演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TTYH1

tweety family member 1

TTYH1 是 tweety family member 1,與細胞腫脹活化的陰離子通道功能相關,可能參與細胞體積調節;在腦部的調節性體積減少過程中,涉及氯離子與 glutamate 外流。

Homo sapiens19q13.42UniProt Q9H313
OFFICIAL SYMBOL
TTYH1
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9H313
PDB / ALPHAFOLD
7P5J
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TTYH1(tweety family member 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 tweety family。來源將其描述為與細胞腫脹相關的陰離子通道,並指出它不依賴 Ca(2+);其活化與細胞體積調節可能有關。TTYH1 蛋白具有多次穿膜的結構,包含五段跨膜區域,並有位於膜外側及細胞質側的區段。這些資料建立了它作為膜蛋白及通道相關蛋白的基本特徵;更具體的離子與溶質通量,以及其在腦部體積調節中的角色,見功能說明。

Official symbol
TTYH1
Gene name
tweety family member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13476
UniProt
Q9H313
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.42
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25TTYH1pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:54,415,219–54,436,904
Gene span
21,686 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000376530 ★54,415,464–54,436,90414
ENST0000042352954,415,219–54,422,2555
ENST0000030119454,415,428–54,436,90014
ENST0000037653154,415,428–54,436,90413
ENST0000089395454,415,428–54,436,90413
ENST0000089395554,415,428–54,436,71912
ENST0000089395654,415,428–54,436,71915
ENST0000089395754,415,428–54,436,71615
ENST0000099032654,415,428–54,436,90414
ENST0000099032754,415,428–54,436,90413
ENST0000105272854,415,428–54,436,72013
ENST0000105273054,415,428–54,436,71814

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TTYH1 被描述為不依賴 Ca(2+) 的陰離子通道,其活性與細胞腫脹相關。來源指出,它可能參與細胞體積調節;因此,對這項作用的表述仍應保留「可能」的程度,不能視為已確立的細胞體積調節機制。

在腦部,TTYH1 被描述為腫脹依賴型、受體積調節的陰離子通道(VRAC-swell),並在調節性體積減少(RVD)過程中扮演重要角色。該過程涉及陰離子及有機滲透物由細胞外流,包括氯離子與 glutamate。這些溶質外流與細胞腫脹後的體積調節相連,但來源未進一步交代其具體調控步驟或不同細胞情境下的作用差異。

