演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TUFT1

tuftelin 1

TUFT1 編碼 tuftelin 1,屬於 tuftelin 家族,與表皮的結構組織,以及牙釉質礦化和結構組織有關。

Homo sapiens1q21.3UniProt Q9NNX1
OFFICIAL SYMBOL
TUFT1
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9NNX1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TUFT1 是一個蛋白質編碼基因,產物為 tuftelin 1,屬於 tuftelin 家族。tuftelin 1 長 390 個胺基酸;目前提供的蛋白質註解指出,其第 358 至 390 個胺基酸區段為無序區。來源將此蛋白與表皮的結構組織,以及牙釉質的礦化和結構組織相連結,呈現其與組織結構形成及牙釉質發育相關的基本角色。

Official symbol
TUFT1
Gene name
tuftelin 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12422
UniProt
Q9NNX1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegTUFT1pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:151,540,305–151,583,583
Gene span
43,279 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368849 ★151,540,309–151,583,58313
ENST00000392712151,540,305–151,583,58311
ENST00000368848151,540,305–151,583,58312
ENST00000873674151,540,305–151,583,58311
ENST00000873675151,540,305–151,583,58312
ENST00000873676151,540,305–151,583,58313
ENST00000943021151,540,305–151,583,58310
ENST00000943022151,540,305–151,583,58312
ENST00000943023151,540,305–151,583,58212
ENST00000943024151,540,305–151,583,58311
ENST00000943025151,540,305–151,583,58311
ENST00001142607151,540,305–151,583,58313

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tuftelin 1 與表皮的結構組織有關。現有資料指出其參與此過程,但未進一步說明它在表皮中作用的細胞類型、分子機制或具體結構,因此不能據此推定其如何組織表皮,也不宜延伸為來源未支持的調控或訊號作用。

在牙釉質方面,tuftelin 1 與礦化及結構組織有關。這項描述將其角色連結到牙釉質形成過程中的礦化,以及牙釉質結構的建立;然而,來源沒有提供其參與的具體化學步驟、作用對象或實驗條件,故無法進一步界定其在礦化中的直接作用方式。相關的定位資料另指出,tuftelin 1 會在牙釉質形成很早期分泌,並集中於牙本質—牙釉質交界及生長中晶體表面;這些位置資訊支持其與早期牙釉質形成環境的關聯,但不等同於已釐清其促進礦化的分子機制。

因此,現有證據支持的功能範圍,主要是 tuftelin 1 與表皮結構組織、牙釉質礦化及結構形成相關。資料未指出這些作用之間是否共享同一機制,也未提供其對組織形態或功能的具體影響程度。對其生物學意義的描述應限於上述關聯,不延伸推論其他組織中的功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 151540309 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TUFT1 ENST00000368849 GRCh38 chr1:151539309-151540409 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCACTTCCCAGGTAGAAAAATCCTCATTCATTCCTAACTGACATAGGACCCAGTCCCTAACTGGGAGGTA
GGGACATTTCTGCTGTTCCTGCCCTAGTGTTGCCTTGAAGAGGGAGCTGGCCCTTCACTAGAGCCTATTG
CCAGGTATAGGAGTACTATCCCTTCAGGAGTGGGTCAGACCTCCTCCTAAAGTATTCTGTCTGCTGTCTC
TGTGGACCACAGCCAAGTGAAGAAGCCATCTGCCAAGAGCAGCTGGGCGGGGACGAAGCTCCAGGGTCCT
GCTTGGCCAACCCTCTCTTCTAGGCCCTCAAGATCCCAGCCTAGGCTTGGGGAGAAAATGCAACTGGAAA
AGTCAAGGCTCATCCTTTCTCACGAACACAAATTCCTTTTAAGGCAATGTGTCCCGCCTCTCCCAACTAT
ATAAGGGCAGCGTCAGTAAAAGAGCTTCTGCAAAACAAGCCCCACCCAGAGCCTAAGCTGACTGGGCCTC
CTGGGCCTCTTGCCAAGGAAGTGCACCTGCCAGACTGGCTTAGGCCAGTCTGAGTGAGCTGGACCTTGGT
GCCTGCCTTTCTGCGGTGGAGGAAAGGTTTACTCAGCTCCACAAAGCCTACAGGTGGCTTACGTATAGGG
AGAGGAGCATGTATGGAAGGAAGCTTTTGCAGGTTCCAACTCCTCATCCACTAGGAGCAGGCAGGGTGAT
TCCCTCTGACCAACACTGATCTTGGAAAGATGGAAAGCGACAAGATTAATGAAGAATGTGCAACCACATA
CTCCAGATAAAGCTGTTCAGTTAAAGCAGCCCCATGTCGCTCCCAAGCCCCACCTTTGTGTAAATCTATG
CGAGCACCGATGGGGCATGTCCCAGACCCATTGGCTCCGCCCACCTCACCTCCTCGCCTATCGTTAGTTC
TCTGCGAAACCGCGAACTGGGGGCGCGGCCTATCTTCAGCCCCGCCCCTGATGGGCCTATACAAGGGGGC
GGTTCCGCGCGCGCCCGCCCAGTTGGAGCCAGACAGCGGGGTGGACAAGTGGCGTGTGTGCTGCGACCCC
GAGGGAAGATGAACGGGACGCGGAACTGGTGTACCCTGGTGGACGTGCACC
TUFT1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TUFT1_1 ↗1:151,540,309正股151,540,260–151,540,319

