基因總覽
TSPAN4（tetraspanin 4）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 tetraspanin（TM4SF）家族，為長 238 個胺基酸的多次穿膜蛋白。蛋白質具有四段穿膜螺旋，並包含位於細胞外及細胞質側的區段；較長的細胞外區段位於第三、第四段穿膜螺旋之間。TSPAN4 是特殊膜微區 tetraspanin-enriched microdomains（TERMs）的結構成分，這些微區可作為受體聚集與訊號傳遞的平台。其已知功能亦涉及遷移細胞後方回縮纖維上的 migrasome。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397397 ★ | 842,852–867,111 | 9 |
| ENST00000971873 | 840,686–867,120 | 11 |
| ENST00000971874 | 841,315–867,120 | 9 |
| ENST00000971875 | 841,834–867,120 | 10 |
| ENST00000894461 | 842,089–867,120 | 7 |
| ENST00000894462 | 842,098–867,120 | 9 |
| ENST00000894463 | 842,152–867,120 | 8 |
| ENST00000397411 | 842,812–867,120 | 8 |
| ENST00000397396 | 842,824–867,120 | 8 |
| ENST00000894464 | 842,835–867,120 | 8 |
| ENST00001092663 | 842,837–867,120 | 9 |
| ENST00000894465 | 842,838–867,120 | 9 |
顯示 12/73 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TSPAN4 是 tetraspanin-enriched microdomains（TERMs）的結構成分。這類特殊膜微區可提供受體聚集及訊號傳遞的平台，讓膜上的受體在特定微區中組織。來源指出 TSPAN4 在細胞遷移相關的 migrasome 形成中具有重要作用。
Migrasome 是遷移細胞後方回縮纖維上形成的大型囊泡狀細胞器。TSPAN4 參與這些結構在回縮纖維上的形成；在形成機制方面，它可感知膜曲率，並於 migrasome 生合成的較晚階段協助穩定其結構。這項作用將 TSPAN4 的膜微區特性與 migrasome 的形成及維持連結起來。
此外，TSPAN4 可能對 histamine H4 receptor（HRH4）具有調節作用，但不影響組織胺與 HRH4 的結合，也不影響 HRH4 的訊號傳遞。因此，這項調節角色不應解讀為改變受體的配體結合或訊號功能；來源未進一步說明其調節方式。
Promoter 與基因調控
>TSPAN4 ENST00000397397 GRCh38 chr11:841852-842952 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGCGACGGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAGAAAAATAAAATAAAAT AAATTTCTGGAGATCAGGGTCTCCCCAGGTTGTCCAGGCTGGTCTCGACCTCCTGGGCTCAAGCAAGCCT CTCGCCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGATGTCAGCCGCCGCGCCCGCCCGTCCTGCAGCGAGG TTTGCAGGACATGGGGTGGGCCTGGGGGCAGAGATGGGAATAGGGCGGAGGCCAAGGGCTTTACTGCGGG TGACAAGACGCCTGCGACCCGCCAGGCCACCTAGAATCCCCAGGACACCACTGGTTTGAAGCCCAACTCC GTTCTCTTCCCCAGACTTCAGGGGATAAGGTTCTCCCGAAAGCAGATCACAGAGCGGGGCTGGAGAAGCC GGGCCTGAAGCTGCTCATGGGGCGCTGGCCTCAGGCAGCGCTGCGCCTCCCGCCCCGGCGCGCACCCCAG GGCGGACTCAGCCCCCAGCCCCGGCCCGCGCCCCACGGCGGACTCAGCCCCTAGCCCCGGCCCGCGCCTC ACCCCTCGGTGTACTCGGCCTGCAGCAGCCCCAGGTAAGCCTCCCACTTGTTGCCGACGATCTTGCCACA AGTGAAGCAGCGTACAGGGATGATCATGGCGGCGGCGCGTCCCAGACTGCCCGGCCCGGCCCGGCCGCAC GCGAAGAACCCCCCCAGGCCCCGCCCCGGGCGCGTCCACTGTTGCGGGAGAATCGGCTCCGCTCGTTCTC CGCTGTTCCGGCCGTCCCTCCACCGGCCCCGCCACCGCTGGCCGCAGTTTCCGCCGCGATAGGGGCTTCC CGTGCGTCCCGGGGCTCCTGGGCCTGTGCGTCCCGGGGCTCCCGGGCCCGCGCGGCCGCGGCAGCAGCAG ACCGCACACCCCCGCCCACCGTCTTGGTGCATCCCGGCGCTACGGCGTCTGAGCAGGGCCGTAAAGCTGC GGCGGCGGTTCGCGTTTCTCGTGTCCGCTTGACTGACAGCTGCGCGGCGGGAGCGGGCGGCGCGAGCGGG AGGCGGCGGCGCAGGTACTGCGCCTGGGGGTTGTGGGGGCGTGCGGCCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TSPAN4_1 ↗ | 11:842,852 | 正股 | 842,803–842,862 |
| TSPAN4_2 ↗ | 11:844,147 | 正股 | 844,098–844,157 |
| TSPAN4_3 ↗ | 11:849,856 | 正股 | 849,807–849,866 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_57BQX · CTCF_binding_site · 838488–838509 · regulatory
