基因總覽
TRO 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 trophinin。其蛋白質產物長 1431 個胺基酸，具有 MAGE 結構域及多個重複序列。現有資料將 trophinin 與細胞黏附相關聯，但未提供更完整的蛋白質家族或其他基本性質資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000173898 ★ | 54,920,824–54,931,431 | 13 |
| ENST00000411534 | 54,920,462–54,923,356 | 2 |
| ENST00000452830 | 54,920,563–54,922,877 | 2 |
| ENST00000420798 | 54,920,563–54,931,429 | 11 |
| ENST00000319167 | 54,920,563–54,931,436 | 13 |
| ENST00000375022 | 54,920,563–54,931,436 | 13 |
| ENST00000399736 | 54,920,563–54,931,436 | 12 |
| ENST00000854214 | 54,920,563–54,931,431 | 12 |
| ENST00000854215 | 54,920,563–54,931,430 | 13 |
| ENST00000854216 | 54,920,563–54,931,428 | 12 |
| ENST00000854217 | 54,920,563–54,931,423 | 12 |
| ENST00000919321 | 54,920,563–54,931,436 | 12 |
顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
trophinin 直接負責同源性細胞黏附，也就是由相同分子彼此作用所介導的細胞黏附。資料指出，這項作用與胚胎著床初期的細胞附著有關。
在胚胎著床時，trophinin 可能與 bystin 及 tastin 一同參與細胞黏附分子複合體，該複合體可能介導囊胚最初附著於子宮上皮細胞。來源以「可能參與」描述其在複合體中的角色，因此不能據此將此複合體作用視為已確定的因果機制。資料未進一步說明這種附著如何調控，也未提供其他生物學過程或功能結果的細節。
Promoter 與基因調控
>TRO ENST00000173898 GRCh38 chrX:54919824-54920924 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATTCTATTGGATAAAATATTCCGTAGGTCCTTTTTGTCTAAAGTGTATTTCAAGTTCAATGTTTCCCTA TCGATTTTCTGTCTGGATGATCTGTGAATTGTTGAAGATGGGGTCTTGAAGTCTCCTACCATTATTGTAT TGCAGTCTACTTCTCCCTTCAGATCTATTAATATTTGTTTTATATATTTAGGTGCTTCTATGTTGGGTGC ATATATTAAATATGTTTATAATTATTCGATATTCACGATGAATTTATCTCATTATCATTATATAATGACC TTTAAGATCTTTTATGGTTTTTGACTTTAAGTCTATTTTATTTGACATATGTGTAGTTATCCTTGCTCTC TTTTGAATGATTGATGGAATAGATAAATGTCATGAATTGTTTTCTGCATGGGGGCACAGTGCACCATGTC ACAAGAGACAGTCTAAGTACAAACTGATATTGTTAAAACATCAATATAGTCATTGTGGGATCAATAAAAA CTTTTCATAGATTTTTATACATTACTGTTTTTATTCTGAATTGCATAAGATGGACGGGCACCCTATCTTT TAGTGTTTAGAACCTCTAAATGTTTTAATGTGGTAACACTTGAAAAACAGAAATGAATATGACCTAGTCC CCTGCTCCAGAGCAGCTCTAGGGAAGAGAGACATAGACACAAGGTATAACAACACTATGTAAATAGTGTT GGGATAGAGGGTCTGTAGGAAGGGTTGGTGTGGGAGTTCAGAGAACTACATTCCTCCTAGGGGAAACAGG AGAATCAAATAGGAACGGAGATACAGAGTGGGGAATAGAGAAGTCAAATGGAGAATAAGAGGGAGTGATA ACTGAATAGGGGTAGTAAGAAGAAAAAGGGAGCTACATTGAGGAGAATGGAAAGTTGAAAGTAGGTATGG AGGGGAGGAGACTGACAGGCAGGAACGGAGACCCCCCTCTGGAGGCGGAAAGAGGCAGGACCACTTCCGG CCAGGGAGGGGGATAGGCTCAGACACAAGGAGAGGCTTGGAGAGAGCAGACGCCTTCTGGATTCAAGAAG ACGAGGTGAGCTGAGGTACCTGGCTTTAGTGAAGACCCTGTGGGGGCTTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRO_1 ↗ | X:54,920,824 | 正股 | 54,920,775–54,920,834 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_83LL5S · promoter · 54920607–54920861 · regulatory
