基因總覽
TXN 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 thioredoxin，其產物屬於 thioredoxin 家族。來源將此蛋白質描述為參與多種氧化還原反應的分子，也指出它與細胞內一氧化氮反應及轉錄活性調節相關。另有資料指出，ADF 可增加 interleukin-2 receptor TAC（IL2R/P55）的表現。這些資訊呈現 thioredoxin 涵蓋氧化還原與細胞調節等不同面向；其具體作用方式與情境另於功能段說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374517 ★ | 110,243,810–110,256,507 | 5 |
| ENST00000374515 | 110,243,810–110,256,604 | 4 |
| ENST00000879758 | 110,243,810–110,256,604 | 3 |
| ENST00000879759 | 110,243,810–110,256,604 | 5 |
| ENST00000879760 | 110,243,810–110,256,604 | 4 |
| ENST00000919885 | 110,243,810–110,256,604 | 4 |
| ENST00000919886 | 110,243,810–110,256,604 | 5 |
| ENST00001080456 | 110,243,810–110,256,604 | 5 |
| ENST00001080461 | 110,243,810–110,256,604 | 5 |
| ENST00001080466 | 110,243,810–110,256,604 | 5 |
| ENST00001092145 | 110,243,810–110,256,604 | 2 |
| ENST00001092146 | 110,243,810–110,256,604 | 4 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thioredoxin 透過活性中心的二硫醇可逆氧化為二硫鍵，參與多種氧化還原反應，並催化二硫醇與二硫鍵之間的交換。這種可逆的氧化還原轉換是其執行相關反應的分子方式；來源未進一步限定這些反應所涉及的所有目標或細胞過程。
它也參與目標蛋白質半胱胺酸殘基的可逆 S-亞硝基化，因而有助於細胞內一氧化氮反應。當細胞受到一氧化氮作用時，thioredoxin 可使 CASP3 活性位點的 Cys 發生亞硝基化，並抑制 caspase-3 活性。這項作用將一氧化氮訊號與 CASP3 的活性調節連結起來；來源描述的是特定條件下的作用，不宜延伸為對所有細胞死亡情境的概括。
在游離輻射（IR）細胞中，thioredoxin 的氧化還原狀態與 FOS/JUN AP-1 DNA 結合活性的誘導有關，並可刺激 AP-1 轉錄活性。相關資料亦指出，thioredoxin 與 APEX1 的互作可依賴氧化還原狀態，刺激 FOS/JUN AP-1 DNA 結合活性。這些觀察顯示其氧化還原特性可連結至轉錄調節，但來源並未提供更廣泛的下游基因或作用範圍。
此外，ADF 可增強 interleukin-2 receptor TAC（IL2R/P55）的表現。這項資訊指出另一種與受體表現相關的作用，但來源未說明其分子機制或適用條件。
Promoter 與基因調控
>TXN ENST00000374517 GRCh38 chr9:110256407-110257507 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCATTCCTGGATCAATGCAAACTCCGACTTCTGTTCCAGGAGTCTGCCTCTGTTAGAAGAATCTCACAC AAGTGTGCGTGCTGTGCCATTGTAAATGCTGTATAAGGTGGCCAGGCCCAATCAGTCCCTGCAAGACACC GAACAGTAAGAACTATCTATGGAGTGTTTACTATGTGCCAAGCACCGTCCTTTGCAAGCACTATTAACCC TCAAAATACCACCACCGTGAGATTGAGACCATCATGATTCCCGTTCTACAGAAGGAAACACTGAGACTTC AGGAGGTCAGGACCTTTCCAGGGTCACAACTGCGTAACTAAGTTGCAGAGCTCAACCCAGTGGCACTTCC ATCTCACACGCAGCTGTCTGATGGTCAAGAGCCCAACCAGTCCCCCGGTCGTTTCTACCGCACTAAACCG CTGTGTCAAGCTGGAGCAGCGGGCTCAGCAGTGAAAATGAAAGAACAGAAGGAGGTTACAGAGAAGAGAA CGGTCACGGTAAATTCCGGAGAGGAGGCAAGGACGTACACACCGAGATACTTCCCGGTCACCGTTACTCA GCACTTTGTGGGGTTCACGTGGCTGGGGGGGCCGGGGCGTGGCGGCCCTTTTCGAGGAATCCAGCCCTGC CTGGGCGGTCCCCATCTCGAGCGTGGGCGTGTTCGATTCAGGCCCGGCGGACGCATCCCCAGGTGACCCG GGAGGGACCTTGTGTCTCTGGGGGTGACTGTCCGTCTCCCCGCCTCCCACCGTCACGCGCAGTGCTGATC CCCACTTCCAGCTGGAGTGCGAGCTGGGCTTGGGGTTACAGGAGCCGAAGCCCTGGAGCTCCGCCCCACG CTTGCGCCAGCCCCGCCCCGATCCCGGCTCGCAGGCTCCAGGGGCGGGGCGTGGCCGGGGCGCAGCGACG GGCGCGGAGGTCCGGCCGGGCGCGCGCGCCCCCGCCACACGCACGCCGGGCGTGCCAGTTTATAAAGGGA GAGAGCAAGCAGCGAGTCTTGAAGCTCTGTTTGGTGCTTTGGATCCATTTCCATCGGTCCTTACAGCCGC TCGTCAGACTCCAGCAGCCAAGATGGTGAAGCAGATCGAGAGCAAGGTACG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TXN_1 ↗ | 9:110,256,507 | 負股 | 110,256,497–110,256,556 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_858J4L · enhancer · 110252539–110252747 · regulatory
ENSR9_BRTR4 · enhancer · 110253715–110254233 · regulatory
ENSR9_CDXDM · enhancer · 110254486–110256455 · regulatory
ENSR9_93LQKX · promoter · 110256456–110256733 · regulatory
