基因總覽
TTF2 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 transcription termination factor 2。其產物屬於 SNF2/RAD54 helicase family，與轉錄終止相關。來源並指出該蛋白具有 ATPase 活性，並可能參與其他細胞過程；這些功能的具體作用方式另於功能說明中整理。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369466 ★ | 117,060,326–117,107,453 | 23 |
| ENST00000931120 | 117,060,285–117,107,453 | 23 |
| ENST00000931121 | 117,060,285–117,107,453 | 23 |
| ENST00000931122 | 117,060,285–117,107,453 | 23 |
| ENST00000931123 | 117,060,285–117,107,453 | 24 |
| ENST00000931124 | 117,060,285–117,107,453 | 24 |
| ENST00000931125 | 117,060,285–117,107,453 | 24 |
| ENST00000931126 | 117,060,285–117,107,453 | 23 |
| ENST00001106100 | 117,060,285–117,082,209 | 10 |
| ENST00001115311 | 117,060,285–117,090,650 | 15 |
| ENST00001115312 | 117,060,285–117,083,263 | 10 |
| ENST00001115313 | 117,060,285–117,083,263 | 10 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TTF2 編碼的蛋白質具有雙股 DNA（DsDNA）依賴性 ATPase 活性，並作為轉錄終止因子。來源所述的作用方式，是將 ATP 水解與 RNA polymerase II 從 DNA 模板上移除相連結，從而參與轉錄終止。其 ATP 水解反應為 ATP 與水生成 ADP、磷酸及氫離子；此反應為 ATPase 活性的化學描述，並非額外指明作用於其他底物。
除了轉錄終止，TTF2 也可能參與有絲分裂期的轉錄抑制。來源以「可能」描述這項作用，因此不宜視為已確立的普遍功能。資料亦指出 TTF2 可能參與 pre-mRNA 剪接，但未提供其在剪接過程中的具體作用方式或影響範圍。
因此，現有資訊將 TTF2 的主要角色連結至 RNA polymerase II 轉錄終止，並提示其可能與有絲分裂期轉錄調控及 pre-mRNA 剪接相關；後兩項仍應保留來源所標示的不確定性。
Promoter 與基因調控
>TTF2 ENST00000369466 GRCh38 chr1:117059326-117060426 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAAAAAGTTTGACAATACAAAATGATAAAGTAAAATTCGCCTTCACCAAAAGTCATCTATTTCCCCTTC TGTGGTTTCCACGTTGCGGCTGGTAACTCGGGGCTTCCACGCTGGGCGAGCCTAGAGAACATCCAGTACA CACAGGAAGCAGCAGCGCGGGCCAAATGGCGCTGAGACCTGCGCACCTGTCCACGGACCGCCCACTCGCC AACTCTGACCTTGGGTGAGTCTCTCAAACTTGAGTCTCGGAATCTTCCACAAAATGCTACCCATCTCACC AGGTCGAGTGAGGAGGGTCGTGTTATGTGTAAGCACTTTGTGAAATCTAAAGCACGAGGCAAACGTAAAG CATTGTAGGGGGTCCTAGAGAAGTCTTTGTGCCTGCCTATCAGAGCCGTTTCAGTTCCCCGCAGCAGCTT CCAAGGACCTCCCACCATGCCCGCCGCTTCGGCTCCTGCACTGCAAATCTCGCGGCTCGGCCTGCAGCGG CGGCTTCCCCTGGCCTCCCACCCCAGCGACTGAGCGCGGAGCCCAGCGCGCACGAGCGCCAGCCTGGCTC AGAGACACCCACGAAGCCAGGGCCTTTCAGCGCCTGCTAACTGGCGCTACCCCTAGGGCCGCCTCTCGGT TTTAAACGTAAACAAGAGTTGCCCTTCCGTCTTCCAAGACCTGCAAATCGAAGCTTCTTTTCCTCCAGAA GCCCCGCCACCTTCTAAGCTTCTCCCCAGCCTCAGCCACGCCCCAGCCTGCAAAAGCCGGGTCCTTTACG CCCCCTGGCTCCGTATTTGATTTCGGCGCGCGCCATACCTGAGGGCAGCTGTGATTGGTTGGAGGTGAGC GAAGTTCCTATATGATTGGCTGATAGCGGCTAGGACGGGTGAAGGCCAAGGGCGGAGAATTATGGGAGGG ATTAAGACTGCAAGAGCTGAGTGATGGTTGGTTCCTGAACAAAGAGGGCGGAGTAAAAGGCGGAAGCAGA ATTGGGGGCGGGGCTTTGTGGAACTTGGGGGACCCAGCGAAATGGAAGAAGTTAGGTGTCCAGAGCACGG TAAGGGGCTAGGGTCTCAGCGTCCCGGGGCCTGTTGATTTAGCGTGGCGTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TTF2_1 ↗ | 1:117,060,327 | 正股 | 117,060,278–117,060,337 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_93PGG8 · enhancer · 117055323–117055700 · regulatory
ENSR1_BT88M · enhancer · 117058736–117059472 · regulatory
ENSR1_BT88Q · promoter · 117059473–117060336 · regulatory
ENSR1_532JF2W · CTCF_binding_site · 117060090–117060111 · regulatory
ENSR1_93PGJ5 · enhancer · 117061918–117062333 · regulatory
· motif · 117056755–117056770 · motif
· motif · 117056757–117056772 · motif
· motif · 117056910–117056925 · motif
· motif · 117059395–117059403 · motif
· motif · 117059489–117059499 · motif
· motif · 117059507–117059516 · motif
· motif · 117059534–117059547 · motif
· motif · 117059537–117059549 · motif
· motif · 117059977–117059988 · motif
· motif · 117060026–117060036 · motif
· motif · 117060060–117060070 · motif
· motif · 117060092–117060108 · motif
· motif · 117060292–117060303 · motif
· motif · 117060292–117060303 · motif
