基因總覽
TROAP 是蛋白質編碼基因，產物名稱為 trophinin associated protein，亦稱 Tastin、Trophinin-assisting protein 或 Trophinin-associated protein。蛋白質長 778 個胺基酸，序列中有四段約 33 個胺基酸的串聯重複；多處區域被註記為無序區。現有資料提出，此蛋白可能與 bystin 和 trophinin 一同參與細胞黏附分子複合體，與胚胎著床時囊胚初始附著於子宮上皮細胞有關。這些資料並未進一步界定其蛋白質家族或更廣泛的分子功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000257909 ★ | 49,323,255–49,331,731 | 15 |
| ENST00000549275 | 49,323,199–49,324,296 | 3 |
| ENST00000551245 | 49,323,199–49,331,733 | 14 |
| ENST00000380327 | 49,323,199–49,324,392 | 4 |
| ENST00000548311 | 49,323,199–49,324,416 | 4 |
| ENST00000550709 | 49,323,199–49,324,380 | 3 |
| ENST00000549534 | 49,323,199–49,324,365 | 2 |
| ENST00000879615 | 49,323,199–49,331,733 | 13 |
| ENST00000879616 | 49,323,199–49,331,733 | 14 |
| ENST00000929587 | 49,323,199–49,331,733 | 15 |
| ENST00000929588 | 49,323,199–49,331,733 | 15 |
| ENST00000971667 | 49,323,199–49,331,733 | 15 |
顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TROAP 的產物可能與 bystin 和 trophinin 一同參與細胞黏附分子複合體。這項功能描述帶有不確定性，表示其可能涉及該複合體，而非已確立其必然參與的結論。
此複合體被描述為可介導胚胎著床時，囊胚與子宮上皮細胞之間的初始附著。來源未提供該作用的分子步驟、實驗條件或其他生物學過程，因此目前可支持的功能範圍限於這項著床初期的細胞黏附關聯。
Promoter 與基因調控
>TROAP ENST00000257909 GRCh38 chr12:49322255-49323355 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGCAACCTGGAGGCAAGGAAATCCCCAGCTGTGAGTAGCCATTCAATTCTGGTGCTGTGGTAACTGAGT TCAAAAACAATGAGTCTTGTTACCTACCCGTAAAATGAAAGACACCTCATCAGACACCTCACTGGATTGT GAGGCTCCAAGGAGCACACATATTGTTAGGCTCAGTTCGATTCCCTCCAGCCCTCTCCGCCCGTTTGAAG GCAGTTCCTTATCCCGGAGACAACGTACAGATGTTCTCTCTTTCCCTCTTTATTTTTTTTAAGACAGGGT CTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCACAGCTCACTACAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAAC ACGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGCGGCTGGGACTACAAGCGCGCACCACTGCACAGGGATTATTAT TATTATTTTATTATTTTGTAGAGAAACGGGTGGGAGTGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAAC TCAGCTCAAGAGATCCTCCCGCCTCGGCGTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCGCGCCCG GACGCAGATATTTTCTATGGGCATCTGGAATGGCGTCCCCAAAGCTTGGCGCCGTGCTATGGTCAAGCCG GGTCGGGGGCTCGGGCCAGCCTTCAACACCGTTGGCAGCAATCGGAACGATCAACTGTACCCTCAGTACC GCGACCTCGCCCGGTCCTGCCAATGGCCGGCCCCTAGCCGGTCCTGAGGCCTCGCGAGAGCTCCCGTGGC TACGCCTTCCCCGGCCTCGGAACGGCCCCATCCTTCCTCTTTCCCCGCCTCCCAGCGGCGCTCCACTCTC GGATTGGCTGATTGATCCGAGTCAGTTTTTTTCCTCGCCAGAAAGCGGTTCGACAATTGGTCCTTCTTTT GGCCCCTCCTGCGATGCCCGCGGATTGGACGGCTGAGTCTGGCTACGCGGGCCTCCGCGGGAGCGCGACC GGGCCAATCAAGAGCTTGGCGTATTTTACAAACTGAGAAAGTAGCTCCAGCAGCACCCGAGAGGGTCAGG AGAAAAGCGGAGGAAGCTGGGTAGGCCCTGAGGGGCCTCGGTAAGGTAAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TROAP_1 ↗ | 12:49,323,255 | 正股 | 49,323,206–49,323,265 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BCR9T · promoter · 49322746–49323283 · regulatory
ENSR12_5FL8BK · CTCF_binding_site · 49323066–49323087 · regulatory
· motif · 49322198–49322209 · motif
· motif · 49322310–49322327 · motif
· motif · 49323066–49323076 · motif
· motif · 49323068–49323084 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：778 aa
