基因總覽
TRIP4（thyroid hormone receptor interactor 4）是蛋白質編碼基因，產物為 581 個胺基酸的蛋白質。此蛋白可與核受體及其他轉錄調控蛋白協同作用，並參與數種不同的細胞功能。其結構包含 C4 型鋅指與 ASCH 結構域；另有兩段區域分別與 DDRGK1、UFL1 的交互作用相關。這些特徵反映其可參與多種分子組成與細胞情境，但不代表各作用必然同時發生。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000261884 ★ | 64,387,836–64,455,303 | 13 |
| ENST00000907326 | 64,387,772–64,458,653 | 13 |
| ENST00000907327 | 64,387,772–64,458,653 | 12 |
| ENST00000907328 | 64,387,772–64,458,653 | 13 |
| ENST00000907329 | 64,387,772–64,458,653 | 11 |
| ENST00000935228 | 64,387,772–64,458,653 | 13 |
| ENST00000935229 | 64,387,772–64,458,653 | 10 |
| ENST00000935230 | 64,387,772–64,458,653 | 13 |
| ENST00000949915 | 64,387,772–64,458,653 | 12 |
| ENST00000949916 | 64,387,772–64,458,653 | 14 |
| ENST00001036379 | 64,387,772–64,455,301 | 13 |
| ENST00001036380 | 64,387,772–64,455,304 | 14 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRIP4 是轉錄共活化因子，能與核受體、其他轉錄共活化因子 EP300、CREBBP、NCOA1，以及基礎轉錄因子 TBP、TFIIA 相互作用，協助核受體介導的轉錄。來源指出，TRIP4 可能依不同細胞條件參與形成不同的共活化因子複合體；因此其轉錄調控作用會隨細胞情境而有所差異。
在核受體相關調控中，TRIP4 參與甲狀腺素受體與雌激素受體的轉錄活化；其參與雄性素受體轉錄活化則屬於相似性推定。除核受體外，TRIP4 也參與 NF-kappa-B、SRF 與 AP1 的轉錄活化。它還能介導核受體對 AP1 或 NF-kappa-B 的轉錄抑制作用，顯示其與這些轉錄因子的關係不僅涉及促進轉錄，也包括調節彼此之間的抑制效應。
TRIP4 也與肌肉及神經肌肉相關過程有關。來源指出它可能參與神經肌肉接合處的發育；參與肌生成後期分化則為相似性推定，不能視為已確立的結論。
此外，TRIP4 是 RQC trigger（RQT）複合體的一部分，能參與活化核糖體品質管制（RQC）途徑。當翻譯過程發生問題時，此途徑會降解尚未完成合成的新生胜肽鏈。這項功能與轉錄調控不同，顯示 TRIP4 也參與細胞處理異常翻譯產物的品質管制。
Promoter 與基因調控
>TRIP4 ENST00000261884 GRCh38 chr15:64386836-64387936 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGGCTAGTAGAAATGAAGAACTTTTAACCTGCAAATGCAACAAAAAGCCAGAAATGAATGGGAAGACAT TATGATCTCCAGAAAAGTTTGGCTAAATTTTCCCCAGCCCATTGTCTTAGCGGGGTAGGGAATTGCAGAC AGCCCTTAAATACTGTCATTTTTGGTTGAGAACTCATGTGGAAAGTCCTCAAAGCCAAATTCCAACTCCT GTTTTACTGTTTTTTACCCTCGAGCTTGCTGAGTTGTCTTGGCTCTCCTGGAAAATACATGGCTCAAAAA ATAAAATAGAAGTTTTAGCGGTGTGAATCTAGTAGTCGACTACAGGGGGTATTAAAAATAAACACTCCAT CCCGGTTAACACGTGAAACCGCGTCGCTACTAAAAATACAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTG CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGT GAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCAAGCCTGGGCGACAGTGCGAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAATA AATTAATTAATTAATTAAAAAATTAAAACCACCACCAGAGCAAAAACTTACAGCGCTTACAATACCTTCC ACGTGCTGTTTTATTTTACATAAAACCATGACGATTAAAAAGCTGGCCTCTCAGCTTTCCGGGTATTGGT TTGTTTTCCCCCTAAACTGTCGTTTTTATAGGCACTTGCACTGTCTTCTTAGCAGAATTGCCAATGGCCT