基因總覽
thyroid hormone receptor interactor 10 是由 TRIP10 編碼的蛋白質，屬於 FNBP1 family。其蛋白質序列包含 F-BAR、REM-1 與 SH3 結構域，並具有多段被註記為無序的區域。這些結構特色與其膜相關及蛋白質互作功能相符；來源也指出它可形成同源二聚體，並能由二聚體首尾聚合成絲狀結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000313244 ★ | 6,739,680–6,751,530 | 15 |
| ENST00000600428 | 6,737,925–6,751,500 | 14 |
| ENST00000313285 | 6,739,651–6,751,526 | 14 |
| ENST00000894345 | 6,739,651–6,751,509 | 15 |
| ENST00000894346 | 6,739,651–6,751,507 | 14 |
| ENST00000894347 | 6,739,651–6,751,509 | 14 |
| ENST00000921000 | 6,739,651–6,751,516 | 14 |
| ENST00000921001 | 6,739,651–6,751,509 | 14 |
| ENST00000943816 | 6,739,651–6,751,505 | 13 |
| ENST00000943817 | 6,739,651–6,751,510 | 15 |
| ENST00000943818 | 6,739,651–6,751,509 | 14 |
| ENST00000943819 | 6,739,651–6,751,509 | 14 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRIP10 的功能之一是在內吞過程中協調膜管形成與肌動蛋白細胞骨架重組。它可結合磷脂醯肌醇 4,5-二磷酸及磷脂醯絲胺酸等脂質，促進膜內陷並形成膜管，將膜形態變化與細胞骨架調整連結起來。
在細胞骨架調節方面，TRIP10 會招募 WASL/N-WASP，促進 CDC42 誘導的肌動蛋白聚合；WASL/N-WASP 隨後活化 Arp2/3 複合體。肌動蛋白聚合可能進一步促進膜管裂解，形成內吞囊泡。來源將這項作用描述為可能的機制，而非確定的必然結果。
TRIP10 也為 podosome 形成所需。Podosome 是富含肌動蛋白、特定於單核球衍生細胞的黏附結構。除內吞與細胞骨架相關作用外，TRIP10 亦可能參與 FASLG/FASL 在溶酶體中的滯留；此項功能仍以可能性表述。
此外，依相似性推定，TRIP10 在胰島素訊號反應中是 GLUT4 移至細胞膜所需的因子。此項敘述具有 By similarity 的證據限定，應與來源直接描述的其他功能區分看待。
Promoter 與基因調控
>TRIP10 ENST00000313244 GRCh38 chr19:6738680-6739780 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCCAAGGCTCTCCTCCTGGGCTCAGCTGTATCTCTCTGTTCTGGGAGCCTGGGTGCTCTGTGTAAGGGGA ACGTATACCCAAGGGCCCCCCTGCAAGACGCCCAGCCTTGTCTGAGGCTGCAGAGAAAGCGCCAAAGCCC GGAGAGAATGGGAGTGGGAATCCCCAGTGCCTCCTCTCCTCTTTCATTCCAGCACCTCAAAGGGATTTAC AAGGTGTGAACAGACTTTTATGGGAGAGGTGACAGACTTCCCTTCTCCAGGGCCCAGATGGCCCAGATGT CTGGGGGAGGGGCGGAGTCGGAATCTCAGGGGCAGTACTGAGAATGAAACCAGGTTAAACTGGAAAATGG GCAGATGCAGGCGCGAACTGGAAGGCAGCTGGGGAAAGGCCTGGGCCTGGCGCCCCAAGGACGGCCTGTC TTCAGTTTCCCAGCGGAGACTCTGGGGGAGGGAAGGCAGGATGCGGTGCGGGAGTTAATGGACCTGGCCT TGGCGAAGGCGCGTCCTGGGTTGGATCGAAACCCTCTCATCCGCCCTGTGGCCGGAGGGACCAGACCATT AGTGGGACGAACCTAGACGCCTGGAGCCGGGCCGGCTCGCAAGAACGGGGTGACCTCAGGTTGCCCCTGC AATGGGGTTGAGGAAGGACTTCTTGAGTTTGGGGTTTTAGTGTCTTGGCCCTTTAAGGAATAATTGCGGG GAAAGGGGAAAAGGAGATGGGAAGAACCGTTTGGAGCGGGGAAGGAAGATGAGAGGACGAGAGGGACCCC GGGGATTTGGAAAAAATGGGTGGGGGTTCTTTAAGGGGTCGGTCCAGCGGCGTCGAGTGGCAACGTTGCT TTAAAAGGGGGCGGAGCGTCCGTTGGGCCCCGCCCCCGAATCGCAGTGCTTGGGCTCCGCGCGGGTGGGG GCGTGGCAGAGCGTGCAGGGGGGCGGGGAAGAGTCTGGGGTGGGCGGGGCCGGGCGGGGCGGGGCGGGGC CAGGCGCACCGCCCTCGGCTGAGTCTCCCCGGGGAGGGCGGCGGGCGGCGGGCGGCGGGGACCGGGTGCG GTGGTGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGGAGCAGCATGGATTGGGGCACTGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRIP10_1 ↗ | 19:6,739,680 | 正股 | 6,739,631–6,739,690 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_53KR5H · CTCF_binding_site · 6736702–6736723 · regulatory
ENSR19_B3C4Q · promoter · 6737250–6737935 · regulatory
ENSR19_87CFC · enhancer · 6737936–6738189 · regulatory
ENSR19_B3C53 · promoter · 6739190–6739772 · regulatory
