基因總覽
TRPC4 是蛋白質編碼基因，產物為 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4。這種膜蛋白可形成受受體活化的非選擇性陽離子通道，具有鈣離子通透性；因此，其基本角色是提供離子跨膜通道。TRPC4 可單獨組成同源通道，也可與 TRPC1 組成異源通道。與同源通道相比，含 TRPC1 的異源通道鈣離子通透性較低。這些特性概括了 TRPC4 作為通道蛋白的主要性質；其在特定細胞情境中的作用與離子通透細節見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000379705 ★ | 37,632,063–37,869,772 | 11 |
| ENST00000338947 | 37,632,063–37,870,344 | 10 |
| ENST00000957123 | 37,632,063–37,870,204 | 12 |
| ENST00000957124 | 37,632,063–37,870,204 | 11 |
| ENST00001132064 | 37,632,063–37,870,344 | 11 |
| ENST00000625583 | 37,636,843–37,783,333 | 10 |
| ENST00000379679 | 37,636,843–37,783,333 | 9 |
| ENST00000426868 | 37,636,843–37,870,344 | 10 |
| ENST00000355779 | 37,636,865–37,870,344 | 11 |
| ENST00000358477 | 37,636,865–37,870,344 | 12 |
| ENST00000379673 | 37,636,865–37,870,344 | 11 |
| ENST00001111817 | 37,673,471–37,870,344 | 5 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRPC4 可形成受受體活化的非選擇性陽離子通道，讓鈣離子通過。其通道也能通透單價離子，包括鈉、鋰與銫離子，因此並非只對鈣離子通透。現有資料指出，TRPC4 既可形成同源離子通道，也可與 TRPC1 形成異源通道；含 TRPC1 的異源通道，其鈣離子通透性低於 TRPC4 同源通道。
在內皮細胞中，TRPC4 也作為依賴細胞間接觸的鈣離子進入通道。這項作用將通道的離子通透功能連結至細胞接觸情境，但來源未進一步說明細胞接觸如何調節通道，或此鈣離子進入所造成的下游效應。
因此，來源支持的功能重點包括受體活化相關的陽離子通透，以及內皮細胞中依賴細胞接觸的鈣離子進入；通道組成不同時，鈣離子通透能力也有所差異。
Promoter 與基因調控
>TRPC4 ENST00000379705 GRCh38 chr13:37869672-37870772 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAACACTAAAGAGATTGGACAAGAGATAACGTTTATCTTGAAATCTCACTCTCAGTAAGATGGTACCAGT ATCGCACACACACACACTCGCACACACGCACATCACCTGCAGCCGCAGAACCTTGCACCCTTGGGCTGGC TCGCGTCTTAGGGTTTTGGTATATTTGGTGGAAACTTGCTGATTTCCTATGCCTTTTGGAAAGACCAAGC TGGATGAGGGTGGTTGGAACGCTGTGGCTCATCATTTATTCATTGCGACTGTTTTGATTGTTGACACTAG TGGCAAGCCGCATCCTCCAGCTCTTGCAAGGGAAGTCTGACACCTTGAGGACAGGAGAGGGGGTGCCAGT CGCCCAGAGAAGCGGGAGTGGGAGAAGCTTTGAGAGTTGCAGGGGACTACTTTTTTCCGGTCGGGCGGCG GGCCTCATGGGTGCTTGTTTACCGGGCTGGGAGCAGGGCATTCAAAAGCTGGGTGTCGGAGCGCACTGAA GTCCAACACGCCTGCAGAGACCGCCCTAAGCCTGGAGGTGTGTCTGGCTTGCATCCAGAACCACAGGGTG GATTCTCGCCACCGACTTGGCTGGATGACGGCTGGCTGGTGGTGAGCTCCCCTGCCCACTGGCTGACCTC AAGCAGTTGGCCCCGGTAGGTGGAGGCTATTCGAGGGGGACAAGCTGGGGACGCAGCGTCAGCTCCTGCC AGCGCGCGGGTCTCCTCCACCTCCAAGCAGTGTGGTGCGTGGGACGCGCATCTTCCCGGACTATCCCTTT CCAGCGCGGTCTGTGCGGACCCCGAGCCCGGCAGCCACCAGGGACGGAGGGCGGGGTGCCTTTCTCTGGG CTCATCCGCTGTCAGCCGTGGGAACTCTTAACTTTATCCAGAGGGATCTGTGCAGGCGGGGGTGGGAGAG GTTCTCCTCCCCTGGCGGTTACCTCCCCCTCCCGGGCCGCCCCTCCCCCGCCTCCCATGGCTTCGCTTTC AGAGCATCCTCACTCCGCCCAGTTCGGTGCCAGCTGCGTGGGCTCCAGCTTCGATCGTTTTCCTTGGAAT GCTCCAAAACTCAGCAGCGACTAAGGGAATTCCATTGGAATTTGCCGGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRPC4_2 ↗ | 13:37,869,772 | 負股 | 37,869,762–37,869,821 |
