基因總覽
TSPAN32 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 tetraspanin 32。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11p15.5。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000182290 ★ | 2,302,013–2,318,204 | 10 |
| ENST00000855795 | 2,301,990–2,318,204 | 9 |
| ENST00000855796 | 2,301,990–2,318,204 | 8 |
| ENST00000961152 | 2,301,990–2,318,204 | 11 |
| ENST00001095227 | 2,301,990–2,318,204 | 8 |
| ENST00001126511 | 2,301,990–2,318,203 | 7 |
| ENST00001143298 | 2,301,990–2,318,204 | 10 |
| ENST00000612299 | 2,302,013–2,318,204 | 9 |
| ENST00000381121 | 2,302,150–2,318,142 | 9 |
| ENST00000451520 | 2,302,723–2,318,204 | 9 |
| ENST00000381117 | 2,302,868–2,317,924 | 8 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TSPAN32 ENST00000182290 GRCh38 chr11:2301013-2302113 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCCAGAGCTGCAGAGGGTGCTGCCTGGGGGTGCTGGGCTGGACGGGGGTCCTGGTTGTCCCTCCTGGTT CTCCTGGTTCTCCCTCCGCAGAGGGAGGGAGGCGGTGGCCTCAGCAGTTCCTCCAGCAGCGTTCCTGAGC GGGCGGCAGCTGGGCCCTCTTCCCACAGCCACGCTGGGGTTGCCATGCCTGCAGGTCTTGGGGCCCCCTC CCCCTTGATGAGGTCCTGACCAAATGCAGGAGGAGCAATTCCAGCACCGAGGGGCGAGCAGAGCCGCCTG TTAGCACTCCTGGGAGGGCCCGGAGTGGTCCCTGAATGATGGATTCACCTGGAACATTTTCACCCTCTTC AGGCCCACCCTGCCCCAGAGGCCCACGGAAACCCTGCCTGTACTGGGGCCGCAGCGCTGCCCCCACCCAT ACGTAATTACACGGCTCGGTGTAATTGCAAATTCGAGGTTTACAAAGCCTCCCCCTGGAGGCCCCACGTG AGTGTGAGCGAGGCCCCAGCCCACCCCTGTGGCCCCAAGAAGGCTCTGCGACAAAATATCCATGAGTGCC GCCCACGAAGGCATTAAAACCAACGACCTTCTCAAAACTTAAGCTGTCACAGGACATTTCAAAGGGTGTT TCCTAAGAACACCTCAATAATGATGTTCCAAGGAGACCCCATCCAAATTCCTCCAAGGATTACGCCCCCA AGGCCCAGTCCACACTTGCTCACTCCCAGGACGGGGAGCTCACCTCCTCCTCCCCGGGCGCCGTCTCCTC CACATCCCACACCAGGTCCTGCCCATGACTTTCCCCCTCTCAGCGCCGTCCTCAGTGGCCACACCAAGAA CGAGGCCATGTCTTCCTGGGAAGGGCCTCAGATGTCAGCAAATGCCCTGGTGTCTTGGGCTGGGCTGGGG GCACCAGGGTGAGGTGGTGGGGGGAGCCAACCTCACTGCCCCTCCCCTTCCTGCCTGCCCTTCTTCCGGG GCACCCAGCAGCTCGGTCCTAGGGCGATGTTGACAGACAGACAGAGGGGCGGATGCAGCCTACCTCCTGG GCAGTGAGCTGCGGTCTGAGGCCCCTGCCCAGCTGGAAACCACAGGGAGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TSPAN32_1 ↗ | 11:2,302,027 | 正股 | 2,301,978–2,302,037 |
| TSPAN32_2 ↗ | 11:2,302,140 | 正股 | 2,302,091–2,302,150 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_5JL76 · CTCF_binding_site · 2298914–2298935 · regulatory
ENSR11_5JL9P · CTCF_binding_site · 2299468–2299489 · regulatory
ENSR11_5JLM2 · CTCF_binding_site · 2301477–2301498 · regulatory
ENSR11_9WN4 · promoter · 2301903–2302160 · regulatory
ENSR11_9WN8 · promoter · 2302233–2302733 · regulatory
ENSR11_5JMBN · CTCF_binding_site · 2305502–2305523 · regulatory
· motif · 2298916–2298932 · motif
· motif · 2299470–2299486 · motif
· motif · 2300401–2300414 · motif
· motif · 2301479–2301495 · motif
· motif · 2305440–2305455 · motif
· motif · 2305504–2305520 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:320 aa
tetraspanin 32 長 320 個胺基酸,屬於 tetraspanin(TM4SF)家族。序列註解標示四段螺旋型跨膜區,分別位於第 14–34、60–80、90–110 與 203–223 個胺基酸位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
tetraspanin 32 被註解為膜蛋白,並具有多次跨膜特徵;現有資料未提供更具體的細胞膜區域或定位條件。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | tetraspanin 32 被描述為膜蛋白,且屬於多次跨膜膜蛋白。此註解支持其與膜的關聯及跨膜特徵,但未指出具體膜區域、細胞內位置或定位條件。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGGGCGATGTTGACAGACAGACAGAGGGGCGGATGCAGCC40TACCTCCTGGGCAGTGAGCTGCGGTCTGAGGCCCCTGCCC80AGCTGGAAACCACAGGGAGGGGAAGGGAGGGGAGGAGAGG120AGAGGAGAGGAACCGTCATGGGGCCTTGGAGTCGAGTCAG160GGTTGCCAAATGCCAGATGCTGGTCACCTGCTTCTTTATC200TTGCTGCTGGGCCTCTCTGTGGCCACCATGGTGACTCTTA240CCTACTTCGGGGCCCACTTTGCTGTCATCCGCCGAGCGTC280CCTGGAGAAGAACCCGTACCAGGCTGTGCACCAATGGGCC320TTCTCTGCGGGGTTGAGCCTGGTGGGCCTCCTGACTCTGG360GAGCCGTGCTGAGCGCTGCAGCCACCGTGAGGGAGGCCCA400GGGCCTCATGGCAGGGGGCTTCCTGTGCTTCTCCCTGGCG440TTCTGCGCACAGGTGCAGGTGGTGTTCTGGAGACTCCACA480GCCCCACCCAGGTGGAGGACGCCATGCTGGACACCTACGA520CCTGGTATATGAGCAGGCGATGAAAGGTACGTCCCACGTC560CGGCGGCAGGAGCTGGCGGCCATCCAGGACGTGTTTCTGT600GCTGTGGGAAGAAGTCTCCTTTCAGCCGTCTGGGGAGCAC640AGAGGCTGACCTGTGTCAGGGAGAGGAGGCGGCGAGAGAG680GACTGCCTTCAGGGCATCCGGAGCTTCCTGAGGACACACC720AGCAGGTCGCCTCCAGCCTGACCAGCATCGGCCTGGCCCT760CACGGTGTCCGCCTTGCTCTTCAGCTCCTTCCTGTGGTTT800GCCATCCGCTGTGGCTGCAGCTTGGACCGCAAGGGCAAAT840ACACCCTGACCCCACGAGCATGTGGCCGCCAGCCCCAGGA880GCCCAGCCTCTTGAGATGCTCCCAGGGTGGACCCACACAT920TGTCTCCACTCCGAAGCAGTTGCTATTGGTCCAAGAGGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。