ENSR19_CN3L · enhancer · 6739773–6741692 · regulatory
ENSR19_53KRS9 · CTCF_binding_site · 6740763–6740784 · regulatory
· motif · 6736054–6736076 · motif
· motif · 6736054–6736076 · motif
· motif · 6736068–6736083 · motif
· motif · 6736315–6736330 · motif
· motif · 6736704–6736720 · motif
· motif · 6736763–6736776 · motif
· motif · 6736763–6736776 · motif
· motif · 6737188–6737199 · motif
· motif · 6737200–6737210 · motif
· motif · 6737416–6737425 · motif
· motif · 6737811–6737820 · motif
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· motif · 6737887–6737900 · motif
· motif · 6737994–6738007 · motif
· motif · 6738124–6738137 · motif
· motif · 6738124–6738139 · motif
· motif · 6738127–6738142 · motif
· motif · 6738135–6738142 · motif
· motif · 6738145–6738160 · motif
· motif · 6738146–6738160 · motif
· motif · 6738147–6738160 · motif
· motif · 6738150–6738162 · motif
· motif · 6738153–6738160 · motif
· motif · 6738216–6738226 · motif
· motif · 6738253–6738268 · motif
· motif · 6738253–6738268 · motif
· motif · 6738254–6738268 · motif
· motif · 6738255–6738268 · motif
· motif · 6738261–6738268 · motif
· motif · 6738407–6738414 · motif
· motif · 6738589–6738598 · motif
· motif · 6738890–6738902 · motif
· motif · 6739443–6739456 · motif
· motif · 6739443–6739456 · motif
· motif · 6739465–6739475 · motif
· motif · 6739526–6739536 · motif
· motif · 6739546–6739556 · motif
· motif · 6739548–6739561 · motif
· motif · 6739581–6739594 · motif
· motif · 6739586–6739596 · motif
· motif · 6739608–6739618 · motif
· motif · 6739683–6739696 · motif
· motif · 6739683–6739696 · motif
· motif · 6739960–6739973 · motif
· motif · 6740063–6740075 · motif
· motif · 6740406–6740419 · motif
· motif · 6740409–6740421 · motif
· motif · 6740412–6740419 · motif
· motif · 6740413–6740426 · motif
· motif · 6740415–6740425 · motif
· motif · 6740430–6740440 · motif
· motif · 6740479–6740489 · motif
· motif · 6740523–6740530 · motif
· motif · 6740523–6740538 · motif
· motif · 6740637–6740652 · motif
· motif · 6740712–6740722 · motif
· motif · 6740733–6740743 · motif
· motif · 6740765–6740781 · motif
· motif · 6740963–6740970 · motif
· motif · 6741312–6741323 · motif
· motif · 6741380–6741393 · motif
· motif · 6742070–6742082 · motif
TRIP10 表現會受細胞狀態與處理條件影響：adriamycin 處理會誘導其表現，而 HGF/SF 可抵銷此效應；在分化過程中，其表現量則會降低。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：601 aa
TRIP10 蛋白質長 601 個胺基酸，具有 F-BAR、REM-1 與 SH3 結構域。第 280–358、390–420 及 479–543 位胺基酸區段被註記為無序區。第 1–117 位區段與 podosome 形成及 AKAP9、微管互作有關，也被註記為胰島素刺激下移至細胞膜所需；其他區段則涉及與 CDC42、PDE6G、FASLG、DNM1、WASL 等分子的互作。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRIP10 可見於細胞質、細胞皮質、溶酶體、高基氏體、細胞膜及巨噬細胞的吞噬部位；在胰島素刺激下可能移至細胞膜，且此轉位可能需要活化的 RHOQ。 其高基氏體定位需要 AKAP9。 Isoform 5 則位於細胞核周區域。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, phagocytic cup。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 29 個夥伴