| TRPC4_1 ↗ | 13:37,870,373 | 負股 | 37,870,363–37,870,422 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR13_C5QGD · enhancer · 37868618–37869712 · regulatory
ENSR13_66G8PF · promoter · 37869713–37869757 · regulatory
ENSR13_B9HWT · promoter · 37869762–37870292 · regulatory
ENSR13_5BWHHM · CTCF_binding_site · 37870114–37870135 · regulatory
ENSR13_5BWHK6 · CTCF_binding_site · 37870439–37870460 · regulatory
ENSR13_8353PB · enhancer · 37871293–37871466 · regulatory
· motif · 37870116–37870132 · motif
· motif · 37870441–37870457 · motif
· motif · 37874601–37874612 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：977 aa
TRPC4 屬於 transient receptor（TC 1.A.4）家族的 STrpC 亞家族及 TRPC4 次亞家族。蛋白質全長 977 個胺基酸，具有多段跨膜螺旋區域，包括 S1 至 S6；其 N 端及 C 端均有細胞質區域，並含有四個 ANK 重複序列。C 端另有 PDZ-binding domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRPC4 是多次跨膜蛋白，定位於細胞膜。 EGF receptor 活化後，TRPC4 插入細胞膜的程度增加。 資料亦指出 Beta 異構型位於細胞膜，並具有多次跨膜蛋白特徵。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MX1P20591 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TRPC4 可組成同源四聚體，也可與 TRPC1 和／或 TRPC5 形成異源四聚體；與 TRPC1 組成的通道中，TRPC1:TRPC4 的比例為 1:3。蛋白質互作方面，Isoform alpha（但非 Isoform beta）與 ITPR1、ITPR2、ITPR3 互作；TRPC4 亦與 NHERF1、MX1、RNF24、SESTD1、CDH5、CTNNB1、SPTAN1、SPTBN5、EPB41L2 及 PLSCR1 互作。另有與 TRPC4AP 互作的相似性證據。來源並描述了多項互作所涉及的結構區域，但未將所有互作關係界定為通道複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 9 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRPC4 可形成受受體活化的非選擇性陽離子通道，並參與依賴細胞間接觸的內皮細胞鈣離子進入。它可形成同源通道，或與 TRPC1 形成異源通道；後者的鈣離子通透性較低。此外，通道也可通透鈉、鋰與銫等單價離子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a receptor-activated non-selective calcium permeant cation channel. Acts as a cell-cell contact-dependent endothelial calcium entry channel. Forms a homomeric ion channel or a heteromeric ion channel with TRPC1; the heteromeric ion channel has reduced calcium permeability compared to the homomeric channel. Also permeable to monovalent ions including sodium, lithium and cesium ions PMID 11042129 ↗ · PMID 11713258 ↗ · PMID 16144838 ↗ · PMID 19996314 ↗ · PMID 39478185 ↗ |