ENSR11_57BWR · CTCF_binding_site · 839318–839339 · regulatory
ENSR11_57C37 · CTCF_binding_site · 840057–840078 · regulatory
ENSR11_9C2S · promoter · 842519–842951 · regulatory
ENSR11_B6J4 · promoter · 843591–844456 · regulatory
ENSR11_C495 · enhancer · 844457–845706 · regulatory
ENSR11_57CSX · CTCF_binding_site · 844750–844771 · regulatory
ENSR11_9C43 · promoter · 846707–847207 · regulatory
· motif · 838490–838506 · motif
· motif · 838694–838703 · motif
· motif · 838694–838703 · motif
· motif · 839320–839336 · motif
· motif · 840059–840075 · motif
· motif · 840702–840713 · motif
· motif · 842505–842515 · motif
· motif · 842569–842579 · motif
· motif · 842647–842657 · motif
· motif · 842653–842668 · motif
· motif · 842660–842677 · motif
· motif · 842753–842768 · motif
· motif · 842760–842775 · motif
· motif · 842764–842774 · motif
· motif · 842770–842780 · motif
· motif · 842834–842849 · motif
· motif · 842931–842944 · motif
· motif · 842936–842946 · motif
· motif · 842961–842970 · motif
· motif · 842997–843013 · motif
· motif · 844061–844071 · motif
· motif · 844192–844202 · motif
· motif · 844230–844240 · motif
· motif · 844236–844246 · motif
· motif · 844242–844252 · motif
· motif · 844261–844271 · motif
· motif · 844280–844290 · motif
· motif · 844752–844768 · motif
· motif · 844826–844837 · motif
· motif · 844894–844906 · motif
· motif · 844897–844904 · motif
· motif · 845269–845291 · motif
· motif · 845269–845291 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：238 aa
TSPAN4 蛋白長 238 個胺基酸，含四段穿膜螺旋，分別位於第 14–34、56–76、86–106 與 202–222 位胺基酸。兩端及部分連接區位於細胞質側；細胞外區段包括第 35–55 位與第 107–201 位胺基酸，其中後者較長。此蛋白屬於 tetraspanin（TM4SF）家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TSPAN4 定位於細胞膜，屬多次穿膜蛋白。 來源未提供其定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 38 個夥伴
- CATSPER1Q8NEC5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHRDQ9H2X0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLEC2DQ9UHP7-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB5Q02930-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- EVA1AQ9H8M9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCHO1A0A0C3SFZ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRS3O43559 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNEQ9Y223-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GUCD1Q96NT3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-11Q9BYQ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-5Q9BYR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-2Q3LI66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-2Q9BYQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-3Q9BYQ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE1AQ5T7P2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE2BO14633 