演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TSSK2SPOGA2

testis specific serine kinase 2

TSSK2 是睪丸特異性的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與精子細胞發育後期的細胞質重組,並作用於 TSKS 與 SPAG16。

Homo sapiens22q11.21UniProt Q96PF2
OFFICIAL SYMBOL
TSSK2
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q96PF2
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TSSK2(testis specific serine kinase 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於蛋白激酶超家族中的 CAMK Ser/Thr protein kinase family。其蛋白質為睪丸特異性的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,具有蛋白激酶結構域;來源並指出其在精子細胞發育過程中發揮作用。這些特徵將 TSSK2 定位為與生殖細胞發育相關的激酶。

Official symbol
TSSK2
Gene name
testis specific serine kinase 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11401
UniProt
Q96PF2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SPOGA2FLJ38613STK22B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q11.21
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegTSSK2pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr22:19,131,308–19,132,622
Gene span
1,315 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000399635 ★19,131,308–19,132,6221

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TSSK2 是精子細胞發育所需的睪丸特異性絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。它能磷酸化 TSKS 的 Ser-288,以及 SPAG16;這些受質作用指出 TSSK2 可透過蛋白質磷酸化參與精子形成。其催化反應以 ATP 為磷酸基來源,可將蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基磷酸化,並產生 ADP 與 H⁺。

TSSK2 的功能與精子形成後期的細胞質重組有關。在精子形成期間,它也被指出是鞭毛基部環狀結構轉變所必需的;此環狀結構源自染色質體(chromatoid body)。來源未進一步說明該轉變的分子步驟,但將 TSSK2 的激酶作用與精子細胞成熟期間的結構重整連結起來。

因此,現有資料支持 TSSK2 參與精子細胞發育後期的磷酸化調控及細胞結構變化,並指出其對特定環狀結構的轉變具有必要性。來源未提供足以延伸至其他生理過程或機制的資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 19131308 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TSSK2 ENST00000399635 GRCh38 chr22:19130308-19131408 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGATACAGGGAGAAGGCTGGAGATAATTCCAGCAGACCAACTCAAAGTGCTACAATTTTCTTACTGTTT
ATATAGGTTGGGGTTATGTGCCTACATGCAGTACAGCAATCACCTAAGTCTACTGGTAACTAATTTTGTT
CCAAGGAGAAGGTCAGAGGCAAAAAAAATGCTTGCTAAGTCCGATTAAAAGGGGCCCAGTGCCTTCAAGG
CCTGTCTACTGTGGTACCGGAGTGATTATTTCGATTGTATCTCCTTTACAGCTTGGTCCAGAGAGCTGCC
TTAGACTATCCAATTGATCTATTCAAACAGCTGCCTGTTCCCTTAACTTGTCTTCAGATTTTGTCGACCC
GAGATGGGTCCTGGCACTAGGAATGTAAAACCGTTCCTATTATTTTGGCTTGCTCCAGCAAAAGAGAAGC
CCATGCAAGGCTCCTGCTGACCATGTTTCATTTCTAGCTTTGATGTCTGGGCACTGATTTCCCTAGATTT
AACTATGTGCTCAATGGTAAGGCAGTGCTGTGGAAATCTGTCTGTGTAACTGGGGTGCTATGCAGGCCTG
TCTGGGTGACTGTCAGGGACAACTGTCCTACCACACCAAGGACACAGCCCTGGGGGTGCTTTTCTTCATA
GCCAAAGAAGCTGCAGGAAACCCACCCTAGTGGGACAAAGACCAATGCAGGGTCAGTCCCCACAGCCAGG
TGATGCAAACAGGCTGGACGTGGGCCGCCTCCCCTCCAGCTTGACTTGTGACAGGGAAACCAATGCAGCA
GCAGCAGGGCCACCAGAGTCCTGTCCTGGGGACAGGCTTCCTTCCAGCGGGCGGGGAGTGGGTGCTCCTG
CCAGACCAGCCTGGCTTCCACGGTTCCAGAGACCCTGTTCTCCCTCAGCCCAGTCCCCGCCCCCACTCCT
TGGCTTTATGAGTTCATTGGCTGAAGTCACCCGGAGACAATGCTGAGTGTTCCACCCCTGAGTCGAAGCC
CAGCCCAGGGCAGCCCAGCCAGACGCCTCCGGTAGTGTAAATGAGGACAATGCCTGCTGGCCCACATGAC
GGGGGGATGTAGACGGCAGCGGCGCCAGTCGCTCCTGGCACCATGGACGAT
TSSK2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_56HGQT · CTCF_binding_site · 19127626–19127647 · regulatory

· motif · 19127628–19127644 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:358 aa

1 aa358 aa結構域功能區域
依 Q96PF2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TSSK2 蛋白質長 358 個胺基酸,屬於 protein kinase superfamily 的 CAMK Ser/Thr protein kinase family。第 12–272 個胺基酸為 Protein kinase 結構域;第 302–358 個胺基酸區段註解為無序區域。