trophinin associated protein 長 778 個胺基酸。其序列包含四段約 33 個胺基酸的串聯重複，位於第 516 至 647 個胺基酸；另有多段區域被註記為無序區，包括第 1–115、212–244、406–425、508–587 與 600–641 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
trophinin associated protein 的定位資料列於細胞質；來源未提供定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
- ACTMAPQ5BKX5-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPQ8N9N5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- BYSLQ13895 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- DYRK1AQ13627 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- DYRK1BQ9Y463 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ERBB4Q15303 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GIGYF1O75420 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAPRE1Q15691 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- MAPRE3Q9UPY8 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- NOTCH2NLCP0DPK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OIP5O43482 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TP53BP2Q05BL1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF2Q12933 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TRIM23P36406 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
trophinin associated protein 可直接結合 bystin，並與 trophinin 間接相關。來源未進一步說明這些互作是否同屬一個複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | trophinin associated protein 可能與 bystin、trophinin 一同參與細胞黏附分子複合體；該複合體在胚胎著床時，可能介導囊胚對子宮上皮細胞的初始附著。此功能具有不確定性。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Could be involved with bystin and trophinin in a cell adhesion molecule complex that mediates an initial attachment of the blastocyst to uterine epithelial cells at the time of the embryo implantation |
| 交互作用 | trophinin associated protein 可直接結合 bystin，並與 trophinin 間接相關；資料未進一步說明間接關係的具體方式。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | trophinin associated protein 的細胞內定位記載為細胞質；此資料未提供定位改變條件或異構型差異。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTATTTTACAAACTGAGAAAGTAGCTCCAGCAGCACCCGA40GAGGGTCAGGAGAAAAGCGGAGGAAGCTGGGTAGGCCCTG80AGGGGCCTCGGTAAGCCATCATGACCACCCGGCAAGCCAC120GAAGGATCCCCTCCTCCGGGGTGTATCTCCTACCCCTAGC160AAGATTCCGGTACGCTCTCAGAAACGCACGCCTTTCCCCA200CTGTTACATCGTGCGCCGTGGACCAGGAGAACCAAGATCC240AAGGAGATGGGTGCAGAAACCACCGCTCAATATTCAACGC280CCCCTCGTTGATTCAGCAGGCCCCAGGCCGAAAGCCAGGC320ACCAGGCAGAGACATCACAAAGATTGGTGGGGATCAGTCA360GCCTCGGAACCCCTTGGAAGAGCTCAGGCCTAGCCCTAGG400GGTCAAAATGTGGGGCCTGGGCCCCCTGCCCAGACAGAGG440CTCCAGGGACCATAGAGTTTGTGGCTGACCCTGCAGCCCT480GGCCACCATCCTGTCAGGTGAGGGTGTGAAGAGCTGTCAC520CTGGGGCGCCAGCCTAGTCTGGCTAAAAGAGTACTGGTTC560GAGGAAGTCAGGGAGGCACCACCCAGAGGGTCCAGGGTGT600TCGGGCCTCTGCATATTTGGCCCCCAGAACCCCCACCCAC640CGACTGGACCCTGCCAGGGCTTCCTGCTTCTCTAGGCTGG680AGGGACCAGGACCTCGAGGCCGGACATTGTGCCCCCAGAG720GCTACAGGCTCTGATTTCACCTTCAGGACCTTCCTTTCAC760CCTTCCACTCGCCCCAGTTTCCAGGAGCTAAGAAGGGAGA800CAGCTGGCAGCAGCCGGACTTCAGTGAGCCAGGCCTCAGG840ATTGCTCCTGGAGACCCCAGTCCAGCCTGCTTTCTCTCTT880CCTAAAGGAGAACGCGAGGTTGTCACTCACTCAGATGAAG920GAGGTGTGGCCTCTCTTGGTCTGGCCCAGCGAGTACCATT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。