演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TUBG2

tubulin gamma 2

TUBG2(tubulin gamma 2)是 tubulin 家族的蛋白質,為 gamma-tubulin ring complex(gTuRC)的組成成員,參與微管成核,與中心體複製及紡錘體形成相關。

Homo sapiens17q21.2UniProt Q9NRH3
OFFICIAL SYMBOL
TUBG2
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9NRH3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TUBG2(tubulin gamma 2)是蛋白質編碼基因,所產生的蛋白質 Tubulin gamma-2 chain 屬於 tubulin 家族。不同於構成微管主要骨架的 alpha-、beta-tubulin,gamma-tubulin 是 gamma-tubulin ring complex(gTuRC)的關鍵成員。此複合體包含 TUBG2 或 TUBG1 等 gamma-tubulin,並與多種 TUBGCP 蛋白共同組成。TUBG2 的基本特性因而與微管的起始形成及其組織有關;微管本身則由 alpha-、beta-tubulin 異源二聚體構成的蛋白質絲組成。

Official symbol
TUBG2
Gene name
tubulin gamma 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12419
UniProt
Q9NRH3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q21.2
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegTUBG2pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:42,659,223–42,667,007
Gene span
7,785 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000251412 ★42,659,284–42,667,00611
ENST0000085488442,659,223–42,667,00712
ENST0000085488542,659,223–42,667,00713
ENST0000085488642,659,223–42,667,00710
ENST0000085488742,659,223–42,667,00712
ENST0000085488842,659,223–42,667,00711
ENST0000085488942,659,223–42,667,00711
ENST0000085489042,659,223–42,667,00711
ENST0000091676242,659,223–42,667,00710
ENST0000091676342,659,223–42,667,00710
ENST0000096823242,659,223–42,667,00711
ENST0000096823342,659,223–42,667,00710

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

微管是由 alpha-、beta-tubulin 異源二聚體組成的蛋白質絲,而 gamma-tubulin 的主要功能與微管成核有關。TUBG2 是 gamma-tubulin ring complex(gTuRC)的成員;gTuRC 促進微管形成的起始,使 alpha-beta tubulin 異源二聚體得以開始組成微管原纖維。

在此過程中,gTuRC 調節微管負端的成核。由複合體所促進的微管原纖維後續生長,構成微管形成的重要步驟。這表示 TUBG2 參與的是微管組裝的起始階段,而非來源所述的 alpha-、beta-tubulin 異源二聚體構成的微管主要骨架。

微管成核與兩項細胞活動相關:中心體複製及紡錘體形成。由於 gTuRC 介導微管成核,TUBG2 作為其組成成員,與這些過程所需的微管形成相連。來源指出其功能脈絡涉及微管負端的成核,以及微管原纖維的生長;未進一步說明 TUBG2 在其他細胞過程中的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42659284 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TUBG2 ENST00000251412 GRCh38 chr17:42658284-42659384 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACATTCACAATAGCCAAAAGGTGGAAGCAACCCAAATGTCCATGGAGGGATGAATGGTTATGCAAAATG
TGGTACATCTATACAATGGAATATTATTCAGTTGTAAAAAGGAAGGAAATTCTGACACATGCTACGAAAT
GGAAGGATCTTGAAGATATTATGTTAAGTGAAAGAAGCCAGACCCAAAAAGACAAATACTGTATAATTCC
ACTCATATCAGGTGCCTAGAGTAGTCAAGGGGAAGTTACTGTTTAATCGCGATAGAGTTTCAGTTTGGGA
AGATAAGAAAGTTCTAGAAAAGAATGGTGGTGGTGGTTACAGAACAATGTGAGTGTACTTGGTGCCACAG
AACTGTATGCAGTACTTACAAATGGTTACAATGGTAAATTTAGGCCAGGAGTGGTGGCTCATGCCTGTAA
TCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGATTGAGGCCAGTAGTTTAAGACCATCTTGGGCAAC
ACGGTGAGATCCCCATCTCTATAAAAATACATTTTAAAAATTTAAAAATTAGCTGGGCGTGGTAGCACAC
GCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAAGTGGGAGGATCACTTAAGCCAGAAGTTCAAGGCTACAGT
GAGCTATGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACCCTTCTAAAAAATAAAAAGGTA
ACATACATGTGTATGTATTGTAACACCATTAAAAAACAGAAATTTAAACGAAGAAAAGTTGGCTTCTAGC
CCTTTGATCTAGCAAAGCTGACAGTGTCCTCACCTACCAATATAGGTAGATGACTCCTTACACGTGGACA
AGCACATCCACCTGGCCGCTTCTCCCCTTTCCTCCCCTCCCCCGTTCCTCTCCTCCCCAACACATCCAGG
TTCCGACCCTGCCACCCCCAACGAGTCTCACTGCGCAGGCGCGGAGCGGTGGGCAGGAGCGGGCGTGGCC
TGACTCTGCGCCTGTGCGGAATTCCAGCTGCGACTGCTGAGGGAGAAAATGATGCCCAGGTTGGGCTCCC
CGGCCCACCGGCCGAGGAGAGGCCTGCGCTGCACACGCGCAGACCGAGCAT
TUBG2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TUBG2_1 ↗17:42,659,284正股42,659,235–42,659,294
TUBG2_2 ↗17:42,660,283正股42,660,234–42,660,293

