基因總覽
TTC4 的正式名稱為 tetratricopeptide repeat domain 4，屬於蛋白質編碼基因。其產物是分子伴護蛋白的協同因子，可將 Hsp90 與 Hsp70 招募至新生多肽，協助多肽形成具功能的蛋白質；已知客戶蛋白包括參與細胞轉譯的真核生物延伸因子 eEF2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371281 ★ | 54,715,861–54,742,657 | 10 |
| ENST00000876949 | 54,715,818–54,742,635 | 8 |
| ENST00000876950 | 54,715,818–54,742,308 | 9 |
| ENST00000934475 | 54,715,818–54,742,650 | 10 |
| ENST00000934476 | 54,715,818–54,742,308 | 9 |
| ENST00000970583 | 54,715,818–54,742,306 | 9 |
| ENST00000970584 | 54,715,818–54,742,262 | 10 |
| ENST00000986142 | 54,715,818–54,742,634 | 9 |
| ENST00001102210 | 54,715,818–54,742,308 | 10 |
| ENST00001102211 | 54,715,818–54,743,465 | 9 |
| ENST00001102213 | 54,715,818–54,743,465 | 7 |
| ENST00001120626 | 54,715,818–54,721,452 | 5 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TTC4 的產物是分子伴護蛋白協同因子，能將 Hsp90（HSC82、HSP82）及 Hsp70（SSA1）招募至新生多肽，協助其正確摺疊成具有功能的蛋白質。這項作用將伴護蛋白帶到尚在形成的多肽上，與蛋白質成熟過程中的摺疊協助相關。
已知客戶蛋白包括真核生物延伸因子 eEF2；eEF2 是細胞轉譯的重要參與者。這顯示 TTC4 所協助的伴護作用可涉及與轉譯相關的蛋白質，但來源未進一步說明 TTC4 對 eEF2 的具體作用方式。
在活性調節方面，TTC4 會刺激 SSA1 的 ATPase 活性；此效應不見於 Hsp90 的 ATPase 活性。上述對 SSA1 的作用依相似性推定，因此不應視為已在此來源中直接證實的機制。
此外，TTC4 促進 Sendai virus（SeV）誘發的宿主細胞先天免疫反應。來源未提供此促進作用的詳細分子步驟，故可確定的功能範圍限於其與 SeV 誘發反應的關聯。
Promoter 與基因調控
>TTC4 ENST00000371281 GRCh38 chr1:54714861-54715961 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTGATCTCAGCTCTGCATCACCTTGAATCCCACCCCTCTGAGCCTTCACTGAGCAGACCTGTGACCCAA TGCCAGTTTAGATTGGTGTGCTTCCTGTCTGCTTTTCATTCCAGACCAGGCTAGGAGCTCCCCAAGGCTG TAGCCCCGGTGCAGGGACCTGCAGCCATTTGCTGGCCGGTAGAGAGGCTGCAGGAAGCCACAGCGGCTGC CTAACCAGGCCTGCAGCACCTGGACCGAAGACCCTTTTCCATCTGAACTGTGGGAGTTAGGGGTGGCTAA GCTCAGAGACAGAGGTCTGATCAGTCTCTCCTTTCCTCGAAACTCTCCAAAAGGTCCCATACCACTGAGG AAATAGCCAAATCCTCATAGTCACAGCCCTTTTGTCCTCCCACCTCATCATCTCCTTGCCCCCTTCCTCA CTCTGCTTCAGCCCCACTGGCCTCCTTGCTGTTCCCCAAGCACAGAAGACTCTCCCGCATCAGGCTTCCG GACTGTTCCCTGTTCCTTCCATGGGAATGCCTTTCCCAGACCCCTCCTAGTCACTCCCAGGCCTCTGGCA GAATGTCTACCCATCCTGTTTAAAACTTTTCCCCAATAGCTCTTGCTACCCCTGACAAACTCTTACATCT CAACTATTGTCGTTTCCTCCCCACTGCCTTAGCAACTCCTAGAGGGCAGAGATTTCATCTGCTCTGCCCA CCGCTATATAGCCAGCCACTAGAACAGGCCGGAAGCGCAGAAAGAGCTAAGTAAGTATGTGTTGACTGAC TGACGAACAAATGAATGAAGTGAGATGGGGGCTTTGGGGATTCGGGTTCACGCACCACCCCAAAAGCATT CGAAGGCCGGGCGAGGCCAGGCACTGCCGAGGAGGGCGGGCCGGGGGAGGAGCGTATTGGCCACGCCCGG CCACGCCCCCAGGCCGGCGGAACCCAAGGCGCGGGGACCTGCGCTGCCGGGAGGATTGAGGGAAGGGAAC CCGCGCCGCCGGAAGGAGCCGCTCGCTTCACGGCGCTGGGACCCGGGCTGGAAGGCAGGGCATCAGCTAT GGAACAACCTGGGCAGGATCCCACCTCAGACGACGTCATGGACTCGTTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TTC4_1 ↗ | 1:54,715,865 | 正股 | 54,715,816–54,715,875 |
| TTC4_2 ↗ | 1:54,716,658 | 正股 | 54,716,609–54,716,668 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：387 aa
TTC4 蛋白長 387 個胺基酸，屬於 TTC4 family。序列註解指出其中有三個 TPR 重複區：TPR 1 位於第 79–112 位、TPR 2 位於第 117–150 位，TPR 3 位於第 151–184 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TTC4 位於細胞核（包括核質）及細胞質。 依相似性資料推定，其定位會隨細胞週期改變：G1 與 S 期主要在細胞核，G2 期則在細胞核與細胞質間均勻分布。 MSL1 可能促進 TTC4 的核定位；此定位調節關係亦屬相似性推定。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- HGH1Q9BTY7 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SNAPC3Q92966 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBK1Q9UHD2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