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_7BWKT8 · enhancer · 151535403–151535504 · regulatory

ENSR1_B35427 · promoter · 151539815–151540526 · regulatory

ENSR1_53BMD9D · CTCF_binding_site · 151540273–151540294 · regulatory

ENSR1_CK327 · enhancer · 151540527–151542045 · regulatory

ENSR1_53BMDDH · CTCF_binding_site · 151540945–151540966 · regulatory

ENSR1_53BMDFW · CTCF_binding_site · 151541250–151541271 · regulatory

ENSR1_B3542L · enhancer · 151542564–151543242 · regulatory

· motif · 151536076–151536089 · motif

· motif · 151536076–151536089 · motif

· motif · 151537225–151537239 · motif

· motif · 151537225–151537239 · motif

· motif · 151537505–151537516 · motif

· motif · 151539722–151539737 · motif

· motif · 151539722–151539737 · motif

· motif · 151539820–151539829 · motif

· motif · 151540182–151540192 · motif

· motif · 151540225–151540233 · motif

· motif · 151540225–151540240 · motif

· motif · 151540237–151540247 · motif

· motif · 151540257–151540267 · motif

· motif · 151540275–151540291 · motif

· motif · 151540283–151540293 · motif

· motif · 151540336–151540347 · motif

· motif · 151540375–151540386 · motif

· motif · 151540375–151540386 · motif

· motif · 151540463–151540477 · motif

· motif · 151540947–151540963 · motif

· motif · 151541137–151541151 · motif

· motif · 151541252–151541268 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:390 aa

1 aa390 aa功能區域
依 Q9NNX1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tuftelin 1 長 390 個胺基酸,屬於 tuftelin 家族。蛋白質註解將第 358 至 390 個胺基酸標示為無序區;現有資料未提供其他結構域或功能區域的資訊。

功能區域Disordered358–390 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NNX1…

AlphaFold · Q9NNX1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

tuftelin 1 會分泌至細胞外。 在牙釉質形成非常早期,它集中於牙本質—牙釉質交界,並緊密結合於生長中晶體的表面;此描述指出其定位與牙釉質形成階段及晶體生長狀態相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TUFT1TUFT1CEP76KAT5LMO2LMO3TRIM27ZYX
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料指出 tuftelin 1 與 TFIP11 互作,但未說明互作是否為直接結合、是否形成特定複合體,或其功能後果,因此不宜進一步界定互作性質。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Woolly hair-skin fragility syndrome(WHSF)是一種體染色體隱性遺傳的皮膚遺傳疾病,與影響此基因的變異有關。其特徵包括羊毛狀髮質、頭髮生長緩慢,以及出生時或新生兒期出現皮膚脆弱;皮膚脆弱之後可能消退,也可能僅留下輕微脫皮,且主要影響手掌與腳底。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tuftelin 1 與表皮的結構組織有關,也參與牙釉質的礦化及結構組織。來源未提供這些作用的具體分子機制或其他實驗條件。含實驗來源
證據與來源

