演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TTYH2C17orf29

tweety family member 2

TTYH2(tweety family member 2)是 tweety family 的蛋白質,具有多段穿膜結構,與細胞膜上的離子通道功能相關。

Homo sapiens17q25.1UniProt Q9BSA4
OFFICIAL SYMBOL
TTYH2
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9BSA4
PDB / ALPHAFOLD
7P54
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TTYH2(tweety family member 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 tweety family。此蛋白質為多次穿膜蛋白,序列註解顯示其含有五段穿膜螺旋,並由胞外區段與胞質區段交替排列。其主要角色與受細胞腫脹調節的陰離子通道功能相關;來源亦將其描述為可能具有大電導、受 Ca(2+) 活化的氯離子通道特性。現有資料支持其作為膜蛋白及通道相關蛋白的基本認識,未提供更完整的家族結構或其他異構型資訊。

Official symbol
TTYH2
Gene name
tweety family member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13877
UniProt
Q9BSA4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C17orf29

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegTTYH2pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:74,213,499–74,262,022
Gene span
48,524 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000269346 ★74,213,571–74,262,02014
ENST0000087676974,213,518–74,262,02213
ENST0000087677074,213,518–74,262,02213
ENST0000087677174,213,518–74,262,02214
ENST0000097058074,213,518–74,262,02214
ENST0000097058174,213,518–74,262,02212
ENST0000097058274,213,518–74,262,02211
ENST0000098494874,213,518–74,262,02214
ENST0000110566974,213,518–74,253,92513
ENST0000112814074,213,518–74,262,02212
ENST0000112814174,213,518–74,262,0225
ENST0000114253374,213,518–74,262,02214

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TTYH2 被描述為一種不依賴鈣離子、但受細胞腫脹影響的體積調節陰離子通道(VRAC-swell)。資料指出,它可能參與腦部的調節性體積減少(RVD):細胞腫脹後,陰離子及有機滲透物由細胞向外移動,所舉例子包括氯離子與 glutamate。這些敘述將 TTYH2 的通道活動與細胞體積調節相連,但「By similarity」標示代表此功能描述具有相似性推論的性質。

另有資料將 TTYH2 列為可能的大電導、Ca(2+) 活化氯離子通道。這項描述帶有「Probable」的不確定性,與前述不依賴鈣離子的 VRAC-swell 描述並列,不宜視為已確立為同一條件下的單一通道模式。功能資料也記錄氯離子向外移動,以及 L-glutamate 向外移動;後者同樣以相似性證據支持。

因此,現有來源所支持的功能重點,是 TTYH2 與陰離子及有機滲透物外流相關,並可能在腦部細胞的 RVD 過程中發揮作用;至於通道活性對鈣離子的依賴性,資料保留了不同描述與證據確定度,不能據此延伸為更廣泛或已完全釐清的調控機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 74213571 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TTYH2 ENST00000269346 GRCh38 chr17:74212571-74213671 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAAGTCACGCCAAGCAGTTTGCGGTTACAGGACGGGTGGGGGCCTCTGCATATGTGCAGAGTACGGAGGG
CCCAGGGACGCGAGGCTCCCCGATGGGCAACCTCCCCTGCCTTTGCTTTTCCCCAGAGCCCCCTCCTGGC
CTGCGTTCGGCATCTTCTCGGGTCGTCATCGCCCTCTGCGGTGCCTGCGCTCGGGGTGAGGGTTTTTGTC
GGCTTTTGTTACATCACCGATGTAACAGTGCCTGGACGTAGTAGGTGCTCAATAAATATGTTGTTGAATG
CGCTTCAGTCTCCCCGAATGCTTGTCCCTTCCGGGCGCTCTCATCGCTCTCCTACCTTCCCCGCTACACA
GCTCGAAGGTCCCCTCCTCCGGGAAGCTCACCCTGTCCCACTTGCCAGGAAGAATCAAGCAAATTTTCTG
AGTGAGACACCTTGTCCTCACTCAGGCGTCCTGCAGGCGGCTTCAGCGAGTTGTTGGGGCAGATGCGCCG
GGAGCTCCCGAGGGCAGGGACGGCGTCTTATTTCTCTTTTTAAGTCCACAGGGCTTGCACAATAGATGCC
CAAAAAATGAGAGTGAATTTAGAATGAGTGACCGAGTGGCTGAAGATTGCCTCCTTCCTTTCCCAGTCTG
TCGGTTACTTACCCTGTGACAAGCCCTTGGGACGGGCAGTCGCCCCTCTCTGGCCTATGACTGCTGGCTG
CCCCCACTGACACCTTATACCCTTGATCTGATCATAAATAAGAAGCAGCCCGGGGACCTCGAGACTGAAA
CTGATTTAGAGACTTCTGGGAGCTTTTTTCACTTCCCTCCTCCCATCCGGCCAGGACAGATCCCCGCCCA
GAAAGGGGCTGTTGACTGCAGCGGGCTGCGCGCCCAGAACTGGGACTGGGATCGCGGCGGGGCGGGGCGG
GCGCGGGCCCAGGGAGAGGCGGGGCCGGGGGCGGGGCGGGCACGGGGCCCCGGCCGGGAGGTGAGCGCAG
CTGTCGTTCAGCTTGTGGGTAGCACTCGGGCCGAGCCATGCAGGCGGCGCGCGTGGACTACATCGCTCCC
TGGTGGGTCGTGTGGCTGCACAGCGTCCCGCACGTCGGCCTGCGCCTGCAG
TTYH2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TTYH2_1 ↗17:74,213,571正股74,213,522–74,213,581

