基因總覽
TTC3（tetratricopeptide repeat domain 3）是蛋白質編碼基因，產物 E3 ubiquitin-protein ligase TTC3 長 2025 個胺基酸，屬於具有 tetratricopeptide repeat（TPR）重複序列的蛋白質。其序列含有多個 TPR 重複區，並在蛋白質末端帶有 RING-type zinc finger。這些結構特徵構成其蛋白質架構；其主要生物學角色與泛素化及多種細胞調控過程相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000418766 ★ | 37,073,254–37,203,107 | 46 |
| ENST00000450533 | 37,073,206–37,203,082 | 46 |
| ENST00000696811 | 37,073,206–37,203,080 | 48 |
| ENST00000399010 | 37,073,206–37,099,098 | 11 |
| ENST00000411496 | 37,073,206–37,203,080 | 47 |
| ENST00001001033 | 37,073,206–37,099,517 | 11 |
| ENST00001040995 | 37,073,206–37,153,330 | 27 |
| ENST00001040996 | 37,073,206–37,153,323 | 27 |
| ENST00001131415 | 37,073,206–37,203,107 | 46 |
| ENST00000492275 | 37,073,226–37,202,779 | 37 |
| ENST00000438055 | 37,073,267–37,165,765 | 32 |
| ENST00000481605 | 37,073,277–37,165,716 | 23 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TTC3 是 E3 ubiquitin-protein ligase，可催化 Lys-48 連結的多聚泛素鏈形成，並參與蛋白質泛素化與後續降解。其一項已描述的作用，是在細胞核中促進已磷酸化 Akt 的泛素化與降解，涉及 AKT1、AKT2 和 AKT3。TTC3 因而參與 Akt 活化後的訊號調節；Akt 對 TTC3 的磷酸化是其泛素連接酶活性的必要條件，這項依賴關係提示細胞可能藉此調控 Akt 活化後的蛋白質量。
在 TGFB1 誘導的上皮間質轉化與肌成纖維細胞分化中，TTC3 透過促進 SMURF2 泛素化及後續降解，正向調節這些過程。此作用說明 TTC3 可藉由改變特定調控蛋白的穩定性，影響 TGFB1 相關的細胞狀態轉變；資料支持的是其參與上述過程，並未提供更廣泛適用於其他情境的結論。
TTC3 也參與神經元分化，並透過涉及 RHOA、CIT 與 ROCK 的訊號級聯，調節 actin 重塑及 Golgi 組織。這些細胞結構相關變化與神經元分化相連，呈現 TTC3 除了泛素化作用外，也能透過訊號調控影響分化相關的細胞組織過程。此外，TTC3 可抑制細胞增殖；現有資料未進一步說明此效應的具體分子機制。
Promoter 與基因調控
>TTC3 ENST00000418766 GRCh38 chr21:37072254-37073354 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTAGGCTAGTGCTGGCACACGGAACACTCAGCAAACACGAGATCCCTTCAGATTTTCTTAAAAAGAGAC ATAGGGAGAAAGAATCAACAGTTCATGTGTGCACAGTCTAACCAATGTATTCTTCCCTTGTCACTGAACG CCAGAAAAAGCCCCTGGCCATCCATCAGGAAAGTACTTACTGAAGCCAAATTGGGAGCTTAAGAAAAGAA CAAAGCCATAAATCGCTCTTTCTGGCAATGGCGACGGTGAATTTTCCACCATTTTTCCTGGGGCTTTAGA CAATCTGTGGAAAAGGAACACAATCAGCGTCAGCGATGTGCTCCGTGGCACCATTGATCCATTCTCGCCT CCTCGCTCCGCCGCGGGTACGGCCCCCGCCGCGCAGAACCGCCTCCCGCGCCTCCGTCCGCAACCCGCGC CCCCGCCTCGAGCGCATACAGACACCCAGGCTGGCGCGCGCCCCGCAACAGAAGGGGTGGCGGAGGATAG GGCAGGGAGGGGGGTTCTGGGGCGATAGACGCGCGCTCCAGCTCTGCAAGCGTGGCCTCCCTGTGGGAGG GGAGGGCAGGGAACAAGGCTCGCGCGGCGCCCACCAGCATGCGGGCCTACTAGGTCGCGGCGCCCAGGCC CCGGGCCCTGCCCATTCGTGGAGACTTCTATTTCTCATTCGAGGCGGGGTATGGGGGGGCCCTCGACCTC GGGTCCTTCATACGCCCACCCAGGCCCCTCCCGACACCTCGGCCACCTCAGCGCTGAGTTCTCCGCGCAA