基因總覽
TRPV6（transient receptor potential cation channel subfamily V member 6）是蛋白質編碼基因，產物屬於 transient receptor（TC 1.A.4）家族的 TrpV 亞家族，並歸於 TRPV6 次亞家族。其蛋白質是一種多次穿越細胞膜的陽離子通道，具有選擇性通透 Ca(2+) 的特性。這項基本性質使它能在細胞膜上參與鈣離子移動；來源並指出，它在包括腸道在內的多種組織中介導 Ca(2+) 攝取，並與身體鈣離子恆定相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000359396 ★ | 142,871,208–142,885,745 | 15 |
| ENST00001138436 | 142,871,208–142,885,781 | 15 |
| ENST00000436401 | 142,874,098–142,885,745 | 6 |
| ENST00000431833 | 142,877,240–142,877,979 | 3 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRPV6 形成選擇性通透 Ca(2+) 的陽離子通道，在包括腸道的多種組織中介導鈣離子攝取。來源指出，它對身體正常的 Ca(2+) 離子恆定很重要，相關範圍包括骨骼與皮膚；這項骨骼與皮膚的角色標註為依相似性推定。其通道功能因此連結細胞膜上的鈣離子通量與身體鈣平衡，但來源未提供各組織間作用的詳細差異。
通道會在細胞內鈣濃度偏低時活化，這可能包括細胞內鈣儲存耗竭的情況。通道電流呈現內向整流，代表其電流特性具有方向性。鈣離子亦參與通道失活調控：失活包含快速的 Ca(2+)-依賴機制，以及較慢的 Ca(2+)-calmodulin 依賴機制；後者可能受磷酸化調節。來源將磷酸化的調控表述為可能性，並未將其列為確定機制。
體外研究中，Mg(2+) 會以不依賴電壓的方式緩慢抑制通道。TRPV6 與 TRPV5 組成異源複合體時，通道性質似乎會改變；TRPV5-TRPV6 異源多聚串聯體則呈現電壓依賴性閘控。這些結果顯示通道調節特性可受離子環境及組成形式影響，但來源未進一步界定異源組裝對各項生理作用的影響程度。
Promoter 與基因調控
>TRPV6 ENST00000359396 GRCh38 chr7:142885645-142886745 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATCAATACAATGTAGATAATAATACCTGCCTTGCAGGTTTGTTACGAGTTTACCTGGGAACGCTCAGTT AAAAGGCCCAGCACACAGTAGCAGCTGAATGTCACCTCCACGGGAAGGCTGGCAGATAGAATACTTGCAA AACGTGGGGTATATTTATACTAAAAAATTCTTTGTTGTTTATCTAAAATTCAAATTTGACCACGTGTCCT GTATTTTATCGGGCACCCACCCCATGCACGGGGCATTGTGGACAGTCTGTGGAGCTCCTGAGCAGGGGGT CTGCCCAGAGCTAGATTTTGTGCCCTGGCTGGTGAGCGAAGAATGCATTTTACATCTTTGGGGGTGGTTA GAAAACAACCACCAAAACAAAACCAAAGAATAACGTACATTAGAGAGTGTACATGGCTTGCAAAACCTAA CATCTTTACATTTCCTATCAGCCCTTCCAGAAAAAGTTTGCTGACCCAAAGGTGATGGGGACTGAGAGGA AAGTCTGGGAGAACTGAGTATCTTCGCAATTTATATACCTATTTCAGGCCTGGCAAGAATGAAACTGGAA GAGTCCAGAAAATGGAATTCTCCAGGACATAAGCAGGGGGAGGCAGAGAGTGAGGCAGGTGGTCGGCAGA AGAGGCACTGTGGGAAAGTGGGGCGCTCCCTCCTGGGAGTCCTCAACATTGGGAATGGGCCTGCCCTGAC TCCTCCCCTCCTTTCTCACTGCCTAGAGTCTCTCAGGGTAGGTCACTGGGTGTTCTGACGTCCAAGGGAG GCCTCGCCAGTCTTTCTGAAGGCCTCCCTGGTTGTGACTGGCCTGGGGGCAGGGAGAGAGCCCTGGGTGG AGAAAGAATTGGAGTTGGCACAAGTCCCCCTTGGTAGGCAGGTCTGTGGCTGGCCTGTGTCTTTAAATCT CAGGTAATTTGGGAGGAGGGAGGGCGTGTCCGTGCAGCTTTGGCTCCTCCTGCTCACTCCCAGCAGGAGC TCCAGACAGGCCAGCCCTGCAGAGTCCTGGCTGGCTCTGCCAAGTGTAACAAACTCACAGCCCTCTCCAA ACTGGCTGGGGCTGCTGGGAGACTCCCAAGGAACTCGTCAGGAAGGCAGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRPV6_1 ↗ | 7:142,885,745 | 負股 | 142,885,735–142,885,794 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_B33CLG · enhancer · 142880836–142881360 · regulatory
ENSR7_944P9B · promoter · 142885735–142886175 · regulatory
