演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TTPAAVED

alpha tocopherol transfer protein

TTPA 編碼 alpha tocopherol transfer protein,參與 alpha-tocopherol 在膜間的轉移及其由肝細胞釋出;相關基因變異可造成維生素 E 缺乏性共濟失調。

Homo sapiens8q12.3UniProt P49638
OFFICIAL SYMBOL
TTPA
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P49638
PDB / ALPHAFOLD
1OIP
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TTPA 是蛋白質編碼基因,產物為 alpha tocopherol transfer protein。此蛋白質含有 CRAL-TRIO 結構域,並具有一段短的無序區域;來源所列的蛋白質全長為 278 個胺基酸。其基本角色與 alpha-tocopherol 的膜間移動及肝細胞釋出有關,並能與特定磷脂醯肌醇磷酸結合。這些特性將 TTPA 定位為參與 alpha-tocopherol 處理的蛋白質。

Official symbol
TTPA
Gene name
alpha tocopherol transfer protein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12404
UniProt
P49638
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
AVED

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q12.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegTTPApq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:63,048,139–63,086,197
Gene span
38,059 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000260116 ★63,059,488–63,086,0535
ENST0000087869263,058,412–63,086,1973
ENST0000087869363,058,412–63,086,1972
ENST0000087869463,058,412–63,086,1975
ENST0000087869563,058,412–63,086,1974
ENST0000087869663,058,412–63,086,1976
ENST0000087869763,058,412–63,086,1974
ENST0000113911363,058,412–63,086,1975
ENST0000099584563,059,811–63,086,1975
ENST0000099584863,059,811–63,086,1973
ENST0000099585563,059,811–63,086,1975

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

alpha tocopherol transfer protein 可結合 alpha-tocopherol,並增進這種分子在彼此分離的膜之間轉移;來源亦指出,此蛋白質會促進 alpha-tocopherol 從肝細胞釋出。這些作用描述了蛋白質與 alpha-tocopherol 的結合,以及其促進膜間轉移和肝細胞釋出的功能。

此蛋白質也能結合 phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate 與 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate。根據相似性推定,結合這些磷脂後會引發構形改變,而此改變對已結合的 alpha-tocopherol 釋出具有重要作用。來源並未將此推定性機制描述為已直接證實,因此其證據性質應與 alpha-tocopherol 結合、膜間轉移及肝細胞釋出的實驗資料區分。

綜合來源所述,TTPA 的功能涉及 alpha-tocopherol 的結合、跨膜間轉移與釋出,而磷脂結合所伴隨的構形變化可能參與調節已結合分子的釋出。這些資料指出 TTPA 對 alpha-tocopherol 的移動與從肝細胞釋出具有直接作用,但沒有提供更廣泛的生理調控途徑或其他下游機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 63086053 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TTPA ENST00000260116 GRCh38 chr8:63085953-63087053 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTTCCACATTATTTCCCTACTTCATCTTCATTCCCCAGGCTTTCATAGACTCAATCATATAACAGCTTT
GGACTGTCCATTTTAGCGAGTAGACATGCTTAAAGTTTAGTGATGGTGGAGTGTAACAGAGTAAGTTTAT
GGTGCTAAAAATATATGGAGGCCAGTCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAAAACTTTGGGAGGCCCAG
GCGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTGGAGGCTGCTGTGAGCCTTGATCAGACTGCTGCACTCCAGCC
TGGGCGACAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAGTAAATAATAAATTAATAAAAAATATAAATATATAAATA
TTGGTGCGGAAGGGGGTCAGGGTACGCGCTAGTCATTTATTTGTGTCAGTAACAGGGGCCGGTGCCAGGA
TTAGAGAAGTTTTCCCGAATCGGGAGGAAGGGAGAAAAGCGGTGAGGCTGCCAAGGAGGCATTATGGAAT
GCGTGTTTTAGAATGCATGCTGTAATCCAGTGCGAGGCGAGGGGTCATCAGTCTGGAATCTGATGGAAGG
AGAAGGGAGAGGGCTCAGTAGCGCGTCGGCCACTGGCCATTAAAGGCTCGTTCTAAGGCTCCTTTCAGCT
CCAAGATTGCAAGAAGGAAGGAAGAATGGAAGGAAGAGAGAGGGAGGAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAAGA
TTCTCTAGTAGATCGTAAAAATCATCCCAACTAACTTTGACATCGTTTCCTCGGTGTTTGAACATCAGTG
GCTTCCCTCGCTGGGAAAAAGCTGGGGTCCCTAACTAAAGCTGCTAAACAGGTGGCTAGCACCCGTGGGG
ACACTGTGCGGTTTCCTTTAAGAGGCAGCTCTGCTCGCCGCGGGTCCGGCGTGCGAGGCCGGAGACCGCC
CTGCCAGGCTGGAGAGTGGTTGTGCGACGGGCAGCGGCCGCAGAGGCGGGGCCGAGGGTGGCGCGGGGCG
CGCGCTTTTCCCGGGTGCCCGGGTAGCTGCGGCCGCAGCAGCGGCGGCGGGCATGGCAGAGGCGCGATCC
CAGCCCTCGGCGGGGCCGCAGCTCAACGCGCTACCGGACCACTCTCCGTTG
TTPA 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TTPA_1 ↗8:63,086,039負股63,086,029–63,086,088

