演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TSPY1CT78

testis specific protein Y-linked 1

TSPY1 是位於 Y 染色體的蛋白質編碼基因,其產物屬於 nucleosome assembly protein(NAP)家族;可能參與精子分化與增殖。

Homo sapiensYp11.2UniProt Q01534
OFFICIAL SYMBOL
TSPY1
CHROMOSOME
Y
UNIPROT
Q01534
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TSPY1(testis specific protein Y-linked 1)是位於 Y 染色體 Yp11.2 的蛋白質編碼基因,產物為 Testis-specific Y-encoded protein 1。此蛋白質屬於 nucleosome assembly protein(NAP)家族。現有資料將其與精子分化及增殖聯繫起來,但其參與程度仍以「可能」描述;來源未提供更詳盡的蛋白質結構或分子作用資訊。

Official symbol
TSPY1
Gene name
testis specific protein Y-linked 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12381
UniProt
Q01534
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CT78TSPY

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome YYp11.2
chrY · 57,227,415 bp · GRCh38chrYp11.32 · 1–300000 · gnegchrYp11.31 · 300001–600000 · gpos50chrYp11.2 · 600001–10300000 · gnegchrYp11.1 · 10300001–10400000 · acenchrYq11.1 · 10400001–10600000 · acenchrYq11.21 · 10600001–12400000 · gnegchrYq11.221 · 12400001–17100000 · gpos50chrYq11.222 · 17100001–19600000 · gnegchrYq11.223 · 19600001–23800000 · gpos50chrYq11.23 · 23800001–26600000 · gnegchrYq12 · 26600001–57227415 · gvarTSPY1pq1 bp57,227,415 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrY:9,466,955–9,469,749
Gene span
2,795 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000451548 ★9,466,955–9,469,7496
ENST000004236479,466,955–9,469,7486

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TSPY1 的蛋白質產物可能參與精子分化與增殖。現有功能註記僅指出這兩項可能相關的生物學過程,並未進一步說明它如何影響精子細胞的分化或增殖,也未提供可據以判定作用方向或具體機制的資訊。因此,這項功能應理解為可能的參與關係,而非已界定的分子機制或確定作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 9466955 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TSPY1 ENST00000451548 GRCh38 chrY:9465955-9467055 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCTGGGTGCTCCCACAGACCCTGGGCCTGCGCAGCCCAGCCCAGCCCAGCCCATGCCCCGCACCCGTAG
GCTCTGGGGGCCCGCTCCCCAGCAGACCCGCTCCCTGCAAGACCCACGCGTCGCCCTGCTGTGAACCTGG
TCCCACACCTACGTGGACCCAGGTTTCCTGAGGACGTCCGCTGGACCCGCAGATCCCGCACTGGCCAAAG
GGCTCCGGTCCCCAGCAGGCTCAACTGCGCACAGGAGCTCGGGAGCCAGAGGCCCCGGCCCTGGGCTTGC
AGAGCCCCACCAACAGGCACCGCAACCGCTGCTGCGGGTGCGGGAGCCTCTGGGTCGTCAAGGCAGCGCA
CAACAGCGTGCGCGCAGGCCGACAATGGCCAACCTGGCGGCTGGCCTCTGGTGTGCCCAGGGCATAGGAC
AAGAGGCCCTTTGGAATGCTCCTTGGAGTACAGCATCCTCAGGGAGGAAGCATGGTACTCGGAGCCTCTA
TTTGCCTCGACCTGTGAGAGTGTGTGCCGGGGCTCTGGCCTCTACAGCAGATCAATTCCACCTCAGCACC
GGCAGGCGACTTTCCTCCCACGTGCCCGCCCCGATCACTTCCCCCAGGACACCCCTGCCGCCCTAGCCCC
AGCAACCAGAGAGAGTTCTCTGCATCTGCTGTATTACCTCCGTACCATCTACCTGGCCTGCCTAACGAAG
AGAGATGTTTCCTGTGTTCATGACACATAGAGATGTTCATGGCTTGCCACACTGAGGATGTCAGGGCACA
GGGCTGCCATGCCCACAATTCCAAAGGCCACGCAGCCCGCGTGTGCCCGGATGCCTAGCTACCCGGCACA
AGCTCCAAGGGCTTCTCGGAGGAGGCTTGGGCAGGGAAGGCAGGGGGGTGGGGGGGCTGGAGATGCAGGC
CCGCCAGTGGCTGTGCCGCCCAGGGAGACGCCCACCGCCCTCCCATTGATTGGCCACGACGGGAGGAAGT
CGGCCTGGGTGCGGCCCCCCGGCCCTTCGCGCGCAGTCCCTTAGGGGGCGCCTGGAAGCCCGGCGCATGC
GCCCTGAGGGCTCGCTGACCTACCGGGTGCCAGAGAGGCTGCGGCAGGGTT
TSPY1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