· motif · 117060309–117060319 · motif
· motif · 117060529–117060538 · motif
· motif · 117060529–117060538 · motif
· motif · 117060662–117060677 · motif
· motif · 117060669–117060677 · motif
· motif · 117060889–117060911 · motif
· motif · 117060889–117060911 · motif
· motif · 117061250–117061265 · motif
· motif · 117062010–117062023 · motif
· motif · 117062010–117062023 · motif
· motif · 117062091–117062104 · motif
· motif · 117062091–117062104 · motif
· motif · 117062140–117062148 · motif
· motif · 117062156–117062164 · motif
· motif · 117062222–117062235 · motif
· motif · 117062413–117062430 · motif
· motif · 117062729–117062742 · motif
· motif · 117062729–117062742 · motif
· motif · 117064794–117064806 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1162 aa
TTF2 蛋白長 1,162 個胺基酸，屬於 SNF2/RAD54 helicase family。其序列含有 GRF-type zinc finger、Helicase ATP-binding domain、Helicase C-terminal domain，以及 DEAH box motif。另有數段區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TTF2 位於細胞質與細胞核，其分布會隨細胞週期階段改變：間期主要位於細胞質；細胞進入有絲分裂時，TTF2 會重新定位至細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CDC5LQ99459 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GMEB2Q9UKD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF12Q99081-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF4P15884-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNIP1Q15025 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TTF2 與 CDC5L 有交互作用，並屬於 spliceosome 的一部分。來源未進一步說明兩者交互作用的性質，也未指出 TTF2 在該複合體中的具體位置或作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TTF2 是雙股 DNA 依賴性 ATPase，藉由將 ATP 水解與 RNA polymerase II 從 DNA 模板移除相連結，發揮轉錄終止因子的作用；它也可能參與有絲分裂期轉錄抑制及 pre-mRNA 剪接。 | 含實驗來源 | 證據與來源DsDNA-dependent ATPase which acts as a transcription termination factor by coupling ATP hydrolysis with removal of RNA polymerase II from the DNA template. May contribute to mitotic transcription repression. May also be involved in pre-mRNA splicing PMID 10455150 ↗ · PMID 12927788 ↗ · PMID 15125840 ↗ · PMID 9748214 ↗ |
| 分子活性 | ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | TTF2 與 CDC5L 有交互作用，並且是 spliceosome 的一部分；來源未進一步說明這項交互作用的性質或 TTF2 在該複合體中的具體作用。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TTF2 位於細胞質及細胞核；間期時定位於細胞質，細胞進入有絲分裂時則重新定位至細胞核，顯示其位置會隨細胞週期階段改變。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Cytoplasmic during interphase. Relocates to the nucleus as cells enter mitosis PMID 15125840 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAACTTGGGGGACCCAGCGAAATGGAAGAAGTTAGGTGTC40CAGAGCACGGGACTTTCTGCTTTCTTAAGACCGGCGTCCG80CGATGGCCCGAATAAAGGAAAGAGCTTCTACGTGTGCCGG120GCAGACACGTGCAGCTTCGTGCGGGCCACCGACATTCCTG160TTTCCCATTGCTTATTGCATGAGGACTTTGTGGTAGAGCT200TCAGGGTTTGCTTCTGCCACAGGACAAGAAAGAATACAGA240TTGTTCTTCCGATGCATTAGAAGTAAGGCAGAGGGGAAAC280GCTGGTGTGGAAGTATTCCATGGCAGGATCCTGATTCCAA320AGAACATTCTGTATCCAATAAGTCTCAGCATGCATCTGAG360ACATTTCATCATTCTTCCAACTGGCTGAGAAATCCATTCA400AGGTACTTGACAAGAATCAAGAACCAGCTCTCTGGAAACA440GCTCATCAAAGGTGAAGGTGAGGAAAAGAAGGCTGATAAG480AAGCAAAGAGAAAAGGGAGATCAGCTTTTCGATCAAAAGA520AAGAACAGAAGCCTGAAATGATGGAGAAAGACCTCTCATC560TGGCCTGGTACCAAAGAAAAAACAATCTGTAGTTCAAGAG600AAGAAGCAAGAAGAGGGAGCAGAGATTCAGTGTGAGGCAG640AGACTGGAGGCACACACAAAAGAGACTTTTCTGAAATTAA680ATCTCAACAGTGCCAAGGTAATGAGCTTACAAGACCATCT720GCATCTTCTCAGGAGAAATCAAGTGGTAAGAGTCAAGATG760TCCAAAGAGAATCAGAACCTCTGAGAGAAAAGGTTACCCA800GCTTTTGCCTCAAAATGTTCACAGTCACAACTCAATAAGC840AAGCCCCAGAAAGGGGGACCCCTCAACAAGGAGTACACGA880ACTGGGAGGCTAAAGAAACAAAGGCAAAGGATGGCCCTAG920CATACAGGCCACCCAGAAAAGCCTGCCTCAGGGGCATTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。