基因總覽
TRGV8 的正式名稱為 T cell receptor gamma variable 8,屬於 T cell receptor gene。現有資料未提供其蛋白質或 RNA 產物的具體性質、結構特色或家族細節;因此不宜據此補述產物形式。資料將其與 T cell receptor complex 關聯,但此關聯屬預測,並非已確立的定位或複合體組成證據。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390343 ★ | 38,330,343–38,330,935 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料預測 TRGV8 可能參與適應性免疫反應與先天免疫反應,並可能位於質膜及成為 T cell receptor complex 的一部分。這些描述均屬預測性資訊,來源未提供實驗情境、作用機制或功能讀出,因此無法進一步說明其如何影響免疫反應,也不能將相關定位或複合體關聯視為已證實。
Promoter 與基因調控
>TRGV8 ENST00000390343 GRCh38 chr7:38330835-38331935 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGCTGTGATGTCAGCAAAAACTGAACTCTCTGAGCTAGGCCAAAACAACAACCAAGAGGGACATTGTTCT ACGTTTTATGAATATCTTAAACATGTGTCCAAACTTTTTTTTTTTTTTACCGAAGTGAAAATCTGTGTAT GCACTACTGAATTTTCACAATTATTTTACTATACTTGTTTTATCACCTGTATCTCCATCTATGAGTCCAG GTCCACTGCAGACATCAGTCAGCTTTCTGAGGATACGGTTGCTAAGTAAAATATGCAATACTCAGGAAAT TTGGACGTTCAGATAAATAACAAGTTTTTAGCTGAAGTATGTCCCAAATATTGCATGACATGGCACCCTG TATTACTTTAAAAAAAAAACTCACACTTCTACTTGAATGAACGGAAATCCTCTAATAAAGAGATCACACA CACAGGCATACACTCCCAACACACACACACACACAAACTCACAGAGGATCACACAAACACCCGCCCCACC CCCACACACCCATTTACCTTAGAGGAGAGTCCAAGACCCACCAACATACCTGACCCTCGATCCTGTTAAT AAAGCAGGTTCAGGCCCTCTCAGAGTGACCCTGGGTGTTGCCTCTAGTGTCCTTGCAGATGTGAAAAGGA TGGTGGTTTAGGGCCCTAATCAGAAGCTTCCCGGCAGAATGAGGGTCTTGCAGTTGCCTTACTTGCTGAA ACTCTGAAGTGCTGGGTGTGAACCTGCTGTGAGACTACCCCCTTTAAGGTCTGAGCCTGTTAACTCCAGG GTCAGCTTCCCCCACATCTGCACTCCCTCTGCTGCAGGCCTGAGCTCTCTATGCCCGGAGCTCTCTTCCT TAGAGGGCCTGCTCTCAGCCGCCACAGAGGGCGCTGGAGAACTGGCCTGAGCAGAGAGGCAGAAACTCCT CTGCAGGTCCTCCTAGGCACCACCCAGAGTCCCCTAAGACAGATCCTCAATCACTTATCTCTGCCTGTGA ATCAGGAAGACCAGCTCCTCCTACTGTCTTCTGTGTTAGGGATCACTTCCTTGTTGAGTGGGACCTGAGT TTTGAGAGGGTCTTCTGCTCCTCTTCGTCTGGTCCCTTACTTCCAAGACCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_9K7R5 · promoter · 38330782–38331129 · regulatory
ENSR7_5C2FJ2 · CTCF_binding_site · 38330925–38330946 · regulatory
ENSR7_9K7R8 · enhancer · 38331130–38331525 · regulatory
ENSR7_9K7RF · enhancer · 38331854–38332140 · regulatory
ENSR7_748T9X · enhancer · 38334709–38334827 · regulatory
ENSR7_C5RP5 · enhancer · 38335147–38336301 · regulatory
ENSR7_5C2GBQ · CTCF_binding_site · 38335619–38335640 · regulatory
ENSR7_5C2GCG · CTCF_binding_site · 38335771–38335792 · regulatory
ENSR7_5C2GCR · CTCF_binding_site · 38335840–38335861 · regulatory
· motif · 38330927–38330943 · motif
· motif · 38331915–38331926 · motif
· motif · 38335374–38335387 · motif
· motif · 38335593–38335606 · motif
· motif · 38335595–38335606 · motif
· motif · 38335595–38335606 · motif
· motif · 38335597–38335606 · motif
· motif · 38335621–38335637 · motif
· motif · 38335773–38335789 · motif
· motif · 38335842–38335858 · motif
基因座與轉錄註解
TRGV8 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390343 ★ | TR_V_gene | 468 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRGV8 預測可能參與適應性免疫反應與先天免疫反應,也預測可能位於質膜並成為 T cell receptor complex 的一部分;這些內容屬預測,並非已證實的功能、定位或複合體組成。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in adaptive immune response and innate immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
CTACTGTCTTCTGTGTTAGGGATCACTTCCTTGTTGAGTG40GGACCTGAGTTTTGAGAGGGTCTTCTGCTCCTCTTCGTCT80GGTCCCTTACTTCCAAGACCCCAGAGAGGAAGGCATGCTG120TTGGCTCTAGCTCTGCTTCTAGCTTTCCTGCCTCCTGCCA160GTCAGAAATCTTCCAACTTGGAAGGGAGAACAAAGTCAGT200CACCAGGCCAACTGGGTCATCAGCTGTAATCACTTGTGAT240CTTCCTGTAGAAAATGCCGTCTACACCCACTGGTACCTAC280ACCAGGAGGGGAAGGCCCCACAGCGTCTTCTGTACTATGA320CTCCTACAACTCCAGGGTTGTGTTGGAATCAGGAATCAGT360CGAGAAAAGTATCATACTTATGCAAGCACAGGGAAGAGCC400TTAAATTTATACTGGAAAATCTAATTGAACGTGACTCTGG440GGTCTATTACTGTGCCACCTGGGATAGG468cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。