演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TRH

thyrotropin releasing hormone

TRH 是 thyrotropin releasing hormone 基因,產物屬於 TRH family,與甲狀腺刺激素分泌調控及毛髮生長調節有關。

Homo sapiens3q22.1UniProt P20396
OFFICIAL SYMBOL
TRH
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P20396
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TRH 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 thyrotropin releasing hormone。其蛋白質產物長 242 個胺基酸,屬於 TRH family;序列註解包含訊號胜肽,以及兩段被註記為無序的區域。來源將其描述為下視丘-腦下垂體-甲狀腺軸的組成成分,並指出它也與毛髮生長調節相關。

Official symbol
TRH
Gene name
thyrotropin releasing hormone
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12298
UniProt
P20396
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33q22.1
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegTRHpq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:129,974,293–129,977,940
Gene span
3,648 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000302649 ★129,974,720–129,977,9353
ENST00000507066129,974,293–129,977,9403
ENST00001143546129,974,293–129,977,9403
ENST00001098899129,975,517–129,977,9403

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TRH 是下視丘-腦下垂體-甲狀腺軸的組成成分,可控制甲狀腺刺激素(TSH)的分泌,並參與甲狀腺激素合成的調節。來源未進一步說明這些作用的分子機制或調控條件。

TRH 也被描述為毛髮生長的調節因子。在毛髮生長相關作用中,它促進毛幹延長,並延長毛囊週期的生長期(anagen);同時,來源指出它會拮抗 TGFB2 所造成的生長期終止(catagen)。

在毛髮基質角質細胞中,TRH 促進細胞增殖並抑制細胞凋亡。這些作用與毛幹延長及生長期延長相互呼應,顯示 TRH 的功能不只涉及甲狀腺軸,也包括毛髮生長週期及其相關細胞的調節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 129974720 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TRH ENST00000302649 GRCh38 chr3:129973720-129974820 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTGGTGGCCGAGAGCAGCCAGGCTCAGCTCCACCTGGCTGTTGACAGGAGGAAATGGGGGCCCATTCTT
TTTCAAGAGAAGCCATAAATCCAAAATTTTCTAAGTTATCTTGGTTTTAAAATGTTGGTTATTCAGATTT
TTTTCAAAACACTGTGGAAGTCAATCAAAATTGTCCATGAACTGGTTGTAGCCTACAGGCCGCCACTTTT
GGAATTCTGAAAGCTTTCCTCTGGCTCCTATTACACAGAGGAGAAAACTGAGGCCCAGAGAAACGGAGGC
ACTAGCCAGGAATGACACAGTTAAGATTAGCACCCTGGAGCCTGCGGGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA
GAGACGCAGGAGTCTGAGGCAGGAGGATGACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGATCG
CGCCACCGCACTCCAGTCTGGGGGACAAAGCGAGATCCCATCTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAG
AGCTCCGCTCCCACTTGCCCCCCATTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTCTACTC
TCGCCCGTCTGCGTTCTACATTGGTTCTGCGGCCGTGTCCCTTTCGTGTGTGTCTGCCCTGTGTTTCTCC
GTCGTCTCCGTGTGGATCTCGGTCTTTGTCTCGCCCTCTAGCTCTCTCGTGCGCCTGTGTTTAATCGTGC
GCTTCTCTCAATCTCTCTGTCCCTCCCTTTGCCCCCTACACGCGTGTTCTCGTCAACAGATCTCCAGAGG
TGGTGCAGAAACGACCCCGCGCCGGCGCCCCATCCTGCGGCCAGTGCCTCCGCGCCCCGGCTCCGGTCCC
CACCGTCCCCGCCCCAGATTTCCGGAGGAGCAGGCGGGCGGGGTCCCGCGGGGCCGGCTGCCGTCAGCGC
CCCTTCCCGGCGGCCGCGACCCCTCCCCGCTGACCTCACTCGAGCCGCCGCCTGGCGCAGATATAAGCGG
CGGCCCATCTGAAGAGGGCTCGGCAGGCGCCCGGGGTCCTCAGCGCTGCAGACTCCTGACCTGCCGACTG
CGGATCCCGAGTCCCCGGATCCCGGACCCATCCTGTGGAGCCCACTCCTGG
TRH 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TRH_2 ↗3:129,974,264正股129,974,215–129,974,274
TRH_1 ↗3:129,974,721正股129,974,672–129,974,731

