基因總覽
TTK 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 TTK protein kinase。其產物屬於 protein kinase 超家族中的 Ser/Thr protein kinase 家族,並具有蛋白質激酶結構域。來源描述的主要角色與有絲分裂紡錘體組裝檢查點訊號,以及修復不正確的動粒—紡錘體微管連接有關;這些功能使 TTK 與細胞分裂期間的染色體排列及檢查點調控相連。其具體磷酸化作用與相關分子過程見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369798 ★ | 80,004,649–80,042,527 | 22 |
| ENST00000509894 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000230510 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000867612 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000936244 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000936246 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000936247 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000936248 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000936249 | 80,003,887–80,043,580 | 20 |
| ENST00001140456 | 80,003,887–80,043,580 | 22 |
| ENST00000936245 | 80,004,616–80,043,580 | 22 |
| ENST00000502580 | 80,004,710–80,008,440 | 4 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TTK 參與有絲分裂紡錘體組裝檢查點訊號。此檢查點會延遲後期開始,直到染色體在紡錘體上完成雙向定向;TTK 也參與修復不正確的動粒—紡錘體微管連接。透過這些作用,TTK 涉及細胞分裂時對染色體與紡錘體連接狀態的監控及調整。
TTK 可磷酸化 MAD1L1,促進有絲分裂紡錘體組裝檢查點。它也磷酸化 CDCA8/Borealin,使動粒處的 AURKB 活性增強。這些反應將 TTK 的激酶作用連結至檢查點訊號及動粒上的調控活動。
在連接修復方面,TTK 磷酸化 SKA3 的 Ser-34,促使 SKA complex 從微管解離,並使微管—動粒連接不穩定。來源另指出 TTK 可磷酸化 KNL1、KNTC1,並可自體磷酸化。這些磷酸化作用與不正確連接的調整相關,但來源未進一步界定各作用的先後關係。
TTK 也會磷酸化 MCRS1,進而增強 KIF2A 被募集至紡錘體微管負端,並促進染色體排列。整體來說,來源所述的作用涵蓋檢查點訊號、動粒微管連接的調節,以及染色體排列;這些過程共同關聯於有絲分裂期間染色體與紡錘體之間的協調。
Promoter 與基因調控
>TTK ENST00000369798 GRCh38 chr6:80003649-80004749 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGACACAGAAAGATGCATTAAGTGATTGAGAAGGGCTCTCACGCTAGCTGGGTGGCTATCCAGAGCTGG GAATGTGAGGGTTCTAAGGATAGCTTTGGAGTTAACAAGTGACAGCTGCAGTTAGTTTCCTATACATACA CAAAACCAACCCGTCCTACCACAGAATATATGTCATAATGCTGGCACAACAGACACATCCCTTTTAGTTT TGCAGACGAGGAGTAACCGTTGCCCTGGACCACAAAGCCACTTAGCGGCAGAGCCTCGCACCCGCGAAGA TTATTACTAGGGAGATGTTTTTACCCCTGAGGACACCTGAGCCCTTAAGTGGGGCAGGCTTCGAGGGAGG GGGGCCGATAAGGCGACTTCAGACAGGGCAATCACGATGGGCGCTTGAGTTCTGCGCAGAATTTTGACAA GGGGGAGGGTCTTGGCTTGAAGACAGAGCGTGGAGTCATTTAAGGATAATGGAAGGGCATAAGCAGAAGC TCAAGGATAAAAAGCACTGAAATTCTTGAGCTGGCGGCAGGGCTGAACGTAGCTCAGTGAAAGATCCTTT CTTGCCACATCCTCTCTAAGCCAGGCTGTGAGAACCGCGGGAAACGAAGGAGAAGGGTGGCGGTGGGGTC AGTAAAGGGCCGGCCCAAGGTGCATCTTTTAGGTCCTGATGCTAGGAGCAGCCGTCCCTGCCCCTATATT CCTCTCACTGGGTAGGTTTGCTCGGGAGTGGCTACCTCCCAGGCAAAAATTCGGCCTGGTTAAACTGGAA AGACCAGGAAAGCCCGCCCACGGGCGTCCGGGGAACGCCTGCAAAGTGCCAGCACCCTACCAACCCAGGC GCCGCACGGGTGGGGTCGCGGCCGCAGGCTCTTCCGGGGCGGGCCTAGCCTGACGCAGGAGGAGGGGCGG CCCCCGTCGCACAAGAACCAATCACGACTGTCGCTTCTACGTGGCTAGCATTGACCAATAGGAGACCGTA GTGATAGCGACGGGGAAATTCAAACGTGTTTGCGGAAAGGAGTTTGGGTTCCATCTTTTCATTTCCCCAG CGCAGCTTTCTGTAGGTAAGTTCTGTCTTACCGGTGCACCGGCGCACTGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TTK_1 ↗ | 6:80,004,650 | 正股 | 80,004,601–80,004,660 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_BKTNL · promoter · 80003466–80004157 · regulatory
ENSR6_936QDF · promoter · 80004159–80004659 · regulatory
ENSR6_BKTNR · enhancer · 80004660–80005323 · regulatory
· motif · 80001520–80001531 · motif
· motif · 80003452–80003465 · motif
· motif · 80003452–80003465 · motif
· motif · 80004240–80004257 · motif
· motif · 80004273–80004280 · motif
· motif · 80004429–80004439 · motif
· motif · 80004546–80004556 · motif
