演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TRPC3

transient receptor potential cation channel subfamily C member 3

TRPC3 編碼 transient receptor potential cation channel subfamily C member 3,是受體活化、可通透 Ca²⁺ 的非選擇性陽離子通道。

Homo sapiens4q27UniProt Q13507
OFFICIAL SYMBOL
TRPC3
CHROMOSOME
4
UNIPROT
Q13507
PDB / ALPHAFOLD
9KDB
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TRPC3 是蛋白質編碼基因,其產物 transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 屬於 transient receptor 家族的 STrpC 亞家族及 TRPC3 次亞家族。此蛋白質為多次穿膜蛋白,具有細胞內與細胞外區段,並含有多個 ANK 重複序列。它的基本角色是形成受體活化的陽離子通道;具體的離子通透與活化方式見功能說明。

Official symbol
TRPC3
Gene name
transient receptor potential cation channel subfamily C member 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12335
UniProt
Q13507
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q27
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25TRPC3pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:121,874,481–121,952,082
Gene span
77,602 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000379645 ★121,874,481–121,952,06012
ENST00000264811121,874,481–121,933,45711
ENST00000871535121,874,481–121,952,08212
ENST00000949674121,874,481–121,952,08213
ENST00001141067121,874,481–121,952,08212
ENST00000513531121,879,736–121,933,03810
ENST00000502968121,932,760–121,950,8742

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TRPC3 形成受體活化的非選擇性陽離子通道,能通透 Ca²⁺。因此,受體訊號可透過此通道連結至 Ca²⁺ 跨膜移動;來源所列的活性方向為 Ca²⁺ 由細胞外流向細胞內。通道具有非選擇性,故其功能描述並非只限於單一陽離子,但目前列出的具體通透離子為 Ca²⁺。

TRPC3 通道可能由磷脂醯肌醇第二信使系統調控。這套訊息系統可由受體酪胺酸激酶或 G 蛋白偶聯受體活化,進而操作通道。來源以「可能」描述這種調控方式,因此不宜將其視為所有受體或條件下皆確定採用的唯一機制。

在此模型中,細胞表面受體的活化與離子通道開啟相連,Ca²⁺ 可由細胞外進入細胞內。這使 TRPC3 成為受體訊號與跨膜 Ca²⁺ 通量之間的通道元件;來源支持其受體活化、非選擇性陽離子通透及 Ca²⁺ 移動方向,但未進一步界定特定細胞類型、下游反應或生理情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 121952060 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TRPC3 ENST00000379645 GRCh38 chr4:121951960-121953060 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAAACATAAAGCACTATACAATATTTACTTGTTTTTGTTTTTCCTATATTAGATGTATAAATGCTATTGC
TTCTTTCAACATATAGACTTGCCAATTTAATACACAATATTTTATTTACTTTTTAAGAATTAAATTCAAA
GGAGCTACATTTTCTTGTGTTTTGCTTAAATTTGGGAAGAATTGTTCCTCTAAAAAGTACAGTATAATTG
GATACAGTTAAATAAATTTTATCTCATCAGAGCGTGTCCAGTATTTTTGTGATTTTTCCTAGTTGGACTT
GCTAGAAAGCCGTCTATTTGAAGCAAGGGAAAGTCTGGAAGAACACACTCTTCTGGATCTAATCTAAGTT
TTCTCACTACCCACCTATCATGAGTACCTTTTTCAGTCTCTCTAGGCCAAGGGTTTCTTATTTAAAAGGA
CCAAGAGACTCCTTGATCCCTAAGATTCCTGCTAAGATTCTGTACCTCTTTCCTCCCAAAAGAATGACTG
GTCTTGAATTCTAAAATGCAATTTTTGTGAGTGTGTTTTAAAAAGAAGACTGCATTTCGCTGAAAAATCT
TCCTTGGAAAGTATATAAATCTTATTAGACGCCTTTGAGAGTCATTAAAAGAACTGAAGCATCATGCACG
TTTAAAACATTACCAGGCTGGATGGAGTACGAAGGCACTCAGGGGAAGGTACTTAAACCTCCGTAGGTTC
AACCAAGTCTTACCGGGAGTAACCCAACGAACAAGTGATGCTTTTTGAGACAAATTTGGAGAGTTGGCTG
CAGGAAAATTAACAAGCCAGTGGATTTCCTTTTCCCTTCCTTAGGAAACTTGTTTCTGTAGATGCAAAAA
GGGCCCTAGATCCTCTGGAAGAGAAAGAGAGTGGGGAGGGGAAGTTTCTCTTTCTTTACTCCCCACCTGC
GGTCTGTCTGATTTCCTCTCCAGCTCTGTCTGATAAGGAATTGATTCTCCCCCTCCTCTTCCCCCTCCCG
CCCTCCCTCTCCTTCTCCCTGAGTAACGATGCTGTCCTAGCAAGTGATGCTGTCGGAGACAGGAGACGGG
CGCCGAGGAGGCATCGCCGCCGCCGCGGGGCTGGAGAGCCTCTCCCAGCAC
TRPC3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TRPC3_1 ↗4:121,952,029負股121,952,019–121,952,078