- ADAM8P78325 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARHGAP12Q1RLN5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARHGAP17Q68EM7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ARHGAP44Q17R89-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FASLGP48023 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RHOJQ9H4E5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3BP1Q9Y3L3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- SMARCE1Q969G3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- TINF2Q9BSI4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WASF1Q92558 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- Inpp5dP97573 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ABI1Q8IZP0-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ABL2P42684-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARHGAP12Q8IWW6-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAAM1Q9Y4D1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DTX3Q8N9I9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXC11O43248 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 18 experiments
- JRKO75564-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX1P50221 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NKX2-5P52952 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAX6P26367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RIN1Q13671 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SF3A2Q15428 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TRIP10 可與 GTP 結合型 RHOQ、CDC42 特異性互作，並能形成同源二聚體；二聚體可首尾聚合成絲狀結構。來源亦列出其與 DNM1、DNM2、WAS/WASP、WASL/N-WASP、FASLG/FASL、AKAP9、微管及多種其他蛋白質的互作。TRIP10 在甲狀腺激素存在時可與甲狀腺受體的配體結合區互作；與 CTNNB1、HD/HTT 的互作則僅列為可能。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRIP10 依相似性推定參與胰島素訊號下 GLUT4 移至細胞膜；它也協調內吞時的膜管形成與肌動蛋白細胞骨架重組，結合特定脂質以促進膜內陷。TRIP10 招募 WASL/N-WASP，促進 CDC42 誘導的肌動蛋白聚合並活化 Arp2/3 複合體；肌動蛋白聚合可能推動膜管裂解。它也為單核球衍生細胞的 podosome 形成所需，且可能協助 FASLG/FASL 滯留於溶酶體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Required for translocation of GLUT4 to the plasma membrane in response to insulin signaling (By similarity). Required to coordinate membrane tubulation with reorganization of the actin cytoskeleton during endocytosis. Binds to lipids such as phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate and phosphatidylserine and promotes membrane invagination and the formation of tubules. Also promotes CDC42-induced actin polymerization by recruiting WASL/N-WASP which in turn activates the Arp2/3 complex. Actin polymerization may promote the fission of membrane tubules to form endocytic vesicles. Required for the formation of podosomes, actin-rich adhesion structures specific to monocyte-derived cells. May be required for the lysosomal retention of FASLG/FASL PMID 11069762 ↗ · PMID 16318909 ↗ · PMID 16326391 ↗ |