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_9X345 · promoter · 63086043–63086543 · regulatory

ENSR8_5JSMX4 · CTCF_binding_site · 63090153–63090174 · regulatory

· motif · 63084176–63084190 · motif

· motif · 63084449–63084464 · motif

· motif · 63085414–63085423 · motif

· motif · 63085414–63085423 · motif

· motif · 63086219–63086235 · motif

· motif · 63086219–63086235 · motif

· motif · 63090155–63090171 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:278 aa

1 aa278 aa結構域功能區域
依 P49638 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

來源所列 alpha tocopherol transfer protein 全長為 278 個胺基酸。第 88 至 253 位胺基酸區段註解為 CRAL-TRIO 結構域;第 1 至 20 位胺基酸則標示為無序區域。

結構域CRAL-TRIO88–253 aa
功能區域Disordered1–20 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1OIP…

PDB · 1OIP

X-ray · 1.95 A · A=1-278

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

alpha tocopherol transfer protein 的定位註解為細胞質。 來源未提供其他定位位置或定位隨條件改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 42 個夥伴 · 最多顯示 50 個
AVEDTTPAAGTRAPAPOA5APOC2ARFIP2ARMC12BIRC7CISD2CMTM4CMTM5COQ3CYSRT1DGAT2L6DHODHFADS6FAM114A2FAM25AFGF14FKBP7GOLGA2HSD17B11JOSD2KRTAP10-7KRTAP12-2KRTAP12-3KRTAP2-4LEUTXMAL2MRM1NDUFA7NOTCH2NLCPEX12REEP2RPRMSAR1ASCAMP1SCAMP5SDR16C5SH3GLB1SLC35E3SYNGR3THAP4TPD52
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 42 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

alpha tocopherol transfer protein 可呈單體或同源四聚體。根據相似性推定,phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 結合會促進同源四聚體形成;phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate 誘導四聚化的效率較低。這些資料描述寡聚狀態與磷脂結合的關係,未列出其他蛋白質結合夥伴。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TTPA 基因變異會造成維生素 E 缺乏性共濟失調(AVED),此病為自體隱性遺傳。患者血漿維生素 E 濃度可能測不到或顯著降低,並可出現脊髓小腦退化、共濟失調、反射消失及本體感覺喪失。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能alpha tocopherol transfer protein 可結合 alpha-tocopherol,促進其在彼此分離的膜之間轉移,並刺激 alpha-tocopherol 從肝細胞釋出。它也能結合 phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate 與 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate;根據相似性推定,這些結合造成的構形改變對已結合 alpha-tocopherol 的釋出很重要。含實驗來源
證據與來源

