基因總覽
TRPC6 是蛋白質編碼基因，其產物屬於 transient receptor（TC 1.A.4）家族的 STrpC 次家族，並歸入 TRPC6 子次家族。這是一種多次跨膜蛋白，主要特徵是形成可通透陽離子的通道。蛋白質序列包含多個 ANK 重複區，並有位於細胞質側、細胞外側及跨膜區段的拓樸結構。這些基本特徵構成 TRPC6 作為膜通道蛋白的分子架構；其受訊號調控的通道作用則見下文。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344327 ★ | 101,451,564–101,584,007 | 13 |
| ENST00000532133 | 101,447,437–101,584,241 | 12 |
| ENST00000893220 | 101,447,437–101,584,241 | 12 |
| ENST00000893221 | 101,447,437–101,584,241 | 13 |
| ENST00000962874 | 101,447,437–101,584,241 | 12 |
| ENST00001143197 | 101,447,437–101,584,241 | 13 |
| ENST00000348423 | 101,452,955–101,583,503 | 11 |
| ENST00000360497 | 101,452,955–101,583,503 | 12 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRPC6 是非選擇性、可通透鈣離子的陽離子通道，能介導鈣離子進入細胞。其活化與 G(q) 偶聯受體或受體酪胺酸激酶的訊號有關：受體活化後會引發 phospholipase C（PLC）作用，使 phosphatidylinositides 水解並產生 diacylglycerol（DAG）；DAG 可直接活化 TRPC6，進而促進鈣離子流入。這條訊號路徑將細胞外受體刺激連結至膜通道開啟及細胞內鈣離子變化。
TRPC6 的通道活性並非看來由細胞內鈣儲存耗竭所啟動，與依賴儲存耗竭開啟的通道調控方式有所區別。來源描述的離子通量方向為鈣離子由細胞外流入細胞，與其介導鈣離子進入的功能一致。
在內在感光視網膜神經節細胞（ipRGCs）中，TRPC6 參與光刺激引發的細胞去極化。光誘導的 melanopsin（OPN4）光轉導透過 G(q)-PLC 訊號傳遞，並由 TRPC6 介導去極化；此作用可能是藉由形成 TRPC6-TRPC7 異源通道完成。這項視網膜功能的證據標示為相似性推論，因此通道組成及作用描述應保留其推論性質。
Promoter 與基因調控
>TRPC6 ENST00000344327 GRCh38 chr11:101583907-101585007 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTATCAAATCAATTGCATTTTCCCACACTTCCAACATTCATTTTGTTGTCCACCTGTTCATGGGAAGCAA AGGCACCTTTGCAGACAGATTTCAGTCTGGCTTTCTTTCATCCAATTGCAATGGGCCTCTGATCTTTTCA TGGCTGGCTGCTTGCCATGCATGTCTCAACTTAACGAGCACCTCCTTGGAGGGGCCTCTTTTAACCATCT CATCTGAAGTAGTCATTCACCAGCTGCCATCACATCAACCTGTTTTATTTTCATTGTAGCATTTGTCCTT GATATTTTTTCATTTGCTTATTTAATTGGTCCCCCTTTCTGCCACGAAAGCTCTATGAGGGCAGACAGGT GCCTCATCTGCTTCTTTGCCTCCGAATTCTGAAATGATTTGAAACGCAGTTGGCATTCATTAAATATTTG TTGACTTAATGAATGGATTCTTAATTGGCTACTACTGCTTAAAGGTCTACAAATACTGATTCATCCTTGT TGACAAGTTTTTACTTCTCACACGTATGCATATTAATCAGAATTTAAAACTAAGTCTTAAAAATAAAACA GCTTGGAAACGTGGGAAACATCTGGCAGAGAAATCATTCTTGCATTCGCAGTGACGGAAGGAAAATTTTT TCTCTGAAGTAAGCAGGTTGTTGGCCTCTTTATCGGTATCATTGGAAAATGCTTGCCTATTTTTGTTGGT TTTCTCAGGAACTGGGAACATCTGGCGTTTGGAACATAGAACGTTGTTCATTTTTAAAGCAGAGTCATAA TAACTTTATGAGTTGAGGGTAAGAGAGAAAATGACCAAAGAAAATGAAGGCAGTCTGGAGAAAGAAGAGG CTCGTGTCCCTTTTAAGGAACAGGTTTCCTTGGCTCTTTGAGAGTGGTTCTTAAAGGAAGCTTCCTACGA AGTCCGCAGTTGGTATCCTTACTAAATGAGCCAACTAAATAGTGGAGGGGAAAAAAAGAGTGCGTGCCTG GCTCCTCCTAGTTCAGGCTCATACCGCCTCCTGAAAGTTGTGGCTACAGGACAGGCTTTGGCTGCTTTCT AGAACGTCGCTCGGATCCCTTTAAAGGTGGGGATCTTGACGGAGAGTGCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRPC6_2 ↗ | 11:101,583,467 | 負股 | 101,583,457–101,583,516 |
| TRPC6_1 ↗ | 11:101,584,007 | 負股 | 101,583,997–101,584,056 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BQ6BQ · promoter · 101583493–101584305 · regulatory
ENSR11_84ZMB8 · enhancer · 101584306–101584457 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：931 aa
TRPC6 蛋白長 931 個胺基酸。其序列包含四個 ANK 重複區，以及六段螺旋跨膜區；N 端與 C 端的大部分區域位於細胞質側，跨膜區之間則穿插細胞外及細胞質區段。N 端前 26 個胺基酸另註記為無序區。家族分類為 transient receptor（TC 1.A.4）家族的 STrpC 次家族及 TRPC6 子次家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRPC6 是多次跨膜蛋白，定位於細胞膜。 現有資料未指出其定位會隨特定刺激改變，也未提供不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MX1P20591 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
TRPC6 可形成同源二聚體，並組成通道複合體。另有資料記載 TRPC6 與 MX1、RNF24 互作；此處僅支持互作關係，未說明這些蛋白是否構成同一通道複合體或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