· motif · 142883170–142883183 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：765 aa
TRPV6 蛋白質長 765 個胺基酸，含六段螺旋型穿膜區，並具有多個位於細胞質側與細胞外側的區段。N 端可辨識出六個 ANK 重複序列；另有標註的 selectivity filter，以及與 calmodulin、S100A10 互作的區域。蛋白質屬於 transient receptor 家族的 TrpV 亞家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRPV6 是細胞膜上的多次穿膜蛋白。 現有定位資料未提供條件依賴的轉位、異構型差異或其他細胞內位置變化。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
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- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
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- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPN1P18031 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TRPV6 可形成同源四聚體，也可能與 TRPV5 形成異源四聚體，並有與 TRPV5 互作的紀錄。它亦與 S100A10 互作；此互作是運送至細胞膜所必需。與 ANAX2-S100A10 異源四聚體的互作則標示為可能。其他互作對象包括 BSPRY（依相似性推定）、TCAF1、TCAF2 isoform 2，以及 calmodulin。
疾病與遺傳關聯
TRPV6 變異會造成 transient neonatal hyperparathyroidism（HRPTTN），此病為自體隱性遺傳，與胎盤母體至胎兒的鈣運輸受損、高血清 PTH，以及新生兒期代謝性骨病相關。表現可包括全身性骨質減少、胸廓狹窄、短肋骨及多處癒合中的骨折，也可能有長骨彎曲或骨折；患者可出現出生後呼吸與餵食困難。口服補充鈣後，病況可在短時間內改善。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRPV6 是選擇性通透 Ca(2+) 的陽離子通道，可在包括腸道的多種組織介導鈣攝取，並依相似性與骨骼、皮膚的鈣恆定相關。細胞內鈣偏低時通道會活化，可能包括鈣儲存耗竭，電流呈內向整流。失活有快速的 Ca(2+)-依賴與較慢的 Ca(2+)-calmodulin 依賴機制，後者可能受磷酸化調控；體外 Mg(2+) 可不依電壓地緩慢抑制通道。與 TRPV5 異源組裝似乎會改變通道性質，異源多聚串聯體呈電壓依賴性閘控。 | 含實驗來源 | 證據與來源Calcium selective cation channel that mediates Ca(2+) uptake in various tissues, including the intestine. Important for normal Ca(2+) ion homeostasis in the body, including bone and skin (By similarity). The channel is activated by low internal calcium level, probably including intracellular calcium store depletion, and the current exhibits an inward rectification. Inactivation includes both a rapid Ca(2+)-dependent and a slower Ca(2+)-calmodulin-dependent mechanism; the latter may be regulated by phosphorylation. In vitro, is slowly inhibited by Mg(2+) in a voltage-independent manner. Heteromeric assembly with TRPV5 seems to modify channel properties. TRPV5-TRPV6 heteromultimeric concatemers exhibit voltage-dependent gating PMID 11097838 ↗ · PMID 11248124 ↗ · PMID 11278579 ↗ · PMID 15184369 ↗ · PMID 23612980 ↗ · PMID 29258289 ↗ · PMID 29861107 ↗ |
| 分子活性 | Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | TRPV6 可形成同源四聚體，也可能與 TRPV5 形成異源四聚體，並與 TRPV5 互作。它與 S100A10 的互作是運送至細胞膜所必需；與 ANAX2-S100A10 異源四聚體的互作則屬可能。其他互作對象包括依相似性推定的 BSPRY、TCAF1、TCAF2 isoform 2 及 calmodulin。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer. Probably also forms heterotetramers with TRPV5. Interacts with TRPV5. Interacts with S100A10 and probably with the ANAX2-S100A10 heterotetramer. The interaction with S100A10 is required for the trafficking to the plasma membrane. Interacts with BSPRY (By similarity). Interacts with TCAF1 and TCAF2 isoform 2. Interacts with calmodulin PMID 11248124 ↗ · PMID 25559186 ↗ · PMID 29258289 ↗ |
