基因總覽
TXK tyrosine kinase 是由蛋白質編碼基因 TXK 產生的非受體型酪胺酸激酶，屬於 protein kinase 超家族中的 Tyr protein kinase 家族及 TEC 亞家族。它是細胞內訊號蛋白，主要與適應性免疫反應及 T 細胞相關功能有關。蛋白質具有 SH3、SH2 與 protein kinase 結構域，並含有一段預測為無序的區域及核定位訊號。這些結構特徵提供辨識訊號分子與催化磷酸化反應的功能區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000264316 ★ | 48,066,393–48,134,250 | 15 |
| ENST00000506073 | 48,063,158–48,114,545 | 14 |
| ENST00000507351 | 48,063,158–48,080,177 | 5 |
| ENST00000960124 | 48,063,158–48,134,256 | 13 |
| ENST00001137620 | 48,063,158–48,134,256 | 15 |
| ENST00001126622 | 48,086,818–48,134,256 | 10 |
| ENST00001126623 | 48,110,397–48,134,256 | 5 |
| ENST00001126624 | 48,131,722–48,134,256 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TXK 與 ITK 在調節適應性免疫反應上具有冗餘作用，並參與傳統 T 細胞與非傳統 NKT 細胞的發育、功能及分化。抗原呈現細胞活化 T 細胞受體後，一連串磷酸化事件促使 TXK 被招募至細胞膜，並在 Tyr-420 位點受到磷酸化；此修飾使 TXK 完全活化。TXK 也參與多種受體訊號及其下游路徑，包括調節肌動蛋白細胞骨架。
在 T 細胞受體相關訊號中，TXK 可磷酸化 PLCG1，促使 PLCG1 定位至脂筏並活化，接續切割其受質。此路徑與內質網將鈣釋放至細胞質，以及活化 T 細胞核因子 NFAT 移入細胞核執行轉錄功能相連。來源指出，這些分子事件構成 TXK 參與受體訊號傳遞的作用方式。
在 T-helper 1 細胞中，TXK 參與正向調節 IFNG 轉錄，並與 PARP1、EEF1A1 組成結合 IFNG 啟動子的複合體；TXK 在此複合體中磷酸化 PARP1 與 EEF1A1。TXK 也可磷酸化 LCP2 的關鍵位點，進而促進 Th1 偏好的細胞激素 IL-2 上調。
此外，TXK 磷酸化 CTLA4 的 Tyr-201，促使 PI-3 kinase 與 CTLA4 受體產生關聯。這些作用顯示 TXK 的功能不只涉及 T 細胞受體下游訊號，也涵蓋轉錄調節及其他受體相關路徑；其酪胺酸激酶反應以 ATP 為磷酸基供體，將蛋白質上的酪胺酸轉為磷酸化形式。
Promoter 與基因調控
>TXK ENST00000264316 GRCh38 chr4:48134150-48135250 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTAACCATGCACAACTTTTAACTGACTTGTAGCTCATTGAAGGAGTCGGTCCTGGCACACTCTACCTTA CTATCACTGTCAGCCTTTTCTCCTTCCTTCCTGACCTTCCCTCCTCCCATCCCATACTTCCCTTTTCACC TTGAGGAGCTACGGGAAGTACTAGGTGGTATGAAAGAGAGTGAGGAGAAGATAGAGTCCCTGTCCTAATG GTCAGTGTATGCTTTTTATGGGAAAACAAGATAGATAGCACCTGGCAACATTTGTCAACATTTCCTTCAA AAATCTTTAAATATTTTTCACTAAGACTTAGAAAAAAAGTTTTATACGAAAGCATAACAAAGGCAAAAGG TGAAGTAAAAATAACAGTCATCACCCAGAATGCTAAGGAGACCTTAATCTAAACCAGGAAATTGGAAGGG CGATTAGAATATGCTGTGTCTTCATTAAAGTTGCTCTGTTAATTAGTTGACACATGGTTATGCTTTCCAG TGGGATGAAGTGAAACTCCCAAGTGTGTTTTGTATTGTTGGTGTTTTTATATTTCTCAGCCATCCCCCAA TCACATTTTAGGGTTATTACTAGATTGACTTCCCCCAAATAAAGTGTCTGCTGAGTGGGAGGATGGAACA TTCTAAACTCAATATTCCAGAGCCTAGAATCTAATTGTTTCTGCCACTCACGGTGTGGCCTTGGGCAAGT CCCTTATTCTGTCTGTGCCTTCATTTCCTTCCCAGTCCAGAGAGGGCAGTTTGATTTGATAATTTTAAAG GTGCCTTTTACCAAAATTTTGTGATTTCTTGAAAATGATGTTTGCGAGTCACCCACACCTTTGGGGATGA GAGACTAATAGCAGATACCCTCAGAGATTGGGATGGAGATTACTGAGCTTTCTTATATATGCCATTGGTT GTCATTTATACTCTTCTGAGGTTTTCAGAACAGGAAAATAGGTGGGGTTAACTCTGCCCGTGAGAAACAT CTTGAGCGAACTATGATTTCAGTTGAAAGATGTGTTTTTGTGAGTAGAGCACCGCAGAAGAACTGAAGAC TGTTGTGTGCTCCCCGCAGAAGGGGCTACCATGATCCTTTCCTCCTGTGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TXK_2 ↗ | 4:48,080,066 | 負股 | 48,080,056–48,080,115 |
| TXK_1 ↗ | 4:48,134,250 | 負股 | 48,134,240–48,134,299 |
| TXK_3 ↗ | 4:48,135,847 | 負股 | 48,135,837–48,135,896 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_BCJW7 · enhancer · 48129399–48130046 · regulatory
