基因總覽
TRIM26（tripartite motif containing 26）是蛋白質編碼基因，產物屬於 TRIM/RBCC 家族。其蛋白質長 539 個胺基酸，具有 RING-type 與 B box-type 鋅指，以及位於羧基端的 B30.2/SPRY 結構域；另有一段被註記為無序區。這些結構特色與其作為 E3 ubiquitin-protein ligase 的分子角色相符。TRIM26 涉及先天免疫、病毒感染反應及細胞壓力相關調節，並能作用於不同的蛋白質受質；部分功能則不依賴其催化活性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000454678 ★ | 30,184,455–30,213,406 | 10 |
| ENST00000437089 | 30,184,446–30,204,948 | 9 |
| ENST00000453195 | 30,184,446–30,214,158 | 9 |
| ENST00000861717 | 30,184,446–30,214,158 | 10 |
| ENST00000861718 | 30,184,446–30,214,158 | 8 |
| ENST00000861719 | 30,184,446–30,214,158 | 9 |
| ENST00000861720 | 30,184,446–30,214,158 | 9 |
| ENST00000861721 | 30,184,446–30,214,158 | 9 |
| ENST00000861722 | 30,184,446–30,214,158 | 9 |
| ENST00000861724 | 30,184,446–30,214,158 | 10 |
| ENST00000861725 | 30,184,446–30,214,158 | 8 |
| ENST00000861726 | 30,184,446–30,214,158 | 8 |
顯示 12/42 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRIM26 是 E3 ubiquitin-protein ligase，可調節多種 DNA 編碼的 pattern-recognition receptors（PRRs）下游的 IFN-beta 產生與抗病毒反應。在病毒感染的先天免疫反應中，它可連接 TBK1 與 NEMO，促進 TBK1 活化；另一方面，TRIM26 也促進細胞核內 IRF3 泛素化及其後續蛋白酶體降解，因而參與調節干擾素相關反應。這些作用呈現其在免疫訊號中的不同調控方向，不能簡化為單一的促進或抑制效果。
在 LPS 介導的發炎性先天免疫反應中，TRIM26 催化 TAB1 的 Lys-11 連結型多聚泛素化，增強 TAB1 活化，進而促進 NF-kappa-B 與 MAPK 訊號傳遞。面對不同形式的氧化壓力時，TRIM26 則透過控制 DNA glycosylases NEIL1、NEIL3 與 NTH1 的量，影響參與受損 DNA 修復的酵素水平，進而參與細胞對氧化壓力的反應。
TRIM26 的受質調控亦涉及轉錄及染色質相關蛋白。它可在 KDM6B 招募後作為支架，促使組蛋白乙醯轉移酶複合體成分 PHF20 泛素化，並引發 PHF20 在細胞核內降解；在 TGF-beta 誘導下，TRIM26 也會使 TFIID 成分 TAF7 泛素化並促進其蛋白酶體降解。相較之下，TRIM26 不依賴自身催化活性抑制 WWP2，因而保護 SOX2，避免其多聚泛素化與蛋白酶體降解。
依據相似性推定，TRIM26 可藉由泛素化 SLC7A11 誘發 ferroptosis；SLC7A11 是清除脂質活性氧的重要蛋白。TRIM26 也可透過泛素化 HBX 並促使其降解，直接抑制 hepatitis B virus 複製。另在陰道上皮細胞中，TRIM26 會降低 IRF3 的細胞核定位，並促進 herpes simplex virus type 2/HHV-2 感染；這項結果顯示其免疫調控與病毒感染的關係會依感染情境而異。
Promoter 與基因調控
>TRIM26 ENST00000454678 GRCh38 chr6:30213306-30214406 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAACCTGCGCCGCCTCTTCTCAGCCTGCTGCCAGCCCAGTGCACGAGCTGAATGCCGCTGCCGCCTGGCT GGCCGGGAAAGACGGGGATCTTGACGCGGCGGCGCCTGGGACACGGCAACCGCAGCACAGGGCATGGCCC TGCGGCTGGACCGGACGCGGCGGCTGCAGGCAGAGCAGGAAGAGAGCGCAGGCTGGGCAGCGGCGTACGC TTCGGCGACGTCAGCTTCCGGGGCCGTGGACGGGGGCGCGCCCGAGCCTCCTGGAAACCTCCCCACCAAG GACCTGGGGAACCCAAGTCTCGGCCCGCTTTGTAGCCTCTGGTTTCTAAATTCAGCGTCGAGGAGCGAAA ACAACCCCCCTGAACTGGGCCCAGACCCTTAAGCTCCTGGAACCTCAGTTTTTCCTTCCGTCGAATGGCG ACAATGGCTGTCTGGTTGAACGTTATTTTACCTAGGAAGTAATAATTTTCGTAAATAGGTCTCTGAGAGT ATTTGCTTGCTAAAATCCTGCTTTGTCCTGGAAGCAAATTTAGGCCACGTTAGGGGCGGGGACTTCGTAT TTGATGTTGAGCACCTGGCGAGCGCCACCTTCGCCTCAAAGCGCCCTCGGACCCTGATCCAGCATAAGGC CAGAGTTGGGCAGTGAGGGGTCTCGAGAGGTGGAAAGGGGATTATTGCCCTCTCAAGAGTCCTACGTAGG TGACTCCTAAGCCTTAGCATTTACTCCCTTAGACCGTGTAACAGGCCACCCCAATTACGCGCCAAACTCA GGCTGCGGCTCTTGGCGCAGCCTCGGTCCCGCCTGATTTCAGTTTCCATTTCGCTGCCCCTGGTGCCCCA CCGCCCGCGGCTGTCTGGGGATTTGCCCGGTGATCAGTGACGTAAAAGAGACTAAGGTTCCCATTGGATG GCGAAGTTCGGCAGGAGCCAATCCCGGGGCTGGTCCGGGAGAAATCTCGGCGAAGGGCCCCGAATAGCCG GGAGATTACGGGGCGGGGACGAGCTGTCGCGCTGGTTGCTCGTGCAGGAGCGGGACCCGGAACAGACCGC CGTGAGAGAGGAGGGGTGCCGGCCGGGATTCGCGGCCCGGAGCTCGGGACC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRIM26_1 ↗ | 6:30,213,363 | 負股 | 30,213,353–30,213,412 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_B7ZW4 · enhancer · 30212666–30213395 · regulatory