TTC4 透過 TPR repeats 與 HSP90AB1 互作，也與 HSPA8、CDC6 及 TBK1 互作。來源未將這些關係描述為同一複合體。TTC4 與 MSL1 的互作則依相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TTC4 是協同伴護因子，可將 Hsp90（HSC82、HSP82）與 Hsp70（SSA1）招募至新生多肽，協助其正確摺疊為功能性蛋白質；客戶蛋白包括參與細胞轉譯的真核生物延伸因子 eEF2。TTC4 會刺激 SSA1、但不刺激 Hsp90 的 ATPase 活性，此項作用依相似性推定；另可促進 Sendai virus（SeV）誘發的宿主細胞先天免疫反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Co-chaperone that recruits molecular chaperones Hsp90 (HSC82 and HSP82) and Hsp70 (SSA1) to nascent polypeptides, facilitating their proper folding into functional proteins. Client proteins include eukaryotic elongation factor eEF2, a key player in cellular translation. Stimulates SSA1 ATPase activity, but not Hsp90 ATPase activity (By similarity). Promotes Sendai virus (SeV)-induced host cell innate immune responses PMID 18320024 ↗ · PMID 29251827 ↗ |
| 交互作用 | TTC4 透過 TPR repeats 與 HSP90AB1 互作，並與 HSPA8、CDC6 及 TBK1 互作；來源未指出這些互作均屬於同一複合體。TTC4 與 MSL1 的互作依相似性推定，並非此處直接描述的實驗證據。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via TPR repeats) with HSP90AB1. Interacts with HSPA8 and CDC6. Interacts with TBK1. Interacts with MSL1 (By similarity) PMID 18320024 ↗ · PMID 29251827 ↗ |
| 細胞定位 | TTC4 可見於細胞核、核質及細胞質。依相似性推定，其定位具有細胞週期差異：G1 與 S 期主要位於細胞核，G2 期則均勻分布於細胞核和細胞質；MSL1 可能促進 TTC4 的核定位，此關係同樣依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Nucleus, nucleoplasm; Cytoplasm; Predominantly nuclear in the G1 and S phases of cell cycle and is evenly distributed between the nucleus and cytoplasm in the G2 phase (By similarity). MSL1 can promote its nuclear localization (By similarity) PMID 18320024 ↗ · PMID 29251827 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTCGCTTCACGGCGCTGGGACCCGGGCTGGAAGGCAGGG40CATCAGCTATGGAACAACCTGGGCAGGATCCCACCTCAGA80CGACGTCATGGACTCGTTCCTGGAAAAGTTCCAGAGCCAG120CCTTACCGTGGCGGCTTTCATGAGGACCAGTGGGAGAAGG160AATTTGAAAAGGTCCCCCTATTTATGTCGAGAGCGCCATC200AGAAATTGATCCCAGGGAGAATCCTGACTTGGCTTGTCTC240CAGTCAATTATTTTTGATGAGGAGCGTTCTCCAGAAGAAC280AGGCCAAGACCTATAAAGATGAGGGCAATGATTACTTTAA320AGAAAAAGACTACAAGAAAGCTGTAATTTCATACACTGAA360GGCTTAAAGAAGAAATGTGCAGATCCTGATTTGAATGCTG400TCCTTTATACCAACCGGGCAGCAGCACAGTACTATCTGGG440CAATTTTCGTTCTGCTCTCAATGATGTGACAGCTGCCAGA480AAGCTAAAACCCTGCCACCTCAAAGCAATAATAAGAGGTG520CCTTATGCCATCTGGAACTGAAACACTTTGCCGAGGCCGT560GAACTGGTGTGATGAGGGACTGCAAATAGATGCCAAAGAG600AAGAAGCTTCTGGAAATGAGGGCTAAAGCAGACAAGCTGA640AGCGAATTGAACAGAGGGATGTGAGGAAAGCCAACTTGAA680AGAAAAGAAGGAGAGGAATCAGAATGAGGCTTTACTCCAG720GCCATCAAGGCTAGGAATATCAGGCTCTCAGAAGCTGCCT760GTGAGGATGAAGATTCAGCCTCAGAAGGTCTAGGTGAGCT800TTTCCTGGATGGACTCAGCACTGAGAACCCCCATGGAGCC840AGGCTGAGTCTAGATGGCCAGGGCAGGCTGAGCTGGCCTG880TGCTCTTTCTGTACCCAGAGTATGCCCAGTCGGACTTCAT920CTCTGCTTTTCATGAGGACTCCAGGTTTATTGATCATCTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。