基因總覽
TRIP6（thyroid hormone receptor interactor 6）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 zyxin/ajuba 家族。此蛋白質含有三個 LIM zinc-binding 結構域，並具有多段被註解為無序的區域；蛋白質全長為 476 個胺基酸。這些結構特色構成其分子辨識與交互作用的基礎。其名稱反映與 thyroid hormone receptor 的關聯，而來源亦記載它參與細胞內訊號傳遞及轉錄調節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000200457 ★ | 100,867,387–100,873,454 | 9 |
| ENST00000893591 | 100,867,126–100,873,524 | 9 |
| ENST00000893592 | 100,867,126–100,873,524 | 8 |
| ENST00000893593 | 100,867,126–100,873,524 | 9 |
| ENST00000893594 | 100,867,126–100,873,524 | 7 |
| ENST00000893595 | 100,867,126–100,873,524 | 8 |
| ENST00000893596 | 100,867,126–100,873,524 | 9 |
| ENST00000893597 | 100,867,126–100,873,524 | 7 |
| ENST00000893598 | 100,867,126–100,873,524 | 9 |
| ENST00000893599 | 100,867,126–100,873,524 | 9 |
| ENST00000936779 | 100,867,126–100,873,516 | 9 |
| ENST00000936780 | 100,867,126–100,873,524 | 7 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRIP6 可將細胞表面的訊號傳遞至細胞核，並與黏著連接的減弱、actin 細胞骨架重組及細胞侵襲性增加相關。這些作用把細胞周邊接收的訊號與細胞結構及行為變化連結起來；來源未進一步說明其訊號傳遞的分子步驟或各效應之間的先後關係。
TRIP6 也參與 lysophosphatidic acid 誘發的細胞黏附與遷移，顯示它與此脂質訊號相關的細胞反應有關。來源指出其具有這些參與作用，但未提供更細節的條件或機制描述。
在轉錄調節方面，TRIP6 可作為 NF-kappa-B 與 JUN 的轉錄共活化因子；另一方面，它也介導 glucocorticoid receptor 誘發的 NF-kappa-B 與 JUN 轉錄抑制。這些描述指出，TRIP6 與兩種轉錄因子的調節關係會依所述調控情境而呈現共活化或參與抑制作用。
Promoter 與基因調控
>TRIP6 ENST00000200457 GRCh38 chr7:100866387-100867487 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCCAGCAGGGGCGCGGCACAGGAGGAGGGCCGGGTGGGCCGGAGGGTGGGGATGCTGAGGGCCCCATCA CAGCCCTCACCTTCCTGTACTTGCCTCGGCCGCCAGCCGATCCCGCCCGATACCCCCGCTACCTGGCGCT ACTGGAGACTCTAACCCGAGACCTGGGCCCCACGCTGCTGGTTCATGGGGTCACTCCAGTCACCTGCACT GATCTGTGATGCCCCTGCCTCCAGGGCTAGGTAGAGAGGGCCCAGGCAGGCGGCCTATCCTGATCCTTGG AGGAGGAGGAAGAGGAGGCCACTGTGGCCCGTGGCCCTGCCCTTGGGACGTGGAGCCCAGGGGAGGTTTG AAGGGGATCCTGGGCTTGGGCATCACGCCCACCTCCTTTGGCAGAGGGACCCCAGCACACTAACTCTGGG TGGCTGTCCCCACCGTGCAGGGGAGGGAGTCCGCAGCCTCCCTTCACTGGTGCCTTGATGCTAGGGGCCA GGCCTCCTCTGTGACTCTGGGCTACCTCAGTTTCCCCATTTTGGCCAGACTCACCGGCCCACTGGGGTGG TGATGTTTTCGTTCTGTTTTATTTTTCTAACTCTGCTGACCATGAATAAAAGACCAAAACACTACAGGCT GGCTGAGCAGTGCTGGTGGGTAGCTGAGAGGGAGGGGGTGGGAATGGAGAGCTCTGCAGAGGGGTGGAGA TCGGAGCCTTCAGCCTCCCGCCGCGAGGCTGCCACGTGCAGGGCTGGGGTGCGGGGCCCGGACGCATCCG TGGACTTGGAGGCTGGCTCGGGCCCGCACCTCCCATCCCCAGCTGCCCGCAACCCCCAGTGACTCGGGAT CCCCCGGAGAGCCCTCCCCTCTCGGCAGGAGGGGGCTGACTCAGGGAGAAATGGCAGTTTAGGGCCTAGG GGGCCACGTGACCCTCCCCCAGGAATGTGGTGACGTCATCGGAGGCGTGGTCGTCCCCAAAATTAGGGAG GAAGAGGAAAAAAAAAAGCCAGAAAAAGTTTTCTTTTCTGGAGTCCCAAACGAGGTGCGGGACGGAAGAG GGGGTGAAGGCCAGAGGCTCGGGGCTTCAAGACCGCTGTCTGGAGTCCCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRIP6_2 ↗ | 7:100,866,221 | 正股 | 100,866,172–100,866,231 |
| TRIP6_1 ↗ | 7:100,867,387 | 正股 | 100,867,338–100,867,397 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_93H2X4 · enhancer · 100863438–100863897 · regulatory
ENSR7_5TPK7W · CTCF_binding_site · 100865706–100865727 · regulatory