ENSR4_9P4SM · enhancer · 48133740–48134053 · regulatory
ENSR4_9P4W6 · enhancer · 48138980–48139464 · regulatory
· motif · 48130280–48130292 · motif
· motif · 48131675–48131686 · motif
· motif · 48134651–48134662 · motif
· motif · 48134652–48134663 · motif
· motif · 48135016–48135027 · motif
· motif · 48139076–48139089 · motif
· motif · 48139159–48139176 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：527 aa
TXK tyrosine kinase 長 527 個胺基酸，含有 SH3、SH2 與 protein kinase 結構域。其第 35–79 位胺基酸區段註解為無序區，第 68–73 位另有核定位訊號。蛋白質分類屬於 protein kinase 超家族的 Tyr protein kinase 家族及 TEC 亞家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TXK 可位於細胞質、細胞核及細胞膜，並以周邊膜蛋白形式存在。 受體受到刺激後，TXK 會移至質膜上細胞表面受體附近；在 T 細胞中，它也可轉移至細胞核，並增強 IFN-gamma 基因轉錄。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
- CBY2Q8NA61-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRKP46108 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DOK2O60496 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DUSP6Q16828 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFHC2Q5JST6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB10Q13322-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IKZF1Q13422-7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IKZF4Q9H2S9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JRKO75564-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KITP10721 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIK3R1P27986-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRDM14Q9GZV8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBAKQ9NYW8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SOCS3O14543 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SOCS6O14544 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STAP2Q9UGK3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNS4Q8IZW8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF587Q96SQ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF792Q3KQV3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF835Q9Y2P0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TXK 與 PARP1、EEF1A1 有互作，並可與兩者共同參與結合 IFNG 啟動子的複合體；在該複合體中，TXK 會磷酸化這兩種蛋白質。TXK 與 SH2D2A、FYN 的互作則標註為依序列相似性推定，並非此處直接確認的實體互作證據。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TXK 是非受體型酪胺酸激酶，與 ITK 在調節適應性免疫反應上具冗餘作用，並調節傳統 T 細胞及非傳統 NKT 細胞的發育、功能和分化。抗原呈現細胞活化 T 細胞受體後，TXK 被招募至細胞膜並在 Tyr-420 磷酸化而完全活化；它也參與多種受體下游訊號、肌動蛋白細胞骨架調節及 PLCG1、LCP2、CTLA4 相關磷酸化。TXK 並參與 T-helper 1 細胞 IFNG 轉錄調節，且能在 IFNG 啟動子複合體中磷酸化 PARP1 與 EEF1A1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Non-receptor tyrosine kinase that plays a redundant role with ITK in regulation of the adaptive immune response. Regulates the development, function and differentiation of conventional T-cells and nonconventional NKT-cells. When antigen presenting cells (APC) activate T-cell receptor (TCR), a series of phosphorylation leads to the recruitment of TXK to the cell