在前列腺癌細胞株中,雄激素處理與 TSPY1 表現上調相關。此調控觀察限於該細胞株的研究情境,不能據此推定其他細胞或組織中的表現調控方式。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:308 aa

TSPY1 蛋白質屬於 nucleosome assembly protein(NAP)家族。現有資料未提供其結構域、序列區段或其他蛋白質結構特徵的註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q01534…

AlphaFold · Q01534

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

TSPY1 蛋白質主要位於細胞質,也可在細胞核中發現。 現有資料未說明兩處定位是否會隨特定條件改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CT78TSPY1Eef1a1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TSPY 位於 gonadoblastoma 的關鍵區域,且在 gonadoblastoma 樣本的腫瘤生殖細胞中有較優先的表現。其表現也與睪丸 seminoma 及前列腺腫瘤生成相關;這些資料描述的是位置或表現關聯,未證明 TSPY1 導致上述腫瘤。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TSPY1 可能參與精子分化與增殖。這項資料指出的是可能的功能關聯,未進一步交代作用機制、影響方向或參與程度,因此不應視為已確立的具體分子作用。含實驗來源
證據與來源

May be involved in sperm differentiation and proliferation

PMID 8923009 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TSPY1 蛋白質主要位於細胞質,也可在細胞核中發現。資料描述了其主要定位與另一處可檢出的定位,但未指出定位變化的條件或兩者之間的動態關係。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Predominantly cytoplasmic. Also found in nucleus

PMID 8923009 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控在前列腺癌細胞株中,雄激素與 TSPY1 表現上調相關。此觀察限於該細胞株的研究情境;資料未支持將此調控結果推廣至其他細胞類型或組織。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by androgen in a prostate cancer cell line

PMID 10747295 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯TSPY 位於 gonadoblastoma 關鍵區域,並在該腫瘤樣本的腫瘤生殖細胞中優先表現;其表現也與睪丸 seminoma 及前列腺腫瘤生成相關。這些是位置與表現關聯,未證明 TSPY1 對腫瘤具有因果作用。含實驗來源
證據與來源

TSPY is located in the gonadoblastoma critical region and is preferentially expressed in tumor germ cells of gonadoblastoma specimens. Expression also correlates with testicular seminoma and tumorigenesis of the prostate gland

PMID 10090875 ↗ · PMID 10773691 ↗ · PMID 11173850 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000451548 · 1,161 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCCCTTCGCGCGCAGTCCCTTAGGGGGCGCCTGGAAGCC40
41CGGCGCATGCGCCCTGAGGGCTCGCTGACCTACCGGGTGC80
81CAGAGAGGCTGCGGCAGGGTTTCTGTGGCGTGGGTCGGGC120
121AGCACAGGCCTTGGTGTGTGCGAGTGCCAAGGAGGGCACC160
161GCCTTCAGGATGGAGGCTGTGCAGGAGGGGGCGGCCGGGG200
201TGGAGAGTGAGCAGGCGGCTTTGGGGGAGGAGGCGGTGCT240
241GCTGTTGGATGACATAATGGCGGAGGTGGAGGTGGTGGCG280
281GAGGAGGAGGGCCTCGTGGAGCGGCGGGAGGAGGCCCAGC320
321GGGCACAGCAGGCTGTGCCTGGCCCTGGGCCCATGACCCC360
361AGAGTCTGCACCGGAGGAGCTGCTGGCCGTTCAGGTGGAG400
401CTGGAGCCGGTTAATGCCCAAGCCAGGAAGGCCTTTTCTC440
441GGCAGCGGGAAAAGATGGAGCGGAGGCGCAAGCCCCACCT480
481AGACCGCAGAGGCGCCGTCATCCAGAGCGTCCCTGGCTTC520
521TGGGCCAATGTTATTGCAAACCACCCCCAGATGTCAGCCC560
561TGATCACTGACGAAGATGAAGACATGCTGAGCTACATGGT600
601CAGCCTGGAGGTGGGAGAAGAGAAGCATCCTGTTCATCTC640
641TGCAAGATCATGTTGTTCTTTCGGAGTAACCCCTACTTCC680
681AGAATAAAGTGATTACCAAGGAATATCTGGTGAACATCAC720
721AGAATACAGGGCTTCTCATTCCACTCCAATTGAGTGGTAT760
761CCGGATTATGAAGTGGAGGCCTATCGCCGCAGACACCACA800
801ACAGCAGCCTTAACTTCTTCAACTGGTTCTCTGACCACAA840
841CTTCGCAGGATCTAACAAGATTGCTGAGATCCTATGTAAG880
881GACCTGTGGCGCAATCCCCTGCAATACTACAAGAGGATGA920
921AGCCACCTGAAGAGGGAACAGAGACGTCAGGGGACTCCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。