演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UAP1AGX1

UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1

UAP1 編碼 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1,參與 UDP-GlcNAc 與 UDP-GalNAc 的合成,也可調節病毒感染時的先天免疫反應。

Homo sapiens1q23.3UniProt Q16222
OFFICIAL SYMBOL
UAP1
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q16222
PDB / ALPHAFOLD
1JV1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UAP1 是蛋白質編碼基因,產物屬於 UDPGP type 1 family。UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 具有參與核苷酸糖生合成的角色,並有 AGX1 與 AGX2 兩種異構型;來源指出兩者對不同糖磷酸底物的活性偏好不同。除了代謝功能,該蛋白也參與病毒感染時的先天免疫調節。

Official symbol
UAP1
Gene name
UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12457
UniProt
Q16222
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
AGX1AgXSPAG2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q23.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegUAP1pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:162,561,476–162,616,939
Gene span
55,464 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000367925 ★162,561,722–162,601,24011
ENST00000367926162,561,476–162,601,24010
ENST00000897999162,561,476–162,601,25911
ENST00000898000162,561,476–162,600,39011
ENST00000898001162,561,476–162,599,83111
ENST00000898002162,561,476–162,599,83712
ENST00000898003162,561,476–162,599,83510
ENST00000898004162,561,476–162,599,83711
ENST00000898005162,561,476–162,599,83112
ENST00000898007162,561,476–162,599,83710
ENST00000898008162,561,476–162,599,83111
ENST00000898010162,561,476–162,599,83712

顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 催化 UDP-GlcNAc 生合成的最後一步,將 UTP 與 glucosamine 1-phosphate(GlcNAc-1-P)轉換為 UDP-GlcNAc。此反應屬於核苷酸糖生合成;另一項底物反應則是以 UTP 和 galactosamine 1-phosphate(GalNAc-1-P)生成 UDP-GalNAc。這些反應使該酵素參與兩種 UDP-N-acetylhexosamine 的形成。

不同異構型對底物的活性有所差異:AGX1 對 GalNAc-1-P 的活性較高,約為 2 至 3 倍;AGX2 對 GlcNAc-1-P 的活性則高 8 倍。這些差異描述的是各異構型對特定底物的相對活性,不表示其反應種類有所不同。

除代謝作用外,UAP1 在病毒感染的先天免疫反應中可介導 IRF3 的焦磷酸化。TBK1 先使 IRF3 的 Ser-386 磷酸化,UAP1 隨後催化其焦磷酸化,促進 IRF3 二聚化與活化,進而引發 type I interferon responses。此作用將 UAP1 與核苷酸糖合成以外的免疫調節功能連結起來。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 162561722 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UAP1 ENST00000367925 GRCh38 chr1:162560722-162561822 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGTGTGTGCACACCCACACTAGGTTATGTAACAGGACTGTAAACACTGGTCCTGGAATGGCCTGGGAGG
TCATCTAGGTCCTCCACCATCTTTCTGCAGAGTACTGAGGCCTAGCGACGTTAAGTCTGCAAACTCACAA
AGATGACCCCGGGCTTATACTACCTTAGGTTACCTACTACCTTTGCTTGCATTTCCTCTCTCCTTTCCTG
TCTGTTTGTGCAAAAGAAAAAAGGCCTGGCTTCGCCTTCTTGGGAGCCAAAACACAACCAAACAGAGAGC
GAGTTTGGAGCCCGGCCAGGCATCTTGTGAACTGCACACAAAATAACTAGCCCAAGGTCAGAGAGCGCGC
CAGGCCCGCCCTGAAAGTTTCTCCGCAGGAAAATCCACCGCCCTTTCCCAACCACCCGCGTGGGTGGCTC
GGAAATCCGCCACCCTGGGGACACAGCTCCCTGCCCATCTCTGTGGCCCGCTTGTGCCCCGTGCCGCTGG
GCCGACTAAGAGCCTCGGGCTCGCACCTCCCAGTACAACCTAGGGACGTCAGGGGTCCTGGGACCCACGA
GCCGCTCTCTGCCGGCCGGCTCCTGGCCCCTCCTAGCAGACCCAACCGACATCCTTCACCCTCAGTTAGT
GCGCAGGAGGGACCGGGACGCCAGCCGACTGCGCTCCAGAACTATTCCCATTGGGCCAGAGAATGAGTGA
CGCACTAGGCCCCGCCCCGGCCCGGTGGGTTACTCCTTTCATGCCCGGCCCCCATCCCTAGCCCCGCCCC
GGCGCCCCGGGCCGCGGCCGCCTCCGCGTCCGCGTCGTCGTCTGTGCTCCCGGCGCTGACGTGTCTGGGC
GGTCGGCTTCCACTCCTTCAGGCGTCGGCAGCCACTAGTCGTGGCGAGAGGGGCGGGGTGGCCGGGGCTG
GCGCTCCACTTGGCCCCCGCTCCCGGCCCGCCCCGCCGCCGCGGCCCCCCGGATGAGGGTATATATTCGG
AGCGAGCGCGGGACGCCGATGAGTGGCCGCGCGGAAGGAGCTGGAGACGGTCGTAGCTGCGGTCGCGCCG
AGAAAGGTGAGGGGCTCCCAGCCCAGCGAGGAGACGGCGGGGCTCGGGACC
UAP1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UAP1_2 ↗1:162,561,531正股162,561,482–162,561,541
UAP1_1 ↗1:162,561,722正股162,561,673–162,561,732

