基因總覽
TSPO 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 translocator protein。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 22q13.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000337554 ★ | 43,151,559–43,163,242 | 4 |
| ENST00000972386 | 43,151,077–43,163,246 | 4 |
| ENST00001104211 | 43,151,349–43,163,246 | 4 |
| ENST00000864330 | 43,151,507–43,163,246 | 4 |
| ENST00000864331 | 43,151,507–43,163,246 | 5 |
| ENST00000864332 | 43,151,507–43,163,246 | 5 |
| ENST00000864333 | 43,151,507–43,163,246 | 5 |
| ENST00000864334 | 43,151,507–43,163,246 | 4 |
| ENST00000864335 | 43,151,507–43,163,246 | 5 |
| ENST00000864336 | 43,151,507–43,163,242 | 4 |
| ENST00000864337 | 43,151,507–43,163,246 | 4 |
| ENST00000864338 | 43,151,507–43,163,246 | 5 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TSPO ENST00000337554 GRCh38 chr22:43150559-43151659 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCAACACAGTAAAAAATAGATTTATGTATGTTTGTTTTTTAATAGAGGAAGAGGCTCACAAAGGCAAA AATGCCAGGTCCTAGGAAAGCCATACTGCAGCCTGGCTGGTCCCCAAGGAGGCTCCTGGCTTCTGTGTCT GGGTAGAAGTAGCCACAGTTCTCCTTGGACCCTGCAGGATCAGTTTGGGCCAACGTGGCTGGTTCAGGCT GATGGGGCGTTGCCAGGCTGAGTTGTCTGGAGGGAGCTGGGACAGCCTTGAACTGCAGCAAGACAGCCAT AGTGCCAAGGGCCTGGGGCTGGACACACCCTGCATGGGAGTGGACCTGGGCAGCTGGAGGCCACCTCTGG GCTGTGATGATGGCAGCCTCCCCTCACTGAGCGCCGAGCATCTGAGGGGTGTCCTGCCTGCATCACCGCG TTGCGGCCTCATCAGTCCCACGACTTTGTGCCCATTTTACAGATGAGGAGATGGAGGCCCAGAGAGCCAG TCAGAAAGTGGCTGGGCCAGGACTAAGAGTGCAGCGCGCTGCCTCCGTGCCCTGCGTCAACAGCTCAAGG AACTGGGGTGCTCCGGAAATGGGGCCAAGGCTGCTGGGCAGCAGGACGCTCAGGGCCTTGGCCTCAGGAG AGGTAATTCCCCACTCGGAGATCGGTCTTGTTGCTGCATTTTATAGATGGGAAAAGTGAGGCTAGAAGAG ACGACAAACGACACGCCGTTGGACACACGGCAACGTTTTAGATGTTGGGTCTGGCCGGGCGGCCGTCACC GGTCACCATGGGGAGGAGGAGGAGCCGAGAGACTTGCTCGCGGCCGGGGGGAGGCAGAAGCGCGTCCCGC GGGAGAGGTGGCTTTGAGGAGTGAGCTCCCGGTCCCGCGGGGACGCGAGTGGGCCCAGTGCCCGGGCTGC CAGGCGGGGCGGGGCGGGGCCGGGCGACTGAGAGGGGCGGGGCCTGGCGGCTGGGAGGGGCGGGGCGGAT GCGGGGACAGCGGCCTGGCTAACTCCTGCCAGGCAGTGCCCTTCCCGGAGCGTGCCCTCGCCGCTGGTGA GTGAGGACGGGACGCGGAGGGGGCAGCGGGAAGTGGGGGCCCGCATGGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TSPO_1 ↗ | 22:43,151,559 | 正股 | 43,151,510–43,151,569 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_9M5DX · enhancer · 43147766–43148166 · regulatory
ENSR22_5D62HR · CTCF_binding_site · 43148106–43148127 · regulatory
ENSR22_8398SD · enhancer · 43148702–43148956 · regulatory
ENSR22_BBK7Z · promoter · 43151057–43151945 · regulatory
ENSR22_C69LK · enhancer · 43151946–43153071 · regulatory
ENSR22_9M5H2 · enhancer · 43154945–43155246 · regulatory
ENSR22_8398ZJ · enhancer · 43155851–43156089 · regulatory
· motif · 43147258–43147271 · motif
· motif · 43147362–43147374 · motif
· motif · 43147888–43147896 · motif
· motif · 43148108–43148124 · motif
· motif · 43155926–43155934 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AACTCCTGCCAGGCAGTGCCCTTCCCGGAGCGTGCCCTCG40CCGCTGAGCTCCCCTGAACAGCAGCTGCAGCAGCCATGGC80CCCGCCCTGGGTGCCCGCCATGGGCTTCACGCTGGCGCCC120AGCCTGGGGTGCTTCGTGGGCTCCCGCTTTGTCCACGGCG160AGGGTCTCCGCTGGTACGCCGGCCTGCAGAAGCCCTCGTG200GCACCCGCCCCACTGGGTGCTGGGCCCTGTCTGGGGCACG240CTCTACTCAGCCATGGGGTACGGCTCCTACCTGGTCTGGA280AAGAGCTGGGAGGCTTCACAGAGAAGGCTGTGGTTCCCCT320GGGCCTCTACACTGGGCAGCTGGCCCTGAACTGGGCATGG360CCCCCCATCTTCTTTGGTGCCCGACAAATGGGCTGGGCCT400TGGTGGATCTCCTGCTGGTCAGTGGGGCGGCGGCAGCCAC440TACCGTGGCCTGGTACCAGGTGAGCCCGCTGGCCGCCCGC480CTGCTCTACCCCTACCTGGCCTGGCTGGCCTTCACGACCA520CACTCAACTACTGCGTATGGCGGGACAACCATGGCTGGCG560TGGGGGACGGCGGCTGCCAGAGTGAGTGCCCGGCCCACCA600GGGACTGCAGCTGCACCAGCAGGTGCCATCACGCTTGTGA640TGTGGTGGCCGTCACGCTTTCATGACCACTGGGCCTGCTA680GTCTGTCAGGGCCTTGGCCCAGGGGTCAGCAGAGCTTCAG720AGGTGGCCCCACCTGAGCCCCCACCCGGGAGCAGTGTCCT760GTGCTTTCTGCATGCTTAGAGCATGTTCTTGGAACATGGA800ATTTTATAAGCTGAATAAAGTTTTTGACTTCCTTTA836cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。