基因總覽
TSN 是蛋白質編碼基因，產物 translin 屬於 translin family。現有資料指出，translin 涉及 DNA 與 RNA 的辨識，並參與 RNA 調控相關作用。來源未提供足以進一步描述其家族特徵或蛋白質整體結構的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000389682 ★ | 121,755,651–121,767,853 | 6 |
| ENST00000455432 | 121,737,103–121,765,218 | 6 |
| ENST00000536142 | 121,755,545–121,767,871 | 5 |
| ENST00000898259 | 121,755,545–121,767,871 | 7 |
| ENST00000898260 | 121,755,545–121,767,871 | 6 |
| ENST00000920039 | 121,755,545–121,767,871 | 6 |
| ENST00001144133 | 121,755,545–121,767,871 | 6 |
| ENST00000898261 | 121,755,660–121,767,871 | 6 |
| ENST00000409193 | 121,756,171–121,767,871 | 6 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
translin 可辨識染色體易位斷點接合處的特定共識序列；這類易位多涉及免疫球蛋白（Ig）或 T 細胞受體基因片段。資料指出，translin 似乎也能辨識重組熱點發生交錯式斷裂後產生的單股 DNA 末端，相關描述保留「似乎」的推論程度。
在 RNA 調控方面，translin 與 TSNAX 組成 Translin-TRAX complex，並參與 RNA-induced silencing complex（RISC）的活化。它在此複合體中有助於結合單股 RNA；RISC 活化則涉及降解 siRNA passenger strand 的切割產物。這些作用將 translin 與 RNA 沉默過程相連結。
另有相似性推論指出，translin 可能參與 tRNA 加工，方式是降解 5′ pre-tRNA 片段。此項功能標示為 By similarity，因此應視為推測，而非已確立的作用。現有資料未提供更多細節以說明此過程的條件或其生物學後果。
Promoter 與基因調控
>TSN ENST00000389682 GRCh38 chr2:121754651-121755751 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCTCGAACTCCTGACTTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCC ACTGCGCCCGGCCGATAGTTTTTTAAAAATGTAGGTGCTAGTGGTCTTACTGTCTTCTTCATGGACATGA AATTATTCTCATATAATGAGAATTAAATATGATCCTTCATGTAAAGAGTTTAGAATAATGTCAGAAACAA AGCAAGCAATAAATTATCATTTAGTTGATAAGAATCATTCCAATTCATCTGGCGAGTGCAACACACACAC ACACTGTATTTGTGTATGGAATAACTGTTCAAGAACACACACACAGTATGTGTGTATGAAATAACTCTTC AAGAACAAAGGGGAAACCGTTATAGGGCATGAAAGGGGAAACCGTTATAGGGCATGGAAGGGGAATTAGG ACAAGGTGTGAGTGGAAAGAGAAACATCCCACCGCACACGCTTAAAAAAGCCGTTTAATTTAAAAATAGG TAATACAGCCATACAGAGAAGACATTAAAAGATCTACACAGAAAATTTTCGCTCCCAATCCATTCCCTAC TCACAGTCCTACATACGTTACTTTTATTTTCCTTTTTTTTGGAAATGCACTGGCCCCCTACTCTCTCACG AAGGCTGAACTCTCTCTACATTCTTCTGCACCTGTTTTTTGTGCATACTCTTTCGTTGTCAAATATTTCC CTCCAACTGTTGTTGTGTATGAAATAAATACACACATATAAGCTAACCAGCCCCACTTGCCCGCACCACC TACACGCCCGTCCCCGCCCTCCCTCAGGCCCACGTGCTCCGAGGGCCGCCTTCGCAGGTTGTTTCTGGCG ATGCCTGTCTGAAGGCCTCAGACTGAGGCCCCGCCCACTCTCCCTCTCCTCTGCCCTTTGGACGCGCGCC TCGGTTCCGAACGCAGCGGACGGCGCCTCAGGCAGCGCGGCGGACAGCCCGTCCTCCGGCGCGCCGCGAG CCTCGGAGGACCCTAGCGACGGTCGTGGCGTAAGACCGGGGGGACGCGGCGGTAGCGGCGGCCGTTGCGA TTGATTGCGCTGGTTGCCTGCGGCGTCCACTTCCTTGGCCGCCCTTGCTAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TSN_2 ↗ | 2:121,737,103 | 正股 | 121,737,054–121,737,113 |
| TSN_1 ↗ | 2:121,755,684 | 正股 | 121,755,635–121,755,694 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_BW6F3 · promoter · 121755055–121755661 · regulatory
ENSR2_93RBSB · promoter · 121755681–121756181 · regulatory
ENSR2_93RBSF · enhancer · 121756182–121756476 · regulatory
· motif · 121755073–121755085 · motif
· motif · 121755427–121755440 · motif
· motif · 121755431–121755441 · motif
· motif · 121755445–121755458 · motif
· motif · 121755449–121755458 · motif
· motif · 121755449–121755458 · motif
· motif · 121755449–121755458 · motif
· motif · 121755518–121755528 · motif
· motif · 121755520–121755533 · motif
· motif · 121755677–121755694 · motif
· motif · 121755821–121755837 · motif
· motif · 121755857–121755870 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：228 aa
translin 長 228 個胺基酸，屬於 translin family。序列註解標示第 86–90 位為 DNA/RNA 結合區域；第 177–198 位則為 leucine-zipper 區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