GCGCCGACTGGGGAGCCGCAGTGGGGAAGAGGAAAACCTGAGGGAAAGGCCTAGGCGCGACGGCAACCCC CACCCTGGCGCAGGCGCACAACGACCCTCCCCGGGTGGGAGCCAGCGAGCGCGGGGGCGGGCGTGATCCC GCGGCTCGCGACGGCGAAGGAGGGGGCGGTGGGGTGCGACTGCGCACGCGCGCTGCCAGCCCACGTGACG CACCTCGCTTCAACGCCGCCACCCGCTCCCTCCCGCCGTCGGCTGACGTGGAGGGCCGGAGGTGGCGGCG GCGGCGGCGGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCCCGCGTCCGAGGCTCGCGGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TTC3_1 ↗ | 21:37,073,274 | 正股 | 37,073,225–37,073,284 |
| TTC3_2 ↗ | 21:37,076,722 | 正股 | 37,076,673–37,076,732 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
TTC3 的表現會受到 TGFB1 訊號上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：2025 aa
E3 ubiquitin-protein ligase TTC3 長 2025 個胺基酸，含有四段註記為 TPR 的重複區，另有位於蛋白質末端的 RING-type zinc finger。序列中另標示多段預測的無序區域。其 N 端 1–230 位胺基酸區段與 POLG 互作相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TTC3 可見於細胞核、細胞質與 Golgi apparatus。 其核定位可能依賴全長蛋白先在細胞質中經蛋白水解切割；此切割可能露出 N 端核定位訊號，使 N 端片段得以進入細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- AKT1P31749 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- AKT2P31751 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- AKT3Q9Y243 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SMURF2Q9HAU4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TTC3 在 Ser-378 磷酸化時與 AKT1、AKT2 和 AKT3 互作，而這些 Akt 蛋白也須處於磷酸化狀態。TTC3 另與 CIT、POLG、HSP70 及 SMURF2 互作。來源記載的是蛋白質互作，未將這些關係一概描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TTC3 是 E3 ubiquitin-protein ligase，可催化 Lys-48 連結的多聚泛素鏈形成，並在細胞核中促進已磷酸化 AKT1、AKT2、AKT3 的泛素化與降解。Akt 對 TTC3 的磷酸化是其泛素連接酶活性的必要條件，提示這可能是 Akt 活化後調控其蛋白質量的機制。TTC3 也藉由促進 SMURF2 泛素化與降解，正向調節 TGFB1 誘導的上皮間質轉化及肌成纖維細胞分化；並透過涉及 RHOA、CIT、ROCK 的訊號級聯，調節神經元分化相關的 actin 重塑與 Golgi 組織。此外，TTC3 可抑制細胞增殖。 | 含實驗來源 | 證據與來源E3 ubiquitin-protein ligase which catalyzes the formation of 'Lys-48'-polyubiquitin chains. Mediates the ubiquitination and subsequent degradation of phosphorylated Akt (AKT1, AKT2 and AKT3) in the nucleus. Acts as a terminal regulator of Akt signaling after activation; its phosphorylation by Akt, which is a prerequisite for ubiquitin ligase activity, suggests the existence of a regulation mechanism required to control Akt levels after activation. Positively regulates TGFB1-induced epithelial-mesenchymal transition and myofibroblast differentiation by mediating the ubiquitination and subsequent degradation of SMURF2. Regulates neuronal differentiation by regulating actin remodeling and Golgi organization via a signaling cascade involving RHOA, CIT and ROCK. Inhibits cell proliferation PMID 17488780 ↗ · PMID 20059950 ↗ · PMID 24695496 ↗ · PMID 30203323 ↗ · PMID 30696809 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 20059950 ↗ · PMID 30696809 ↗ |