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_5MG9PJ · CTCF_binding_site · 74210575–74210596 · regulatory

ENSR17_846WML · promoter · 74213332–74213581 · regulatory

ENSR17_C9CSJ · enhancer · 74213582–74215500 · regulatory

ENSR17_5MGB9T · CTCF_binding_site · 74213888–74213909 · regulatory

ENSR17_76CSDM · promoter · 74215501–74215626 · regulatory

ENSR17_934GCW · enhancer · 74217056–74217394 · regulatory

· motif · 74210509–74210521 · motif

· motif · 74210577–74210593 · motif

· motif · 74210771–74210784 · motif

· motif · 74210771–74210784 · motif

· motif · 74210926–74210939 · motif

· motif · 74210926–74210939 · motif

· motif · 74211086–74211094 · motif

· motif · 74211146–74211163 · motif

· motif · 74212582–74212597 · motif

· motif · 74212589–74212597 · motif

· motif · 74212746–74212763 · motif

· motif · 74213114–74213123 · motif

· motif · 74213221–74213234 · motif

· motif · 74213468–74213478 · motif

· motif · 74213495–74213505 · motif

· motif · 74213507–74213517 · motif

· motif · 74213728–74213743 · motif

· motif · 74213890–74213906 · motif

· motif · 74215666–74215675 · motif

· motif · 74215851–74215868 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:534 aa

1 aa534 aa基序跨膜區拓樸區域
依 Q9BSA4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TTYH2 蛋白質長 534 個胺基酸,屬於 tweety family。序列註解包含五段穿膜螺旋,胞外區與胞質區段交錯分布;第 164–166 位有 RGD motif。胞質端第 506–509 位的 PY-motif 被註明可介導與 NEDD4L 的交互作用。

拓樸區域Extracellular1–44 aa
跨膜區Helical; Name=145–65 aa
拓樸區域Cytoplasmic66–87 aa
跨膜區Helical; Name=288–108 aa
拓樸區域Extracellular109–213 aa
跨膜區Helical; Name=3214–234 aa
拓樸區域Cytoplasmic235–240 aa
跨膜區Helical; Name=4241–261 aa
拓樸區域Extracellular262–388 aa
跨膜區Helical; Name=5389–409 aa
拓樸區域Cytoplasmic410–534 aa
基序RGD164–166 aa
基序PY-motif; mediates interaction with NEDD4L506–509 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7P54…