· motif · 80004797–80004807 · motif
· motif · 80004859–80004869 · motif
· motif · 80004920–80004931 · motif
· motif · 80005594–80005607 · motif
· motif · 80005594–80005607 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:857 aa
TTK protein kinase 長 857 個胺基酸,屬於 protein kinase 超家族中的 Ser/Thr protein kinase 家族。其 protein kinase 結構域位於第 525–791 個胺基酸。來源另將第 371–410 與第 836–857 個胺基酸區段註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- NDC80O14777 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NUF2Q9BZD4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TTK 與 TPR 有實體交互作用,且此交互作用不依賴微管。來源也記載 TTK 與 MAD1L1、MAD2L1 交互作用;未提供這些交互作用是否形成特定複合體的進一步資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TTK 參與有絲分裂紡錘體組裝檢查點訊號,該檢查點會在染色體於紡錘體上完成雙向定向前延遲後期;TTK 也參與修復不正確的動粒—紡錘體微管連接。它可磷酸化 MAD1L1、CDCA8/Borealin、SKA3、KNL1、KNTC1 與 MCRS1,並能自體磷酸化。相關結果包括增強動粒處 AURKB 活性、促使 SKA complex 從微管解離,以及促進染色體排列。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in mitotic spindle assembly checkpoint signaling, a process that delays anaphase until chromosomes are bioriented on the spindle, and in the repair of incorrect mitotic kinetochore-spindle microtubule attachments. Phosphorylates MAD1L1 to promote the mitotic spindle assembly checkpoint. Phosphorylates CDCA8/Borealin leading to enhanced AURKB activity at the kinetochore. Phosphorylates SKA3 at 'Ser-34' leading to dissociation of the SKA complex from microtubules and destabilization of microtubule-kinetochore attachments. Phosphorylates KNL1, KNTC1 and autophosphorylates. Phosphorylates MCRS1 which enhances recruitment of KIF2A to the minus end of spindle microtubules and promotes chromosome alignment PMID 18243099 ↗ · PMID 28441529 ↗ · PMID 29162720 ↗ · PMID 30785839 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) PMID 30785839 ↗ · PMID 29162720 ↗ |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 交互作用 | TTK 與 TPR 交互作用,且此交互作用不依賴微管;來源另記載 TTK 與 MAD1L1 及 MAD2L1 交互作用。資料未進一步說明後兩者交互作用的條件,也未指出這些分子是否共同形成特定複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with TPR; the interactions occurs in a microtubule-independent manner. Interacts with MAD1L1 and MAD2L1 PMID 19273613 ↗ · PMID 29162720 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CAAACGTGTTTGCGGAAAGGAGTTTGGGTTCCATCTTTTC40ATTTCCCCAGCGCAGCTTTCTGTAGAAATGGAATCCGAGG80ATTTAAGTGGCAGAGAATTGACAATTGATTCCATAATGAA120CAAAGTGAGAGACATTAAAAATAAGTTTAAAAATGAAGAC160CTTACTGATGAACTAAGCTTGAATAAAATTTCTGCTGATA200CTACAGATAACTCGGGAACTGTTAACCAAATTATGATGAT240GGCAAACAACCCAGAGGACTGGTTGAGTTTGTTGCTCAAA280CTAGAGAAAAACAGTGTTCCGCTAAGTGATGCTCTTTTAA320ATAAATTGATTGGTCGTTACAGTCAAGCAATTGAAGCGCT360TCCCCCAGATAAATATGGCCAAAATGAGAGTTTTGCTAGA400ATTCAAGTGAGATTTGCTGAATTAAAAGCTATTCAAGAGC440CAGATGATGCACGTGACTACTTTCAAATGGCCAGAGCAAA480CTGCAAGAAATTTGCTTTTGTTCATATATCTTTTGCACAA520TTTGAACTGTCACAAGGTAATGTCAAAAAAAGTAAACAAC560TTCTTCAAAAAGCTGTAGAACGTGGAGCAGTACCACTAGA600AATGCTGGAAATTGCCCTGCGGAATTTAAACCTCCAAAAA640AAGCAGCTGCTTTCAGAGGAGGAAAAGAAGAATTTATCAG680CATCTACGGTATTAACTGCCCAAGAATCATTTTCCGGTTC720ACTTGGGCATTTACAGAATAGGAACAACAGTTGTGATTCC760AGAGGACAGACTACTAAAGCCAGGTTTTTATATGGAGAGA800ACATGCCACCACAAGATGCAGAAATAGGTTACCGGAATTC840ATTGAGACAAACTAACAAAACTAAACAGTCATGCCCATTT880GGAAGAGTCCCAGTTAACCTTCTAAATAGCCCAGATTGTG920ATGTGAAGACAGATGATTCAGTTGTACCTTGTTTTATGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。