TCCTCGAGTCCTACGTTTAGCGATTGGCAAGAATCATGCACTGACAGAGCTCGACTCCGGAGGGCACAAG GAAGTAGACAACAAAGCAGGAAGAAGCAGGAGGCGCACAGATGGGCGGGATCTGCACTGGAGGCGGTGCG ACCTTGCGGGGCGGTGCAAGCTGGCGGAACCCGCGTGAGAGAGGTTGGTGTTGCGAAGGGAACTAGTCCG GTGCAGGACGTGGGGCTTTTGCAGCTCAGCTGGTTCCGGCTGGGGAAGATGGCGGTGGCTGGGGCGGTGT CCGGGGAGCCGCTGGTGCACTGGTGCACCCAGCAGTTGCGGAAGACTTTCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRIP4_1 ↗ | 15:64,387,843 | 正股 | 64,387,794–64,387,853 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_9XK2N · promoter · 64387346–64387846 · regulatory
ENSR15_5K5WF8 · CTCF_binding_site · 64387694–64387715 · regulatory
· motif · 64383950–64383961 · motif
· motif · 64387463–64387472 · motif
· motif · 64387463–64387472 · motif
· motif · 64387539–64387550 · motif
· motif · 64387540–64387551 · motif
· motif · 64387670–64387681 · motif
· motif · 64387689–64387700 · motif
· motif · 64387696–64387712 · motif
· motif · 64387862–64387872 · motif
· motif · 64392328–64392341 · motif
· motif · 64392328–64392341 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：581 aa
TRIP4 蛋白長 581 個胺基酸，含有位於第 171–187 位的 C4 型鋅指，以及第 437–531 位的 ASCH 結構域。第 97–118 位被註記為無序區。第 200–300 位與 DDRGK1 交互作用相關，第 300–400 位則與 UFL1 交互作用相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRIP4 位於細胞核、細胞質與中心體；血清剝奪條件下則記錄為位於細胞質。 它也與 NEK6 在中心體共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TRIP4 與甲狀腺素受體的配體結合域互作，且此互作需要甲狀腺素；與雄性素受體的互作則依賴雄性素，包括睪固酮或雙氫睪固酮。它也與配體結合的 ESR1 互作，並與 UFSP2 競爭；UFSP2 與配體結合 ESR1 之間亦呈競爭關係。TRIP4 與 DDRGK1 的互作為直接互作，也與 UFL1、NCOA1、EP300、NEK6、CSRP1 及 ZCCHC4 互作。複合體方面，TRIP4 是含 ASCC1、ASCC2、ASCC3 的 ASC-1 複合體成員，也被辨識為含 ASCC2、ASCC3 的 RQT 複合體成員。
疾病與遺傳關聯
TRIP4 相關基因變異與兩種常染色體隱性疾病有關。脊髓性肌肉萎縮合併先天性骨折 1（SMABF1）可於產前發病，表現包括脊髓性肌肉萎縮、多發性先天攣縮、呼吸窘迫及先天性骨折。Davignon-Chauveau 型先天性肌肉失養症（MDCDC）為嚴重疾病，通常在新生兒期出現肌無力，主要影響軀幹肌，並可有危及生命的呼吸衰竭、皮膚異常及關節過度鬆弛而無攣縮；肌肉切片可見多發小核心、肌肉帽狀病灶與失養性病變。來源將兩者描述為受影響基因變異所致，並未提供特定變異細節。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRIP4 作為轉錄共活化因子，與核受體、EP300、CREBBP、NCOA1 及基礎轉錄因子 TBP、TFIIA 協作，促進核受體介導的轉錄，並可能依細胞條件形成不同共活化複合體。它參與甲狀腺素受體與雌激素受體的轉錄活化；雄性素受體活化的關聯屬相似性推定。它也參與 NF-kappa-B、SRF、AP1 的轉錄活化，並介導核受體對 AP1 或 NF-kappa-B 的轉錄抑制。此外，可能涉及神經肌肉接合處發育；晚期肌生成分化亦為相似性推定。TRIP4 還是 RQT 複合體成員，可活化 RQC 途徑，以降解問題翻譯過程產生的新生胜肽鏈。