ENSR6_B7ZW7 · promoter · 30213396–30213917 · regulatory
· motif · 30209072–30209083 · motif
· motif · 30209239–30209254 · motif
· motif · 30209240–30209253 · motif
· motif · 30209254–30209276 · motif
· motif · 30209254–30209276 · motif
· motif · 30211021–30211033 · motif
· motif · 30211025–30211041 · motif
· motif · 30211034–30211046 · motif
· motif · 30211037–30211052 · motif
· motif · 30211099–30211106 · motif
· motif · 30211280–30211291 · motif
· motif · 30212864–30212879 · motif
· motif · 30212889–30212906 · motif
· motif · 30213167–30213174 · motif
· motif · 30213408–30213418 · motif
· motif · 30213525–30213541 · motif
· motif · 30213577–30213597 · motif
· motif · 30213583–30213603 · motif
· motif · 30213596–30213612 · motif
· motif · 30214175–30214184 · motif
· motif · 30214282–30214290 · motif
· motif · 30215375–30215388 · motif
TRIM26 的調控與數種刺激相關：TGF-beta 可促進其表現，且活化的 SMAD3 會結合 TRIM26 啟動子；herpes simplex virus type 2/HHV-2 感染及 type I interferon 也與 TRIM26 調控有關。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：539 aa
TRIM26 蛋白長 539 個胺基酸，屬於 TRIM/RBCC 家族。其 RING-type 鋅指位於第 16–57 位，B box-type 鋅指位於第 97–138 位；B30.2/SPRY 結構域位於第 295–539 位。第 376–437 位另被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
病毒感染可介導 TRIM26 轉位至細胞核，表示其定位會隨感染情境改變；來源未提供不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
- BEND7Q8N7W2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BIVMQ86UB2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EPN2O95208-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EPN3I6L9I8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MACROH2A1O75367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGEA6P43360 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- THAP1Q9NVV9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TLE5Q08117 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
TRIM26 與 TBK1 有交互作用，並可在先天抗病毒反應中連接 TBK1 和 NEMO，以促進 TBK1 活化。來源亦記載 TRIM26 與 INCA1 交互作用，但未提供其結合性質或功能結果的進一步說明。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRIM26 是 E3 ubiquitin-protein ligase，調節多種 DNA 編碼 PRR 下游的 IFN-beta 產生與抗病毒反應，並透過控制 DNA glycosylases NEIL1、NEIL3、NTH1 參與氧化壓力反應及受損 DNA 修復。它可促進核內 IRF3 泛素化與降解、連接 TBK1 和 NEMO，也能促進 TAB1 活化及 NF-kappa-B、MAPK 訊號。另可影響 SOX2、PHF20、TAF7、SLC7A11 與 HBX；其中抑制 WWP2、保護 SOX2 的作用不依賴其催化活性，SLC7A11 相關 ferroptosis 則為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源E3 ubiquitin-protein ligase which regulates the IFN-beta production and antiviral response downstream of various DNA-encoded pattern-recognition receptors (PRRs). Also plays a central role in determining the response to different forms of oxidative stress by controlling levels of DNA glycosylases NEIL1, NEIL3 and NTH1 that are involved in repair of damaged DNA. Promotes nuclear IRF3 ubiquitination and proteasomal degradation. Bridges together TBK1 and NEMO during the innate response to viral infection leading to the activation of TBK1. Positively regulates LPS-mediated inflammatory innate immune response by catalyzing the 'Lys-11'-linked polyubiquitination of TAB1 to enhance its activation and subsequent NF-kappa-B and MAPK signaling. In a manner independent of its catalytic activity, inhibits WWP2, a SOX2-directed E3 ubiquitin ligase, and thus protects SOX2 from polyubiquitination and proteasomal