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B3793M · enhancer · 162560457–162561335 · regulatory

ENSR1_94DJ5G · promoter · 162561336–162561732 · regulatory

ENSR1_CL5JF · enhancer · 162561733–162562983 · regulatory

ENSR1_86R3C4 · enhancer · 162565118–162565261 · regulatory

· motif · 162560515–162560524 · motif

· motif · 162560540–162560555 · motif

· motif · 162560540–162560555 · motif

· motif · 162560541–162560555 · motif

· motif · 162561749–162561766 · motif

· motif · 162561845–162561862 · motif

· motif · 162561892–162561908 · motif

· motif · 162561892–162561908 · motif

· motif · 162562523–162562536 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:522 aa

UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 屬於 UDPGP type 1 family。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1JV1…

PDB · 1JV1

X-ray · 1.90 A · A/B=1-522

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol

UAP1 位於細胞質與胞質溶膠。 在精子中,蛋白主要定位於尾部主段及頭部頸區,另有較少部分位於尾部中段。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
AGX1UAP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UAP1 可呈單體或同源二聚體形式;來源未提供其他特定結合夥伴或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

10 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 10 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UAP1 催化 UDP-GlcNAc 生合成的最後一步,以 UTP 和 GlcNAc-1-P 生成 UDP-GlcNAc;也能以 UTP 和 GalNAc-1-P 生成 UDP-GalNAc。病毒感染時,UAP1 可使經 TBK1 磷酸化於 Ser-386 的 IRF3 發生焦磷酸化,促進其二聚化與活化,進而引發 type I interferon responses。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the last step in biosynthesis of uridine diphosphate-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) by converting UTP and glucosamine 1-phosphate (GlcNAc-1-P) to the sugar nucleotide. Also converts UTP and galactosamine 1-phosphate (GalNAc-1-P) into uridine diphosphate-N-acetylgalactosamine (UDP-GalNAc). In addition to its role in metabolism, acts as a regulator of innate immunity in response to virus infection by mediating pyrophosphorylation of IRF3: catalyzes pyrophosphorylation of IRF3 phosphorylated at 'Ser-386' by TBK1, promoting IRF3 dimerization and activation, leading to type I interferon responses

PMID 36603579 ↗ · PMID 9603950 ↗ · PMID 9765219 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能UAP1 的 AGX1 異構型對 galactosamine 1-phosphate(GalNAc-1-P)的活性較高,約為 2 至 3 倍;此差異描述該異構型對此底物的活性。含實驗來源
證據與來源

Isoform AGX1 has 2 to 3 times higher activity towards galactosamine 1-phosphate (GalNAc-1-P)

PMID 9765219 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能UAP1 的 AGX2 異構型對 glucosamine 1-phosphate(GlcNAc-1-P)的活性高 8 倍;此資訊指出其對該底物的相對活性較高。含實驗來源
證據與來源

Isoform AGX2 has 8 times more activity towards glucosamine 1-phosphate (GlcNAc-1-P)

PMID 9765219 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性N-acetyl-alpha-D-galactosamine 1-phosphate + UTP + H(+) = UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine + diphosphate含實驗來源
證據與來源

