基因總覽
TST 是蛋白質編碼基因,產物為 thiosulfate sulfurtransferase。此蛋白質屬於 Rhodanese 家族,具有兩個 Rhodanese 結構域,中間由一段 hinge 區域連接。來源描述其具有硫轉移相關功能,並指出它也參與細胞質 5S rRNA 的粒線體輸入;相關作用的條件與分子過程見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000249042 ★ | 37,010,865–37,019,447 | 3 |
| ENST00000403892 | 37,010,859–37,019,467 | 2 |
| ENST00000622841 | 37,010,859–37,020,183 | 3 |
| ENST00000864747 | 37,010,859–37,024,797 | 3 |
| ENST00000864748 | 37,010,859–37,022,956 | 3 |
| ENST00000864749 | 37,010,859–37,020,649 | 3 |
| ENST00000864750 | 37,010,859–37,019,777 | 3 |
| ENST00000864751 | 37,010,859–37,019,777 | 3 |
| ENST00000864752 | 37,010,859–37,019,454 | 4 |
| ENST00000864753 | 37,010,859–37,019,454 | 3 |
| ENST00001095808 | 37,010,859–37,019,454 | 3 |
| ENST00001095809 | 37,010,859–37,019,454 | 3 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thiosulfate sulfurtransferase 可催化硫離子由 thiosulfate 轉移至 cyanide,反應產物為 thiocyanate 與 sulfite,並伴隨產生 2 個 H⁺。來源指出,除 cyanide 外,其他 thiol 化合物也可能作為硫離子受體;此類受體範圍的描述並未限定為單一化合物。TST 在氰化物解毒中具有關鍵作用,而相關催化描述部分依序列相似性推定,應保留其證據性質。
此蛋白質另具有較弱的 mercaptopyruvate sulfurtransferase(MST)活性。這項活性同樣是依相似性提出,來源未提供其作用強度以外的細節,因此不宜據此推展其他底物或生理效應。
TST 也與細胞質 5S rRNA 的粒線體輸入有關:它與 MRPL18 一同作為輸入因子。能結合 5S rRNA 的是新生、尚未摺疊的細胞質 TST;來源並未將此結合能力概括到成熟或已摺疊的蛋白質。這項作用使 TST 除硫轉移相關功能外,也參與 5S rRNA 由細胞質進入粒線體的過程。
Promoter 與基因調控
>TST ENST00000249042 GRCh38 chr22:37019347-37020447 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CATGAACCTTCAGGGAAGAGCCAGGTAAACAAAGGCAGCTGGTACCACGTGGGCTTCAGACCAGGGATCA GGCCCGGCCTCAACTCTGGGTGTGTCCTCCAGCAACTCGCTCTGCCGCTCTCTCCTGTCTTAGTAAGTTT CTGGCCTACTCCTCAGGGTTATTGTGGGAATTAAGTCACACCACGGGAGTACCCAGCAAAGTGCCACACC AAGCAGGGCTGGACAATGTTAGTTCCTTTCACTCACTAACAAGTTATTGGCTAGTGTCTCTTCCTGGGGC CTCTGGGTCAGCGGGGTCTCGTCTCCCTGTCCTCCTCTCTCTCCCCCGCCCTCTCTGGTGCCACCAGGTC ACCCACTTCCACCCAAGGCTCCCCACCCGCCACTCGCCACGACCCCACCCGGCAGGCCGCCCCAAGCGGA CAGTCACCCTTAGTGCCAACGTAGCGGCGCGCCTTCTCTCCTAGACTAAGCCCCCTCTTCCGCCCAGGTC CCGCGCGGGAGCCCCGCGCCGAGCACCCCCAAAGAGCCACTCCCTCCCCCTCCAGAAAGGCAAGCCGCCA CGCCGCGGCAGTTACCCGGGTCTCGGACTCCCGGCTTCCTGGCTCCGCCATGGCCCCCGCGGCGCGGCGC CCCCTCCCCGCGCCCGCAGCTGTCCCCTCCTCCCGCCACCAACCTGCAGCGGACCAAAGGGAGGAGACTC CGGCACAGCCCACCGCCGCGGCCACTCGGAGCCGCTGCTGCCCGCGCCTTCCACTGGCCGGGCCGTGGGG GTACGCCCGCTCCGCCCAGCCCAGGCCCGCGCGGCCCCCGCGCCACCCGGCGTCCCCCTCAGACCCCCGC GGGTCCCGGAGGCCCCGCGCGCGAGGTTGGCAGGTGCCGGGCGCGAAGCGGCCGCGCGGGGGAGGCGCGG GATGGCGGCGGGCGGCGCAGGGTCCCCCTCTGGCGGTGGCGCGATGGTGCGCGCCGCCTGGGGAGCTGCG GCCGGGGGTTTGAACCGGCCAACTTCTCCAGCCGGCCGGGGCGAGCGCCAGCGCGGCGTCCGGGGCGAGT GAGTGCGGGGCGGGGGCAGCGGCCGGGCGCCTGGGCCGCCGGTCGGGCCAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TST_1 ↗ | 22:37,019,446 | 負股 | 37,019,436–37,019,495 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9JNPN · promoter · 37019437–37019782 · regulatory
ENSR22_5BP4N6 · CTCF_binding_site · 37019621–37019642 · regulatory
ENSR22_5BP4NH · CTCF_binding_site · 37019687–37019708 · regulatory
ENSR22_9JNPR · enhancer · 37019783–37020172 · regulatory
ENSR22_9JNPX · promoter · 37020173–37020673 · regulatory
ENSR22_9JNQD · enhancer · 37021872–37022264 · regulatory
ENSR22_5BP54R · CTCF_binding_site · 37022132–37022153 · regulatory
