基因總覽
TSPY1(testis specific protein Y-linked 1)是位於 Y 染色體 Yp11.2 的蛋白質編碼基因,產物為 Testis-specific Y-encoded protein 1。此蛋白質屬於 nucleosome assembly protein(NAP)家族。現有資料將其與精子分化及增殖聯繫起來,但其參與程度仍以「可能」描述;來源未提供更詳盡的蛋白質結構或分子作用資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000451548 ★ | 9,466,955–9,469,749 | 6 |
| ENST00000423647 | 9,466,955–9,469,748 | 6 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TSPY1 的蛋白質產物可能參與精子分化與增殖。現有功能註記僅指出這兩項可能相關的生物學過程,並未進一步說明它如何影響精子細胞的分化或增殖,也未提供可據以判定作用方向或具體機制的資訊。因此,這項功能應理解為可能的參與關係,而非已界定的分子機制或確定作用。
Promoter 與基因調控
>TSPY1 ENST00000451548 GRCh38 chrY:9465955-9467055 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCCTGGGTGCTCCCACAGACCCTGGGCCTGCGCAGCCCAGCCCAGCCCAGCCCATGCCCCGCACCCGTAG GCTCTGGGGGCCCGCTCCCCAGCAGACCCGCTCCCTGCAAGACCCACGCGTCGCCCTGCTGTGAACCTGG TCCCACACCTACGTGGACCCAGGTTTCCTGAGGACGTCCGCTGGACCCGCAGATCCCGCACTGGCCAAAG GGCTCCGGTCCCCAGCAGGCTCAACTGCGCACAGGAGCTCGGGAGCCAGAGGCCCCGGCCCTGGGCTTGC AGAGCCCCACCAACAGGCACCGCAACCGCTGCTGCGGGTGCGGGAGCCTCTGGGTCGTCAAGGCAGCGCA CAACAGCGTGCGCGCAGGCCGACAATGGCCAACCTGGCGGCTGGCCTCTGGTGTGCCCAGGGCATAGGAC AAGAGGCCCTTTGGAATGCTCCTTGGAGTACAGCATCCTCAGGGAGGAAGCATGGTACTCGGAGCCTCTA TTTGCCTCGACCTGTGAGAGTGTGTGCCGGGGCTCTGGCCTCTACAGCAGATCAATTCCACCTCAGCACC GGCAGGCGACTTTCCTCCCACGTGCCCGCCCCGATCACTTCCCCCAGGACACCCCTGCCGCCCTAGCCCC AGCAACCAGAGAGAGTTCTCTGCATCTGCTGTATTACCTCCGTACCATCTACCTGGCCTGCCTAACGAAG AGAGATGTTTCCTGTGTTCATGACACATAGAGATGTTCATGGCTTGCCACACTGAGGATGTCAGGGCACA GGGCTGCCATGCCCACAATTCCAAAGGCCACGCAGCCCGCGTGTGCCCGGATGCCTAGCTACCCGGCACA AGCTCCAAGGGCTTCTCGGAGGAGGCTTGGGCAGGGAAGGCAGGGGGGTGGGGGGGCTGGAGATGCAGGC CCGCCAGTGGCTGTGCCGCCCAGGGAGACGCCCACCGCCCTCCCATTGATTGGCCACGACGGGAGGAAGT CGGCCTGGGTGCGGCCCCCCGGCCCTTCGCGCGCAGTCCCTTAGGGGGCGCCTGGAAGCCCGGCGCATGC GCCCTGAGGGCTCGCTGACCTACCGGGTGCCAGAGAGGCTGCGGCAGGGTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
在前列腺癌細胞株中,雄激素處理與 TSPY1 表現上調相關。此調控觀察限於該細胞株的研究情境,不能據此推定其他細胞或組織中的表現調控方式。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:308 aa
TSPY1 蛋白質屬於 nucleosome assembly protein(NAP)家族。現有資料未提供其結構域、序列區段或其他蛋白質結構特徵的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TSPY1 蛋白質主要位於細胞質,也可在細胞核中發現。 現有資料未說明兩處定位是否會隨特定條件改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- Eef1a1P10126 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