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription coactivator which associates with nuclear receptors, transcriptional coactivators including EP300, CREBBP and NCOA1, and basal transcription factors like TBP and TFIIA to facilitate nuclear receptors-mediated transcription. May thereby play an important role in establishing distinct coactivator complexes under different cellular conditions. Plays a role in thyroid hormone receptor and estrogen receptor transactivation. Also involved in androgen receptor transactivation (By similarity). Plays a pivotal role in the transactivation of NF-kappa-B, SRF and AP1. Acts as a mediator of transrepression between nuclear receptor and either AP1 or NF-kappa-B. May play a role in the development of neuromuscular junction. May play a role in late myogenic differentiation (By similarity). Also functions as part of the RQC trigger (RQT) complex that activates the ribosome quality control (RQC) pathway, a pathway that degrades nascent peptide chains during problematic translation PMID 10454579 ↗ · PMID 12077347 ↗ · PMID 25219498 ↗ · PMID 26924529 ↗ · PMID 32099016 ↗ · PMID 32579943 ↗ · PMID 36302773 ↗ |
| 交互作用 | TRIP4 與甲狀腺素受體的配體結合域互作，且需要甲狀腺素；與雄性素受體互作則依賴雄性素、睪固酮或雙氫睪固酮。TRIP4 與配體結合的 ESR1 互作，並與 UFSP2 競爭；UFSP2 也與配體結合 ESR1 競爭。TRIP4 與 DDRGK1、UFL1、NCOA1、EP300、NEK6、CSRP1、ZCCHC4 互作，其中 DDRGK1 的互作為直接互作。TRIP4 是含 ASCC1、ASCC2、ASCC3 的 ASC-1 複合體成員，也被辨識為含 ASCC2、ASCC3 的 RQT 複合體成員。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the thyroid hormone receptor/TR (via the ligand-binding domain); this interaction requires the presence of thyroid hormone. Interacts with the androgen receptor/AR; in an androgen, testosterone and dihydrotestosterone-dependent manner. Interacts with ESR1 (estrogen ligand-bound); competes with UFSP2. Interacts with UFSP2; competes with ligand-bound ESR1. Interacts with DDRGK1 and UFL1; the interaction with DDRGK1 is direct. Interacts with NCOA1. Interacts with EP300. Part of the ASC-1 complex, that contains TRIP4, ASCC1, ASCC2 and ASCC3. Identified in the RQT (ribosome quality control trigger) complex, that contains ASCC2, ASCC3 and TRIP4. Interacts with NEK6. Interacts with CSRP1. Interacts with ZCCHC4 PMID 10454579 ↗ · PMID 12077347 ↗ · PMID 12390891 ↗ · PMID 20873783 ↗ · PMID 25219498 ↗ · PMID 26924529 ↗ · PMID 31799605 ↗ · PMID 32099016 ↗ · PMID 32579943 ↗ · PMID 36302773 ↗ |
| 細胞定位 | TRIP4 記錄於細胞核、細胞質胞質溶膠及細胞骨架的微管組織中心／中心體；血清剝奪條件下位於細胞質。TRIP4 也在中心體與 NEK6 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, cytosol; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasmic under conditions of serum deprivation. Colocalizes with NEK6 in the centrosome PMID 10454579 ↗ · PMID 12077347 ↗ · PMID 20873783 ↗ · PMID 26924529 ↗ |
