演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TUBA3CbA408E5.3

tubulin alpha 3c

TUBA3C 編碼 tubulin alpha 3c,屬於 tubulin 家族。其產物參與微管構成;微管由 α、β-tubulin 異源二聚體組成,並具有可動態延伸的結構。

Homo sapiens13q12.11UniProt P0DPH7
OFFICIAL SYMBOL
TUBA3C
CHROMOSOME
13
UNIPROT
P0DPH7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TUBA3C 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 tubulin alpha 3c,產物屬於 tubulin 家族。Tubulin 是微管的主要構成成分;微管呈中空管狀,由沿管壁排列的原絲構成,而原絲包含 α、β-tubulin 異源二聚體。這些特性使 TUBA3C 產物成為微管結構組成的一員。來源提供了此基因的家族歸屬與微管基本構造資訊,但未描述其他結構特色或不同異構型之間的差異。

Official symbol
TUBA3C
Gene name
tubulin alpha 3c
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12408
UniProt
P0DPH7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
bA408E5.3TUBA2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1313q12.11
chr13 · 114,364,328 bp · GRCh38chr13p13 · 1–4600000 · gvarchr13p12 · 4600001–10100000 · stalkchr13p11.2 · 10100001–16500000 · gvarchr13p11.1 · 16500001–17700000 · acenchr13q11 · 17700001–18900000 · acenchr13q12.11 · 18900001–22600000 · gnegchr13q12.12 · 22600001–24900000 · gpos25chr13q12.13 · 24900001–27200000 · gnegchr13q12.2 · 27200001–28300000 · gpos25chr13q12.3 · 28300001–31600000 · gnegchr13q13.1 · 31600001–33400000 · gpos50chr13q13.2 · 33400001–34900000 · gnegchr13q13.3 · 34900001–39500000 · gpos75chr13q14.11 · 39500001–44600000 · gnegchr13q14.12 · 44600001–45200000 · gpos25chr13q14.13 · 45200001–46700000 · gnegchr13q14.2 · 46700001–50300000 · gpos50chr13q14.3 · 50300001–54700000 · gnegchr13q21.1 · 54700001–59000000 · gpos100chr13q21.2 · 59000001–61800000 · gnegchr13q21.31 · 61800001–65200000 · gpos75chr13q21.32 · 65200001–68100000 · gnegchr13q21.33 · 68100001–72800000 · gpos100chr13q22.1 · 72800001–74900000 · gnegchr13q22.2 · 74900001–76700000 · gpos50chr13q22.3 · 76700001–78500000 · gnegchr13q31.1 · 78500001–87100000 · gpos100chr13q31.2 · 87100001–89400000 · gnegchr13q31.3 · 89400001–94400000 · gpos100chr13q32.1 · 94400001–97500000 · gnegchr13q32.2 · 97500001–98700000 · gpos25chr13q32.3 · 98700001–101100000 · gnegchr13q33.1 · 101100001–104200000 · gpos100chr13q33.2 · 104200001–106400000 · gnegchr13q33.3 · 106400001–109600000 · gpos100chr13q34 · 109600001–114364328 · gnegTUBA3Cpq1 bp114,364,328 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr13:19,173,770–19,181,824
Gene span
8,055 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000400113 ★19,173,772–19,181,8245
ENST0000109064919,173,770–19,181,8244
ENST0000113178319,173,770–19,181,8245

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Tubulin 是微管的主要構成成分。微管是由線性原絲側向排列形成的圓柱狀結構,原絲則由 α-tubulin 與 β-tubulin 組成的異源二聚體構成。因此,TUBA3C 所編碼的 tubulin alpha 3c 屬於微管的結構組成部分。

微管可藉由 GTP-tubulin 二聚體加入微管末端而延長。新加入的二聚體在末端形成具有穩定作用的帽狀區域;帽狀區以下的 tubulin 二聚體則處於 GDP 結合狀態。來源將此狀態歸因於 α-tubulin 的 GTPase 活性。

所列反應式為 GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+)。這項核苷酸水解反應與微管末端的 GTP-tubulin 加入及帽狀區形成相關;來源並未進一步說明 TUBA3C 特有的調控方式或其相較於其他 tubulin 的功能差異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 19181824 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TUBA3C ENST00000400113 GRCh38 chr13:19181724-19182824 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGGTCTCACCACGTTGCCCAGGCTGGTTGCAAACTCCTGACCTCAAGCAATCCTCCGGCGGAGGCCTCCC
AAAGCACTGGAATTACAGGCCTGAGGCACTGCGCCCAGCCCAACCTCTCCACCTATATTAATTTTACCTC
TGCTTCTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGACGGAGTCTCGCCCAGGCTGCAGTGCGATCTC
GGCTAACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCCCCAGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT
ACAGGCACGCCCACCATACCCGGATAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTGGCCA
GGTTGGTCTCCAACTCCTGACTTCAGGTGATCTGCCCGCCTCTGCCTCCGAAGTGATGGGATTACAGACG
TGAGCCACAGAAACCCACTCACTTTTTCCTTTCAGATCACAAAAGTGATCGAATCCCGCCACTTCCCGGG
TGCTGGGTGGGAAGGTGGGGTGATTGCTGTGCTGCTGTGACTTGGGTAGATGCCGTGAAGGCCTCTCAAA
GGCGGCCATGTTTGCAAAGATCTGAATAAGGCACCTCCAGAGGAACCGGTCTGGGGCAACTGGGGAGGAG
GCAGCGGCACAAGTTCGTGGTCAAGCCACTGCAAGGCTGGGAGCTTACTTACAAAGCAATGTTCCTCCAC
CTATAAAGACGCAGTAGCTGCTCCATCCCCGGTCAGAGGACCCCCGGAAACGTCTCAGCCCACGCACTGC
CCTCTGACCCCACTGCCTTCCCGCCAGTCCTGCATCCAGTCAGAGGGCCCTCTCTGAGCCTGCTGCCTTC
CCGCCAATCCTGCATCCAATCAGAGGGCGTCCCCACTACGTGGTTTGCACAACGGCCAATCAAAACTAGG
ATCCGAGCCTTGGCCCGCCTCCCAGGACGTCCGGACCAATGGTGGCCTGGCACCAGCAGGCCAATCCCAG
ACAGCGCACGGCGGGAGGCTGTCGTTGGGCGTGCGCAGCTGCAGCGGCGGTTGAGGTCAAGTAGTAGCGT
TGGGCTGCGGCAGCGGAGGAGCTCAACATGGTAAGGCCAGGTCACTCCCAC
TUBA3C 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TUBA3C_1 ↗13:19,181,782負股19,181,772–19,181,831