TSPY 位於 gonadoblastoma 的關鍵區域,且在 gonadoblastoma 樣本的腫瘤生殖細胞中有較優先的表現。其表現也與睪丸 seminoma 及前列腺腫瘤生成相關;這些資料描述的是位置或表現關聯,未證明 TSPY1 導致上述腫瘤。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TSPY1 可能參與精子分化與增殖。這項資料指出的是可能的功能關聯,未進一步交代作用機制、影響方向或參與程度,因此不應視為已確立的具體分子作用。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TSPY1 蛋白質主要位於細胞質,也可在細胞核中發現。資料描述了其主要定位與另一處可檢出的定位,但未指出定位變化的條件或兩者之間的動態關係。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在前列腺癌細胞株中,雄激素與 TSPY1 表現上調相關。此觀察限於該細胞株的研究情境;資料未支持將此調控結果推廣至其他細胞類型或組織。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | TSPY 位於 gonadoblastoma 關鍵區域,並在該腫瘤樣本的腫瘤生殖細胞中優先表現;其表現也與睪丸 seminoma 及前列腺腫瘤生成相關。這些是位置與表現關聯,未證明 TSPY1 對腫瘤具有因果作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源TSPY is located in the gonadoblastoma critical region and is preferentially expressed in tumor germ cells of gonadoblastoma specimens. Expression also correlates with testicular seminoma and tumorigenesis of the prostate gland PMID 10090875 ↗ · PMID 10773691 ↗ · PMID 11173850 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGCCCTTCGCGCGCAGTCCCTTAGGGGGCGCCTGGAAGCC40CGGCGCATGCGCCCTGAGGGCTCGCTGACCTACCGGGTGC80CAGAGAGGCTGCGGCAGGGTTTCTGTGGCGTGGGTCGGGC120AGCACAGGCCTTGGTGTGTGCGAGTGCCAAGGAGGGCACC160GCCTTCAGGATGGAGGCTGTGCAGGAGGGGGCGGCCGGGG200TGGAGAGTGAGCAGGCGGCTTTGGGGGAGGAGGCGGTGCT240GCTGTTGGATGACATAATGGCGGAGGTGGAGGTGGTGGCG280GAGGAGGAGGGCCTCGTGGAGCGGCGGGAGGAGGCCCAGC320GGGCACAGCAGGCTGTGCCTGGCCCTGGGCCCATGACCCC360AGAGTCTGCACCGGAGGAGCTGCTGGCCGTTCAGGTGGAG400CTGGAGCCGGTTAATGCCCAAGCCAGGAAGGCCTTTTCTC440GGCAGCGGGAAAAGATGGAGCGGAGGCGCAAGCCCCACCT480AGACCGCAGAGGCGCCGTCATCCAGAGCGTCCCTGGCTTC520TGGGCCAATGTTATTGCAAACCACCCCCAGATGTCAGCCC560TGATCACTGACGAAGATGAAGACATGCTGAGCTACATGGT600CAGCCTGGAGGTGGGAGAAGAGAAGCATCCTGTTCATCTC640TGCAAGATCATGTTGTTCTTTCGGAGTAACCCCTACTTCC680AGAATAAAGTGATTACCAAGGAATATCTGGTGAACATCAC720AGAATACAGGGCTTCTCATTCCACTCCAATTGAGTGGTAT760CCGGATTATGAAGTGGAGGCCTATCGCCGCAGACACCACA800ACAGCAGCCTTAACTTCTTCAACTGGTTCTCTGACCACAA840CTTCGCAGGATCTAACAAGATTGCTGAGATCCTATGTAAG880GACCTGTGGCGCAATCCCCTGCAATACTACAAGAGGATGA920AGCCACCTGAAGAGGGAACAGAGACGTCAGGGGACTCCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。