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_C689H · enhancer · 42653271–42654456 · regulatory

ENSR17_9LX5H · enhancer · 42655525–42655872 · regulatory

ENSR17_9LX5M · enhancer · 42655981–42656486 · regulatory

ENSR17_9LX6H · promoter · 42658859–42659294 · regulatory

ENSR17_9LX6W · promoter · 42660282–42660782 · regulatory

· motif · 42655788–42655800 · motif

· motif · 42655790–42655805 · motif

· motif · 42656107–42656115 · motif

· motif · 42656364–42656377 · motif

· motif · 42656364–42656377 · motif

· motif · 42656478–42656490 · motif

· motif · 42656480–42656487 · motif

· motif · 42656480–42656495 · motif

· motif · 42656531–42656542 · motif

· motif · 42658829–42658844 · motif

· motif · 42659225–42659236 · motif

· motif · 42659225–42659236 · motif

· motif · 42659270–42659281 · motif

· motif · 42659270–42659281 · motif

· motif · 42659363–42659374 · motif

· motif · 42659363–42659374 · motif

· motif · 42659912–42659927 · motif

· motif · 42659919–42659927 · motif

· motif · 42659919–42659936 · motif

· motif · 42660087–42660102 · motif

· motif · 42660087–42660102 · motif

· motif · 42660184–42660199 · motif

· motif · 42660185–42660199 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:451 aa

Tubulin gamma-2 chain 屬於 tubulin 家族。現有來源未提供其結構域、功能區域或序列註解的進一步資訊。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NRH3…

AlphaFold · Q9NRH3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome

來源將 TUBG2 記錄於細胞質、細胞骨架、微管組織中心及中心體;未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TUBG2TUBG2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TUBG2 可作為 gamma-tubulin ring complex(gTuRC)的組成成員;該複合體也包含 TUBGCP2、TUBGCP3、TUBGCP4、TUBGCP5、TUBGCP6,並可含 TUBG1 或 TUBG2。複合體中的 TUBGCP 蛋白以 5:5:2:1:1 的化學計量組裝,各自與 gamma-tubulin 相連,使 14 個 gamma-tubulin 呈螺旋排列。首位 gamma-tubulin 受末位 TUBGCP3 阻擋,讓 13 條原纖維得以生長形成微管。TUBG2 所在的 gTuRC 也與 alpha-beta tubulin 異源二聚體互作,這項互作可使微管自 gTuRC 成核。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能微管是由 alpha-、beta-tubulin 異源二聚體構成的主要蛋白質絲;gamma-tubulin 則是促進微管成核的 gamma-tubulin ring complex(gTuRC)關鍵成員。gTuRC 調節 alpha-beta tubulin 異源二聚體在微管負端的成核,並促使其生長形成微管原纖維。這項成核步驟與中心體複製及紡錘體形成相關。含實驗來源
證據與來源

