基因總覽
TRIM34（tripartite motif containing 34）是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質，屬於 TRIM/RBCC 家族。其蛋白質全長 488 個胺基酸，具有 RING-type 鋅指、B box-type 鋅指及 B30.2/SPRY 結構域。這些結構特色構成 TRIM34 的基本分子架構；來源資料亦指出它可形成同源三聚體。TRIM34 涉及抗病毒防禦，並參與感染相關的細胞反應。其生物學作用不限於病毒限制，資料也記載它與粒線體功能及上皮細胞形成多核巨細胞的過程有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000429814 ★ | 5,625,001–5,644,398 | 8 |
| ENST00000514226 | 5,619,764–5,644,398 | 8 |
| ENST00000970166 | 5,621,039–5,644,398 | 8 |
| ENST00000870811 | 5,624,988–5,644,398 | 9 |
| ENST00000870812 | 5,624,988–5,644,398 | 7 |
| ENST00000870813 | 5,624,988–5,644,398 | 8 |
| ENST00001126342 | 5,624,988–5,636,532 | 5 |
| ENST00001142177 | 5,624,988–5,644,398 | 8 |
| ENST00000930054 | 5,631,450–5,644,398 | 8 |
| ENST00000870814 | 5,632,149–5,644,398 | 7 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRIM34 具有抗病毒作用，參與抵禦逆轉錄病毒感染。它在 TRIM5 協助下作為特異辨識病毒衣殼的限制因子，可阻止非宿主適應型逆轉錄病毒造成感染；此作用與其對 HIV-1 衣殼複合體的互作相符。來源描述的是對非宿主適應型病毒的限制，並未將此結論擴大至所有逆轉錄病毒或感染情境。
在 influenza A virus 感染期間，TRIM34 促進程序性細胞死亡。它使 ZBP1 發生 Lys-63 連結的多聚泛素化，並進一步促進 ZBP1 招募 RIPK3，以介導病毒誘發的程序性壞死。這項作用連結了蛋白質泛素化與感染時的細胞死亡反應；資料所述的方向是促進 ZBP1 招募 RIPK3，而非單純描述泛素化本身。
TRIM34 也會負向調節粒線體功能：它增強粒線體去極化，繼而促使 cytochrome c 釋出，並導向粒線體依賴型細胞凋亡。這項描述指出一連串與粒線體狀態相關的變化，但未提供更廣泛的細胞條件或其他調控因子，因此不宜推論其在所有情境中的效應。
此外，在上皮細胞中，TRIM34 促進多核巨細胞形成，涉及細胞融合與吞噬作用。這顯示其相關功能不只限於病毒感染中的限制與細胞死亡，也包括上皮細胞的融合及多核化；來源並未進一步界定這些細胞事件與抗病毒作用之間的因果關係。
Promoter 與基因調控
>TRIM34 ENST00000429814 GRCh38 chr11:5624001-5625101 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCTCATGAAAATGGAGCATGCTGTTTGTGGAGGCACAATGTGGGGTCATCCTGTGACCAAACGAGTGGC AACTCTTGTTCAAGTTTCCTCCTCGTTCGGTTTGATTTCAAGGTTACCTCAGTTTCAAAGCAGCCCTTTC TGTCCAGGGCACAAAACTCCTGATTTACTACTTACAACTAGTGGTTCTCAGCCTCAGATTCGCGTAAAAA TTACCTGGAAGACTTTTCATTTTTAAATAATGTTACTGATATATATGTTATATGCAATAATATGCACCCA TTTACTGTGCACAGTTTGATGAGTTTTGAAAAAGTTTTACCCCTTTTAAAGATTTAGAGCATTTCCAACA CTCCCAAAAGTTCCCCAGGTCCTTTGTAGCCAACTTTTCTCAGCACCATCCACCTCTCCGCCACCCATCC TCCATCTCCTAGCGGGTGACATGGTACTTTGGTAGGTAGCACACAAGTGGATCGTTGGAGCTGAAGGATA ATTCAAATTGGTAAACTGATTCGAGGGACCATGTGCAACCATGAAAGTGGTAGGAGAAGGGGAGTTGGGT GTTTAGCTGGCCTGGGAGGCAGGGAAGGTTAAAACAGGGCTTTTCAAACACAGCACTATTGATGTTTTGG AATGGATCATTCTTTGCTGTGGGAACTGTCCCATACATTGTAGAATGCTTAGCGGCATCTGTGACCTGTA CCCACTAAGATGCCAGTAGCATTCCCCTAGTTAACAACCAAATATCTCTTCAGACATTGCCAAATGTGCC