degradation. Ubiquitinates the histone acetyltransferase protein complex component PHF20 and thereby triggers its degradation in the nucleus after its recruitment by the histone demethylase KDM6B, serving as a scaffold protein. Upon induction by TGF-beta, ubiquitinates the TFIID component TAF7 for proteasomal degradation. Induces ferroptosis by ubiquitinating SLC7A11, a critical protein for lipid reactive oxygen species (ROS) scavenging (By similarity). Inhibits directly hepatitis B virus replication by mediating HBX ubiquitination and subsequent degradation PMID 23452852 ↗ · PMID 25763818 ↗ · PMID 26611359 ↗ · PMID 29203640 ↗ · PMID 29610152 ↗ · PMID 34017102 ↗ · PMID 34732716 ↗ · PMID 35872575 ↗ · PMID 36232914 ↗ |
| 功能 | 在陰道上皮細胞的 herpes simplex virus type 2/HHV-2 感染情境中，TRIM26 會降低 IRF3 的細胞核定位。由於 IRF3 是 type I interferon 活化的主要介質，此作用與促進病毒感染相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Promotes herpes simplex virus type 2/HHV-2 infection in vaginal epithelial cells by decreasing the nuclear localization of IRF3, the primary mediator of type I interferon activation PMID 33419081 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 26611359 ↗ · PMID 29203640 ↗ · PMID 29610152 ↗ · PMID 34017102 ↗ |
| 交互作用 | TRIM26 與 TBK1 交互作用，並藉此連接 TBK1 和 NEMO，以促進 TBK1 活化；來源也記載 TRIM26 與 INCA1 交互作用，但未提供其功能關係的進一步描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with TBK1; this interaction bridges together TBK1 and NEMO in order to activate TBK1. Interacts with INCA1 PMID 21750715 ↗ · PMID 26611359 ↗ |
| 細胞定位 | TRIM26 位於細胞質及細胞核；病毒感染可介導 TRIM26 轉位至細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Viral infection mediates TRIM26 nuclear translocation PMID 25763818 ↗ · PMID 34017102 ↗ · PMID 35872575 ↗ · PMID 33419081 ↗ |
| 調控 | TRIM26 的調控與 TGF-beta、herpes simplex virus type 2/HHV-2 感染及 type I interferon 有關。TGF-beta 誘導與活化 SMAD3 結合 TRIM26 啟動子相關；來源亦記載病毒感染及 type I interferon 對 TRIM26 的調控。 | 含實驗來源 | 證據與來源By cytokine TGF-beta and binding of activated SMAD3 to the TRIM26 promoter. Upon herpes simplex virus type 2/HHV-2 infection. By type I interferon PMID 29203640 ↗ · PMID 33419081 ↗ · PMID 35872575 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGCTGTCGCGCTGGTTGCTCGTGCAGGAGCGGGACCCGG40AACAGACCGCCGTGAGAGAGGAGGGGTGCCGGCCGGGATT80CGCGGCCCGGAGCTCGGGACCGGAGTCAGGAATGGAGAGA120AGGGTAATGGTTTTACCTCTTATTGTGGAAACCTGTTGAG160ATCACAGAGAATATACTGACGGCATAAAAGGGCAGAACCA200TAGCAGGGTGCGGTTGCTTCATTCCAGCCTCGCAGTCACC240TCTGTGCCCTGCTGGTTGTCTTCCCAGCGCTGCTGTAGTT280GCCTTCCATGGATCTATAGGAGAGCAAGTCCTCCAGGAGC320TGGTGGTGTCTGTCGATTGACTGAGTGCTGGAGCTGGCAG360CCCTGTGCAGGCTGCCACCTTTGCCCCTTTACTGTGCTTG400CTCCTGACTCTATGTCGCGTCTCCAAGGAGAAGAAGTCCT440CACCAGTGAACGGAGACCTCTCTGAACTAAGGATACCATG480GCCACGTCAGCCCCACTACGGAGCCTGGAAGAGGAGGTGA520CCTGCTCCATCTGTCTTGATTACCTGCGGGACCCTGTGAC560CATTGACTGTGGCCACGTCTTCTGCCGCAGCTGCACCACA600GACGTCCGCCCCATCTCAGGGAGCCGCCCCGTCTGCCCAC640TCTGCAAGAAGCCTTTTAAGAAGGAGAACATCCGACCCGT680GTGGCAACTGGCCAGCCTGGTGGAGAACATTGAGCGGCTG720AAGGTGGACAAGGGCAGGCAGCCGGGAGAGGTGACCCGGG760AGCAGCAGGATGCAAAGTTGTGCGAGCGACACCGAGAGAA800GCTGCACTACTACTGTGAGGACGACGGGAAGCTGCTGTGC840GTGATGTGCCGGGAGTCCCGGGAGCACAGGCCCCACACGG880CCGTCCTCATGGAGAAGGCCGCCCAGCCCCACAGGGAAAA920AATCCTGAACCACCTGAGTACCCTAAGGAGGGACAGAGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。