| 功能 | TRPC4 可形成受受體活化的非選擇性陽離子通道，且該通道具有鈣離子通透性。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | Na(+)(in) = Na(+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | Li(+)(in) = Li(+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | Cs(+)(in) = Cs(+)(out) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | TRPC4 可形成同源四聚體，或與 TRPC1 和／或 TRPC5 組成異源四聚體；與 TRPC1 組成的通道中，TRPC1:TRPC4 比例為 1:3。Isoform alpha 與 ITPR1、ITPR2、ITPR3 互作，但 Isoform beta 不具此互作；另列有 TRPC4AP、NHERF1、MX1、RNF24、SESTD1、CDH5、CTNNB1、SPTAN1、SPTBN5、EPB41L2 及 PLSCR1 等互作對象，其中 TRPC4AP 與 PLSCR1 的互作依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer. Heterotetramer with TRPC1 and/or TRPC5. Forms a heteromeric ion channel with TRPC1, with a 1:3 TRPC1:TRPC4 stoichiometry. Interacts with TRPC4AP (By similarity). Isoform alpha but not isoform beta interacts with ITPR1, ITPR2 and ITPR3. Interacts with (via PDZ-binding domain) with NHERF1. Interacts with MX1 and RNF24. Interacts (via CIRB domain) with SESTD1 (via spectrin 1 repeat). Interacts with CDH5 and CTNNB1. Interacts with SPTAN1 (via C-terminal spectrin repeats) and SPTBN5 (via C-terminus). Interacts (via protein 4.1-binding domain) with EPB41L2. Interacts with PLSCR1 (By similarity) PMID 11163362 ↗ · PMID 12032305 ↗ · PMID 12154080 ↗ · PMID 15757897 ↗ · PMID 16254212 ↗ · PMID 17850865 ↗ · PMID 18048348 ↗ · PMID 19996314 ↗ · PMID 20164195 ↗ · PMID 39478185 ↗ |
| 細胞定位 | TRPC4 是位於細胞膜的多次跨膜蛋白；EGF receptor 活化後，TRPC4 插入細胞膜的程度增加。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Enhanced insertion into the cell membrane after activation of the EGF receptor PMID 11042129 ↗ · PMID 11713258 ↗ · PMID 12154080 ↗ · PMID 16144838 ↗ · PMID 16254212 ↗ · PMID 39478185 ↗ |
| 細胞定位 | Beta 異構型是位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTTCGGTGCCAGCTGCGTGGGCTCCAGCTTCGATCGTTT40TCCTTGGAATGCTCCAAAACTCAGCAGCGACTAAGGGAAT80TCCATTGGAATTTGCCGGGCGTGCTCTCACCCCGCACGGC120ACCCGCGCCGTCAGTCCTCGGATCCCATCACTTCAGCCCG160AAGATTGCAACTTTGCAGAGACGAAGAAATAGCATGGCAT200GAAACATGGCTCAGTTCTATTACAAAAGAAATGTTAATGC240TCCCTATAGAGACCGCATCCCTCTAAGGATAGTAAGAGCA280GAATCAGAACTCTCGCCATCAGAAAAAGCCTACTTGAATG320CTGTGGAAAAGGGAGATTATGCCAGTGTCAAGAAATCCCT360AGAGGAAGCTGAAATTTATTTTAAAATCAATATTAATTGC400ATTGATCCTCTCGGAAGAACTGCTCTCCTCATTGCAATTG440AAAATGAGAACTTGGAGCTCATCGAACTACTCTTAAGCTT480TAATGTCTATGTTGGAGATGCTCTATTACATGCTATCAGA520AAAGAAGTCGTCGGAGCTGTTGAGCTGTTATTGAACCACA560AAAAACCTAGTGGAGAAAAACAGGTGCCTCCTATACTCCT600TGATAAGCAGTTCTCTGAATTCACTCCAGACATTACACCA640ATCATTTTGGCAGCCCATACAAATAATTATGAGATAATAA680AACTCTTGGTTCAGAAAGGAGTCTCAGTGCCTCGACCCCA720CGAGGTCCGCTGTAACTGTGTGGAATGCGTGTCCAGTTCA760GATGTGGACAGCCTCCGTCACTCACGCTCCAGACTCAACA800TCTACAAGGCCTTGGCCAGTCCCTCTCTCATTGCACTGTC840AAGCGAAGATCCTTTTCTCACAGCCTTTCAGTTAAGTTGG880GAACTTCAGGAACTGAGCAAGGTGGAAAATGAATTCAAGT920CGGAGTATGAAGAGCTGTCACGGCAGTGCAAACAATTTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。