membrane, where it is phosphorylated at Tyr-420. Phosphorylation leads to TXK full activation. Also contributes to signaling from many receptors and participates in multiple downstream pathways, including regulation of the actin cytoskeleton. Like ITK, can phosphorylate PLCG1, leading to its localization in lipid rafts and activation, followed by subsequent cleavage of its substrates. In turn, the endoplasmic reticulum releases calcium in the cytoplasm and the nuclear activator of activated T-cells (NFAT) translocates into the nucleus to perform its transcriptional duty. Plays a role in the positive regulation of IFNG transcription in T-helper 1 cells as part of an IFNG promoter-binding complex with PARP1 and EEF1A1. Within the complex, phosphorylates both PARP1 and EEF1A1. Also phosphorylates key sites in LCP2 leading to the up-regulation of Th1 preferred cytokine IL-2. Phosphorylates 'Tyr-201' of CTLA4 which leads to the association of PI-3 kinase with the CTLA4 receptor PMID 10523612 ↗ · PMID 11564877 ↗ · PMID 11859127 ↗ · PMID 17177976 ↗ · PMID 9813138 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | TXK 與 PARP1、EEF1A1 有互作；與 SH2D2A 及 FYN 的互作則是依序列相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PARP1 and EEF1A1. Interacts with SH2D2A (By similarity). Interacts with FYN (By similarity) PMID 17177976 ↗ |
| 細胞定位 | TXK 可位於細胞質、細胞核及細胞膜，並以周邊膜蛋白形式存在。受體受到刺激後，TXK 會移至質膜上細胞表面受體附近；在 T 細胞中，TXK 也會轉移至細胞核並增強 IFN-gamma 基因轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Cell membrane / Peripheral membrane protein; Localizes in the vicinity of cell surface receptors in the plasma membrane after receptor stimulation. Translocates into the nucleus and enhances IFN-gamma gene transcription in T-cells PMID 17177976 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTGAAAGATGTGTTTTTGTGAGTAGAGCACCGCAGAAG40AACTGAAGACTGTTGTGTGCTCCCCGCAGAAGGGGCTACC80ATGATCCTTTCCTCCTATAACACCATCCAGTCGGTTTTCT120GTTGCTGCTGTTGCTGTTCAGTGCAGAAGCGACAAATGAG160AACACAGATAAGCCTGAGCACAGATGAAGAGCTTCCAGAA200AAATACACCCAGCGTCGCAGGCCGTGGCTCAGCCAATTGT240CAAATAAGAAGCAATCCAACACGGGCCGTGTGCAGCCGTC280AAAACGAAAGCCACTGCCTCCCCTCCCACCCTCTGAGGTT320GCTGAAGAGAAGATCCAAGTCAAGGCACTTTATGATTTTC360TGCCCAGAGAACCCTGTAATTTAGCCTTAAGGAGAGCAGA400AGAATACCTGATACTGGAGAAATACAATCCTCACTGGTGG440AAGGCAAGAGACCGTTTGGGGAATGAAGGCTTAATCCCAA480GCAACTATGTGACTGAAAACAAAATAACTAATTTAGAAAT520ATATGAGTGGTACCATAGAAACATTACCAGAAATCAGGCA560GAACATCTATTGAGACAAGAGTCTAAAGAAGGTGCATTTA600TTGTCAGAGATTCAAGACATTTAGGATCCTACACAATTTC640CGTATTTATGGGAGCTAGAAGAAGTACGGAGGCTGCCATA680AAACATTATCAGATAAAAAAGAATGACTCAGGACAGTGGT720ATGTGGCTGAAAGACACGCCTTTCAATCAATCCCTGAGTT760AATCTGGTATCACCAGCACAATGCAGCCGGTCTCATGACT800CGTCTCCGATATCCAGTTGGGCTGATGGGCAGTTGTTTAC840CAGCCACAGCTGGGTTTAGCTACGAAAAGTGGGAGATAGA880TCCATCTGAGTTGGCTTTTATAAAGGAGATTGGAAGCGGT920CAGTTTGGAGTGGTCCATTTAGGTGAATGGCGGTCACATA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。