功能註記亦列出氯離子外流及 L-glutamate 外流。這些通量資訊支持 TTYH1 與陰離子及有機溶質跨膜移動相關;其中腦部 RVD 的描述明確連結到氯離子和 glutamate 外流。現有資料未提供更多生理條件或實驗細節,因此不延伸推定其對其他生物過程的影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 54415464 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TTYH1 ENST00000376530 GRCh38 chr19:54414464-54415564 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATGGGTTAAGTGGAGAACTAATCTCCCTTTCTTCCACTCATCCCAATTCCCACAAGAGAGGCCACGTGT
GTGGTTTCCAGATGGCAAAGTCTCACCCTGCCCTACAGCAAGAGGGGACCCCTGGGGCCAGATTCCTGAG
CACCTAGTTTTGGCTGCAATAGTGACAGTCTGGGTGATGATGTCAGGGTGGCCAGGTCCCCTCCCAGGGT
TGGCACTTCCCCATCTATCGGTGTGGCATCGGAGGATTCCAGTGAGATGTAACATGGGGAGTGGCTGGAA
AAATACTCTGTAACTGTATGGCGAATGCCAAGGGGCAGGGGTCCTTGTATACACCGAAGTAATCCCGAGT
CAGTTTACAGGATGGGAAGGGCCCCTATATAGATGACCAGGGTCCTTATGCAGGTAGAAGGGGTCCTTAT
GCAGCATGAAGGCTTGCTACACAGGCGTGTGGATTTTTCCATACATTCTGGAGTAGCCTCTACACATAGG
AGTGTTTGTGCTTAGAAGCTGTGTCCTTATGCAGGCTAGGAATAAAAGTGGGACGGAGATTTTACACAAA
TACGGGCATCTTTTACAGGTGGGAGCACTTTCGTACACAGAGGACTTCTTATCCATGGAATTGGCCGTTC
TTTGTAAAACGCTCTGTACTTACTAGCAACCTTTACACAGACATGAAGTTTCTCCATAAGGATAAAGGGA
TCATTATGTTTTAGGTGAAATAACAGTATGAGTGGCCTCGTATGGACAAGGAGGGCTGATTTCAATCGCG
ATGCAAGCCAGCTGTCCGGATGCCGCCGACGCCAGCAGCGCGGTACCTGCGCGGGCAGCAGGTGGGAGCC
GCGACCGGGGTGGGGCGCGGAGCGCTGGGGGCCTCCCGACTCCCGCAGTCCCCGCCGCGACCACCAGGGG
CAGCACCGTCCCCGCCCGGCCCGCGCCTCCCTCCCCCCAATCTCCGCCCCCCACCCCCTGCCTCCCCCCC
GCTCCCGCTCCCCTGAGCCCAGCCAGACCCCGCGCCGCCCGCGCCCCGCTCGACTCCGGAGGCTCCCGCA
GCCCCGGCGTCCGCCCCGCTGCCCCCTCCCCCGGGGGCCATGGGGGCGCCC
TTYH1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TTYH1_2 ↗19:54,415,468正股54,415,419–54,415,478
TTYH1_1 ↗19:54,436,101正股54,436,052–54,436,111

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BDRKK · promoter · 54414967–54415536 · regulatory

ENSR19_5GRKH2 · CTCF_binding_site · 54415360–54415381 · regulatory

ENSR19_BDRL2 · enhancer · 54417900–54418852 · regulatory

ENSR19_C7DRN · enhancer · 54419998–54421820 · regulatory

· motif · 54414346–54414359 · motif

· motif · 54414346–54414359 · motif

· motif · 54415362–54415378 · motif

· motif · 54418192–54418204 · motif

· motif · 54420388–54420398 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:450 aa

1 aa450 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9H313 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TTYH1 蛋白長 450 個胺基酸,屬於 tweety family。序列註解指出其具有五段螺旋型跨膜區域,膜外側區段與細胞質側區段交錯排列;C 端另有一段被註記為無序區域。此拓撲資訊描述的是蛋白質結構特徵,來源未將該無序區域指定為特定功能區。

拓樸區域Extracellular1–43 aa
跨膜區Helical; Name=144–64 aa
拓樸區域Cytoplasmic65–88 aa
跨膜區Helical; Name=289–109 aa
拓樸區域Extracellular110–214 aa
跨膜區Helical; Name=3215–235 aa
拓樸區域Cytoplasmic236–240 aa
跨膜區Helical; Name=4241–261 aa
拓樸區域Extracellular262–390 aa
跨膜區Helical; Name=5391–411 aa
拓樸區域Cytoplasmic412–450 aa
功能區域Disordered428–450 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7P5J…

PDB · 7P5J

EM · 4.00 A · A/B=2-450

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

TTYH1 被註記為細胞膜上的多次穿膜蛋白。 來源未提供定位改變的條件、異構型差異或動態變化資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TTYH1TTYH1GPR37LAMP2PRPF40ASH3GLB1TMEM60
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TTYH1 有同源寡聚體的註記:依序列相似性資料,描述為以二硫鍵連結的同源四聚體;另有文獻資料記載同源二聚體。這些資訊分別呈現不同的組成形式,來源未說明兩者之間的條件或關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TTYH1 被描述為不依賴 Ca(2+)、受細胞腫脹影響的體積調節陰離子通道(VRAC-swell)。它在腦部調節性體積減少(RVD)過程中具有重要作用,涉及氯離子等陰離子及 glutamate 等有機滲透物外流。推論支持
證據與來源