ENSR7_BQ2H3 · promoter · 100866897–100867508 · regulatory
· motif · 100863804–100863819 · motif
· motif · 100863804–100863819 · motif
· motif · 100863823–100863838 · motif
· motif · 100865708–100865724 · motif
· motif · 100867108–100867124 · motif
· motif · 100867108–100867124 · motif
· motif · 100867117–100867126 · motif
· motif · 100867200–100867215 · motif
· motif · 100867259–100867273 · motif
· motif · 100867299–100867308 · motif
· motif · 100867299–100867308 · motif
· motif · 100867306–100867316 · motif
· motif · 100867316–100867325 · motif
· motif · 100867324–100867337 · motif
· motif · 100867324–100867337 · motif
· motif · 100867337–100867347 · motif
· motif · 100869176–100869191 · motif
· motif · 100869415–100869427 · motif
· motif · 100869417–100869432 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：476 aa
TRIP6 蛋白質長 476 個胺基酸，屬於 zyxin/ajuba 家族，含有三個 LIM zinc-binding 結構域，位置分別為 279–316、339–398 與 399–467。第 1–93 與 108–253 位胺基酸區段被註解為無序區。第 469–476 位區段與 MAGI1 和 PTPN13 的交互作用相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRIP6 位於細胞質、細胞骨架、細胞接合處、黏著斑及細胞核，並可在細胞核與細胞質之間穿梭；來源亦記載其與 actin 共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 145 個夥伴
- ABI2Q9NYB9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ADAMTSL4Q6UY14-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ATN1P54259 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ATP5POP48047 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- AXIN1A0A0S2Z4M1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AXIN1O15169 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- BAG3O95817 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEX2Q9BXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BYSLQ13895 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- C11orf87Q6NUJ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CATSPER1Q8NEC5 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CCDC120Q96HB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC24Q8N4L8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP57L1Q8IYX8-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNTFP26441 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB5Q02930-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRYBA4P53673 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTAG2O75638 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TRIP6 在 thyroid hormone 存在時與 thyroid receptor（TR）的 ligand-binding domain 特異性交互作用。它也透過第三個 LIM 結構域及 C 端與 PTPN13 的第二個 PDZ domain 互作；與 PDLIM4 的互作則涉及第二個 LIM 結構域，或第三個 LIM 結構域加 C 端。另有資料指出 TRIP6 與 PTPN13、PDLIM4 同處一複合體，但此複合體資訊標示為 By similarity。其他記載的互作對象包括 SVIL isoform 2、LPAR2、PRKAA2、MAGI1、SCRIB，以及感染情況下的 S.typhimurium protein sseI；來源未將這些互作一概描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRIP6 將細胞表面訊號傳至細胞核，與黏著連接減弱、actin 細胞骨架重組及細胞侵襲性增加相關；也參與 lysophosphatidic acid 誘發的細胞黏附與遷移。