Binds alpha-tocopherol, enhances its transfer between separate membranes, and stimulates its release from liver cells. Binds both phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate and phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate; the resulting conformation change is important for the release of the bound alpha-tocopherol (By similarity)

PMID 7887897 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用alpha tocopherol transfer protein 可呈單體或同源四聚體。根據相似性推定,phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 結合會誘導同源四聚體形成;phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate 誘導四聚化的效率較低。推論支持
證據與來源

Monomer and homotetramer. Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate binding induces the formation of homotetramers. Phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate is less efficient in inducing tetramerization (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位alpha tocopherol transfer protein 定位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 7887897 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯維生素 E 缺乏性共濟失調(AVED)是一種自體隱性遺傳疾病,特徵包括血漿維生素 E 濃度測不到或顯著降低、脊髓小腦退化、共濟失調、反射消失及本體感覺喪失。影響此條目所代表基因的變異會造成此病。含實驗來源
證據與來源

Ataxia with vitamin E deficiency AVED An autosomal recessive disease characterized by undetectable or markedly reduced plasma levels of vitamin E, spinocerebellar degeneration, ataxia, areflexia and proprioception loss. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 277460

PMID 15065857 ↗ · PMID 15300460 ↗ · PMID 7566022 ↗ · PMID 8602747 ↗ · PMID 9463307 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000260116 · 2,633 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGTAGCTGCGGCCGCAGCAGCGGCGGCGGGCATGGCAGA40
41GGCGCGATCCCAGCCCTCGGCGGGGCCGCAGCTCAACGCG80
81CTACCGGACCACTCTCCGTTGCTGCAGCCGGGCCTGGCGG120
121CGCTGCGGCGCCGGGCCCGGGAAGCTGGCGTCCCGCTCGC160
161GCCGCTGCCGCTCACCGACTCCTTCCTGCTGCGGTTCCTG200
201CGCGCCCGGGATTTCGATCTGGACCTGGCCTGGCGGTTAC240
241TAAAAAACTATTATAAGTGGAGAGCAGAATGTCCAGAAAT280
281AAGTGCAGATCTACACCCTAGAAGTATTATTGGCCTCCTA320
321AAGGCTGGCTACCATGGAGTCCTGAGATCCAGGGATCCCA360
361CTGGCAGCAAAGTTCTTATTTACAGAATCGCACACTGGGA400
401CCCCAAAGTTTTTACAGCTTATGACGTATTTCGAGTAAGT440
441CTAATCACATCCGAGCTTATTGTACAGGAGGTAGAAACTC480
481AGCGGAATGGAATCAAGGCTATCTTTGATCTGGAAGGTTG520
521GCAGTTTTCTCATGCTTTTCAAATCACTCCATCCGTAGCC560
561AAGAAGATTGCTGCTGTACTTACGGATTCATTTCCATTGA600
601AAGTTCGTGGCATCCATTTGATAAATGAACCAGTAATTTT640
641CCATGCTGTCTTTTCCATGATCAAACCATTCCTGACTGAA680
681AAAATTAAGGAACGGATTCACATGCATGGGAACAACTACA720
721AACAAAGCTTGCTTCAGCATTTCCCAGACATTCTTCCTCT760
761GGAATATGGTGGTGAAGAATTCTCCATGGAGGACATTTGT800
801CAGGAATGGACAAATTTTATAATGAAGTCTGAAGATTATC840
841TCAGCAGCATTTCTGAGAGCATTCAATGAGAAGTTATGTC880
881ATGTGAATGGCTTCCTAACTAAAAATACATGAGTGATATC920
921CAACCTGGTTAAATGAATGAAAGAAAAGGAGCAAATCTTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。