基因總覽
TRGV9 是位於人類第 7 號染色體的 T cell receptor gene,正式名稱為 T cell receptor gamma variable 9。現有資料將其列為 T 細胞受體基因,但未提供產物的結構或其他基本特性細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000444775 ★ | 38,317,017–38,318,861 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
資料預測 TRGV9 可能具有 MHC protein 結合與 peptide antigen 結合活性,並可能參與適應性免疫反應及先天免疫反應。這些功能描述屬於預測,來源未提供支持它們的實驗細節或作用機制。
定位方面,資料預測其可能位於質膜外側,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;這些定位與複合體關係同樣屬預測。來源未說明其參與免疫反應的具體方式。
Promoter 與基因調控
>TRGV9 ENST00000444775 GRCh38 chr7:38318761-38319861 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAACCTCCAGGGTGATAGACCAGCTTAGAGACCAAGATTTTATCTTTCCTAAGTGATCTCACCTTCAGAG GCATCATCACCAGACTTTTCAAGTTTTGTTTCTTAGAAATGGTCCCAAGTTCTTTCCCTCTCATCGTCTC TTGCTTTAGGGAGCCTCCCAGCTAGTCTGTCTTAGCAAGACAAGGGCATAGCTGGTGCATTGCTGCTGGT GAGCAGGGGCAAGTTCACAGAAGGCAGCATGGGAGAGTATAACAGAAATCACCATCAGTTTCCAAGGGCT TGCTCTGTGTCAGGCATTGCCCTAAACAGTCTACCTGGGCAAACATTTATTCTTTGCAACATCCAGTAAG GTAGGCTGTGATTTTATTCTCCTTTGGTAGATAAGAAAACAGAGGCAGAGAGAACTACTCAAAGAGCTCA GGCTTTGCAGCCCGATAGAATTAATCTTAAATCTGTCACCAACAAGCTGTTAAACCTTGACCCATTACCT GACCTGCTTTGAGTAGGGCTTTGTGAAGATTATACTAAATTTATGGTATTAAACATCATAATGGCTACAA ACTGCTTGACACATTAAGGCATTCACTAAGTGTCCATTGCTTGGTAACTCTTTAAAAACTGTATTTTAAA TGGTGATGTTTTGTTAACATCAGAACGACAAAAAAATACTACAATGGCCATCCATTCCCTCACTCCACCC TTTCATCTATTCAACAAACACCTGGGAATAGAGAGATAAACAGCACATGATCTTACTCCCCTGGGAACTC TTAACTGTCGTTTAGAATGAGAGAGAAATGGGTAAACAGGCCAAGACTTGGGTAGGAGGTGCTAGGAGAG AGGAAGGCACTAGGTGGCGTGAAGAGAAAGCAATTTGAAGCATCTCCATCCTGGACTTACTGGGTGAGGT AAGCTTCCTGGGGAAGACTGCCTGGGGCTGAGCCCAGAAGGATAAACAGGAATTAGCCAGGGAATGTGGA GTAGAATGCAGTCCAAACACAAAAAAATTCAAGTCAATCCATAGAAGTGGGTCGTGGAATTCCAGGCAGA AAGTGACTAAATGAAGATGGAAGGACAGGGAGGGGGTGGCCACATCACAGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_9K7M3 · enhancer · 38316759–38317087 · regulatory
ENSR7_B9LBM · enhancer · 38317450–38317989 · regulatory
ENSR7_B9LBR · enhancer · 38318358–38319299 · regulatory
ENSR7_5C2CGS · CTCF_binding_site · 38318999–38319020 · regulatory
ENSR7_B9LC8 · enhancer · 38321433–38321973 · regulatory
· motif · 38319001–38319017 · motif
· motif · 38319094–38319107 · motif
· motif · 38319094–38319107 · motif
· motif · 38319388–38319410 · motif
· motif · 38319388–38319410 · motif
基因座與轉錄註解
TRGV9 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000444775 ★ | TR_V_gene | 1,735 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRGV9 被預測可能具有 MHC protein 結合與 peptide antigen 結合活性,可能參與適應性及先天免疫反應;也預測可能位於質膜外側,並屬於 T cell receptor complex。以上均為預測性描述。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable MHC protein binding activity and peptide antigen binding activity. Predicted to be involved in adaptive immune response and innate immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in external side of plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AAAAAAATTCAAGTCAATCCATAGAAGTGGGTCGTGGAAT40TCCAGGCAGAAAGTGACTAAATGAAGATGGAAGGACAGGG80AGGGGGTGGCCACATCACAGAGAACCTCTTATCCTAAGAA120CTCTGGACTTCATCTTCAGAGGCAAGGTAGAGAGAGCAAG160GACTTTAGAGCAGGAAAAGGACCAGGTCAGTCTAGTGGCC200ATGGGGAAGGTGGGTGGGAGGGGCCGAGATGGGATGTATG240GAGGTGCGTGAGGTGGAGGCAGTGGTGAGCCAGGAAATGT280TTAGGACGTAGAATCCTCAGGAATTAGAGTGCGGTGAATT320AGAGGGGAGAATTGAGGCTGATGCTCAAGCTCCTGGCTTG360GGCAATGTGGGTAGTTATGTCATACAGGGAACTCGGAAGA400AGATATGGTTTGGGGGAAGGGAATGAGTTCACTCTGGCTA440TGAGCAGACTTTGTTTGAGATCCCATGTCAGACGTACTTG480AAAATGTCCAAGAGTTAGCTGGATATGGGTACAGACAGCT520TTCGATTTAACTGAGGTCCGACTTAAGATTTTTTTTTACT560TTATGATGGTGCAAAAGTGACACGCATTTGGTAGAAAACA600TAATTTGACCTTTGCTGTTTCCCCAGGACAGTGATATAAG640GTTATGATACTCTCTTGCGATGCTGGGCAGTGGCAGTGAG680CTGCAGCTCCCAGTGGGTAAATTAAGCATGGAAATCTGGA720ACACAGCAGCTTTTAAGGGATGCACTGGGGAGAGCAGTTT760GTAAAAATACCTTGGGACGGATTAAATGTCTTGGCTTAGA800GAAAGAACAACAGACAATAGGAAACTGTCATTGAGGAGAA840GCCGGGATTCAGGAGATGTACATTATTCAGGTAGCTGAGG880GAGGGGACAGGAACCTGAATCTTCAACAGAAGCAAACAAA920CTGGGATGGAGGGCCCAGCCTCATGAAGGTGACCAGAAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。