演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TTKPYT

TTK protein kinase

TTK protein kinase 是由 TTK 編碼的蛋白質激酶,參與有絲分裂紡錘體組裝檢查點訊號及染色體與紡錘體微管連接的調節。

Homo sapiens6q14.1UniProt P33981
OFFICIAL SYMBOL
TTK
CHROMOSOME
6
UNIPROT
P33981
PDB / ALPHAFOLD
6GVJ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TTK 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 TTK protein kinase。其產物屬於 protein kinase 超家族中的 Ser/Thr protein kinase 家族,並具有蛋白質激酶結構域。來源描述的主要角色與有絲分裂紡錘體組裝檢查點訊號,以及修復不正確的動粒—紡錘體微管連接有關;這些功能使 TTK 與細胞分裂期間的染色體排列及檢查點調控相連。其具體磷酸化作用與相關分子過程見功能說明。

Official symbol
TTK
Gene name
TTK protein kinase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12401
UniProt
P33981
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PYTMPS1MPS1L1CT96MPH1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q14.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegTTKpq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:80,003,887–80,043,580
Gene span
39,694 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000369798 ★80,004,649–80,042,52722
ENST0000050989480,003,887–80,043,58022
ENST0000023051080,003,887–80,043,58022
ENST0000086761280,003,887–80,043,58022
ENST0000093624480,003,887–80,043,58022
ENST0000093624680,003,887–80,043,58022
ENST0000093624780,003,887–80,043,58022
ENST0000093624880,003,887–80,043,58022
ENST0000093624980,003,887–80,043,58020
ENST0000114045680,003,887–80,043,58022
ENST0000093624580,004,616–80,043,58022
ENST0000050258080,004,710–80,008,4404

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TTK 參與有絲分裂紡錘體組裝檢查點訊號。此檢查點會延遲後期開始,直到染色體在紡錘體上完成雙向定向;TTK 也參與修復不正確的動粒—紡錘體微管連接。透過這些作用,TTK 涉及細胞分裂時對染色體與紡錘體連接狀態的監控及調整。

TTK 可磷酸化 MAD1L1,促進有絲分裂紡錘體組裝檢查點。它也磷酸化 CDCA8/Borealin,使動粒處的 AURKB 活性增強。這些反應將 TTK 的激酶作用連結至檢查點訊號及動粒上的調控活動。

在連接修復方面,TTK 磷酸化 SKA3 的 Ser-34,促使 SKA complex 從微管解離,並使微管—動粒連接不穩定。來源另指出 TTK 可磷酸化 KNL1、KNTC1,並可自體磷酸化。這些磷酸化作用與不正確連接的調整相關,但來源未進一步界定各作用的先後關係。

TTK 也會磷酸化 MCRS1,進而增強 KIF2A 被募集至紡錘體微管負端,並促進染色體排列。整體來說,來源所述的作用涵蓋檢查點訊號、動粒微管連接的調節,以及染色體排列;這些過程共同關聯於有絲分裂期間染色體與紡錘體之間的協調。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 80004649 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TTK ENST00000369798 GRCh38 chr6:80003649-80004749 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGACACAGAAAGATGCATTAAGTGATTGAGAAGGGCTCTCACGCTAGCTGGGTGGCTATCCAGAGCTGG
GAATGTGAGGGTTCTAAGGATAGCTTTGGAGTTAACAAGTGACAGCTGCAGTTAGTTTCCTATACATACA
CAAAACCAACCCGTCCTACCACAGAATATATGTCATAATGCTGGCACAACAGACACATCCCTTTTAGTTT
TGCAGACGAGGAGTAACCGTTGCCCTGGACCACAAAGCCACTTAGCGGCAGAGCCTCGCACCCGCGAAGA
TTATTACTAGGGAGATGTTTTTACCCCTGAGGACACCTGAGCCCTTAAGTGGGGCAGGCTTCGAGGGAGG
GGGGCCGATAAGGCGACTTCAGACAGGGCAATCACGATGGGCGCTTGAGTTCTGCGCAGAATTTTGACAA
GGGGGAGGGTCTTGGCTTGAAGACAGAGCGTGGAGTCATTTAAGGATAATGGAAGGGCATAAGCAGAAGC
TCAAGGATAAAAAGCACTGAAATTCTTGAGCTGGCGGCAGGGCTGAACGTAGCTCAGTGAAAGATCCTTT
CTTGCCACATCCTCTCTAAGCCAGGCTGTGAGAACCGCGGGAAACGAAGGAGAAGGGTGGCGGTGGGGTC
AGTAAAGGGCCGGCCCAAGGTGCATCTTTTAGGTCCTGATGCTAGGAGCAGCCGTCCCTGCCCCTATATT
CCTCTCACTGGGTAGGTTTGCTCGGGAGTGGCTACCTCCCAGGCAAAAATTCGGCCTGGTTAAACTGGAA
AGACCAGGAAAGCCCGCCCACGGGCGTCCGGGGAACGCCTGCAAAGTGCCAGCACCCTACCAACCCAGGC
GCCGCACGGGTGGGGTCGCGGCCGCAGGCTCTTCCGGGGCGGGCCTAGCCTGACGCAGGAGGAGGGGCGG
CCCCCGTCGCACAAGAACCAATCACGACTGTCGCTTCTACGTGGCTAGCATTGACCAATAGGAGACCGTA
GTGATAGCGACGGGGAAATTCAAACGTGTTTGCGGAAAGGAGTTTGGGTTCCATCTTTTCATTTCCCCAG
CGCAGCTTTCTGTAGGTAAGTTCTGTCTTACCGGTGCACCGGCGCACTGAG
TTK 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TTK_1 ↗6:80,004,650正股80,004,601–80,004,660

