基因總覽
TYRO3 protein tyrosine kinase 是一種單次跨膜的受體型酪胺酸激酶，屬於 protein kinase 超家族中的 Tyr protein kinase 家族及 AXL/UFO 次家族。其蛋白質具有細胞外區、跨膜區與細胞質區：細胞外部分包含兩個 Ig-like C2-type 結構域及兩個 Fibronectin type-III 結構域，細胞質部分則含 protein kinase 結構域。這種配置使 TYRO3 能在細胞表面接收細胞外訊號，並將訊號傳入細胞內。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000263798 ★ | 41,559,212–41,583,589 | 19 |
| ENST00000559066 | 41,557,675–41,578,805 | 19 |
| ENST00000869538 | 41,558,836–41,579,338 | 19 |
| ENST00000869539 | 41,558,836–41,579,338 | 19 |
| ENST00000869540 | 41,558,836–41,579,338 | 20 |
| ENST00000869541 | 41,558,836–41,579,067 | 20 |
| ENST00000938082 | 41,558,836–41,579,338 | 19 |
| ENST00000938083 | 41,558,836–41,579,059 | 19 |
| ENST00000938084 | 41,558,836–41,579,331 | 19 |
| ENST00000941856 | 41,558,836–41,579,327 | 18 |
| ENST00000941857 | 41,558,836–41,579,326 | 17 |
| ENST00000941858 | 41,558,836–41,579,327 | 20 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TYRO3 可結合 PROS1、TULP1 或 GAS6 等配體，將細胞外訊號傳至細胞質。配體在細胞表面結合後，會促使 TYRO3 二聚化，並使其細胞內區域發生自體磷酸化；磷酸化位置可作為下游訊號分子的停靠點。TYRO3 具有蛋白質酪胺酸激酶活性，可催化蛋白質上的酪胺酸磷酸化。這些訊號作用與細胞存活、遷移及分化等生理過程有關；部分相關功能屬於依相似性推定。
配體活化後，TYRO3 可與 PIK3R1 互作，並增強 PI3-kinase 活性；它也會活化 AKT 存活路徑，伴隨 NF-kappa-B 移入細胞核，以及 NF-kappa-B 調控基因的轉錄增加。TYRO3 訊號亦與神經元抵抗興奮毒性損傷、血小板聚集及細胞骨架重組有關。
在先天免疫調節方面，TYRO3 可透過活化 STAT1，選擇性誘導細胞激素訊號抑制因子 SOCS1 與 SOCS3 的生成，進而抑制 Toll-like receptors（TLRs）介導的先天免疫反應。另一方面，PROS1 結合後，TYRO3 也可促進 MLKL 磷酸化，推動 MLKL 同源寡聚化與活化，因而參與程序性細胞死亡 necroptosis。
微生物感染相關資料指出，TYRO3 可作為 Lassa virus 與 lymphocytic choriomeningitis virus 的受體；此作用可能是透過 GAS6 結合病毒包膜表面的 phosphatidyl-serine。TYRO3 也被報告可作為 Ebolavirus 的受體，可能涉及相同的 GAS6 與 phosphatidyl-serine 機制；這些受體作用的描述保留來源所述的可能性。
Promoter 與基因調控
>TYRO3 ENST00000263798 GRCh38 chr15:41558212-41559312 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTGTGACGACACAGCCAACTTTCACACCAGGTCCTGGGAAAAGGGGTAGAAGCAGGGGAAGCAACCAGG AAAAATGACAGCCCAAAAAGATACGGGCAATTAGGCTTTGGCCTGTGTAGTGTAGTGGTGGGGATATATA TTAGGTAAAACCTGGGGATTACCAAGATCTTGGGAAACTCAGGACCCAAGTTGGAAAACATACGGCAATT GGGGCTGGAGAAAATGGGCATTTTTCAGGTGGGAGGGACTTGGAGATAAAGGCATGGCAATAGGACATGA ATATGGGGATTTTGGGTGAATGGCTCAATGAAAGGGAGGCACGAAGGGATGCTAGCCGATCCTGTTGGGG GAGCCCCGGGTCACGGCAGTTTCGGGGAGCCAGATGGATGGGAGTGTCTAGGGGTTGAGGTGCTCTAAGT CCTGAGAGGGGGATGCTGGATTCTGGGATCAGAGTCCGAACAAGAGTTGGGGTGTGGTGGGGGCTGACAG CGGGGTTTTGAGGGAAGGCTCTGGAGGGCTGGGTTAGAAAAGATGCCGGAGCGGGTTTAGGGAAAGGAGG GGCGTGGCCGGGGAGCCCATCCTGGAGGCCAAGCCGGATCCTCAGGTTTGGCCAGGGGGCGGCTGGGGCC GGCGTGCCGGCGGGGCGCCGGCGGGGCCGCGGGGGTTTGCGGCGCTGGCTGGGATTCGCGCTCCGAGCCA GTCGCCGGGGCTCCGCGGGGGGGCGGTGCGAGCTCGGGCTGCGGGCGGGCCGGGAGGAGGCGGCGGCTCC GAGAAGAACATGAATCAGCGGCGGCGACGGCGGCGACGGCAGTGGAAGGAGCGCGGTGGCGCGGGAGCGG CCCCGGGGACCCCGCGCTGCTGACGGCGGCGACCGCGGCCGGAGGCGGGCGCGGGTCTCGGAGGCGGTCG CCTCAGCACCGCCCCACGGGCGGCCCCAGCCCCTCCCGCAGCCCTCCTCCCTCCCGCTCCCTTCCCGCCG CCTCCTCCCCGCCCTCCTCCCTCCTCGCTCGCGGGCCGGGCCCGGCATGGTGCGGCGTCGCCGCCGATGG CGCTGAGGCGGAGCATGGGGCGGCCGGGGCTCCCGCCGCTGCCGCTGCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TYRO3_1 ↗ | 15:41,559,022 | 正股 | 41,558,973–41,559,032 |