Tubulin is the major constituent of microtubules, protein filaments consisting of alpha- and beta-tubulin heterodimers. Gamma-tubulin is a key component of the gamma-tubulin ring complex (gTuRC) which mediates microtubule nucleation. The gTuRC regulates the minus-end nucleation of alpha-beta tubulin heterodimers that grow into microtubule protafilaments, a critical step in centrosome duplication and spindle formation

PMID 38305685 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TUBG2 或 TUBG1 可作為 gamma-tubulin,與 TUBGCP2、TUBGCP3、TUBGCP4、TUBGCP5、TUBGCP6 組成 gamma-tubulin ring complex(gTuRC)。五種 TUBGCP 蛋白按 5:5:2:1:1 組裝,各自連接 gamma-tubulin,排列成螺旋狀的 14 個 gamma-tubulin;首位 gamma-tubulin 受末位 TUBGCP3 阻擋,使 13 條原纖維得以生長形成微管。gTuRC 與 alpha-beta tubulin 異源二聚體互作,並藉此促進微管成核。含實驗來源
證據與來源

Component of the gamma-tubulin ring complex (gTuRC) consisting of TUBGCP2, TUBGCP3, TUBGCP4, TUBGCP5 and TUBGCP6 and gamma-tubulin TUBG1 or TUBG2. TUBGCP2, TUBGCP3, TUBGCP4, TUBGCP5 and TUBGCP6 assemble in a 5:5:2:1:1 stoichiometry; each is associated with a gamma-tubulin, thereby arranging 14 gamma-tubulins in a helical manner. Gamma-tubulin at the first position is blocked by TUBGCP3 at the last position, allowing 13 protafilaments to grow into a microtubule. Interacts with alpha-beta tubulin heterodimers; the interaction allows microtubules to nucleate from the gTuRC

PMID 38305685 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TUBG2 的記錄定位包括細胞質、細胞骨架、微管組織中心及中心體。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000251412 · 1,782 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTCCAGCTGCGACTGCTGAGGGAGAAAATGATGCCCAGG40
41TTGGGCTCCCCGGCCCACCGGCCGAGGAGAGGCCTGCGCT80
81GCACACGCGCAGACCGAGCATCCGCGTCAAGAGGCGAAGA120
121GAGCGCGCGCTCCCCACGTCCTGCGCTCCTGGCTGCCGGG160
161CATTCGTCTCAGCCGTGACTCTCGCCAGGCCGGGGCTGGC200
201GCGCCCACGTCTGAAGAGCGATGCCCCGGGAGATCATCAC240
241CCTGCAGCTGGGCCAGTGCGGCAACCAGATTGGGTTCGAG280
281TTCTGGAAACAGCTGTGCGCCGAGCATGGTATCAGCCCCG320
321AGGGCATCGTGGAGGAATTCGCCACCGAGGGCACTGACCG360
361CAAGGACGTCTTTTTCTACCAGGCAGACGATGAGCACTAC400
401ATCCCCCGGGCCGTGCTGCTGGACTTGGAACCCCGGGTGA440
441TCCACTCCATCCTCAACTCCCCCTATGCCAAGCTCTACAA480
481CCCAGAGAACATCTACCTGTCGGAACATGGAGGAGGAGCT520
521GGCAACAACTGGGCCAGCGGATTCTCCCAGGGTGAGAAAA560
561TTCATGAAGACATCTTTGACATCATAGACCGAGAAGCAGA600
601TGGAAGTGACAGTTTGGAGGGCTTCGTGCTGTGTCACTCC640
641ATCGCTGGGGGTACGGGTTCTGGCCTGGGCTCCTACCTCC680
681TGGAGCGACTGAATGACAGGTACCCCAAGAAGCTAGTGCA720
721GACTTATTCAGTGTTTCCCTACCAGGACGAGATGAGCGAC760
761GTAGTGGTTCAGCCCTACAATTCACTCCTGACACTCAAGA800
801GGCTGACGCAGAACGCAGATTGTGTGGTGGTGCTGGACAA840
841CACAGCCCTGAACCGGATTGCCACAGACCGCCTGCACATC880
881CAGAACCCGTCCTTCTCCCAGATCAACCAGCTGGTGTCCA920
921CCATCATGTCGGCCAGCACCACCACCCTGCGCTACCCCGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。