基因總覽
TSPAN6 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 tetraspanin 6。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 Xq22.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373020 ★ | 100,627,108–100,636,806 | 8 |
| ENST00000974238 | 100,627,080–100,636,829 | 7 |
| ENST00001073177 | 100,627,080–100,636,829 | 6 |
| ENST00001132106 | 100,627,108–100,636,829 | 8 |
| ENST00000612152 | 100,627,109–100,637,104 | 7 |
| ENST00000867886 | 100,628,553–100,636,829 | 7 |
| ENST00000867888 | 100,628,715–100,636,829 | 8 |
| ENST00001073176 | 100,628,717–100,636,829 | 8 |
| ENST00000867887 | 100,628,722–100,636,829 | 7 |
| ENST00000974239 | 100,628,724–100,636,829 | 7 |
| ENST00000867890 | 100,629,030–100,636,829 | 7 |
| ENST00000867889 | 100,629,031–100,636,829 | 8 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TSPAN6 ENST00000373020 GRCh38 chrX:100636706-100637806 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCACTTAACACTCAGTCTCTGCCTTCAAAGAGCTGACGCTTTAGTTGAGAAATCAGACCTTAACGCACC TCCTGTGTTGTAACAACATAGACCAATATATTCACAATATATAACATTAGGTTTTAATCTCTCTGTAATC AGCTGGGTTTTGATGGGAAAAACCAGGTGGCTGGAATGTACAGTGCCTTTCTGTTTTAACATTTAAGAGG AGGTCACACTCACCAGGGATTTTTCCATTGCACTCTCTCTTTTTAAAAGTTTACAGCGAATAGCTGAACT TACATTTCACTATTATGTAAAAATACTTTCCCTCAACTTTCCAATTACTTAGGGGATAAAAAAGGAGAGG AATACTGGGGTTTTGCAAAGTCCTGCAGGTAAATTCTAAAGTCATTATTATCTTTAATACCTAGCTTAGA AATTCTTTCAACAAGTGGTGATTATTTTCCTCCATTCACATCTCCCCTTCCTAACCCATAAAACAATGTT CACAAATTGAAAAGCACACAAGTGAGAAAAAAATCAGCCTAATTCCACCAGAGGTAAATTTCACTGTTCC TTTCAGTTTTTGTCTAAGCACACGTGACTGTATGTATTGCTTTGCAATCCGCTTTCTTTTTGCAAATATA TTTCTTGTGGGTATTTTCCCATGTATTTTCTTAGGTCGCTTTTAACCTCTTCATTCTTTTCCTTCTCTCT AGGGCACCAGGGGCCAGGGAGGCCCAATCTCAGAGCGCTGCGGGCTCTGCTGGTGATAGAAACAATATGG TGAAGTTATAAGGAGAGGGGAGGGGTGGGGGGCGGGAAAGATTCCTTAGGATAGAAAAAAAACAATGAAG AAAGCTCCACTTGAAGACCTATGAAATTTCCGACACTAGAACCTTTGTATATAGTTTTCGGTAACCTTCG GCAGGGGGCGCTCTGAAATTGTTGCCACTTTCCGGACAGCCTCCCATACTTTACCCTCTACAAAATTGTA CAGTGTTTCCGGCCCTTCTCAGTTGTGGACGCTCGTAAGTTTTCGGCAGTTTCCGGGGAGACTCGGGGAC TCCGCGTCTCGCTCTCTGTGTTCCAATCGCCCGGTGCGGTGGTGCAGGGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TSPAN6_1 ↗ | X:100,636,751 | 負股 | 100,636,741–100,636,800 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_93GXHH · promoter · 100636796–100637194 · regulatory
ENSRX_5TN4ZJ · CTCF_binding_site · 100636883–100636904 · regulatory
ENSRX_5TN539 · CTCF_binding_site · 100637256–100637277 · regulatory
· motif · 100635278–100635289 · motif
· motif · 100636885–100636901 · motif
· motif · 100637258–100637274 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：245 aa
TSPAN6（tetraspanin 6）屬於 tetraspanin（TM4SF）家族，全長 245 個胺基酸。序列註解顯示其具有四段跨膜螺旋，並在膜兩側分布胞質區域與胞外區域；其中第 115–208 位胺基酸構成較長的胞外區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TSPAN6 被註解為多次穿越膜的膜蛋白。 此資料未提供特定細胞器定位、定位變化條件或異構型差異。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | TSPAN6 被分類為膜蛋白，且屬於多次穿越膜的類型；此註解未進一步指出其所在的特定膜或細胞內位置。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTTGTGGACGCTCGTAAGTTTTCGGCAGTTTCCGGGGAG40ACTCGGGGACTCCGCGTCTCGCTCTCTGTGTTCCAATCGC80CCGGTGCGGTGGTGCAGGGTCTCGGGCTAGTCATGGCGTC120CCCGTCTCGGAGACTGCAGACTAAACCAGTCATTACTTGT160TTCAAGAGCGTTCTGCTAATCTACACTTTTATTTTCTGGA200TCACTGGCGTTATCCTTCTTGCAGTTGGCATTTGGGGCAA240GGTGAGCCTGGAGAATTACTTTTCTCTTTTAAATGAGAAG280GCCACCAATGTCCCCTTCGTGCTCATTGCTACTGGTACCG320TCATTATTCTTTTGGGCACCTTTGGTTGTTTTGCTACCTG360CCGAGCTTCTGCATGGATGCTAAAACTGTATGCAATGTTT400CTGACTCTCGTTTTTTTGGTCGAACTGGTCGCTGCCATCG440TAGGATTTGTTTTCAGACATGAGATTAAGAACAGCTTTAA480GAATAATTATGAGAAGGCTTTGAAGCAGTATAACTCTACA520GGAGATTATAGAAGCCATGCAGTAGACAAGATCCAAAATA560CGTTGCATTGTTGTGGTGTCACCGATTATAGAGATTGGAC600AGATACTAATTATTACTCAGAAAAAGGATTTCCTAAGAGT640TGCTGTAAACTTGAAGATTGTACTCCACAGAGAGATGCAG680ACAAAGTAAACAATGAAGGTTGTTTTATAAAGGTGATGAC720CATTATAGAGTCAGAAATGGGAGTCGTTGCAGGAATTTCC760TTTGGAGTTGCTTGCTTCCAACTGATTGGAATCTTTCTCG800CCTACTGCCTCTCTCGTGCCATAACAAATAACCAGTATGA840GATAGTGTAACCCAATGTATCTGTGGGCCTATTCCTCTCT880ACCTTTAAGGACATTTAGGGTCCCCCCTGTGAATTAGAAA920GTTGCTTGGCTGGAGAACTGACAACACTACTTACTGATAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。