基因總覽
TRH 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 thyrotropin releasing hormone。其蛋白質產物長 242 個胺基酸,屬於 TRH family;序列註解包含訊號胜肽,以及兩段被註記為無序的區域。來源將其描述為下視丘-腦下垂體-甲狀腺軸的組成成分,並指出它也與毛髮生長調節相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000302649 ★ | 129,974,720–129,977,935 | 3 |
| ENST00000507066 | 129,974,293–129,977,940 | 3 |
| ENST00001143546 | 129,974,293–129,977,940 | 3 |
| ENST00001098899 | 129,975,517–129,977,940 | 3 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRH 是下視丘-腦下垂體-甲狀腺軸的組成成分,可控制甲狀腺刺激素(TSH)的分泌,並參與甲狀腺激素合成的調節。來源未進一步說明這些作用的分子機制或調控條件。
TRH 也被描述為毛髮生長的調節因子。在毛髮生長相關作用中,它促進毛幹延長,並延長毛囊週期的生長期(anagen);同時,來源指出它會拮抗 TGFB2 所造成的生長期終止(catagen)。
在毛髮基質角質細胞中,TRH 促進細胞增殖並抑制細胞凋亡。這些作用與毛幹延長及生長期延長相互呼應,顯示 TRH 的功能不只涉及甲狀腺軸,也包括毛髮生長週期及其相關細胞的調節。
Promoter 與基因調控
>TRH ENST00000302649 GRCh38 chr3:129973720-129974820 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTGGTGGCCGAGAGCAGCCAGGCTCAGCTCCACCTGGCTGTTGACAGGAGGAAATGGGGGCCCATTCTT TTTCAAGAGAAGCCATAAATCCAAAATTTTCTAAGTTATCTTGGTTTTAAAATGTTGGTTATTCAGATTT TTTTCAAAACACTGTGGAAGTCAATCAAAATTGTCCATGAACTGGTTGTAGCCTACAGGCCGCCACTTTT GGAATTCTGAAAGCTTTCCTCTGGCTCCTATTACACAGAGGAGAAAACTGAGGCCCAGAGAAACGGAGGC ACTAGCCAGGAATGACACAGTTAAGATTAGCACCCTGGAGCCTGCGGGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA GAGACGCAGGAGTCTGAGGCAGGAGGATGACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGATCG CGCCACCGCACTCCAGTCTGGGGGACAAAGCGAGATCCCATCTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAG AGCTCCGCTCCCACTTGCCCCCCATTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTCTACTC TCGCCCGTCTGCGTTCTACATTGGTTCTGCGGCCGTGTCCCTTTCGTGTGTGTCTGCCCTGTGTTTCTCC GTCGTCTCCGTGTGGATCTCGGTCTTTGTCTCGCCCTCTAGCTCTCTCGTGCGCCTGTGTTTAATCGTGC GCTTCTCTCAATCTCTCTGTCCCTCCCTTTGCCCCCTACACGCGTGTTCTCGTCAACAGATCTCCAGAGG TGGTGCAGAAACGACCCCGCGCCGGCGCCCCATCCTGCGGCCAGTGCCTCCGCGCCCCGGCTCCGGTCCC CACCGTCCCCGCCCCAGATTTCCGGAGGAGCAGGCGGGCGGGGTCCCGCGGGGCCGGCTGCCGTCAGCGC CCCTTCCCGGCGGCCGCGACCCCTCCCCGCTGACCTCACTCGAGCCGCCGCCTGGCGCAGATATAAGCGG CGGCCCATCTGAAGAGGGCTCGGCAGGCGCCCGGGGTCCTCAGCGCTGCAGACTCCTGACCTGCCGACTG CGGATCCCGAGTCCCCGGATCCCGGACCCATCCTGTGGAGCCCACTCCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRH_2 ↗ | 3:129,974,264 | 正股 | 129,974,215–129,974,274 |
| TRH_1 ↗ | 3:129,974,721 | 正股 | 129,974,672–129,974,731 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_93WKTJ · enhancer · 129971382–129971789 · regulatory
ENSR3_93WKWC · promoter · 129974268–129974730 · regulatory
ENSR3_85S6RW · enhancer · 129974731–129974959 · regulatory
