基因總覽
TRPC2 的正式名稱為 transient receptor potential cation channel subfamily C member 2 (pseudogene)，基因類型為假基因。現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的基本性質、家族關係或結構特色，因此不據此推定其產物具有離子通道結構或功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000451043 ★ | 3,616,679–3,637,549 | 12 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
現有資料將多項分子功能列為預測，包括與 calmodulin、diacylglycerol 及 inositol 1,4,5 trisphosphate 的結合。這些資訊代表資料庫所列的預測功能，並未提供實驗細節或作用機制，不能據此視為已確認的結合活動，也不能推定 TRPC2 假基因產生具有這些功能的蛋白質。
資料亦預測 TRPC2 可能作用於或參與若干行為相關過程，包括雌性求偶行為、雄性之間的攻擊行為，以及交配行為與性別辨識。來源未說明這些預測所依據的物種、實驗系統或證據，因此不宜將其解讀為已證實的生理作用，也無法由此確定該基因與相關行為之間的作用方向或因果關係。
在細胞位置方面，資料預測其可能位於 Golgi 膜、樹突膜及核膜。此處同樣屬預測性註記，來源沒有提供定位驗證、細胞條件或異構型資訊；因此這些位置不能視為已確認的 TRPC2 產物定位。
Promoter 與基因調控
>TRPC2 ENST00000451043 GRCh38 chr11:3615679-3616779 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAGAGGGCCCAGGTCAGAGTTTTGAATAGATAGAAAAGAGGGTGCTAGGCACAGTCAGGGAGAAGACTG AGCAGGAGTTCAGTCCTTCGGTTCCTGTCAGCACAGGTGCCAGCATAGGTGGGCACAGCCATGGACCCCA TCACGGTAAGAAGCCTGCTCCCCTACCTTCTCCCATTCTGCTCCCATTTCTACCCATGAATAAAAGAAAA GATTGGCCCAGAGGCACTGCAGGGGCATCCTAGCTGCCAAGCAGATGGCTGACATCACTATGTAGGTGGG AGAAGAGCCCTTGGAACCCTGAGCTTGGGCCCAGAAGAGAAGAGCAGTGAGGATGGGGCCGGGCCTGGTA GAAGAGAGGGATGAGGCAGTGCCAAGGGGGAGAAATGCCCCCCAAAGCAGGGGAGGGCAAAGCGGGAGGA TTGGTGAAGAAAGAGTATGTTGGGATCCTGCTGGGGCCCTGGTCAGAGCGGAGGGGCTTGGCAAAAGCCC ACACAAAACCCTCCTGTGTGGACATGTCCGGGCCTGCCTGTGGGAGAGGCTCTAGGACTTTAAGAGGGAA GAGCAGCTGGGAGATGAAGTCAACAAGAGGGGAGCTGGGTCGGAACAGATCCTGTGCACCCGTATGTGGG GTTAGGCTGCCAGGGCAGCCCACCCCTGCTTTAACCTACCCTTGCTCAAGGTACCCACAGGTAGCTCTGC TGTTGGGGGGCTCCTGTGAGGGTAGAAGTCAAGCTGAGGAAGGGGCCCCCGGTCAGACCCACCTGAGGAA GGGGCCCCCAGTCTCTACCCAGTGGGGGAAGAATAGAAAGCCCCCACTGTACAGTGTCAATTTTCCTAAC CTGAGAATCTACACAATAAAATGGTGAATGAGACAATATTTGCCAGTGTGTGTTTGGGACAAGGAAGAAT ATAATGGTGGCTGGATATAGAGGGTTAAGTGCTAGAACATGGAAGGGTGAAAGAGGCCCCAAAACAAAGG GAGTTGAAACTCAGGGTCCTAGCCTCTCCACTCCTTCGTCCGCCAACAGCCTAACTGGACTGAGATCGTG AACAGGAAGCTCAGCTTCCCACCTCCACTCCTGGATGCCATCCAGGAGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BPCX · enhancer · 3614267–3615017 · regulatory
ENSR11_93FQJ · enhancer · 3616702–3617030 · regulatory
· motif · 3614397–3614403 · motif
· motif · 3614752–3614760 · motif
· motif · 3614829–3614837 · motif
· motif · 3614874–3614887 · motif
· motif · 3614874–3614887 · motif
· motif · 3614930–3614943 · motif
· motif · 3614930–3614943 · motif
· motif · 3614981–3614994 · motif
基因座與轉錄註解
TRPC2 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000451043 ★ | transcribed_unitary_pseudogene | 2,683 nt | 12 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 TRPC2 具有與 calmodulin、diacylglycerol 及 inositol 1,4,5 trisphosphate 結合的功能，並可能作用於或參與雌性求偶、雄性間攻擊、交配及性別辨識等行為過程；另預測其位於 Golgi 膜、樹突膜與核膜。這些皆為預測，來源未提供實驗條件或驗證細節。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable several functions, including calmodulin binding activity; diacylglycerol binding activity; and inositol 1,4,5 trisphosphate binding activity. Predicted to act upstream of or within several processes, including female courtship behavior; inter-male aggressive behavior; and mating behavior, sex discrimination. Predicted to be located in several cellular components, including Golgi membrane; dendrite membrane; and nuclear envelope. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AGCCTCTCCACTCCTTCGTCCGCCAACAGCCTAACTGGAC40TGAGATCGTGAACAGGAAGCTCAGCTTCCCACCTCCACTC80CTGGATGCCATCCAGGAGGGCCGACTGGGCTTTGTGCAGC120AGCTGCTGGAGTCAGAGGTTGAGGCCACAAGCGAGCAGTG160GGCCAGGCTGGCCCCTGTGGAATGTGGAAGAGGCTGAGGA200CCGCTGCTGGAGGGAGGCACTCAACCTGGCCATCCGCCTG240GGCCATGAGGCCCTCACCGATGTGCTGTTGGCCAGTGTCA280AGTTTGACTTCCGCCAGATCCATGAGGCCCTGCTAGTGGC320AGTGGACACAAACCAGCAGCAGTGGTGCGTCGCCTGCCGG360CCCGGCTGGAACGGGAGAAGGGTCGCAAAGTAGACACCAG400GTCTTTCTCACTGGCTTTCTTTGACTCATCAATTGATGGC440TCCCGCTTTGCACCTGGTGTGACTCCCCTCCCCCAGGCCT480GCCAGAAGGACCTGTATGAGATAGCACAGCTGCTCATGGA520ACAGGGCCACACCATTGCCCGGCCCCACCCGGTCTCCTGT560GCCTGCCTCGAGTGCAGCAACGCCCGCCGCTATGACCTGC600TGAAACTCTCTCTGTCCCGCATCAACACCTACCTTGGCAT640CGCCAGCAGGGCCCACCTCTCACTGGCCAGTGAGGATGCC680ATGCTGGCTGCCTTCCAGCTTAGCCGTGAGCTCAGGCGCC720TTGCACGCAAGGAGCCTGAATTTAAGCCTGAGTACATTGC760TCTGGAGTCACTGAGCCAGGACTATGGCTTTCAGCTGCTG800GGCATGTGCTGGAACCAGAGTGAGGTCACTGCAGTGCTCA840ACGACCTGGCCGAGGACAGCGAGACTGAGCCCGAGGCTGA880AGGCCTGGGCCTGGCCTTTGAGGAAGGCATCCCCAACCTG920GTGAGGCTGCGACTGGCTGTCAACTACAACCAGAAGCGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。