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_533NGD2 · CTCF_binding_site · 121949270–121949291 · regulatory

ENSR4_533NGJZ · CTCF_binding_site · 121950345–121950366 · regulatory

ENSR4_93RDWN · promoter · 121950473–121950974 · regulatory

ENSR4_93RDX4 · promoter · 121952050–121952451 · regulatory

· motif · 121949272–121949288 · motif

· motif · 121950301–121950313 · motif

· motif · 121950303–121950310 · motif

· motif · 121950347–121950363 · motif

· motif · 121951661–121951673 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:921 aa

1 aa921 aa功能區域重複區跨膜區拓樸區域
依 Q13507 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 長 921 個胺基酸,屬 transient receptor 家族的 STrpC 亞家族及 TRPC3 次亞家族。其序列含五段螺旋型穿膜區,並有五個 ANK 重複序列;第 850–870 位區段註記為可結合 IP3R3。

拓樸區域Cytoplasmic1–459 aa
跨膜區Helical460–477 aa
拓樸區域Extracellular478–508 aa
跨膜區Helical509–527 aa
拓樸區域Cytoplasmic528–540 aa
跨膜區Helical541–562 aa
拓樸區域Extracellular563–606 aa
跨膜區Helical607–630 aa
拓樸區域Cytoplasmic631–649 aa
跨膜區Helical650–673 aa
拓樸區域Extracellular674–713 aa
跨膜區Helical714–739 aa
拓樸區域Cytoplasmic740–921 aa
重複區ANK 1111–140 aa
重複區ANK 2146–175 aa
重複區ANK 3177–203 aa
重複區ANK 4232–261 aa
重複區ANK 5634–663 aa
功能區域Disordered1–73 aa
功能區域Binds to IP3R3850–870 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9KDB…

PDB · 9KDB

EM · 2.67 A · A/B/C/D=1-921

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

TRPC3 位於細胞膜,是多次穿膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TRPC3TRPC3ITPR3MX1ORAI1Plcg1SrcWnk4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TRPC3 可形成同源四聚體,並與 ITPR1、ITPR3、MX1、RNF24 及 TRPC1 的短異構型互作。它也與 JPH2 互作;此互作與骨骼肌 Ca²⁺ 恆定的維持有關,且由 JPH2 的 Ser-165 磷酸化介導。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TRPC3 基因的變異被列為脊髓小腦性共濟失調 41(SCA41)的致病原因。SCA41 屬於臨床與遺傳異質性較高的小腦疾病;患者可出現步態逐漸失調,也常有手部、言語及眼球運動協調不良,與小腦退化有關,腦幹及脊髓則可能有程度不一的受累。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TRPC3 形成受體活化的非選擇性陽離子通道,且此通道可通透 Ca²⁺。含實驗來源
證據與來源

Forms a receptor-activated non-selective calcium permeant cation channel

PMID 10611319 ↗ · PMID 29726814 ↗ · PMID 30139744 ↗ · PMID 35051376 ↗ · PMID 9417057 ↗ · PMID 9930701 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能TRPC3 形成受體活化、可通透 Ca²⁺ 的非選擇性陽離子通道;通道可能受磷脂醯肌醇第二信使系統操作,而該系統可由受體酪胺酸激酶或 G 蛋白偶聯受體活化。含實驗來源
證據與來源

Forms a receptor-activated non-selective calcium permeant cation channel. May be operated by a phosphatidylinositol second messenger system activated by receptor tyrosine kinases or G protein-coupled receptors

PMID 8646775 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out)含實驗來源
證據與來源

Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out)

