演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TSTRDS

thiosulfate sulfurtransferase

TST 編碼 thiosulfate sulfurtransferase,參與硫離子轉移與氰化物解毒,也與細胞質 5S rRNA 進入粒線體有關。

Homo sapiens22q12.3UniProt Q16762
OFFICIAL SYMBOL
TST
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q16762
PDB / ALPHAFOLD
8AGF
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TST 是蛋白質編碼基因,產物為 thiosulfate sulfurtransferase。此蛋白質屬於 Rhodanese 家族,具有兩個 Rhodanese 結構域,中間由一段 hinge 區域連接。來源描述其具有硫轉移相關功能,並指出它也參與細胞質 5S rRNA 的粒線體輸入;相關作用的條件與分子過程見功能說明。

Official symbol
TST
Gene name
thiosulfate sulfurtransferase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12388
UniProt
Q16762
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RDS

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q12.3
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegTSTpq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr22:37,010,859–37,024,797
Gene span
13,939 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000249042 ★37,010,865–37,019,4473
ENST0000040389237,010,859–37,019,4672
ENST0000062284137,010,859–37,020,1833
ENST0000086474737,010,859–37,024,7973
ENST0000086474837,010,859–37,022,9563
ENST0000086474937,010,859–37,020,6493
ENST0000086475037,010,859–37,019,7773
ENST0000086475137,010,859–37,019,7773
ENST0000086475237,010,859–37,019,4544
ENST0000086475337,010,859–37,019,4543
ENST0000109580837,010,859–37,019,4543
ENST0000109580937,010,859–37,019,4543

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

thiosulfate sulfurtransferase 可催化硫離子由 thiosulfate 轉移至 cyanide,反應產物為 thiocyanate 與 sulfite,並伴隨產生 2 個 H⁺。來源指出,除 cyanide 外,其他 thiol 化合物也可能作為硫離子受體;此類受體範圍的描述並未限定為單一化合物。TST 在氰化物解毒中具有關鍵作用,而相關催化描述部分依序列相似性推定,應保留其證據性質。

此蛋白質另具有較弱的 mercaptopyruvate sulfurtransferase(MST)活性。這項活性同樣是依相似性提出,來源未提供其作用強度以外的細節,因此不宜據此推展其他底物或生理效應。

TST 也與細胞質 5S rRNA 的粒線體輸入有關:它與 MRPL18 一同作為輸入因子。能結合 5S rRNA 的是新生、尚未摺疊的細胞質 TST;來源並未將此結合能力概括到成熟或已摺疊的蛋白質。這項作用使 TST 除硫轉移相關功能外,也參與 5S rRNA 由細胞質進入粒線體的過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 37019447 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TST ENST00000249042 GRCh38 chr22:37019347-37020447 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATGAACCTTCAGGGAAGAGCCAGGTAAACAAAGGCAGCTGGTACCACGTGGGCTTCAGACCAGGGATCA
GGCCCGGCCTCAACTCTGGGTGTGTCCTCCAGCAACTCGCTCTGCCGCTCTCTCCTGTCTTAGTAAGTTT
CTGGCCTACTCCTCAGGGTTATTGTGGGAATTAAGTCACACCACGGGAGTACCCAGCAAAGTGCCACACC
AAGCAGGGCTGGACAATGTTAGTTCCTTTCACTCACTAACAAGTTATTGGCTAGTGTCTCTTCCTGGGGC
CTCTGGGTCAGCGGGGTCTCGTCTCCCTGTCCTCCTCTCTCTCCCCCGCCCTCTCTGGTGCCACCAGGTC
ACCCACTTCCACCCAAGGCTCCCCACCCGCCACTCGCCACGACCCCACCCGGCAGGCCGCCCCAAGCGGA
CAGTCACCCTTAGTGCCAACGTAGCGGCGCGCCTTCTCTCCTAGACTAAGCCCCCTCTTCCGCCCAGGTC
CCGCGCGGGAGCCCCGCGCCGAGCACCCCCAAAGAGCCACTCCCTCCCCCTCCAGAAAGGCAAGCCGCCA
CGCCGCGGCAGTTACCCGGGTCTCGGACTCCCGGCTTCCTGGCTCCGCCATGGCCCCCGCGGCGCGGCGC
CCCCTCCCCGCGCCCGCAGCTGTCCCCTCCTCCCGCCACCAACCTGCAGCGGACCAAAGGGAGGAGACTC
CGGCACAGCCCACCGCCGCGGCCACTCGGAGCCGCTGCTGCCCGCGCCTTCCACTGGCCGGGCCGTGGGG
GTACGCCCGCTCCGCCCAGCCCAGGCCCGCGCGGCCCCCGCGCCACCCGGCGTCCCCCTCAGACCCCCGC
GGGTCCCGGAGGCCCCGCGCGCGAGGTTGGCAGGTGCCGGGCGCGAAGCGGCCGCGCGGGGGAGGCGCGG
GATGGCGGCGGGCGGCGCAGGGTCCCCCTCTGGCGGTGGCGCGATGGTGCGCGCCGCCTGGGGAGCTGCG
GCCGGGGGTTTGAACCGGCCAACTTCTCCAGCCGGCCGGGGCGAGCGCCAGCGCGGCGTCCGGGGCGAGT
GAGTGCGGGGCGGGGGCAGCGGCCGGGCGCCTGGGCCGCCGGTCGGGCCAC
TST 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TST_1 ↗22:37,019,446負股37,019,436–37,019,495

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_9JNPN · promoter · 37019437–37019782 · regulatory

