基因總覽
TSPAN8 的正式名稱為 tetraspanin 8，是一種蛋白質編碼基因，其產物屬於 tetraspanin（TM4SF）家族。TSPAN8 蛋白由 237 個胺基酸構成，具有多次跨膜的拓撲結構：蛋白質兩端及部分短區段位於細胞質側，另有兩段區域位於細胞外。這些基本特徵使它成為細胞膜上的組成成員。來源將其描述為 tetraspanin-enriched microdomains 的結構成分；這類膜微區可作為受體聚集與訊號傳遞的平台。其主要角色因而與膜上分子組織及多種細胞活動相連，具體作用方式依不同生物過程而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000247829 ★ | 71,125,096–71,157,999 | 9 |
| ENST00000393330 | 71,124,454–71,441,898 | 12 |
| ENST00000546561 | 71,124,454–71,157,910 | 8 |
| ENST00000861089 | 71,124,454–71,163,333 | 9 |
| ENST00000861090 | 71,124,454–71,163,042 | 9 |
| ENST00000861091 | 71,124,454–71,158,747 | 9 |
| ENST00000861092 | 71,124,454–71,158,178 | 8 |
| ENST00000861093 | 71,124,454–71,158,457 | 9 |
| ENST00000861094 | 71,124,454–71,158,164 | 9 |
| ENST00000861095 | 71,124,454–71,158,178 | 8 |
| ENST00000861096 | 71,124,454–71,158,178 | 8 |
| ENST00000861097 | 71,124,454–71,158,178 | 9 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TSPAN8 是 tetraspanin-enriched microdomains（TERMs）的結構成分。這些特殊膜微區可作為受體聚集與訊號傳遞的平台，使 TSPAN8 參與細胞訊號傳遞、細胞移動及蛋白質運輸等不同過程。其作用不只在於形成膜上區域，也包括協助特定分子進入或發揮作用的局部環境。
在一項訊號途徑中，TSPAN8 與 RICTOR 及 integrin alpha3/ITGA3 形成複合體，促進 mTORC2 活化及 AKT1 磷酸化，進而導向細胞移動。另在高葡萄糖引起的細胞反應中，TSPAN8 與 mTOR、RICTOR 形成複合體，可降低凋亡與自噬。這些結果顯示，TSPAN8 相關作用可連結膜上的分子組織與細胞內訊號，但來源未將兩種情境合併為單一機制。
TSPAN8 也參與 ADAM17 介導的 TNF 加工：它將 ADAM17 招募至 tetraspanin-enriched microdomains，促進此加工過程。於腸道，TSPAN8 有助維持腸上皮屏障，並參與腸道發炎調節；其作用與改變 interferon gamma receptor 1/IFNGR1 的內吞途徑有關，使受體由 clathrin 依賴途徑轉向 lipid raft 依賴途徑，從而限制 STAT1 活化的幅度與持續時間。
此外，TSPAN8 與 endothelin converting enzyme ECE1 相關聯，並調節 ECE1 將 endothelin-1 前驅物轉換為 endothelin 的活性，因此可調節 endothelin 軸。這些不同例子反映 TSPAN8 涉及多種膜相關功能；其具體影響取決於所參與的分子及生物情境。
Promoter 與基因調控
>TSPAN8 ENST00000247829 GRCh38 chr12:71157899-71158999 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAAATAATATTTTTCTTTTGTAAGGAGTTCATGCTTGCTTATCGTGTAAAACTTAGCAAAGATTCTAAA GAATAATTTTCTCAACAACCTTTTAAAGTAGAGGGTTCTTTTATTTAGGGGGAGAAGAACTCCCTTTGAG AGGCAGGATGTGGAAACTAACATGACCCAGGCTGTTTACACAAAGCAGTCCACACCTCCCTGATGATGTC GGAGCATTTTGCCTTTACCTGAGACAGCTGCCTTCTATTAGCACTAGAAACAAATAGTAAAATCTATGGT CACTGATCCATGACCACCTTCCCATTTTGAATTTTTTTGTCCGGGAGGACCTGGAATCCAGAAACTGAGT TGGTGGAGAACAGCTGTTGCTAGATACAATTTATCAGAGGAAGGAAATTACAGTGTCCACCTTAAAAACA AACCAAGCTATCAGAATGACTACGCATTATAAAATGAAAACAATGTTGCAGTCAGTGCCACTTTATGATT TCTTTCCCTTTGTATCATAAAGAAATAAAGATAAAAAGCAAATGGTCTTATCATGATAGGCAAGGCTGCC TCTCCCTCTGCAATTTCTGTGGTGTATTTACGGCAGCTCTGGAATTCTTTTGAAATAAATTTAGATGTTT TGGAGGGCAGATACATGTAATGGTTATTTTACTATTCTAGGTTTAATGATAACAGGTTGCTATGTCTAAG