ATCTAGTGCAAATCCTCCATTCTGCCCTCGAGAATCACTGGATTAAGAGCATTACCTTCTGTCCAGAGGC TCTAAAGGACTACACAGCTCATTTCACCTAGACGCTCCTTCCCCTTTTCTCTTCCTGACAGCCCCAAAAA TTTCACTTTCATTTCTCAGGCAGTTCCTCCTCAGGAGGGAGGGACTTCTTCACACAGAGGAACCTCATTT GTTGAATGAATCCTGACCACACCCACCCTGGCTTTTCTTCACCTCTTCAACCAGGAGCCGAGATTTCTGT TGCTCTGAAGGTGTGTGGGGAGGTTTGTGGGGGGTAGAGGGTATGAGACTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRIM34_2 ↗ | 11:5,619,736 | 正股 | 5,619,687–5,619,746 |
| TRIM34_1 ↗ | 11:5,625,005 | 正股 | 5,624,956–5,625,015 |
| TRIM34_3 ↗ | 11:5,632,180 | 正股 | 5,632,131–5,632,190 |
| TRIM34_4 ↗ | 11:5,632,581 | 正股 | 5,632,532–5,632,591 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_CK3L · enhancer · 5620545–5621643 · regulatory
ENSR11_9489J · promoter · 5624511–5625011 · regulatory
ENSR11_53BPGL · CTCF_binding_site · 5624763–5624784 · regulatory
ENSR11_B355T · enhancer · 5625012–5625825 · regulatory
ENSR11_86GL2 · enhancer · 5626260–5626512 · regulatory
· motif · 5622989–5623002 · motif
· motif · 5623792–5623803 · motif
· motif · 5624765–5624781 · motif
· motif · 5624876–5624889 · motif
· motif · 5628094–5628109 · motif
TRIM34 的表現會受 interferons 上調；來源未提供更細的誘導條件或不同 interferon 類型之間的差異。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：488 aa
TRIM34 蛋白長 488 個胺基酸，屬於 TRIM/RBCC 家族。其 N 端含 RING-type 鋅指（第 15–60 位）及 B box-type 鋅指（第 92–134 位）；C 端為 B30.2/SPRY 結構域（第 283–488 位）。
蛋白質三維結構
細胞內定位
感染期間，它與 TRIM5 及進入細胞的 HIV-1 衣殼共同定位於細胞質小體；此處描述的是感染條件下的定位情形。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TRIM34 可形成同源三聚體，並透過 B-box 與 SPRY 結構域和 TRIM5 互作。微生物感染期間，它也可經由 B30.2/SPRY 結構域與 HIV-1 衣殼複合體互作。這些是來源記載的分子互作，不代表所有情境下均形成同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRIM34 參與抗病毒防禦，可在 TRIM5 協助下作為衣殼特異性限制因子，阻止非宿主適應型逆轉錄病毒感染。influenza A virus 感染時，它促進 ZBP1 的 Lys-63 連結多聚泛素化，並促進 ZBP1 招募 RIPK3 以介導病毒誘發的程序性壞死；此外，TRIM34 增強粒線體去極化、cytochrome c 釋出及粒線體依賴型細胞凋亡，也促進上皮細胞透過融合與吞噬形成多核巨細胞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as antiviral protein and contributes to the defense against retroviral infections. Acts as a capsid-specific restriction factor with the help of TRIM5 and prevents infection from non-host-adapted retroviruses. During influenza A virus infection, promotes programmed cell death by targeting ZBP1 for 'Lys-63'-linked polyubiquitination. In turn, promotes ZBP1 recruitment of RIPK3 to mediate virus-induced programmed necrosis. Negatively regulates