ENSR9_CDXDR · enhancer · 110256734–110258347 · regulatory
ENSR9_5XX7JT · CTCF_binding_site · 110257161–110257182 · regulatory
· motif · 110252391–110252403 · motif
· motif · 110252694–110252708 · motif
· motif · 110252694–110252709 · motif
· motif · 110252723–110252736 · motif
· motif · 110253182–110253195 · motif
· motif · 110253182–110253195 · motif
· motif · 110254268–110254290 · motif
· motif · 110254268–110254290 · motif
· motif · 110254983–110255005 · motif
· motif · 110254983–110255005 · motif
· motif · 110255633–110255642 · motif
· motif · 110255730–110255739 · motif
· motif · 110255730–110255739 · motif
· motif · 110255750–110255765 · motif
· motif · 110256074–110256089 · motif
· motif · 110256122–110256135 · motif
· motif · 110256560–110256573 · motif
· motif · 110256609–110256622 · motif
· motif · 110256660–110256671 · motif
· motif · 110256660–110256671 · motif
· motif · 110256847–110256860 · motif
· motif · 110256923–110256940 · motif
· motif · 110256940–110256951 · motif
· motif · 110256959–110256970 · motif
· motif · 110257163–110257179 · motif
· motif · 110257218–110257225 · motif
· motif · 110257218–110257233 · motif
· motif · 110257705–110257717 · motif
· motif · 110258927–110258940 · motif
· motif · 110258944–110258957 · motif
游離輻射會上調 TXN。來源未提供其他調控條件或調控機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：105 aa
thioredoxin 長 105 個胺基酸，屬於 thioredoxin 家族。蛋白質註解將第 2 至第 105 位標示為 Thioredoxin 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
未受游離輻射照射的細胞中，thioredoxin 主要位於細胞質；游離輻射可促使其由細胞質移至細胞核。 PMA 誘導後也觀察到由細胞質移入細胞核。 另有資料指出，thioredoxin 可經由不具 leader sequence 的分泌途徑分泌。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 35 個夥伴
- A2MP01023 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ACTN1P12814 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKT1P31749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANKRD11X5D778 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- BDNFP23560-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CASP3P42574 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- COPS5Q92905 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNM2P50570-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ERBB2P04626 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FSTP19883 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAPDHP04406 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GFAPP14136 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSP90AA1P07900 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LRP8Q14114-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAP3K5Q99683 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MECP2P51608 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MRFAP1Q9Y605 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYD88Q99836 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NDUFV2P19404 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NIF3L1Q9GZT8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUP62P37198 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