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_93WKTJ · enhancer · 129971382–129971789 · regulatory

ENSR3_93WKWC · promoter · 129974268–129974730 · regulatory

ENSR3_85S6RW · enhancer · 129974731–129974959 · regulatory

ENSR3_535KFNB · CTCF_binding_site · 129975899–129975920 · regulatory

ENSR3_535KFNK · CTCF_binding_site · 129975950–129975971 · regulatory

· motif · 129975901–129975917 · motif

· motif · 129975952–129975968 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:242 aa

1 aa242 aa功能區域訊號胜肽
依 P20396 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TRH 產物長 242 個胺基酸,屬於 TRH family。蛋白質序列第 1–24 位標註為訊號胜肽;第 63–205 位及第 220–242 位則標註為無序區域。

訊號胜肽1–24 aa
功能區域Disordered63–205 aa
功能區域Disordered220–242 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P20396…

AlphaFold · P20396

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

TRH 的定位註記為分泌型;來源未提供其他定位或定位改變條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TRHTRHKCNIP4LCN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TRH 是下視丘-腦下垂體-甲狀腺軸的組成成分,可控制甲狀腺刺激素(TSH)分泌並參與甲狀腺激素合成調節。它也調節毛髮生長,促進毛幹延長並延長生長期(anagen),且拮抗 TGFB2 對生長期終止(catagen)的作用;此外,TRH 促進毛髮基質角質細胞增殖並抑制其凋亡。含實驗來源
證據與來源

As a component of the hypothalamic-pituitary-thyroid axis, it controls the secretion of thyroid-stimulating hormone (TSH) and is involved in thyroid hormone synthesis regulation. It also operates as modulator of hair growth. It promotes hair-shaft elongation, prolongs the hair cycle growth phase (anagen) and antagonizes its termination (catagen) by TGFB2. It stimulates proliferation and inhibits apoptosis of hair matrix keratinocytes

PMID 19825978 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000302649 · 1,560 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CGGCAGGCGCCCGGGGTCCTCAGCGCTGCAGACTCCTGAC40
41CTGCCGACTGCGGATCCCGAGTCCCCGGATCCCGGACCCA80
81TCCTGTGGAGCCCACTCCTGGCAGACGCCGCGATGCCCGG120
121CCCTTGGTTGCTGCTCGCTCTGGCTTTGACCCTGAACCTG160
161ACCGGTGTCCCCGGCGGCCGTGCTCAGCCAGAGGCGGCCC200
201AGCAGGAGGCAGTGACGGCCGCGGAGCATCCGGGCCTGGA240
241TGACTTCCTGCGCCAGGTGGAGCGCCTCCTCTTCCTCCGG280
281GAAAACATCCAGCGGCTGCAAGGGGACCAGGGTGAGCACT320
321CCGCGTCCCAGATCTTTCAATCTGACTGGCTCTCCAAACG360
361TCAGCATCCAGGCAAAAGAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGGA400
401GTTGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGGGGGGGCTGTGGGAC440
441CCCACAAACGGCAGCACCCTGGCCGACGAGAAGATGAGGC480
481TTCATGGTCAGTCGATGTAACCCAGCACAAGCGGCAGCAT520
521CCTGGCCGGCGCTCCCCCTGGCTTGCATATGCTGTCCCGA560
561AGCGGCAGCACCCAGGCAGAAGGCTGGCAGATCCCAAGGC600
601TCAAAGGAGCTGGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGAGA640
641GAGGAAGACCTGATGCCTGAAAAACGCCAGCATCCGGGCA680
681AGAGGGCCCTGGGAGGCCCCTGTGGGCCCCAGGGAGCCTA720
721TGGTCAAGCGGGCCTTCTGCTGGGGCTCCTGGATGACCTG760
761AGTAGGAGCCAGGGAGCTGAGGAAAAGCGGCAGCACCCTG800
801GTCGGCGGGCAGCCTGGGTCAGAGAGCCCCTGGAGGAGTG840
841AACCCAGTTTTCCCTGAAGTCGAGTTTGTGGTCTAAGGAT880
881GTCTTGAGCCCTGTGTGCCCCACCATTCATGACCTCTGTA920
921TTCTCTAGTTAGATCCCTGACCATAAGCCTGAGCCCCTCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。