CTTTGATATTTTGCAGATTTCTAAATGCATTTTATTGCATTTAGAAGGAATTTTGTAGTATTGAGAAAAT GCAATGCAAAAATGAGTAGAGATACAATGTCCATTTAACTCAGAACAAAACAACCTTATTTCCCCATAGT TGAAATGGAGGGCGGGGAAGTCAGGCAGTGGTTTCTGAAAGCCAAGAACTTAGTAGCACTGTGCCATTCT CTTGCCTGATCCAGTGCCATTCCCTTCACTTGATATCTGTTTACTTTAGAGGAGGCAGTTTTTGAGAAAG GATCATAAATATCCTGGCCCAGTGCCCCAGGAGCTATGACAAGCAAAGGAACATACTTGCCTGGAGATAG CCTTTGCGATATTTAAATGTGTGAGTTAATAGCCTTTGAGATATTTAAATG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TSPAN8_3 ↗ | 12:71,157,804 | 負股 | 71,157,794–71,157,853 |
| TSPAN8_1 ↗ | 12:71,157,999 | 負股 | 71,157,989–71,158,048 |
| TSPAN8_2 ↗ | 12:71,440,870 | 負股 | 71,440,860–71,440,919 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_844H3H · enhancer · 71152922–71153125 · regulatory
ENSR12_9338KP · promoter · 71157889–71158223 · regulatory
ENSR12_844H82 · enhancer · 71160683–71160897 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：237 aa
TSPAN8 蛋白長 237 個胺基酸，屬於 tetraspanin（TM4SF）家族。序列註解指出有四段螺旋跨膜區，分別位於第 10–33、58–72、84–109 與 206–230 個胺基酸；兩端及部分短區段位於細胞質側，另有兩段區域位於細胞外。這些拓撲區段的註解依據為計算性證據。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TSPAN8 定位於細胞膜，為多次跨膜蛋白。 來源未提供刺激條件、異構型差異或定位動態的描述。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- MEP1BQ16820 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PNLIPRP1P54315 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC38A7Q9NVC3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STX2P32856-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TIMM23O14925 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TSPAN8 可形成同源寡聚體，並與 MEP1B、integrin alpha3/ITGA3、RICTOR、MTOR、ADAM17 及 ECE1 發生交互作用。另有功能描述指出，TSPAN8 與 RICTOR、integrin alpha3/ITGA3 可形成與 mTORC2 活化相關的複合體；與 mTOR、RICTOR 形成的複合體則與高葡萄糖誘發的凋亡及自噬減少相關。這些功能關係不代表來源所列的每一項交互作用都屬於同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TSPAN8 是 tetraspanin-enriched microdomains（TERMs）的結構成分，這些微區可作為受體聚集與訊號傳遞平台，並與細胞訊號傳遞、移動及蛋白質運輸相關。它可招募 ADAM17 以促進 TNF 加工，並透過與 RICTOR、integrin alpha3/ITGA3 或 mTOR 的複合體影響 mTORC2、AKT1、凋亡與自噬；在腸道也參與上皮屏障維持、發炎調節及 IFNGR1 內吞途徑轉換，並可調節 ECE1 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Structural component of specialized membrane microdomains known as tetraspanin-enriched microdomains (TERMs), which act as platforms for receptor clustering and signaling. Participates thereby in diverse biological functions such as cell signal transduction, migration and protein trafficking. Promotes ADAM17-mediated TNF processing through recruitment of ADAM17 to tetraspanin-enriched micro-domains (TEMs). Forms a complex with RICTOR