| TYRO3_2 ↗ | 15:41,559,218 | 正股 | 41,559,169–41,559,228 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_74FZG5 · promoter · 41557585–41557685 · regulatory
ENSR15_66TXWJ · CTCF_binding_site · 41557750–41557782 · regulatory
ENSR15_9LHD6 · promoter · 41558722–41559222 · regulatory
ENSR15_66TZ29 · CTCF_binding_site · 41558920–41558978 · regulatory
ENSR15_BB8P2 · enhancer · 41561682–41562200 · regulatory
ENSR15_5CQXJF · CTCF_binding_site · 41561937–41561958 · regulatory
ENSR15_5CQXM2 · CTCF_binding_site · 41562500–41562521 · regulatory
ENSR15_BB8P7 · enhancer · 41562751–41563720 · regulatory
· motif · 41557752–41557768 · motif
· motif · 41557763–41557779 · motif
· motif · 41558922–41558938 · motif
· motif · 41558959–41558975 · motif
· motif · 41561939–41561955 · motif
· motif · 41562502–41562518 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：890 aa
TYRO3 蛋白質長 890 個胺基酸，N 端訊號胜肽為第 1–40 位，細胞外區為第 41–429 位；第 430–450 位為螺旋型跨膜區，細胞質區延伸至 C 端。細胞外區含兩個 Ig-like C2-type 與兩個 Fibronectin type-III 結構域；細胞質區的 protein kinase 結構域位於第 518–790 位。另有兩段序列被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TYRO3 是細胞膜上的單次跨膜 I 型膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或異構型間定位差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 33 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HAVCR1Q96D42 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLK4Q9Y5K2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-2Q9BYR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-9P26371 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRTAP9-2Q9BYQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
TYRO3 可呈單體或同源二聚體形式；配體結合會誘導二聚化。它也會與 PIK3R1 互作，而此互作可增強 PI3-kinase 活性。來源未將此互作描述為兩者形成的特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TYRO3 是受體型酪胺酸激酶，可結合 PROS1、TULP1 或 GAS6，將細胞外訊號傳入細胞質。配體結合促使其二聚化與細胞內區域自體磷酸化，提供下游分子停靠位置；活化後與 PIK3R1 互作並增強 PI3-kinase 活性，也涉及 AKT、NF-kappa-B、STAT1、SOCS1、SOCS3 與 MLKL 等訊號。其相關過程包括細胞存活、遷移、分化、神經元保護、血小板聚集、細胞骨架重組、先天免疫抑制及 necroptosis；部分功能為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor tyrosine kinase that transduces signals from the extracellular matrix into the cytoplasm by binding to several ligands including PROS1, TULP1 or GAS6. Regulates many physiological processes including cell survival, migration and differentiation (By similarity). Ligand binding at the cell surface induces dimerization and autophosphorylation of TYRO3 on its intracellular domain that provides docking sites for downstream signaling molecules (By similarity). Following activation by ligand, interacts with PIK3R1 and thereby enhances PI3-kinase activity (By similarity). Activates the AKT survival pathway, including nuclear translocation of NF-kappa-B and up-regulation of transcription of NF-kappa-B-regulated genes (By similarity). TYRO3 signaling