| 分子活性 | TTC3 參與蛋白質修飾，具體涉及蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | TTC3 在 Ser-378 磷酸化時與 AKT1、AKT2 和 AKT3 互作，且互作對象也須處於磷酸化狀態；此外，TTC3 與 CIT、POLG、HSP70 及 SMURF2 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (when phosphorylated on Ser-378) with AKT1, AKT2 and AKT3 (when phosphorylated). Interacts with CIT. Interacts with POLG. Interacts with HSP70. Interacts with SMURF2 PMID 17488780 ↗ · PMID 20059950 ↗ · PMID 29290964 ↗ · PMID 30696809 ↗ |
| 細胞定位 | TTC3 位於細胞核、細胞質與 Golgi apparatus。核定位可能依賴全長蛋白在細胞質中的蛋白水解切割；此切割可能露出 N 端核定位訊號，使 N 端片段進入細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Golgi apparatus; Nuclear localization may be dependent on the proteolytic cleavage of full length protein in the cytoplasm. This cleavage may reveal an N-terminal nuclear localization signal, allowing N-terminal fragments to enter the nucleus PMID 20059950 ↗ · PMID 30203323 ↗ |
| 調控 | TTC3 會受到 TGFB1 訊號上調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACCCGCTCCCTCCCGCCGTCGGCTGACGTGGAGGGCCGGA40GGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCC80CGCGTCCGAGGCTCGCGGGCGGCGGGCCCGGGTGAGTGCA120CACCCGGCGCGCTGCCGGGCTCCCGGATGTGTCACCTTGT160CCCGCTGCAGCCGAGATGCCGGGGGAGCGGGGCCTTCCAC200ACCCCCTCCGTGGGTGTGTGACTTGTGCACCATGGACAAT240TTTGCTGAGGGAGATTTCACTGTGGCGGATTATGCCTTGT280TAGAAGATTGCCCTCACGTGGATGATTGTGTCTTTGCTGC320TGAATTTATGAGCAATGATTATGTTCGTGTGACTCAGCTT360TACTGTGATGGGGTGGGTGTGCAATATAAAGATTATATCC400AAAGTGAGAGGAATTTGGAATTTGACATCTGCAGTATATG440GTGTAGTAAACCAATTTCTGTCCTGCAAGATTATTGCGAT480GCCATTAAAATAAACATCTTCTGGCCACTTCTGTTTCAAC520ATCAAAACAGTTCCGTAATATCACGATTGCATCCCTGTGT560GGACGCCAACAATTCACGTGCTTCTGAGATAAATTTGAAG600AAACTACAACATCTTGAGTTGATGGAAGATATTGTGGATT640TGGCAAAGAAAGTTGCTAATGATTCATTCCTTATTGGAGG680CTTATTGAGAATTGGTTGTAAAATAGAAAATAAAATCTTG720GCAATGGAAGAAGCTCTGAATTGGATAAAATATGCAGGCG760ATGTAACAATTCTAACTAAATTAGGATCAATTGACAATTG800TTGGCCTATGTTAAGTATTTTCTTTACTGAATACAAGTAC840CACATAACTAAAATTGTAATGGAAGACTGCAATTTGCTTG880AAGAACTTAAAACTCAAAGTTGTATGGATTGTATAGAGGA920AGGAGAACTAATGAAAATGAAAGGAAATGAAGAGTTTTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。