| 細胞定位 | TRPV6 定位於細胞膜，且屬於多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 11097838 ↗ · PMID 11248124 ↗ · PMID 11278579 ↗ · PMID 15184369 ↗ · PMID 23612980 ↗ · PMID 29258289 ↗ · PMID 29861107 ↗ |
| 疾病關聯 | TRPV6 變異會造成自體隱性遺傳的 transient neonatal hyperparathyroidism。此病與胎盤母體至胎兒鈣運輸受損、高血清 PTH 及新生兒期代謝性骨病相關，可見骨質減少、胸廓狹窄、短肋骨與多處癒合中的骨折，也可能有長骨彎曲或骨折，並伴隨出生後呼吸及餵食困難。口服補充鈣後，病況可在短時間內改善。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hyperparathyroidism, transient neonatal HRPTTN An autosomal recessive disease characterized by impaired transplacental maternal-fetal transport of calcium, high serum PTH levels and signs of metabolic bone disease in the neonatal period. Skeletal anomalies include generalized osteopenia, narrow chest, short ribs with multiple healing fractures, and bowing or fractures of long bones. Affected individuals experience postnatal respiratory and feeding difficulties. The condition improves within a short time after birth once calcium is provided orally. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618188 PMID 29861107 ↗ · PMID 30820485 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGTCCTGGCTGGCTCTGCCAAGTGTAACAAACTCACAG40CCCTCTCCAAACTGGCTGGGGCTGCTGGGAGACTCCCAAG80GAACTCGTCAGGAAGGCAGGAGACAGGAGACGGGACCTCT120ACAGGGAGACGGTGGGCCGGCCCTTGGGGGGGCTGATGTG160GCCCCAAGGCTGAGTCCCGTCAGGGTCTGGCCTCGGCCTC200AGGCCCCCAAGGAGCCGGCCCTACACCCCATGGGTTTGTC240ACTGCCCAAGGAGAAAGGGCTAATTCTCTGCCTATGGAGC280AAGTTCTGCAGATGGTTCCAGAGACGGGAGTCCTGGGCCC320AGAGCCGAGATGAGCAGAACCTGCTGCAGCAGAAGAGGAT360CTGGGAGTCTCCTCTCCTTCTAGCTGCCAAAGATAATGAT400GTCCAGGCCCTGAACAAGTTGCTCAAGTATGAGGATTGCA440AGGTGCACCAGAGAGGAGCCATGGGGGAAACAGCGCTACA480CATAGCAGCCCTCTATGACAACCTGGAGGCCGCCATGGTG520CTGATGGAGGCTGCCCCGGAGCTGGTCTTTGAGCCCATGA560CATCTGAGCTCTATGAGGGTCAGACTGCACTGCACATCGC600TGTTGTGAACCAGAACATGAACCTGGTGCGAGCCCTGCTT640GCCCGCAGGGCCAGTGTCTCTGCCAGAGCCACAGGCACTG680CCTTCCGCCGTAGTCCCTGCAACCTCATCTACTTTGGGGA720GCACCCTTTGTCCTTTGCTGCCTGTGTGAACAGTGAGGAG760ATCGTGCGGCTGCTCATTGAGCATGGAGCTGACATCCGGG800CCCAGGACTCCCTGGGAAACACAGTGTTACACATCCTCAT840CCTCCAGCCCAACAAAACCTTTGCCTGCCAGATGTACAAC880CTGTTGCTGTCCTACGACAGACATGGGGACCACCTGCAGC920CCCTGGACCTCGTGCCCAATCACCAGGGTCTCACCCCTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。