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE2DQ5TA82 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE3AQ5TA76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE3CQ5T5A8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE3DQ9BYE3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE4AQ5TA78 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TSPAN4 與 integrins 形成複合體，並與 HRH4 交互作用。來源未進一步界定這些關係是否涉及直接結合，也未描述相關複合體的組成或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TSPAN4 是 tetraspanin-enriched microdomains（TERMs）的結構成分，這些膜微區可作為受體聚集與訊號傳遞的平台。它對遷移細胞後方回縮纖維上的 migrasome 形成具有重要作用；並可感知膜曲率，在生合成較晚階段協助穩定 migrasome。TSPAN4 也可能調節 HRH4，但不影響組織胺與 HRH4 的結合或其訊號傳遞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Structural component of specialized membrane microdomains known as tetraspanin-enriched microdomains (TERMs), which act as platforms for receptor clustering and signaling. Plays an essential role in migrasome formation and migration on retracting fibers at the rear end of migrating cells. Migrasomes are cellular organelles that form as large vesicle-like structures on retraction fibers of migrating cells. Mechanistically, acts as a membrane curvature sensor and participates in stabilizing the migrasome structure in a late stage of biogenesis. May also play a regulatory role for the histamine H4 receptor/HRH4 without affecting histamine binding to HRH4 or signaling PMID 31371828 ↗ · PMID 34439793 ↗ · PMID 36252000 ↗ · PMID 36823145 ↗ |
| 交互作用 | TSPAN4 與 integrins 形成複合體，並與 HRH4 交互作用。來源未進一步說明這些關係是否為直接結合，或提供其複合體組成與功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TSPAN4 位於細胞膜，並屬於多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGTCCGCTTGACTGACAGCTGCGCGGCGGGAGCGGGCGG40CGCGAGCGGGAGGCGGCGGCGCAGAGCTTGGGGCTTCCTT80GGTCGCACCCACCACCTGCCTGCCCACTGGTCAGCCTTCA120GGGACCCTGAGCACCGCCTGGTCTCTTTCCTGTGGCCAGC160CCAGAACTGAAGCGCTGCGGCATGGCGCGCGCCTGCCTCC200AGGCCGTCAAGTACCTCATGTTCGCCTTCAACCTGCTCTT240CTGGCTGGGAGGCTGTGGCGTGCTGGGTGTCGGCATCTGG280CTGGCCGCCACACAGGGGAGCTTCGCCACGCTGTCCTCTT320CCTTCCCGTCCCTGTCGGCTGCCAACTTGCTCATCATCAC360CGGCGCCTTTGTCATGGCCATCGGCTTCGTGGGCTGCCTG400GGTGCCATCAAGGAGAACAAGTGCCTCCTGCTCACTTTCT440TCCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTCCTGCTGGAGGCCACCAT480CGCCATCCTCTTCTTCGCCTACACGGACAAGATTGACAGG520TATGCCCAGCAAGACCTGAAGAAAGGCTTGCACCTGTACG560GCACGCAGGGCAACGTGGGCCTCACCAACGCCTGGAGCAT600CATCCAGACCGACTTCCGCTGCTGTGGCGTCTCCAACTAC640ACTGACTGGTTCGAGGTGTACAACGCCACGCGGGTACCTG680ACTCCTGCTGCTTGGAGTTCAGTGAGAGCTGTGGGCTGCA720CGCCCCCGGCACCTGGTGGAAGGCGCCGTGCTACGAGACG760GTGAAGGTGTGGCTTCAGGAGAACCTGCTGGCTGTGGGCA800TCTTTGGGCTGTGCACGGCGCTGGTGCAGATCCTGGGCCT840GACCTTCGCCATGACCATGTACTGCCAAGTGGTCAAGGCA880GACACCTACTGCGCGTAGGCCGCCCACCGCCCGCTTCTCT920GCCAAAAGGACGCCCACGGGGAGATGGCCGCACCCACAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。