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_BKTNL · promoter · 80003466–80004157 · regulatory

ENSR6_936QDF · promoter · 80004159–80004659 · regulatory

ENSR6_BKTNR · enhancer · 80004660–80005323 · regulatory

· motif · 80001520–80001531 · motif

· motif · 80003452–80003465 · motif

· motif · 80003452–80003465 · motif

· motif · 80004240–80004257 · motif

· motif · 80004273–80004280 · motif

· motif · 80004429–80004439 · motif

· motif · 80004546–80004556 · motif

· motif · 80004797–80004807 · motif

· motif · 80004859–80004869 · motif

· motif · 80004920–80004931 · motif

· motif · 80005594–80005607 · motif

· motif · 80005594–80005607 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:857 aa

1 aa857 aa結構域功能區域
依 P33981 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TTK protein kinase 長 857 個胺基酸,屬於 protein kinase 超家族中的 Ser/Thr protein kinase 家族。其 protein kinase 結構域位於第 525–791 個胺基酸。來源另將第 371–410 與第 836–857 個胺基酸區段註記為無序區。

結構域Protein kinase525–791 aa
功能區域Disordered371–410 aa
功能區域Disordered836–857 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6GVJ…

PDB · 6GVJ

X-ray · 2.41 A · A=400-808

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PYTTTKNDC80NUF2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TTK 與 TPR 有實體交互作用,且此交互作用不依賴微管。來源也記載 TTK 與 MAD1L1、MAD2L1 交互作用;未提供這些交互作用是否形成特定複合體的進一步資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TTK 參與有絲分裂紡錘體組裝檢查點訊號,該檢查點會在染色體於紡錘體上完成雙向定向前延遲後期;TTK 也參與修復不正確的動粒—紡錘體微管連接。它可磷酸化 MAD1L1、CDCA8/Borealin、SKA3、KNL1、KNTC1 與 MCRS1,並能自體磷酸化。相關結果包括增強動粒處 AURKB 活性、促使 SKA complex 從微管解離,以及促進染色體排列。含實驗來源
證據與來源

Involved in mitotic spindle assembly checkpoint signaling, a process that delays anaphase until chromosomes are bioriented on the spindle, and in the repair of incorrect mitotic kinetochore-spindle microtubule attachments. Phosphorylates MAD1L1 to promote the mitotic spindle assembly checkpoint. Phosphorylates CDCA8/Borealin leading to enhanced AURKB activity at the kinetochore. Phosphorylates SKA3 at 'Ser-34' leading to dissociation of the SKA complex from microtubules and destabilization of microtubule-kinetochore attachments. Phosphorylates KNL1, KNTC1 and autophosphorylates. Phosphorylates MCRS1 which enhances recruitment of KIF2A to the minus end of spindle microtubules and promotes chromosome alignment

PMID 18243099 ↗ · PMID 28441529 ↗ · PMID 29162720 ↗ · PMID 30785839 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 30785839 ↗ · PMID 29162720 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)推論支持
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 29162720 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+)推論支持
證據與來源

L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 29162720 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TTK 與 TPR 交互作用,且此交互作用不依賴微管;來源另記載 TTK 與 MAD1L1 及 MAD2L1 交互作用。資料未進一步說明後兩者交互作用的條件,也未指出這些分子是否共同形成特定複合體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TPR; the interactions occurs in a microtubule-independent manner. Interacts with MAD1L1 and MAD2L1

PMID 19273613 ↗ · PMID 29162720 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000369798 · 2,966 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CAAACGTGTTTGCGGAAAGGAGTTTGGGTTCCATCTTTTC40
41ATTTCCCCAGCGCAGCTTTCTGTAGAAATGGAATCCGAGG80
81ATTTAAGTGGCAGAGAATTGACAATTGATTCCATAATGAA120
121CAAAGTGAGAGACATTAAAAATAAGTTTAAAAATGAAGAC160
161CTTACTGATGAACTAAGCTTGAATAAAATTTCTGCTGATA200
201CTACAGATAACTCGGGAACTGTTAACCAAATTATGATGAT240
241GGCAAACAACCCAGAGGACTGGTTGAGTTTGTTGCTCAAA280
281CTAGAGAAAAACAGTGTTCCGCTAAGTGATGCTCTTTTAA320
321ATAAATTGATTGGTCGTTACAGTCAAGCAATTGAAGCGCT360
361TCCCCCAGATAAATATGGCCAAAATGAGAGTTTTGCTAGA400
401ATTCAAGTGAGATTTGCTGAATTAAAAGCTATTCAAGAGC440
441CAGATGATGCACGTGACTACTTTCAAATGGCCAGAGCAAA480
481CTGCAAGAAATTTGCTTTTGTTCATATATCTTTTGCACAA520
521TTTGAACTGTCACAAGGTAATGTCAAAAAAAGTAAACAAC560
561TTCTTCAAAAAGCTGTAGAACGTGGAGCAGTACCACTAGA600
601AATGCTGGAAATTGCCCTGCGGAATTTAAACCTCCAAAAA640
641AAGCAGCTGCTTTCAGAGGAGGAAAAGAAGAATTTATCAG680
681CATCTACGGTATTAACTGCCCAAGAATCATTTTCCGGTTC720
721ACTTGGGCATTTACAGAATAGGAACAACAGTTGTGATTCC760
761AGAGGACAGACTACTAAAGCCAGGTTTTTATATGGAGAGA800
801ACATGCCACCACAAGATGCAGAAATAGGTTACCGGAATTC840
841ATTGAGACAAACTAACAAAACTAAACAGTCATGCCCATTT880
881GGAAGAGTCCCAGTTAACCTTCTAAATAGCCCAGATTGTG920
921ATGTGAAGACAGATGATTCAGTTGTACCTTGTTTTATGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。