ENSR22_5BP4N6 · CTCF_binding_site · 37019621–37019642 · regulatory

ENSR22_5BP4NH · CTCF_binding_site · 37019687–37019708 · regulatory

ENSR22_9JNPR · enhancer · 37019783–37020172 · regulatory

ENSR22_9JNPX · promoter · 37020173–37020673 · regulatory

ENSR22_9JNQD · enhancer · 37021872–37022264 · regulatory

ENSR22_5BP54R · CTCF_binding_site · 37022132–37022153 · regulatory

· motif · 37019267–37019280 · motif

· motif · 37019542–37019555 · motif

· motif · 37019623–37019639 · motif

· motif · 37019689–37019705 · motif

· motif · 37020096–37020111 · motif

· motif · 37020266–37020281 · motif

· motif · 37021551–37021564 · motif

· motif · 37021691–37021706 · motif

· motif · 37021696–37021708 · motif

· motif · 37021699–37021706 · motif

· motif · 37022134–37022150 · motif

· motif · 37022145–37022160 · motif

· motif · 37023841–37023856 · motif

· motif · 37023931–37023941 · motif

· motif · 37024069–37024084 · motif

· motif · 37024093–37024103 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:297 aa

1 aa297 aa結構域功能區域
依 Q16762 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

thiosulfate sulfurtransferase 長 297 個胺基酸。其 N 端包含 Rhodanese 1 結構域(第 25–143 位),C 端包含 Rhodanese 2 結構域(第 173–288 位);兩者之間的 hinge 區域位於第 144–159 位。

結構域Rhodanese 125–143 aa
結構域Rhodanese 2173–288 aa
功能區域Hinge144–159 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8AGF…

PDB · 8AGF

X-ray · 3.40 A · A=5-294

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion;Mitochondrion matrix

來源將 TST 定位於粒線體及粒線體基質,未提供不同條件或異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RDSTST
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源將 TST 描述為單體,未列出其形成的蛋白質複合體或其他實體結合夥伴。TST 與 MRPL18 共同參與 5S rRNA 的粒線體輸入,屬於功能關係的描述;來源未將此關係界定為兩者直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TST 可將硫離子由 thiosulfate 轉移至 cyanide,其他 thiol 化合物也可作為硫受體;其氰化物解毒作用具有關鍵地位,而硫轉移及較弱的 MST 活性描述依相似性推定。TST 也與 MRPL18 協助細胞質 5S rRNA 進入粒線體,但僅新生、未摺疊的細胞質 TST 能結合該 RNA。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the transfer of sulfur ion from thiosulfate to cyanide, although other thiol compounds, besides cyanide, can act as sulfur ion acceptors (By similarity). It also has weak mercaptopyruvate sulfurtransferase (MST) activity (By similarity). Has a pivotal role in cyanide detoxification. Together with MRPL18, acts as a mitochondrial import factor for the cytosolic 5S rRNA. Only the nascent unfolded cytoplasmic form is able to bind to the 5S rRNA

PMID 20663881 ↗ · PMID 21685364 ↗ · PMID 40033006 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性thiosulfate + hydrogen cyanide = thiocyanate + sulfite + 2 H(+)推論支持
證據與來源

thiosulfate + hydrogen cyanide = thiocyanate + sulfite + 2 H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer資料庫紀錄
證據與來源

Monomer

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TST 的定位為粒線體及粒線體基質;此定位資料未提供條件差異或異構型差異。推論支持
證據與來源

Mitochondrion; Mitochondrion matrix

PMID 20663881 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000249042 · 1,125 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AACTTCTCCAGCCGGCCGGGGCGAGCGCCAGCGCGGCGTC40
41CGGGGCGAGTGACACGCAGAGCTGAAGCCATGGTTCATCA80
81GGTGCTCTACCGGGCGCTGGTCTCCACCAAGTGGCTGGCG120
121GAGTCCATCAGGACTGGCAAGCTGGGGCCCGGCCTGCGGG160
161TGCTGGACGCGTCCTGGTACTCACCAGGCACCCGAGAGGC200
201CCGCAAGGAGTACCTCGAGCGCCACGTACCCGGCGCCTCT240
241TTCTTTGACATAGAAGAGTGCCGGGACACGGCGTCGCCCT280
281ACGAGATGATGCTGCCCAGCGAGGCTGGCTTCGCCGAGTA320
321TGTGGGCCGCCTGGGCATCAGCAACCACACGCACGTGGTG360
361GTGTATGATGGTGAACACCTGGGCAGCTTCTATGCTCCCC400
401GGGTCTGGTGGATGTTCCGTGTGTTTGGCCACCGCACCGT440
441ATCAGTGCTCAATGGTGGCTTCCGGAACTGGCTGAAGGAG480
481GGCCACCCGGTGACATCCGAGCCCTCACGCCCAGAACCGG520
521CCGTCTTCAAAGCCACACTGGACCGCTCCCTGCTCAAGAC560
561CTACGAGCAGGTGCTGGAGAACCTTGAATCTAAGAGGTTC600
601CAGCTGGTGGATTCAAGGTCTCAAGGGCGGTTCCTGGGCA640
641CCGAGCCGGAGCCGGATGCAGTAGGACTGGACTCGGGCCA680
681TATCCGTGGTGCCGTCAACATGCCTTTCATGGACTTCCTG720
721ACTGAGGATGGCTTCGAGAAGGGCCCAGAAGAGCTCCGTG760
761CTCTGTTCCAGACCAAGAAGGTGGATCTCTCGCAGCCTCT800
801CATTGCCACGTGCCGCAAGGGAGTCACCGCCTGCCACGTG840
841GCCTTGGCTGCCTACCTCTGCGGCAAGCCTGATGTGGCCG880
881TGTACGATGGCTCCTGGTCCGAGTGGTTTCGCCGGGCCCC920
921CCCAGAGAGCCGTGTGTCCCAGGGAAAGTCTGAGAAGGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。