PMID 10611319 ↗ · PMID 29726814 ↗ · PMID 30139744 ↗ · PMID 35051376 ↗ · PMID 9417057 ↗ · PMID 9930701 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TRPC3 可形成同源四聚體,並與 ITPR1、ITPR3、MX1、RNF24 及 JPH2 互作。TRPC3 與 JPH2 的互作涉及骨骼肌 Ca²⁺ 恆定維持,且由 JPH2 Ser-165 磷酸化介導。含實驗來源
證據與來源

Homotetramer. Interacts with ITPR1. Interacts with ITPR3. Interacts with MX1. Interacts with RNF24. Interacts with JPH2; the interaction is involved in maintaining Ca(2+) homeostasis in skeletal muscle and is mediated by JPH2 'Ser-165' phosphorylation

PMID 10611319 ↗ · PMID 15757897 ↗ · PMID 17850865 ↗ · PMID 20095964 ↗ · PMID 29700422 ↗ · PMID 29726814 ↗ · PMID 30139744 ↗ · PMID 35051376 ↗ · PMID 9853757 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TRPC3 與 TRPC1 的短異構型互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts with isoform short of TRPC1

PMID 9215637 ↗

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細胞定位TRPC3 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 25477146 ↗

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疾病關聯TRPC3 基因變異被列為脊髓小腦性共濟失調 41(SCA41)的致病原因。此疾病屬臨床與遺傳異質性較高的小腦疾病,患者可有逐漸加重的步態失調,常伴手部、言語及眼球運動協調不良;病理描述為小腦退化,腦幹與脊髓可能有程度不一的受累。含實驗來源
證據與來源

Spinocerebellar ataxia 41 SCA41 A form of spinocerebellar ataxia, a clinically and genetically heterogeneous group of cerebellar disorders. Patients show progressive incoordination of gait and often poor coordination of hands, speech and eye movements, due to degeneration of the cerebellum with variable involvement of the brainstem and spinal cord. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616410

PMID 25477146 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000379645 · 8,401 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGTAACGATGCTGTCCTAGCAAGTGATGCTGTCGGAGAC40
41AGGAGACGGGCGCCGAGGAGGCATCGCCGCCGCCGCGGGG80
81CTGGAGAGCCTCTCCCAGCACCAGAGCCCCGCTCGGCCCC120
121GGGCTTCCTCGTCGCAGCCACGGCCGCGGCAGCTGCTCCC160
161ACGGTTTGATGGTGGGCGGCGGCAGCTCGGCTTCGGCGCT200
201AGCCTCTAACTGCTGGATCGCGGGCCGCGACGCTCTCCGC240
241TCCTGCCTTCCCGCCCTGGGCCGCCCGGGGCCCCGGAAGC280
281CGCGGGAGGTGGTGAAGGGGCGCCGCGGGAAGACTGCACT320
321GCCGCGAAGGCGGAGGAGGCCGGCAGCCGGCACCCCCACA360
361CTCGGACCGCAGCCGGCGCGATGTCCACCAAGGTCAGGAA400
401GTGCAAAGAACAAGCAAGGGTGACCTTCCCGGCGCCGGAG440
441GAGGAGGAAGACGAGGGCGAGGACGAGGGCGCGGAGCCGC480
481AGCGCCGCCGCCGGGGCTGGAGGGGCGTCAACGGGGGGCT520
521GGAGCCGCGCTCGGCGCCCTCGCAGCGGGAGCCGCACGGC560
561TACTGCCCGCCGCCCTTCTCCCACGGGCCGGACCTGTCCA600
601TGGAGGGAAGCCCATCCCTGAGACGCATGACAGTGATGCG640
641GGAGAAGGGCCGGCGCCAGGCTGTCAGGGGCCCGGCCTTC680
681ATGTTCAATGACCGCGGCACCAGCCTCACCGCCGAGGAGG720
721AGCGCTTCCTCGACGCCGCCGAGTACGGCAACATCCCAGT760
761GGTGCGCAAGATGCTGGAGGAGTCCAAGACGCTGAACGTC800
801AACTGCGTGGACTACATGGGCCAGAACGCGCTGCAGCTGG840
841CTGTGGGCAACGAGCACCTGGAGGTGACCGAGCTGCTGCT880
881CAAGAAGGAGAACCTGGCGCGCATTGGCGACGCCCTGCTG920
921CTCGCCATCAGCAAGGGCTACGTGCGCATCGTAGAGGCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。