擾素刺激基因產物及 P53 等細胞蛋白質形成共價接合,此修飾稱為 ISGylation。UBA7 與 ISG15 共同參與抗病毒免疫,可限制多種病毒複製;來源舉例指出,NS1 的 ISG15 修飾會破壞其與 importin-alpha 的關聯並抑制核輸入,而 UL26 的 ISGylation 會調節其穩定性並抑制其壓制 NF-kappa-B 訊號的活性。含實驗來源
證據與來源

E1-activating enzyme that catalyzes the covalent conjugation of the ubiquitin-like protein product of ISG15 to additional interferon stimulated proteins (ISGs) as well as other cellular proteins such as P53 in a process termed protein ISGylation. Plays an essential role in antiviral immunity together with ISG15 by restricting the replication of many viruses including rabies virus, influenza virus, sindbis virus, rotavirus or human cytomegalovirus. For example, ISG15 modification of influenza A protein NS1 disrupts the association of the NS1 with importin-alpha leading to NS1 nuclear import inhibition. ISGylation of human cytomegalovirs protein UL26 regulates its stability and inhibits its activities to suppress NF-kappa-B signaling

PMID 16254333 ↗ · PMID 19073728 ↗ · PMID 20133869 ↗ · PMID 27545325 ↗ · PMID 27564865 ↗ · PMID 29056542 ↗ · PMID 29743376 ↗ · PMID 37722521 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UBA7 的功能註記涵蓋蛋白質修飾與蛋白質泛素化;此項來源未提供更細的反應條件或具體作用標的。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,UBA7 與 human cytomegalovirus 蛋白質 NEC2/UL50 及 UL26 互作。這些互作會抑制 ISGylation,並促使 UBA7 經蛋白酶體降解。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with human cytomegalovirus proteins NEC2/UL50 and UL26; these interactions inhibit ISGylation and cause proteasomal degradation of UBA7

PMID 27564865 ↗ · PMID 29743376 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,UBA7 與 rotavirus 非結構蛋白 NSP5 互作;此互作會促進 UBA7 經蛋白酶體降解。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with rotavirus non-structural protein 5 (NSP5); this interaction promotes UBA7 proteasomal degradation

PMID 37722521 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UBA7 註記為單體,此項組態資訊是依相似性推定。UBA7 會結合 G1P2/ISG15,並參與 G1P2/ISG15 的接合反應。推論支持
證據與來源

Monomer (By similarity). Binds and is involved in the conjugation of G1P2/ISG15

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UBA7 的細胞內定位註記包括細胞質與細胞核;此項資料未進一步描述定位改變的條件或動態。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus

PMID 29743376 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控UBA7 的調控註記包括 DNA 損傷相關調控,以及暴露於 interferon-alpha 後的調控;來源未進一步說明調控方向或分子機制。含實驗來源
證據與來源

By DNA damage. Upon interferon-alpha exposure

PMID 27545325 ↗ · PMID 28035359 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000333486 · 3,304 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTTTCTCCAGGAAGAGAGCTGTGACCAGCAGCGTCCCTT40
41ATTCGCTTGGCCTTGGTTCCTGTTTGCACTGGCTACAGCA80
81GGGCACTGGCCCCTACTGTCACCGCCACCTACACAAAGAC120
121CCTATCTCTGAGCGCTGCAGCCTACTGTTCAGCCCCAGGT160
161TTGAGGATGGATGCCCTGGACGCTTCGAAGCTACTGGATG200
201AGGAGCTGTATTCAAGACAGCTGTATGTGCTGGGCTCACC240
241TGCCATGCAGAGGATTCAGGGAGCCAGGGTCCTGGTGTCA280
281GGCCTGCAGGGCCTGGGGGCCGAGGTGGCCAAGAACTTGG320
321TTCTGATGGGTGTGGGCAGCCTCACTCTGCATGATCCCCA360
361CCCCACCTGCTGGTCCGACCTGGCTGCCCAGTTTCTCCTC400
401TCAGAGCAGGACTTGGAAAGGAGCAGAGCCGAGGCCTCTC440
441AAGAGCTCTTGGCTCAGCTCAACAGAGCTGTCCAGGTCGT480
481CGTGCACACGGGTGACATCACTGAGGACCTGCTGTTGGAC520
521TTCCAGGTGGTGGTGCTGACTGCTGCAAAGCTGGAGGAGC560
561AGCTGAAGGTGGGCACCTTGTGTCATAAGCATGGAGTTTG600
601CTTTCTGGCGGCTGACACCCGGGGCCTCGTGGGGCAGTTG640
641TTCTGTGACTTTGGTGAGGACTTCACTGTGCAGGACCCCA680
681CAGAGGCAGAACCCCTGACAGCTGCCATCCAGCACATCTC720
721CCAGGGCTCCCCTGGCATTCTCACTCTGAGGAAAGGGGCC760
761AATACCCACTACTTCCGTGATGGAGACTTGGTGACTTTCT800
801CGGGAATTGAGGGAATGGTTGAGCTCAACGACTGTGATCC840
841CCGGTCTATCCACGTGCGGGAGGATGGGTCCCTGGAGATT880
881GGAGACACAACAACTTTCTCTCGGTACTTGCGTGGTGGGG920
921CTATCACTGAAGTCAAGAGACCCAAGACTGTGAGACATAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。