Involved in the structural organization of the epidermis. Involved in the mineralization and structural organization of enamel

PMID 36689522 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tuftelin 1 與 TFIP11 互作;來源未進一步說明互作是否為直接結合,或其功能意義。推論支持
證據與來源

Interacts with TFIP11

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tuftelin 1 會分泌;在牙釉質形成非常早期,集中於牙本質—牙釉質交界,並緊密結合在生長中晶體的表面。推論支持
證據與來源

Secreted; Secreted at a very early stage of enamel formation, concentrated at the dentin-enamel junction and tightly bound to the surface of the growing crystallites

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Woolly hair-skin fragility syndrome(WHSF)是體染色體隱性遺傳的皮膚遺傳疾病,與影響此基因的變異有關。患者可有羊毛狀髮質、頭髮生長緩慢,以及出生時或新生兒期出現的皮膚脆弱;後者之後可能消退,或僅持續為輕微脫皮,主要影響手掌與腳底。含實驗來源
證據與來源

Woolly hair-skin fragility syndrome WHSF An autosomal recessive genodermatosis characterized by woolly hair texture with slow hair growth, and skin fragility present at birth or appearing in the neonatal period. Skin fragility then resolves or only persists as minor skin peeling, predominantly affecting the palms and soles. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620415

PMID 36689522 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368849 · 3,107 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTTGGAGCCAGACAGCGGGGTGGACAAGTGGCGTGTGTG40
41CTGCGACCCCGAGGGAAGATGAACGGGACGCGGAACTGGT80
81GTACCCTGGTGGACGTGCACCCAGAGGACCAGGCGGCGGG120
121CAGCGTGGACATTCTCAGGCTGACTCTCCAGGGTGAACTG160
161ACAGGAGATGAACTTGAACACATAGCCCAGAAGGCGGGCA200
201GGAAGACCTATGCCATGGTGTCCAGCCACTCAGCTGGTCA240
241TTCTCTGGCTTCAGAACTGGTGGAGTCCCATGATGGACAT280
281GAGGAGATCATTAAGGTGTACTTGAAGGGGAGGTCTGGAG320
321ACAAGATGATTCACGAGAAGAATATTAACCAGCTGAAGAG360
361TGAGGTCCAGTACATCCAGGAGGCCAGGAACTGCCTACAG400
401AAGCTCCGGGAGGATATAAGTAGCAAGCTTGACAGGAACC440
441TAGGAGATTCTCTCCATCGACAGGAGATACAGGTGGTGCT480
481AGAAAAGCCAAATGGCTTTAGTCAGAGTCCCACAGCCCTG520
521TACAGCAGCCCACCTGAGGTGGACACCTGTATAAATGAGG560
561ATGTTGAGAGCTTGAGGAAGACGGTGCAGGACTTGCTGGC600
601CAAGCTTCAGGAGGCCAAGCGGCAACACCAGTCAGACTGT640
641GTGGCTTTTGAGGTCACACTCAGCCGGTACCAGAGGGAAG680
681CAGAACAAAGTAATGTGGCCCTTCAGAGAGAGGAGGACAG720
721AGTGGAGCAGAAAGAGGCAGAAGTCGGAGAGCTGCAGAGG760
761CGCTTGCTAGGGATGGAGACGGAGCATCAGGCCTTACTGG800
801CGAAAGTGAGGGAAGGGGAGGTGGCCCTAGAGGAACTTCG840
841GAGCAACAATGCTGACTGCCAAGCAGAACGAGAAAAGGCT880
881GCTACCCTGGAAAAGGAAGTGGCCGGGTTGCGGGAGAAGA920
921TCCACCACTTGGATGACATGCTCAAGAGCCAGCAGCGGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。