· motif · 37019267–37019280 · motif
· motif · 37019542–37019555 · motif
· motif · 37019623–37019639 · motif
· motif · 37019689–37019705 · motif
· motif · 37020096–37020111 · motif
· motif · 37020266–37020281 · motif
· motif · 37021551–37021564 · motif
· motif · 37021691–37021706 · motif
· motif · 37021696–37021708 · motif
· motif · 37021699–37021706 · motif
· motif · 37022134–37022150 · motif
· motif · 37022145–37022160 · motif
· motif · 37023841–37023856 · motif
· motif · 37023931–37023941 · motif
· motif · 37024069–37024084 · motif
· motif · 37024093–37024103 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:297 aa
thiosulfate sulfurtransferase 長 297 個胺基酸。其 N 端包含 Rhodanese 1 結構域(第 25–143 位),C 端包含 Rhodanese 2 結構域(第 173–288 位);兩者之間的 hinge 區域位於第 144–159 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 TST 定位於粒線體及粒線體基質,未提供不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
來源將 TST 描述為單體,未列出其形成的蛋白質複合體或其他實體結合夥伴。TST 與 MRPL18 共同參與 5S rRNA 的粒線體輸入,屬於功能關係的描述;來源未將此關係界定為兩者直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TST 可將硫離子由 thiosulfate 轉移至 cyanide,其他 thiol 化合物也可作為硫受體;其氰化物解毒作用具有關鍵地位,而硫轉移及較弱的 MST 活性描述依相似性推定。TST 也與 MRPL18 協助細胞質 5S rRNA 進入粒線體,但僅新生、未摺疊的細胞質 TST 能結合該 RNA。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the transfer of sulfur ion from thiosulfate to cyanide, although other thiol compounds, besides cyanide, can act as sulfur ion acceptors (By similarity). It also has weak mercaptopyruvate sulfurtransferase (MST) activity (By similarity). Has a pivotal role in cyanide detoxification. Together with MRPL18, acts as a mitochondrial import factor for the cytosolic 5S rRNA. Only the nascent unfolded cytoplasmic form is able to bind to the 5S rRNA PMID 20663881 ↗ · PMID 21685364 ↗ · PMID 40033006 ↗ |
| 分子活性 | thiosulfate + hydrogen cyanide = thiocyanate + sulfite + 2 H(+) | 推論支持 | |
| 交互作用 | Monomer | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | TST 的定位為粒線體及粒線體基質;此定位資料未提供條件差異或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AACTTCTCCAGCCGGCCGGGGCGAGCGCCAGCGCGGCGTC40CGGGGCGAGTGACACGCAGAGCTGAAGCCATGGTTCATCA80GGTGCTCTACCGGGCGCTGGTCTCCACCAAGTGGCTGGCG120GAGTCCATCAGGACTGGCAAGCTGGGGCCCGGCCTGCGGG160TGCTGGACGCGTCCTGGTACTCACCAGGCACCCGAGAGGC200CCGCAAGGAGTACCTCGAGCGCCACGTACCCGGCGCCTCT240TTCTTTGACATAGAAGAGTGCCGGGACACGGCGTCGCCCT280ACGAGATGATGCTGCCCAGCGAGGCTGGCTTCGCCGAGTA320TGTGGGCCGCCTGGGCATCAGCAACCACACGCACGTGGTG360GTGTATGATGGTGAACACCTGGGCAGCTTCTATGCTCCCC400GGGTCTGGTGGATGTTCCGTGTGTTTGGCCACCGCACCGT440ATCAGTGCTCAATGGTGGCTTCCGGAACTGGCTGAAGGAG480GGCCACCCGGTGACATCCGAGCCCTCACGCCCAGAACCGG520CCGTCTTCAAAGCCACACTGGACCGCTCCCTGCTCAAGAC560CTACGAGCAGGTGCTGGAGAACCTTGAATCTAAGAGGTTC600CAGCTGGTGGATTCAAGGTCTCAAGGGCGGTTCCTGGGCA640CCGAGCCGGAGCCGGATGCAGTAGGACTGGACTCGGGCCA680TATCCGTGGTGCCGTCAACATGCCTTTCATGGACTTCCTG720ACTGAGGATGGCTTCGAGAAGGGCCCAGAAGAGCTCCGTG760CTCTGTTCCAGACCAAGAAGGTGGATCTCTCGCAGCCTCT800CATTGCCACGTGCCGCAAGGGAGTCACCGCCTGCCACGTG840GCCTTGGCTGCCTACCTCTGCGGCAAGCCTGATGTGGCCG880TGTACGATGGCTCCTGGTCCGAGTGGTTTCGCCGGGCCCC920CCCAGAGAGCCGTGTGTCCCAGGGAAAGTCTGAGAAGGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。