the function of mitochondria by enhancing mitochondrial depolarization leading to cytochrome c release and mitochondria-dependent apoptosis. Also promotes the formation of multinucleated giant cells by means of cell fusion and phagocytosis in epithelial cells PMID 17156811 ↗ · PMID 31487507 ↗ · PMID 31956709 ↗ · PMID 32282853 ↗ · PMID 35065966 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 推論支持 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 35065966 ↗ |
| 分子活性 | TRIM34 涉及蛋白質修飾，具體包括蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | TRIM34 可形成同源三聚體，並透過 B-box 與 SPRY 結構域和 TRIM5 互作。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染條件下，TRIM34 可透過 B30.2/SPRY 結構域與 HIV-1 衣殼複合體互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via the B30.2/SPRY domain) with HIV-1 capsid complexes PMID 17156811 ↗ |
| 細胞定位 | TRIM34 位於細胞質與粒線體；感染期間，它會與 TRIM5 及進入細胞的 HIV-1 衣殼共同定位於細胞質小體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Mitochondrion; Localizes in cytoplasmic bodies together with TRIM5 and incoming HIV-1 capsids during infection PMID 17156811 ↗ · PMID 31487507 ↗ · PMID 32282853 ↗ · PMID 31956709 ↗ |
| 調控 | TRIM34 的表現會受 interferons 上調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACCCACCCTGGCTTTTCTTCACCTCTTCAACCAGGAGCCG40AGATTTCTGTTGCTCTGAAGCCATCCAGGGGTCTTTAACC80AGAAGAGAGAGGAGAGCCTCAGGAGTTAGGACCAGAAGAA120GCCAGGGAAGCAGTGCAATGGCTTCAAAAATCTTGCTTAA160CGTACAAGAGGAGGTGACCTGTCCCATCTGCCTGGAGCTG200TTGACAGAACCCTTGAGTCTAGACTGTGGCCACAGCCTCT240GCCGAGCCTGCATCACTGTGAGCAACAAGGAGGCAGTGAC280CAGCATGGGAGGAAAAAGCAGCTGTCCTGTGTGTGGTATC320AGTTACTCATTTGAACATCTACAGGCTAATCAGCATCTGG360CCAACATAGTGGAGAGACTCAAGGAGGTCAAGTTGAGCCC400AGACAATGGGAAGAAGAGAGATCTCTGTGATCATCATGGA440GAGAAACTCCTACTCTTCTGTAAGGAGGATAGGAAAGTCA480TTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACCGTGGTCA520CCACACAGTCCTCACGGAGGAAGTATTCAAGGAATGTCAG560GAGAAACTCCAGGCAGTCCTCAAGAGGCTGAAGAAGGAAG600AGGAGGAAGCTGAGAAGCTGGAAGCTGACATCAGAGAAGA640GAAAACTTCCTGGAAGTATCAGGTACAAACTGAGAGACAA680AGGATACAAACAGAATTTGATCAGCTTAGAAGCATCCTAA720ATAATGAGGAGCAGAGAGAGCTGCAAAGATTGGAAGAAGA760AGAAAAGAAGACGCTGGATAAGTTTGCAGAGGCTGAGGAT800GAGCTAGTTCAGCAGAAGCAGTTGGTGAGAGAGCTCATCT840CAGATGTGGAGTGTCGGAGTCAGTGGTCAACAATGGAGCT880GCTGCAGGACATGAGTGGAATCATGAAATGGAGTGAGATC920TGGAGGCTGAAAAAGCCAAAAATGGTTTCCAAGAAACTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。