N-acetyl-alpha-D-galactosamine 1-phosphate + UTP + H(+) = UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine + diphosphate

PMID 9765219 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性N-acetyl-alpha-D-glucosamine 1-phosphate + UTP + H(+) = UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine + diphosphate含實驗來源
證據與來源

N-acetyl-alpha-D-glucosamine 1-phosphate + UTP + H(+) = UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine + diphosphate

PMID 9603950 ↗ · PMID 9765219 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性5-diphospho-1D-myo-inositol 1,2,3,4,6-pentakisphosphate + O-phospho-L-seryl-[protein] = O-diphospho-L-seryl-[protein] + 1D-myo-inositol hexakisphosphate含實驗來源
證據與來源

5-diphospho-1D-myo-inositol 1,2,3,4,6-pentakisphosphate + O-phospho-L-seryl-[protein] = O-diphospho-L-seryl-[protein] + 1D-myo-inositol hexakisphosphate

PMID 36603579 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UAP1 參與核苷酸糖生合成,並可由 N-acetyl-alpha-D-glucosamine 1-phosphate 生成 UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine;此反應在所列路徑中為第 1 步,也是唯一一步。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleotide-sugar biosynthesis; UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine biosynthesis; UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine from N-acetyl-alpha-D-glucosamine 1-phosphate: step 1/1

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UAP1 可呈現單體與同源二聚體兩種形式;此項資訊描述其亞基組成狀態。含實驗來源
證據與來源

Monomer and homodimer

PMID 9765219 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer含實驗來源
證據與來源

Homodimer

PMID 9765219 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UAP1 位於細胞質與胞質溶膠。在精子中,定位於尾部主段和頭部頸區,尾部中段也有較少量分布。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol; In spermatozoa, localized to the principal piece of the tail, the neck region of the head and to a lesser extent, the midpiece of the tail

PMID 8025165 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 10 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000367925 · 3,559 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGTGGCCGCGCGGAAGGAGCTGGAGACGGTCGTAGCTGC40
41GGTCGCGCCGAGAAAGGTTTACAGGTACATACATTACACC80
81CCTATTTCTACAAAGCTTGGCTATTAGAGCATTATGAACA120
121TTAATGACCTCAAACTCACGTTGTCCAAAGCTGGGCAAGA160
161GCACCTACTACGTTTCTGGAATGAGCTTGAAGAAGCCCAA200
201CAGGTAGAACTTTATGCAGAGCTCCAGGCCATGAACTTTG240
241AGGAGCTGAACTTCTTTTTCCAAAAGGCCATTGAAGGTTT280
281TAACCAGTCTTCTCACCAAAAGAATGTGGATGCACGAATG320
321GAACCTGTGCCTCGAGAGGTATTAGGCAGTGCTACAAGGG360
361ATCAAGATCAGCTCCAGGCCTGGGAAAGTGAAGGACTTTT400
401CCAGATTTCTCAGAATAAAGTAGCAGTTCTTCTTCTAGCT440
441GGTGGGCAGGGGACAAGACTCGGCGTTGCATATCCTAAGG480
481GGATGTATGATGTTGGTTTGCCATCCCGTAAGACACTTTT520
521TCAGATTCAAGCAGAGCGTATCCTGAAGCTACAGCAGGTT560
561GCTGAAAAATATTATGGCAACAAATGCATTATTCCATGGT600
601ATATAATGACCAGTGGCAGAACAATGGAATCTACAAAGGA640
641GTTCTTCACCAAGCACAAGTACTTTGGTTTAAAAAAAGAG680
681AATGTAATCTTTTTTCAGCAAGGAATGCTCCCCGCCATGA720
721GTTTTGATGGGAAAATTATTTTGGAAGAGAAGAACAAAGT760
761TTCTATGGCTCCAGATGGGAATGGTGGTCTTTATCGGGCA800
801CTTGCAGCCCAGAATATTGTGGAGGATATGGAGCAAAGAG840
841GCATTTGGAGCATTCATGTCTATTGTGTTGACAACATATT880
881AGTAAAAGTGGCAGACCCACGGTTCATTGGATTTTGCATT920
921CAGAAAGGAGCAGACTGTGGAGCAAAGGTGGTAGAGAAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。