translin 位於細胞質與細胞質溶膠，也可見於細胞核。 DNA 損傷時，translin 會轉位至細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GIT2Q14161 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GORASP2Q9H8Y8 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MORF4L2Q15014 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSNAXQ99598 · UniProt INTERACTION · 16 experiments
- UBE2IQ7KZS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2KP61086 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TSN 與 TSNAX 可組成 Translin-TRAX complex，又稱 C3PO。此複合體為環狀異源八聚體，由六個 TSN 與兩個 TSNAX 次單元構成；DNA/RNA 結合發生於環內。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | translin 是 DNA 結合蛋白，可辨識染色體易位斷點接合處的特定共識序列；相關易位多涉及免疫球蛋白（Ig）或 T 細胞受體基因片段。它似乎也能辨識重組熱點發生交錯式斷裂後產生的單股 DNA 末端。 | 含實驗來源 | 證據與來源DNA-binding protein that specifically recognizes consensus sequences at the breakpoint junctions in chromosomal translocations, mostly involving immunoglobulin (Ig)/T-cell receptor gene segments. Seems to recognize single-stranded DNA ends generated by staggered breaks occurring at recombination hot spots PMID 9111049 ↗ |
| 功能 | translin 作為 Translin-TRAX complex 的一部分，會降解 siRNA passenger strand 的切割產物，參與 RISC 活化，並有助於複合體結合單股 RNA。另依相似性推論，它可能透過降解 5′ pre-tRNA 片段參與 tRNA 加工。 | 含實驗來源 | 證據與來源As part of the Translin-TRAX complex, participates in the activation of the RNA-induced silencing complex (RISC) by degrading siRNA passenger strand cleavage products. Within the complex, contributes to binding of ssRNA. May play a role in tRNA processing by degrading 5' pre-tRNA fragments (By similarity) PMID 21552258 ↗ |
| 交互作用 | TSN 與 TSNAX 組成環狀異源八聚體，其中包含六個 TSN 和兩個 TSNAX 次單元，DNA/RNA 結合發生於環內。此 Translin-TRAX complex 亦稱 C3PO，由 TSN/Translin 與 TSNAX/TRAX 組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ring-shaped heterooctamer of six TSN and two TSNAX subunits, DNA/RNA binding occurs inside the ring. Part of the Translin-TRAX complex (also known as C3PO), composed of TSN/Translin and TSNAX/TRAX PMID 11801738 ↗ · PMID 21552258 ↗ |
| 細胞定位 | translin 位於細胞質、細胞質溶膠及細胞核；DNA 損傷發生時，translin 會轉位至細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytosol; Nucleus; Translocates to the nucleus in response to DNA damage PMID 11801738 ↗ · PMID 7663511 ↗ · PMID 9111049 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGTCGTGGCGTAAGACCGGGGGGACGCGGCGGTAGCGGCG40GCCGTTGCGATTGATTGCGCTGGTTGCCTGCGGCGTCCAC80TTCCTTGGCCGCCCTTGCTACACTGGCTGATTGTTGTGCA120GCCGGCGCCATGTCTGTGAGCGAGATCTTCGTGGAGCTGC160AGGGCTTTTTGGCTGCCGAGCAGGACATCCGAGAGGAAAT200CAGAAAAGTTGTACAGAGTTTAGAACAAACAGCTCGAGAG240ATTTTAACTCTACTGCAAGGGGTCCATCAGGGTGCTGGGT280TTCAGGACATTCCAAAGAGGTGTTTGAAAGCTCGAGAACA320TTTTGGTACAGTAAAAACACATCTAACATCTTTGAAGACC360AAATTTCCTGCTGAACAGTATTACAGATTTCATGAGCACT400GGAGGTTTGTGTTGCAGCGCTTGGTCTTCTTGGCAGCATT440TGTTGTGTATTTGGAAACAGAAACACTAGTGACTCGAGAA480GCAGTTACAGAAATTCTTGGCATTGAGCCAGATCGGGAGA520AAGGATTTCATCTGGATGTAGAAGATTATCTCTCAGGAGT560TCTAATTCTTGCCAGTGAACTGTCGAGGCTGTCTGTCAAC600AGCGTGACTGCTGGAGACTACTCCCGACCCCTCCACATCT640CCACCTTCATCAATGAGCTGGATTCCGGTTTTCGCCTTCT680CAACCTGAAAAATGACTCCCTGAGGAAGCGCTACGACGGA720TTGAAATATGACGTGAAGAAAGTAGAGGAAGTGGTCTATG760ATCTCTCCATCCGGGGCTTTAATAAGGAGACGGCAGCAGC800TTGTGTTGAAAAATAGGAGGCTCTCCTTGCTCCTGGCCTT840GCTGACCTCAGCGGTTGCCAGGAAGGGGTGAGCACAGAGT880GCCTCTTACGGTAGTTAGGATGCTCAGTTGCTAAACACTG920CGCTTTATTTTCTTAACCAGTTGTGGTGTGAGTATCAGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。