and integrin alpha3/ITGA3 to mediate mTORC2 activation and AKT1 phosphorylation leading to cell migration. Reduces apoptosis and autophagy induced by high glucose levels through forming a complex with mTOR and RICTOR. Contributes to the maintenance of intestinal epithelial barrier and plays a role in the regulation of intestine inflammation by switching interferon gamma receptor 1/IFNGR1 from clathrin-dependent to lipid raft-dependent endocytosis route to limit STAT1 activation magnitude and duration. Acts as a modulator of the endothelin axis by associating with endothelin converting enzyme ECE1 and regulating its activity of conversion of the endothelin-1 precursor to endothelin PMID 25761241 ↗ · PMID 27180357 ↗ · PMID 35904232 ↗ · PMID 36078095 ↗ · PMID 37204469 ↗ · PMID 37835445 ↗ |
| 交互作用 | TSPAN8 可形成同源寡聚體，並與 MEP1B、integrin alpha3/ITGA3、RICTOR、MTOR、ADAM17 及 ECE1 發生交互作用。來源列出這些分子互作，但未指出它們全都共同組成同一複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms homooligomers. Interacts with MEP1B. Interacts with integrin alpha3/ITGA3. Interacts with RICTOR and MTOR. Interacts with ADAM17. Interacts with ECE1 PMID 25761241 ↗ · PMID 27180357 ↗ · PMID 34524408 ↗ · PMID 35904232 ↗ · PMID 36078095 ↗ · PMID 37835445 ↗ |
| 細胞定位 | TSPAN8 定位於細胞膜，屬於多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 27180357 ↗ · PMID 34524408 ↗ · PMID 37204469 ↗ · PMID 37835445 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTGCCCCAGGAGCTATGACAAGCAAAGGAACATACTTGC40CTGGAGATAGCCTTTGCGATATTTAAATGTCCGTGGATAC80AGAAATCTCTGCAGGCAAGTTGCTCCAGAGCATATTGCAG120GACAAGCCTGTAACGAATAGTTAAATTCACGGCATCTGGA160TTCCTAATCCTTTTCCGAAATGGCAGGTGTGAGTGCCTGT200ATAAAATATTCTATGTTTACCTTCAACTTCTTGTTCTGGC240TATGTGGTATCTTGATCCTAGCATTAGCAATATGGGTACG280AGTAAGCAATGACTCTCAAGCAATTTTTGGTTCTGAAGAT320GTAGGCTCTAGCTCCTACGTTGCTGTGGACATATTGATTG360CTGTAGGTGCCATCATCATGATTCTGGGCTTCCTGGGATG400CTGCGGTGCTATAAAAGAAAGTCGCTGCATGCTTCTGTTG440TTTTTCATAGGCTTGCTTCTGATCCTGCTCCTGCAGGTGG480CGACAGGTATCCTAGGAGCTGTTTTCAAATCTAAGTCTGA520TCGCATTGTGAATGAAACTCTCTATGAAAACACAAAGCTT560TTGAGCGCCACAGGGGAAAGTGAAAAACAATTCCAGGAAG600CCATAATTGTGTTTCAAGAAGAGTTTAAATGCTGCGGTTT640GGTCAATGGAGCTGCTGATTGGGGAAATAATTTTCAACAC680TATCCTGAATTATGTGCCTGTCTAGATAAGCAGAGACCAT720GCCAAAGCTATAATGGAAAACAAGTTTACAAAGAGACCTG760TATTTCTTTCATAAAAGACTTCTTGGCAAAAAATTTGATT800ATAGTTATTGGAATATCATTTGGACTGGCAGTTATTGAGA840TACTGGGTTTGGTGTTTTCTATGGTCCTGTATTGCCAGAT880CGGGAACAAATGAATCTGTGGATGCATCAACCTATCGTCA920GTCAAACCCCTTTAAAATGTTGCTTTGGCTTTGTAAATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。