plays a role in various processes such as neuron protection from excitotoxic injury, platelet aggregation and cytoskeleton reorganization. Also plays an important role in inhibition of Toll-like receptors (TLRs)-mediated innate immune response by activating STAT1, which selectively induces production of suppressors of cytokine signaling SOCS1 and SOCS3 (By similarity). Also acts as an activator of necroptosis, a programmed cell death process, by mediating phosphorylation of MLKL following PROS1-binding, thereby promoting MLKL homooligomerization and activation PMID 14623883 ↗ · PMID 20546121 ↗ · PMID 31230815 ↗ · PMID 7634325 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，TYRO3 可作為 Lassa virus 與 lymphocytic choriomeningitis virus 的受體；此作用可能透過 GAS6 結合病毒包膜表面的 phosphatidyl-serine。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as a receptor for lassa virus and lymphocytic choriomeningitis virus, possibly through GAS6 binding to phosphatidyl-serine at the surface of virion envelope PMID 22156524 ↗ · PMID 22673088 ↗ · PMID 25277499 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，TYRO3 可作為 Ebolavirus 的受體；此作用可能透過 GAS6 結合病毒包膜表面的 phosphatidyl-serine。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as a receptor for Ebolavirus, possibly through GAS6 binding to phosphatidyl-serine at the surface of virion envelope PMID 17005688 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 31230815 ↗ · PMID 7537495 ↗ |
| 交互作用 | TYRO3 可呈單體或同源二聚體形式，並與 PIK3R1 互作；依相似性推定，此互作會提高 PI3-kinase 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer and homodimer. Interacts with PIK3R1; this interaction increases PI3-kinase activity (By similarity) PMID 14623883 ↗ |
| 細胞定位 | TYRO3 位於細胞膜，是單次跨膜 I 型膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCCTCGCTCGCGGGCCGGGCCCGGCATGGTGCGGCGTCG40CCGCCGATGGCGCTGAGGCGGAGCATGGGGCGGCCGGGGC80TCCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCCACCGCGGCTCGGGCT120GCTGCTGGCGGCTCTGGCTTCTCTGCTGCTCCCGGAGTCC160GCCGCCGCAGGTCTGAAGCTCATGGGAGCCCCGGTGAAGC200TGACAGTGTCTCAGGGGCAGCCGGTGAAGCTCAACTGCAG240TGTGGAGGGGATGGAGGAGCCTGACATCCAGTGGGTGAAG280GATGGGGCTGTGGTCCAGAACTTGGACCAGTTGTACATCC320CAGTCAGCGAGCAGCACTGGATCGGCTTCCTCAGCCTGAA360GTCAGTGGAGCGCTCTGACGCCGGCCGGTACTGGTGCCAG400GTGGAGGATGGGGGTGAAACCGAGATCTCCCAGCCAGTGT440GGCTCACGGTAGAAGGTGTGCCATTTTTCACAGTGGAGCC480AAAAGATCTGGCAGTGCCACCCAATGCCCCTTTCCAACTG520TCTTGTGAGGCTGTGGGTCCCCCTGAACCTGTTACCATTG560TCTGGTGGAGAGGAACTACGAAGATCGGGGGACCCGCTCC600CTCTCCATCTGTTTTAAATGTAACAGGGGTGACCCAGAGC640ACCATGTTTTCCTGTGAAGCTCACAACCTAAAAGGCCTGG680CCTCTTCTCGCACAGCCACTGTTCACCTTCAAGCACTGCC720TGCAGCCCCCTTCAACATCACCGTGACAAAGCTTTCCAGC760AGCAACGCTAGTGTGGCCTGGATGCCAGGTGCTGATGGCC800GAGCTCTGCTACAGTCCTGTACAGTTCAGGTGACACAGGC840CCCAGGAGGCTGGGAAGTCCTGGCTGTTGTGGTCCCTGTG880CCCCCCTTTACCTGCCTGCTCCGGGACCTGGTGCCTGCCA920CCAACTACAGCCTCAGGGTGCGCTGTGCCAATGCCTTGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。