PDB · 7P54

EM · 3.30 A · A/B=2-534

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

TTYH2 定位於細胞膜,屬多次穿膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C17orf29TTYH2COPB1TUSC5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TTYH2 可形成同源二聚體。依相似性推論,在 Ca(+2) 存在時形成 cis 同源二聚體;缺乏 Ca(2+) 時則可呈單體或形成 trans 二聚體。另有資料記載 TTYH2 與 NEDD4L 交互作用;其胞質端 PY-motif 被註明可介導此交互作用。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TTYH2 被描述為不依賴鈣離子、受細胞腫脹調節的陰離子通道,可能透過氯離子及 glutamate 等物質外流,參與腦部調節性體積減少。另有資料指出它可能是大電導、受 Ca(2+) 活化的氯離子通道;相關描述包含相似性推論與可能性限制。含實驗來源
證據與來源

Calcium-independent, swelling-dependent volume-regulated anion channel (VRAC-swell) which plays a pivotal role in the process of regulatory volume decrease (RVD) in the brain through the efflux of anions like chloride and organic osmolytes like glutamate (By similarity). Probable large-conductance Ca(2+)-activated chloride channel

PMID 15010458 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性chloride(in) = chloride(out)含實驗來源
證據與來源

chloride(in) = chloride(out)

PMID 15010458 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-glutamate(out) = L-glutamate(in)推論支持
證據與來源

L-glutamate(out) = L-glutamate(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TTYH2 可形成同源二聚體;依相似性推論,Ca(+2) 存在時形成 cis 同源二聚體,缺乏 Ca(2+) 時可呈單體或形成 trans 二聚體。另有資料記載其與 NEDD4L 交互作用。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Forms cis-homodimers in the presence of Ca(+2) and forms monomers and trans-dimers in the absence of Ca(2+) (By similarity). Interacts with NEDD4L

PMID 18577513 ↗ · PMID 34385445 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TTYH2 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 18260827 ↗ · PMID 18577513 ↗ · PMID 34385445 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000269346 · 3,433 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGCACTCGGGCCGAGCCATGCAGGCGGCGCGCGTGGACTA40
41CATCGCTCCCTGGTGGGTCGTGTGGCTGCACAGCGTCCCG80
81CACGTCGGCCTGCGCCTGCAGCCCGTGAACAGCACCTTCA120
121GCCCCGGCGACGAGAGTTACCAGGAGTCGCTGCTGTTCCT160
161GGGGCTGGTGGCCGCCGTCTGCCTGGGCCTGAACCTCATC200
201TTCCTTGTGGCTTACCTGGTCTGTGCATGCCACTGCCGGC240
241GGGACGATGCGGTGCAGACCAAGCAGCACCACTCCTGCTG280
281CATCACCTGGACGGCCGTGGTGGCCGGGCTCATCTGCTGT320
321GCTGCGGTGGGCGTTGGTTTCTATGGAAACAGCGAGACCA360
361ACGATGGGGCGTACCAGCTGATGTACTCCTTGGACGATGC400
401CAACCACACCTTCTCTGGGATCGATGCTCTGGTTTCCGGA440
441ACTACCCAGAAGATGAAGGTGGACCTAGAGCAGCACCTGG480
481CCCGGCTCAGTGAGATCTTTGCTGCCCGGGGCGATTACCT520
521GCAGACCCTGAAGTTCATACAGCAGATGGCGGGCAGCGTT560
561GTTGTTCAGCTCTCAGGACTGCCCGTGTGGAGGGAGGTCA600
601CCATGGAGCTGACCAAGCTATCCGACCAGACTGGCTACGT640
641GGAGTACTACAGGTGGCTCTCCTACCTCCTGCTCTTTATC680
681CTGGACCTGGTCATCTGCCTCATTGCCTGCCTGGGACTGG720
721CCAAGCGCTCCAAGTGTCTCCTGGCCTCGATGCTGTGCTG760
761TGGGGCACTGAGCCTGCTCCTCAGTTGGGCATCCCTGGCC800
801GCTGATGGCTCTGCGGCAGTGGCCACCAGTGACTTCTGTG840
841TGGCTCCTGACACCTTCATCCTGAACGTCACGGAGGGCCA880
881GATCAGCACAGAGGTGACTCGCTACTACCTGTATTGCAGC920
921CAGAGTGGAAGCAGCCCCTTCCAGCAGACCCTGACCACCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。