TRPC6 的基因變異與局部節段性腎小球硬化症 2（FSGS2）相關，來源將此病描述為由影響該基因的變異所致。其病理特徵是腎小球出現節段性硬化，並可伴隨蛋白尿、腎絲球過濾率降低及腎功能逐步衰退；腎功能不全常進一步惡化至末期腎病，可能需要透析或腎臟移植。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRPC6 是非選擇性且可通透鈣離子的陽離子通道，可在 G(q) 偶聯受體或受體酪胺酸激酶活化後，經 PLC 水解 phosphatidylinositides 產生的 DAG 直接活化而介導鈣離子流入。其活化看來不依賴細胞內鈣儲存耗竭；在 ipRGCs 中則參與光刺激經 melanopsin、G(q)-PLC 訊號引發的去極化，且可能形成 TRPC6-TRPC7 異源通道，此項描述為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Non-selective, calcium-permeable cation channel. Mediates calcium entry following G(q)-coupled receptor or receptor tyrosine kinase activation, which triggers phospholipase C (PLC)-mediated hydrolysis of phosphatidylinositides and production of diacylglycerol (DAG) that directly activates TRPC6. Does not appear to be activated by depletion of intracellular calcium stores. Mediates depolarization of intrinsically photosensitive retinal ganglion cells (ipRGCs) in response to light-induced melanopsin (OPN4)-mediated phototransduction via G(q)-PLC signaling, likely by forming heteromeric TRPC6-TRPC7 channels (By similarity) PMID 19936226 ↗ · PMID 23291369 ↗ · PMID 26892346 ↗ · PMID 9930701 ↗ |
| 分子活性 | Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | TRPC6 可形成同源二聚體並組成通道複合體；此外，資料記載它與 MX1 及 RNF24 互作，但未提供這些互作的功能結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; forms channel complex. Interacts with MX1 and RNF24 PMID 15757897 ↗ · PMID 17850865 ↗ · PMID 26892346 ↗ |
| 細胞定位 | TRPC6 是定位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 TRPC6 基因的變異與局部節段性腎小球硬化症 2（FSGS2）相關。此病以腎小球節段性硬化為特徵，可造成蛋白尿、腎絲球過濾率降低及腎功能進行性衰退；腎功能不全常進展至末期腎病，可能需要透析或腎臟移植。 | 含實驗來源 | 證據與來源Focal segmental glomerulosclerosis 2 FSGS2 A renal pathology defined by the presence of segmental sclerosis in glomeruli and resulting in proteinuria, reduced glomerular filtration rate and progressive decline in renal function. Renal insufficiency often progresses to end-stage renal disease, a highly morbid state requiring either dialysis therapy or kidney transplantation. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 603965 PMID 15879175 ↗ · PMID 15924139 ↗ · PMID 19458060 ↗ · PMID 19936226 ↗ · PMID 20798252 ↗ · PMID 21511817 ↗ · PMID 21734084 ↗ · PMID 22732337 ↗ · PMID 23014460 ↗ · PMID 23291369 ↗ · PMID 26892346 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATACCGCCTCCTGAAAGTTGTGGCTACAGGACAGGCTTTG40GCTGCTTTCTAGAACGTCGCTCGGATCCCTTTAAAGGTGG80GGATCTTGACGGAGAGTGCGGGGGATGAAGGCGGGAGCTG120AGGGCTGGAGAGTCTCTGTTGACATAGTAACTCTTCAGCT160CCGTCTCCCTTGCTCTCCGCTCTTACGCTTCGCTACCACC200AGCGGCCCCGCCTGTGCCCTCTCTGCCCGGGCGCCCCAGA240CGCATCCTCGCGGGGTCTCCTCGGCCTGACCTGCTCAGGT280CAAGATCCTCTTTGCACCCCCTTAAGTGGTGACTTTTCCC320CGGGCCAGTGGGCGAGCCACTTGCGGCGGGCGTCTGCACC360CCCTGCTTCACCGTCGTCCCCTGGGCACCGGTCTGCCCAG400GTCCAGTTCGGCCGCTGACGCGAACCCTCCGCACCGGGTC440CCCGCTGGAACTGCCCACTCGGCTCCCCCGGGAGCGGGGC480CCAGGCCAGTCGGGCGTTCCCGCCATGAGCCAGAGCCCGG520CGTTCGGGCCCCGGAGGGGCAGTTCTCCCCGGGGCGCTGC560CGGAGCCGCTGCGCGGCGCAACGAGAGCCAGGACTATCTG600CTCATGGACTCGGAGCTGGGAGAAGACGGCTGCCCGCAAG640CCCCGCTGCCTTGCTACGGCTACTACCCCTGCTTCCGGGG680ATCTGACAACAGACTGGCTCACCGGCGGCAGACAGTTCTC720CGTGAGAAGGGGAGAAGGTTAGCTAATCGAGGACCAGCAT760ACATGTTTAGTGATCGCTCCACAAGCCTATCTATAGAGGA800GGAACGCTTTTTGGATGCAGCTGAATATGGTAACATCCCA840GTGGTGCGGAAGATGTTAGAAGAATGCCACTCACTCAACG880TTAACTGTGTGGATTACATGGGCCAGAATGCCCTACAGTT920GGCAGTGGCCAATGAGCATCTGGAAATTACAGAACTTCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。