| 交互作用 | TRIP10 特異性互作於 GTP 結合型 RHOQ 與 CDC42，也與 DNM2、PDE6G 互作（依相似性）。它可形成同源二聚體，並由二聚體首尾聚合成絲狀結構；另列有多種互作分子，包括 DNM1、FASLG/FASL、WAS/WASP、WASL/N-WASP 與微管。甲狀腺激素存在時，TRIP10 會與甲狀腺受體的配體結合區互作；與 CTNNB1、HD/HTT 的互作則屬可能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts specifically with GTP-bound RHOQ. Interacts with DNM2 and PDE6G (By similarity). Homodimerizes, the dimers can polymerize end-to-end to form filamentous structures. Interacts specifically with GTP-bound CDC42. Interacts with AKAP9, ARHGAP17, DAAM1, DIAPH1, DIAPH2, DNM1, FASLG/FASL, GAPVD1, LYN, microtubules, SRC, WAS/WASP and WASL/N-WASP. Interacts with the ligand binding domain of the thyroid receptor (TR) in the presence of thyroid hormone. May interact with CTNNB1 and HD/HTT PMID 10713100 ↗ · PMID 11431473 ↗ · PMID 12456510 ↗ · PMID 12604778 ↗ · PMID 15047863 ↗ · PMID 16318909 ↗ · PMID 16326391 ↗ · PMID 16343437 ↗ · PMID 16630611 ↗ · PMID 17512409 ↗ · PMID 9210375 ↗ |
| 細胞定位 | TRIP10 位於細胞質、細胞皮質、溶酶體、高基氏體、細胞膜及巨噬細胞的吞噬部位，並與 F-actin 共定位於細胞皮質區域。胰島素刺激會促使其移至細胞膜，此轉位可能需要活化的 RHOQ，且此項定位依相似性描述。其高基氏體定位需要 AKAP9。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton; Cytoplasm, cell cortex; Lysosome; Golgi apparatus; Cell membrane; Cell projection, phagocytic cup; Translocates to the plasma membrane in response to insulin stimulation, and this may require active RHOQ (By similarity). Localizes to cortical regions coincident with F-actin, to lysosomes and to sites of phagocytosis in macrophages. Also localizes to the Golgi, and this requires AKAP9 |
| 細胞定位 | Isoform 5 位於細胞質的核周區域。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | adriamycin 處理會誘導 TRIP10 表現，而 HGF/SF 可抵銷此誘導效應；在細胞分化過程中，TRIP10 的表現量會降低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Induced by adriamycin treatment and this effect is counteracted by HGF/SF. Expression is reduced during differentiation PMID 11691828 ↗ · PMID 12054674 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGTCTCCCCGGGGAGGGCGGCGGGCGGCGGGCGGCGGGG40ACCGGGTGCGGTGGTGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGGAGCA80GCATGGATTGGGGCACTGAGCTGTGGGATCAGTTCGAGGT120GCTCGAGCGCCACACGCAGTGGGGGCTGGACCTGTTGGAC160AGATATGTAAAGTTCGTGAAAGAACGCACCGAAGTGGAAC200AGGCTTACGCCAAACAACTGCGGAGCCTGGTGAAAAAATA240TCTGCCCAAGAGACCTGCCAAGGATGATCCTGAGTCCAAA280TTCAGCCAGCAACAGTCCTTCGTACAGATTCTCCAGGAGG320TGAATGACTTTGCAGGCCAGCGGGAGCTGGTGGCTGAGAA360CCTCAGTGTCCGTGTATGTCTTGAGCTGACCAAGTACTCA400CAAGAGATGAAACAGGAGAGGAAGATGCACTTCCAAGAAG440GGCGGCGGGCCCAGCAGCAGCTGGAAAATGGCTTTAAACA480GCTGGAGAATAGTAAGCGTAAATTTGAGCGGGACTGCCGG520GAGGCAGAGAAGGCAGCCCAGACTGCTGAACGGCTAGACC560AGGATATCAACGCCACCAAGGCTGATGTGGAGAAGGCCAA600GCAGCAAGCCCACCTTCGGAGTCACATGGCCGAAGAAAGC640AAAAACGAATATGCGGCTCAACTGCAGCGCTTCAACCGAG680ACCAAGCCCACTTCTATTTTTCACAGATGCCCCAGATATT720CGATAAGCTCCAAGACATGGATGAACGCAGGGCCACCCGC760CTGGGTGCCGGGTATGGGCTCCTGTCGGAGGCCGAGCTGG800AGGTGGTGCCCATAATAGCCAAGTGCTTGGAGGGCATGAA840GGTGGCTGCAAATGCTGTGGATCCCAAGAACGACTCCCAC880GTCCTTATAGAGCTGCACAAGTCAGGTTTTGCCCGCCCGG920GCGACGTGGAATTCGAGGACTTCAGCCAGCCCATGAACCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。