結構域Protein kinase12–272 aa
功能區域Disordered302–358 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96PF2…

AlphaFold · Q96PF2

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriole

TSSK2 位於細胞質,並可見於細胞骨架相關的微管組織中心、中心體與中心粒。 在精子細胞形成鞭毛期間,TSSK2 會集中於精子細胞的中心粒;延長中的精子細胞則可在細胞質中檢出。 依相似性推定,成熟精子中的定位包括赤道區段、頸部、中段及特定頭部區室。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPOGA2TSSK2FAM229BHSP90AB1LZTS2TSEN15TSKSYWHAE
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TSSK2 與 TSSK1B 有交互作用。它也與 HSP90 交互作用;依相似性資料,這項交互作用可穩定 TSSK2。來源未指出 TSSK2 與這些蛋白質形成特定複合體,因此不將此交互作用延伸解讀為複合體組成。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TSSK2 是精子細胞發育所需的睪丸特異性絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,可磷酸化 TSKS 的 Ser-288 與 SPAG16。它參與精子形成後期的細胞質重組,並且是精子形成期間鞭毛基部環狀結構轉變所必需的;該結構源自染色質體。含實驗來源
證據與來源

Testis-specific serine/threonine-protein kinase required during spermatid development. Phosphorylates TSKS at 'Ser-288' and SPAG16. Involved in the late stages of spermatogenesis, during the reconstruction of the cytoplasm. During spermatogenesis, required for the transformation of a ring-shaped structure around the base of the flagellum originating from the chromatoid body

PMID 15044604 ↗ · PMID 18533145 ↗ · PMID 20729278 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 20729278 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 20729278 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TSSK2 與 TSSK1B 有交互作用;它也與 HSP90 交互作用,且依相似性資料,HSP90 的交互作用可穩定 TSSK2。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TSSK1B. Interacts with HSP90; this interaction stabilizes TSSK2 (By similarity)

PMID 15044604 ↗ · PMID 18533145 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TSSK2 位於細胞質及微管組織中心、中心體與中心粒;精子形成期間,延長中的精子細胞細胞質可檢出 TSSK2,形成鞭毛時則集中於中心粒。依相似性推定,成熟精子中的定位包括赤道區段、頸部、中段及特定頭部區室。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriole; Present in the cytoplasm of elongating spermatids. In spermatozoa, localizes in the equatorial segment, neck, the midpiece and in a specific sperm head compartment (By similarity). In spermatids, concentrates in centrioles during flagellogenesis

PMID 18495105 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000399635 · 1,315 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACGCCTCCGGTAGTGTAAATGAGGACAATGCCTGCTGG40
41CCCACATGACGGGGGGATGTAGACGGCAGCGGCGCCAGTC80
81GCTCCTGGCACCATGGACGATGCCACAGTCCTAAGGAAGA120
121AGGGTTACATCGTAGGCATCAATCTTGGCAAGGGTTCCTA160
161CGCAAAAGTCAAATCTGCCTACTCTGAGCGCCTCAAGTTC200
201AATGTGGCTGTCAAGATCATCGACCGCAAGAAAACACCTA240
241CTGACTTTGTGGAGAGATTCCTTCCTCGGGAGATGGACAT280
281CCTGGCAACTGTCAACCACGGCTCCATCATCAAGACTTAC320
321GAGATCTTTGAGACCTCTGACGGACGGATCTACATCATCA360
361TGGAGCTTGGCGTCCAGGGCGACCTCCTCGAGTTCATCAA400
401GTGCCAGGGAGCCCTGCATGAGGACGTGGCACGCAAGATG440
441TTCCGACAGCTCTCCTCCGCCGTCAAGTACTGCCACGACC480
481TGGACATCGTCCACCGGGACCTCAAGTGCGAGAACCTTCT520
521CCTCGACAAGGACTTCAACATCAAGCTGTCTGACTTTGGC560
561TTCTCCAAGCGCTGCCTGCGGGACAGCAATGGGCGCATCA600
601TCCTCAGCAAGACCTTCTGCGGGTCGGCAGCATATGCAGC640
641CCCCGAGGTGCTGCAGAGCATCCCCTACCAGCCCAAGGTG680
681TATGACATCTGGAGCCTGGGCGTGATCCTGTACATCATGG720
721TCTGCGGCTCCATGCCCTATGACGACTCCGACATCAGGAA760
761GATGCTGCGTATCCAGAAGGAGCACCGTGTGGACTTCCCG800
801CGCTCCAAGAACCTGACCTGCGAGTGCAAGGACCTCATCT840
841ACCGCATGCTGCAGCCCGACGTCAGCCAGCGGCTCCACAT880
881CGATGAGATCCTCAGCCACTCGTGGCTGCAGCCCCCCAAG920
921CCCAAAGCCACGTCTTCTGCCTCCTTCAAGAGGGAGGGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。