ENSR3_535KFNB · CTCF_binding_site · 129975899–129975920 · regulatory
ENSR3_535KFNK · CTCF_binding_site · 129975950–129975971 · regulatory
· motif · 129975901–129975917 · motif
· motif · 129975952–129975968 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:242 aa
TRH 產物長 242 個胺基酸,屬於 TRH family。蛋白質序列第 1–24 位標註為訊號胜肽;第 63–205 位及第 220–242 位則標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRH 的定位註記為分泌型;來源未提供其他定位或定位改變條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- KCNIP4Q6PIL6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCN2P80188 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRH 是下視丘-腦下垂體-甲狀腺軸的組成成分,可控制甲狀腺刺激素(TSH)分泌並參與甲狀腺激素合成調節。它也調節毛髮生長,促進毛幹延長並延長生長期(anagen),且拮抗 TGFB2 對生長期終止(catagen)的作用;此外,TRH 促進毛髮基質角質細胞增殖並抑制其凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源As a component of the hypothalamic-pituitary-thyroid axis, it controls the secretion of thyroid-stimulating hormone (TSH) and is involved in thyroid hormone synthesis regulation. It also operates as modulator of hair growth. It promotes hair-shaft elongation, prolongs the hair cycle growth phase (anagen) and antagonizes its termination (catagen) by TGFB2. It stimulates proliferation and inhibits apoptosis of hair matrix keratinocytes PMID 19825978 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CGGCAGGCGCCCGGGGTCCTCAGCGCTGCAGACTCCTGAC40CTGCCGACTGCGGATCCCGAGTCCCCGGATCCCGGACCCA80TCCTGTGGAGCCCACTCCTGGCAGACGCCGCGATGCCCGG120CCCTTGGTTGCTGCTCGCTCTGGCTTTGACCCTGAACCTG160ACCGGTGTCCCCGGCGGCCGTGCTCAGCCAGAGGCGGCCC200AGCAGGAGGCAGTGACGGCCGCGGAGCATCCGGGCCTGGA240TGACTTCCTGCGCCAGGTGGAGCGCCTCCTCTTCCTCCGG280GAAAACATCCAGCGGCTGCAAGGGGACCAGGGTGAGCACT320CCGCGTCCCAGATCTTTCAATCTGACTGGCTCTCCAAACG360TCAGCATCCAGGCAAAAGAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGGA400GTTGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGGGGGGGCTGTGGGAC440CCCACAAACGGCAGCACCCTGGCCGACGAGAAGATGAGGC480TTCATGGTCAGTCGATGTAACCCAGCACAAGCGGCAGCAT520CCTGGCCGGCGCTCCCCCTGGCTTGCATATGCTGTCCCGA560AGCGGCAGCACCCAGGCAGAAGGCTGGCAGATCCCAAGGC600TCAAAGGAGCTGGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGAGA640GAGGAAGACCTGATGCCTGAAAAACGCCAGCATCCGGGCA680AGAGGGCCCTGGGAGGCCCCTGTGGGCCCCAGGGAGCCTA720TGGTCAAGCGGGCCTTCTGCTGGGGCTCCTGGATGACCTG760AGTAGGAGCCAGGGAGCTGAGGAAAAGCGGCAGCACCCTG800GTCGGCGGGCAGCCTGGGTCAGAGAGCCCCTGGAGGAGTG840AACCCAGTTTTCCCTGAAGTCGAGTTTGTGGTCTAAGGAT880GTCTTGAGCCCTGTGTGCCCCACCATTCATGACCTCTGTA920TTCTCTAGTTAGATCCCTGACCATAAGCCTGAGCCCCTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。