此外，它是 NF-kappa-B 與 JUN 的轉錄共活化因子，並介導 glucocorticoid receptor 誘發的兩者轉錄抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Relays signals from the cell surface to the nucleus to weaken adherens junction and promote actin cytoskeleton reorganization and cell invasiveness. Involved in lysophosphatidic acid-induced cell adhesion and migration. Acts as a transcriptional coactivator for NF-kappa-B and JUN, and mediates the transrepression of these transcription factors induced by glucocorticoid receptor PMID 14688263 ↗ · PMID 15489293 ↗ · PMID 16624523 ↗ · PMID 19017743 ↗ |
| 交互作用 | TRIP6 在 thyroid hormone 存在時與 thyroid receptor 的 ligand-binding domain 互作；另與 PTPN13、PDLIM4、SVIL isoform 2、LPAR2、PRKAA2、MAGI1 及 SCRIB 互作，且感染時可與 S.typhimurium protein sseI 互作。它與 PTPN13、PDLIM4 同處複合體的說法標示為 By similarity。 | 含實驗來源 | 證據與來源Specifically interacts with the ligand binding domain of the thyroid receptor (TR) in the presence of thyroid hormone. Interacts (via the third LIM domain and C-terminus) with PTPN13 (via the second PDZ domain). Interacts (via the second LIM domain or via the third LIM domain plus C-terminus) with PDLIM4 (via PDZ domain). Found in a complex with PTPN13 and PDLIM4 (By similarity). Interacts with SVIL isoform 2. Interacts with LPAR2 but not other LPA receptors. Interacts with PRKAA2. Interacts with MAGI1. Interacts with SCRIB. In case of infection, interacts with S.typhimurium protein sseI PMID 10400701 ↗ · PMID 10826496 ↗ · PMID 14688263 ↗ · PMID 16137684 ↗ · PMID 16624523 ↗ · PMID 16880273 ↗ · PMID 17095609 ↗ · PMID 17591779 ↗ · PMID 19017743 ↗ |
| 細胞定位 | TRIP6 的定位包括細胞質、細胞骨架、細胞接合處、黏著斑與細胞核，並可在細胞核和細胞質之間穿梭；另有資料記載它與 actin 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton; Cell junction, focal adhesion; Nucleus; Cytoplasm; Shuttles between nucleus and cytoplasm. Colocalizes with actin PMID 16624523 ↗ · PMID 10826496 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAAAAGTTTTCTTTTCTGGAGTCCCAAACGAGGTGCGG40GACGGAAGAGGGGGTGAAGGCCAGAGGCTCGGGGCTTCAA80GACCGCTGTCTGGAGTCCCCCTTTCCAGGCCATGTCGGGG120CCCACCTGGCTGCCCCCGAAGCAGCCGGAGCCCGCCAGAG160CCCCTCAGGGGAGGGCGATCCCCCGCGGCACCCCGGGGCC200ACCACCGGCCCACGGAGCAGCACTCCAGCCCCACCCCAGG240GTCAATTTTTGCCCCCTTCCATCTGAGCAGTGTTACCAGG280CCCCAGGGGGACCGGAGGATCGGGGGCCGGCGTGGGTGGG320GTCCCATGGAGTACTCCAGCACACGCAGGGGCTCCCTGCA360GACAGGGGGGGCCTTCGCCCTGGAAGCCTGGACGCCGAGA400TAGACTTGCTGAGCAGCACGCTGGCCGAGCTGAATGGGGG440TCGGGGTCATGCGTCACGGCGACCAGACCGACAGGCATAT480GAGCCCCCGCCACCTCCTGCCTACCGCACGGGCTCCCTGA520AGCCAAATCCAGCCTCGCCGCTCCCAGCGTCTCCCTATGG560GGGCCCCACTCCAGCCTCTTACACTACCGCCAGCACCCCG600GCTGGCCCAGCCTTCCCCGTGCAAGTGAAGGTGGCACAGC640CAGTGAGGGGCTGCGGCCCACCCAGGCGGGGAGCCTCTCA680GGCCTCTGGGCCCCTCCCGGGCCCCCACTTTCCTCTCCCA720GGCCGAGGTGAAGTCTGGGGGCCTGGCTATAGGAGCCAGA760GAGAGCCAGGGCCAGGGGCCAAAGAGGAAGCTGCTGGGGT800CTCTGGCCCTGCAGGAAGAGGAAGAGGAGGCGAGCACGGG840CCCCAGGTGCCCCTGAGCCAGCCTCCAGAGGATGAGCTGG880ATAGGCTGACGAAGAAGCTGGTTCACGACATGAACCACCC920GCCCAGCGGGGAGTACTTTGGCCAGTGTGGTGGCTGCGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。