ENSRX_C7G5W · enhancer · 54920862–54922156 · regulatory
· motif · 54921884–54921895 · motif
· motif · 54921884–54921895 · motif
· motif · 54921970–54921981 · motif
· motif · 54921970–54921981 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1431 aa
trophinin 長 1431 個胺基酸。其 MAGE 結構域位於第 444–642 個胺基酸；第 751–1200 位附近另註記多個連續重複序列，其中部分標示為約略位置。資料未提供這些結構特徵的具體功能說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- BYSLQ13895 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
trophinin 可直接結合 bystin，並與 tastin 間接相連。另有資料指出，trophinin 可能與 bystin、tastin 一同參與細胞黏附分子複合體；這項複合體關係屬於可能性描述，不能等同於已確認三者皆直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | trophinin 可能與 bystin、tastin 一同參與細胞黏附分子複合體，該複合體可能介導胚胎著床時囊胚最初附著於子宮上皮細胞；此外，trophinin 直接負責同源性細胞黏附。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Could be involved with bystin and tastin in a cell adhesion molecule complex that mediates an initial attachment of the blastocyst to uterine epithelial cells at the time of the embryo implantation. Directly responsible for homophilic cell adhesion |
| 交互作用 | trophinin 可直接結合 bystin，並與 tastin 間接相連；此描述區分了直接結合與間接關聯，未說明間接相連的具體方式。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGACACAAGGAGAGGCTTGGAGAGAGCAGACGCCTTCTGG40ATTCAAGAAGACGAGGCCCATTCCCCTCAGGCTCACCTGT80TACTCGGCCTCCCAGAAAGATGGATAGGAGAAATGACTAC120GGATATAGGGTGCCTCTATTTCAGGGCCCTCTGCCTCCCC160CGGGGAGCCTGGGGCTTCCCTTCCCTCCAGATATACAGAC200TGAGACCACAGAAGAGGACAGTGTCCTGCTGATGCATACC240CTGTTGGCGGCAACCAAGGACTCCCTGGCCATGGACCCAC280CAGTTGTCAACCGGCCTAAGAAAAGCAAGACCAAGAAGGC320CCCTATAAAGACTATTACTAAGGCTGCACCTGCTGCCCCT360CCAGTCCCAGCTGCCAATGAGATTGCCACCAACAAGCCCA400AAATAACTTGGCAGGCTTTAAACCTGCCAGTCATTACCCA440GATCAGCCAGGCTTTACCTACCACTGAGGTAACCAATACT480CAGGCTTCTTCAGTCACTGCTCAGCCTAAGAAAGCCAACA520AGATGAAGAGAGTTACTGCCAAGGCAGCCCAAGGCTCCCA560ATCCCCAACTGGCCATGAGGGTGGCACTATACAGCTGAAG600TCACCCTTGCAGGTCCTAAAGCTACCAGTCATCTCACAGA640ATATTCACGCTCCAATTGCCAATGAGTCAGCCAGTTCCCA680AGCCTTGATAACCTCTATCAAGCCTAAGAAAGCTTCCAAG720GCTAAGAAGGCTGCAAATAAGGCCATAGCTAGTGCCACCG760AGGTCTCGCTGGCTGCAACTGCCACCCATACAGCTACCAC800CCAAGGCCAAATTACCAATGAGACAGCCAGTATCCACACC840ACAGCAGCCTCCATCCGAACCAAGAAAGCCTCCAAAGCCA880GGAAGACAATTGCTAAGGTCATAAATACTGACACTGAGCA920TATAGAGGCTCTAAATGTCACTGACGCAGCTACCAGGCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。