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 19178573–19178585 · motif

· motif · 19178768–19178783 · motif

· motif · 19185825–19185837 · motif

· motif · 19185925–19185940 · motif

· motif · 19185932–19185940 · motif

· motif · 19185932–19185947 · motif

· motif · 19185938–19185960 · motif

· motif · 19185938–19185960 · motif

· motif · 19186175–19186187 · motif

· motif · 19186226–19186233 · motif

· motif · 19186230–19186242 · motif

· motif · 19186232–19186247 · motif

· motif · 19186274–19186286 · motif

· motif · 19186277–19186284 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:450 aa

1 aa450 aa基序
依 P0DPH7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tubulin alpha 3c 長 450 個胺基酸,屬於 tubulin 家族。序列註解指出其第 1 至第 4 位胺基酸具有 MREC motif;此特徵的證據標示為與相似蛋白的推論。

基序MREC motif1–4 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P0DPH7…

AlphaFold · P0DPH7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

資料將 TUBA3C 產物標示於細胞質與細胞骨架。 來源未提供定位變化的條件、細胞狀態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
bA408E5.3TUBA3C
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

此蛋白質以 α、β 鏈形成異源二聚體。二聚體可首尾相接組成沿微管壁縱向延伸的原絲;β-tubulin 朝向微管正端,使微管具有結構極性。典型微管是中空管狀結構,外徑約 25 nm、內徑約 15 nM,通常包含 13 條原絲;某些生物或特化細胞中則可見不同數目的原絲。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Tubulin 是微管的主要成分;微管由側向排列的線性原絲構成,原絲包含 α、β-tubulin 異源二聚體。GTP-tubulin 二聚體加入微管末端,使微管延長並形成穩定帽狀區;帽狀區以下的二聚體因 α-tubulin 的 GTPase 活性而處於 GDP 結合狀態。資料庫紀錄
證據與來源

Tubulin is the major constituent of microtubules, a cylinder consisting of laterally associated linear protofilaments composed of alpha- and beta-tubulin heterodimers. Microtubules grow by the addition of GTP-tubulin dimers to the microtubule end, where a stabilizing cap forms. Below the cap, tubulin dimers are in GDP-bound state, owing to GTPase activity of alpha-tubulin

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

GTP + H2O = GDP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用α、β 鏈形成異源二聚體,並首尾相接組成沿微管壁縱向延伸的原絲。β-tubulin 朝向微管正端,賦予微管結構極性。典型微管為中空管狀,外徑 25 nm、內徑 15 nM,通常有 13 條原絲;某些生物與特化細胞則可能具有不同原絲數目。資料庫紀錄
證據與來源

Dimer of alpha and beta chains. A typical microtubule is a hollow water-filled tube with an outer diameter of 25 nm and an inner diameter of 15 nM. Alpha-beta heterodimers associate head-to-tail to form protofilaments running lengthwise along the microtubule wall with the beta-tubulin subunit facing the microtubule plus end conferring a structural polarity. Microtubules usually have 13 protofilaments but different protofilament numbers can be found in some organisms and specialized cells

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TUBA3C 產物的細胞內定位標示為細胞質與細胞骨架。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000400113 · 1,521 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCGTTGGGCGTGCGCAGCTGCAGCGGCGGTTGAGGTCAA40
41GTAGTAGCGTTGGGCTGCGGCAGCGGAGGAGCTCAACATG80
81CGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCC120
121AGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTGCCTGGAACA160
161TGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACC200
201ATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCAACACGTTCTTCAGTG240
241AGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGT280
281GGACCTGGAGCCCACTGTGGTCGATGAAGTGCGCACAGGA320
321ACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCG360
361GGAAGGAAGATGCGGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTA400
401CACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGG440
441ATCCGCAAACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCT480
481TCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGG520
521GTTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTAC560
561GGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCCAGCCC600
601CCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCAT640
641CCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATTCTGACTGTGCC680
681TTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGC720
721GCAACCTGGACATCGAGCGTCCCACGTACACCAACCTCAA760
761TCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCC800
801CTGCGATTTGACGGGGCCCTGAATGTGGACTTGACGGAAT840
841TCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCC880
881CCTGGCCACCTACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCC920
921TACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。