| 疾病關聯 | 脊髓性肌肉萎縮合併先天性骨折 1（SMABF1）是常染色體隱性神經肌肉疾病，可在產前發病，特徵包括脊髓性肌肉萎縮、多發性先天攣縮（符合多發性先天性關節攣縮）、呼吸窘迫與先天性骨折。此病被描述為由本條目所代表基因的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spinal muscular atrophy with congenital bone fractures 1 SMABF1 An autosomal recessive neuromuscular disorder characterized by prenatal-onset spinal muscular atrophy, multiple congenital contractures consistent with arthrogryposis multiplex congenita, respiratory distress, and congenital bone fractures. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616866 PMID 26924529 ↗ |
| 疾病關聯 | Davignon-Chauveau 型先天性肌肉失養症（MDCDC）是嚴重的常染色體隱性先天性肌肉失養症，新生兒期開始出現肌無力，主要涉及軀幹肌，並有危及生命的呼吸衰竭、皮膚異常及無攣縮的關節過度鬆弛。肌肉切片可見多發小核心、肌肉帽狀病灶與失養性病變。此病被描述為由本條目所代表基因的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源Muscular dystrophy, congenital, Davignon-Chauveau type MDCDC An autosomal recessive, severe congenital muscular dystrophy characterized by neonatal onset of muscle weakness predominantly involving axial muscles, life-threatening respiratory failure, skin abnormalities and joint hyperlaxity without contractures. Muscle biopsies show multi-minicores, caps and dystrophic lesions. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617066 PMID 27008887 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCAGCTCAGCTGGTTCCGGCTGGGGAAGATGGCGGTGGCT40GGGGCGGTGTCCGGGGAGCCGCTGGTGCACTGGTGCACCC80AGCAGTTGCGGAAGACTTTCGGCCTGGATGTCAGCGAGGA120GATCATTCAGTACGTTTTGTCAATTGAGAGTGCTGAAGAG160ATACGAGAATATGTTACTGATCTCCTCCAGGGAAATGAAG200GCAAAAAAGGTCAATTCATAGAAGAACTTATAACCAAATG240GCAAAAGAATGATCAGGAGTTGATTTCGGATCCTTTGCAG280CAGTGCTTCAAAAAAGATGAAATTTTAGATGGGCAGAAAT320CAGGCGACCATCTAAAGCGGGGTAGGAAGAAAGGGAGAAA360CAGACAGGAAGTTCCTGCATTTACTGAACCTGACACGACT400GCAGAGGTTAAAACACCTTTTGATTTGGCCAAGGCACAAG440AGAACAGCAACTCCGTAAAGAAGAAGACAAAGTTTGTCAA480TTTATACACAAGAGAGGGACAGGACAGGCTTGCAGTCCTG520CTCCCTGGTCGTCACCCTTGTGATTGCCTGGGCCAGAAGC560ACAAGCTCATCAATAACTGTCTGATCTGTGGGCGCATTGT600CTGTGAACAAGAAGGCTCAGGCCCTTGCTTATTCTGTGGC640ACTCTGGTGTGTACTCATGAGGAACAAGATATTTTACAGC680GTGACTCAAACAAGAGCCAGAAACTGCTAAAGAAACTCAT720GTCAGGAGTGGAGAATTCTGGAAAGGTGGACATCTCTACC760AAGGACCTTCTTCCTCATCAAGAATTGCGAATTAAGTCTG800GTCTGGAGAAGGCTATCAAGCATAAAGACAAACTGTTAGA840GTTTGACAGAACTAGTATTCGAAGGACCCAAGTCATTGAT880GATGAGTCAGATTACTTTGCCAGTGATTCTAACCAATGGT920TGTCCAAACTTGAGCGGGAAACCTTGCAGAAGCGAGAGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。