thioredoxin 可形成以二硫鍵連結的同源二聚體。它透過氧化還原活性位點與 TXNIP 互作，也與 MAP3K5、CASP3 互作；感染情況下則與 S.typhimurium 蛋白質 slrP 互作。與 APEX1 的互作可依賴氧化還原狀態，刺激 FOS/JUN AP-1 DNA 結合活性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | thioredoxin 透過活性中心二硫醇與二硫鍵的可逆轉換參與多種氧化還原反應，並催化二硫醇－二硫鍵交換。它也參與目標蛋白質半胱胺酸的可逆 S-亞硝基化；在一氧化氮作用下，可使 CASP3 活性位點 Cys 亞硝基化並抑制 caspase-3。游離輻射細胞中，其氧化還原狀態與 FOS/JUN AP-1 DNA 結合及轉錄活性相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Participates in various redox reactions through the reversible oxidation of its active center dithiol to a disulfide and catalyzes dithiol-disulfide exchange reactions. Plays a role in the reversible S-nitrosylation of cysteine residues in target proteins, and thereby contributes to the response to intracellular nitric oxide. Nitrosylates the active site Cys of CASP3 in response to nitric oxide (NO), and thereby inhibits caspase-3 activity. Induces the FOS/JUN AP-1 DNA-binding activity in ionizing radiation (IR) cells through its oxidation/reduction status and stimulates AP-1 transcriptional activity PMID 11118054 ↗ · PMID 16408020 ↗ · PMID 17182577 ↗ · PMID 17606900 ↗ · PMID 19032234 ↗ · PMID 2176490 ↗ · PMID 9108029 ↗ |
| 功能 | ADF 可增加 interleukin-2 receptor TAC（IL2R/P55）的表現；此項敘述未進一步提供作用條件或分子機制。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | thioredoxin 可形成由二硫鍵連結的同源二聚體，並透過氧化還原活性位點與 TXNIP 互作；此外，它與 MAP3K5、CASP3 互作，感染時也與 S.typhimurium 蛋白質 slrP 互作。thioredoxin 與 APEX1 的互作可依賴氧化還原狀態，刺激 FOS/JUN AP-1 DNA 結合活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; disulfide-linked. Interacts with TXNIP through the redox-active site. Interacts with MAP3K5 and CASP3. In case of infection, interacts with S.typhimurium protein slrP. Interacts with APEX1; the interaction stimulates the FOS/JUN AP-1 DNA-binding activity in a redox-dependent manner PMID 15246877 ↗ · PMID 17260951 ↗ · PMID 19690162 ↗ · PMID 9108029 ↗ · PMID 9369469 ↗ |
| 細胞定位 | thioredoxin 在未受游離輻射照射的細胞中主要位於細胞質；游離輻射或 PMA 誘導可促使其由細胞質移至細胞核。它也可經由不具 leader sequence 的分泌途徑分泌。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Secreted; Translocates from the cytoplasm into the nucleus after phorbol 12-myristate 13-acetate induction (PMA). Predominantly in the cytoplasm in non irradiated cells. Radiation induces translocation of TRX from the cytoplasm to the nucleus. Secreted by a leaderless secretory pathway PMID 11118054 ↗ · PMID 9108029 ↗ · PMID 1332947 ↗ |
| 調控 | 游離輻射會上調 TXN；此項資料未提供其他調控條件或作用機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAAGCTCTGTTTGGTGCTTTGGATCCATTTCCATCGGTCC40TTACAGCCGCTCGTCAGACTCCAGCAGCCAAGATGGTGAA80GCAGATCGAGAGCAAGACTGCTTTTCAGGAAGCCTTGGAC120GCTGCAGGTGATAAACTTGTAGTAGTTGACTTCTCAGCCA160CGTGGTGTGGGCCTTGCAAAATGATCAAGCCTTTCTTTCA200TTCCCTCTCTGAAAAGTATTCCAACGTGATATTCCTTGAA240GTAGATGTGGATGACTGTCAGGATGTTGCTTCAGAGTGTG280AAGTCAAATGCATGCCAACATTCCAGTTTTTTAAGAAGGG320ACAAAAGGTGGGTGAATTTTCTGGAGCCAATAAGGAAAAG360CTTGAAGCCACCATTAATGAATTAGTCTAATCATGTTTTC400TGAAAATATAACCAGCCATTGGCTATTTAAAACTTGTAAT440TTTTTTAATTTACAAAAATATAAAATATGAAGACATAAAC480CCAGTTGCCATCTGCGTGACAATAAAACATTAATGCTAAC520ACTTTTTAAAACCGTCTCATGTCTGAATAGCTTTCAAAAT560AAATGTGAAATGGTCATTTAATGTATTTTCCTATATTCTC600AATCACTTTTTAGTAACCTTGTAGGCCACTGATTATTTTA640AGATTTTAAAAATTATTATTGCTACCTTAATGTATTGCTA680CAAAAATCTCTTGTTGGGGGCAATGCAGGTAATAAAGTAG720TATGTTGTTATTTGTTA737cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。