Calcium-independent, swelling-dependent volume-regulated anion channel (VRAC-swell) which plays a pivotal role in the process of regulatory volume decrease (RVD) in the brain through the efflux of anions like chloride and organic osmolytes like glutamate

開啟資料庫紀錄 ↗

功能TTYH1 被描述為不依賴 Ca(2+)、由細胞腫脹活化的氯離子通道;它可能參與細胞體積調節。來源以可能性表述此項作用,未將其描述為已確立的調節機制。含實驗來源
證據與來源

Ca(2+)-independent, swelling-activated chloride channel, possibly involved in regulation of cell volume

PMID 15010458 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性chloride(in) = chloride(out)含實驗來源
證據與來源

chloride(in) = chloride(out)

PMID 15010458 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-glutamate(out) = L-glutamate(in)推論支持
證據與來源

L-glutamate(out) = L-glutamate(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TTYH1 的組成形式有兩項註記:依序列相似性,描述為以二硫鍵連結的同源四聚體;另有文獻記載同源二聚體。來源沒有說明兩種形式的形成條件或彼此關係。含實驗來源
證據與來源

Homotetramer; disulfide-linked (By similarity). Homodimer

PMID 34385445 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TTYH1 被註記為細胞膜上的多次穿膜蛋白。此定位資訊未描述定位改變的條件、不同異構型間的差異或蛋白質在細胞內的動態變化。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 34385445 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000376530 · 2,056 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCCAGACCCCGCGCCGCCCGCGCCCCGCTCGACTCCGGA40
41GGCTCCCGCAGCCCCGGCGTCCGCCCCGCTGCCCCCTCCC80
81CCGGGGGCCATGGGGGCGCCCCCGGGCTACCGGCCCTCAG120
121CTTGGGTGCATCTCCTCCACCAGCTGCCCCGCGCCGACTT160
161CCAGCTCCGCCCGGTGCCCAGCGTTTTCGCGCCCCAAGAG200
201CAGGAATACCAGCAGGCCTTGTTGCTGGTGGCGGCCTTGG240
241CGGGCCTGGGCTTGGGCCTGAGCCTCATTTTCATCGCTGT280
281CTACCTCATCCGCTTCTGCTGCTGCCGGCCCCCCGAGCCC320
321CCCGGGTCCAAGATCCCCTCGCCCGGGGGAGGCTGCGTCA360
361CCTGGAGCTGCATTGTCGCCCTTCTCGCCGGCTGCACTGG400
401CATTGGCATCGGTTTCTATGGCAACAGTGAGACCAGTGAT440
441GGGGTGTCCCAGCTCAGCTCTGCGCTGCTGCACGCCAACC480
481ACACACTCAGCACCATTGACCACCTGGTGTTGGAGACGGT520
521GGAGAGGCTGGGCGAGGCGGTGAGGACAGAGCTGACCACC560
561CTGGAGGAGGTGCTCGAGCCGCGCACGGAGCTGGTGGCTG600
601CCGCCCGAGGGGCTCGACGGCAGGCGGAGGCTGCGGCCCA640
641GCAGCTGCAGGGGCTGGCCTTCTGGCAGGGAGTGCCCCTG680
681AGCCCCCTGCAGGTGGCTGAAAATGTGTCCTTTGTGGAGG720
721AGTACAGGTGGCTGGCCTACGTCCTCCTGCTGCTCCTGGA760
761GCTGCTGGTCTGCCTCTTCACCCTCCTGGGCCTGGCGAAG800
801CAGAGCAAGTGGCTGGTGATCGTGATGACAGTCATGAGTC840
841TCCTGGTTCTCGTCCTGAGCTGGGGCTCCATGGGCCTGGA880
881GGCAGCCACGGCCGTGGGCCTCAGTGACTTCTGCTCCAAT920
921CCAGACCCTTATGTTCTGAACCTGACCCAGGAGGAGACAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。