基因總覽
TRGV5P 是人類假基因（pseudogene），正式名稱為 T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene)。登錄類型為 T cell receptor pseudogene。此基因座位於 7p14.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000419915 ★ | 38,345,030–38,345,499 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
Promoter 與基因調控
>TRGV5P ENST00000419915 GRCh38 chr7:38345399-38346499 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCTTACAGAGGTGGTGATAATCTGTGAATGCCTTACTGAATTTTCACAATAATATTACTGTACTTGATT TGTCCCCTTATTTTCATCTGTGAATCCAGGTGCACTGCAGATATTAGTCTGCTTTCTGAGGGTAGGGATG ACAAATAAAATATACAATACGCAGAGAATTGGAAGTTCAGATAAATAACAAGTTTTTAGTTTAAGTATGT TCCAAATGTTGCATGACATGGCACCCAGTACTACTTTAAAAACAAACAAGCAAACAAACAAACTCACATT CCTACTTAATGAACAAAAATCCTCTAATAAGGAGGTCACACACACAGGATTACAGGCACAACTCACCCCC CCCAACACACACACACATTTACCTTAGAGCAGAGTCCAAGACACACCAACACACATGATCCTCAGTCCTT TTAATTTAAAGCACGTTCAACCCTTCTCAGAGTGGCCTTGAGTGGTTGCCTCCATGTGTCTGCAGATGCG AAAAGGAACTTGGTTCAGGGCCCTAATCAGAGGCTTCCTGTCAGGACAAGGTCCTGGCATCAGCATTAGC TGCTGCAACTCTGAAGGGCAGGGTAGGAGCCTGTTGTGGGACTGCCCCCTCCAAGGTCTGAGCCTGTTAA TTCCAGGGTCAGCTTCCCCTAAATCTGCAGTCCCTCTGCTGGAGGCCTGAACTCTCAATGCCCCTGCCTC CCTTCTGCCCTGGGCCTGCTCTCAGCTGCCACAAGAGGGCGCCGAAGAAAGGGCCTGAGGAGACACAGGA GCTCCTCTGCAGGTCCTCCCAGGAACCACCCCTTCTGGGAGGAAGGCTTGGGAGTCCCCTAAGACACATC CTCAGTCACTTCTCTCTGCCTGTGTCTCAGGAATACCAGCTCCTCCTACTGTCTTCTGTGCTAGGGATCA CTTCCTTGTTGAGTGGGACCTGAGTTTTGAGAGGATCTTCTACTCCTTTTCATCTGGTCCCTTTCCTTCC AAGGCCCCAGAAAGGAAGGCATGCGGTGAGCCCTAGCGGTGCTTCTAGCTTTCCTGTATCCTGGTGAGTG TGCTGCCTACAGAGAGGCTCACAGGTTGGGTTTTGTTTTGTTTTCTTCTTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_B9LFX · enhancer · 38340237–38340777 · regulatory
ENSR7_B9LG4 · promoter · 38341070–38341711 · regulatory
ENSR7_5C2HBZ · CTCF_binding_site · 38341495–38341516 · regulatory
ENSR7_748TL3 · enhancer · 38341712–38341816 · regulatory
ENSR7_9K7XB · promoter · 38345142–38345642 · regulatory
ENSR7_5C2J2Z · CTCF_binding_site · 38345604–38345625 · regulatory
ENSR7_9K7XG · enhancer · 38345643–38346151 · regulatory
ENSR7_5C2J3N · CTCF_binding_site · 38345755–38345776 · regulatory
ENSR7_835FWC · enhancer · 38346529–38346755 · regulatory
ENSR7_5C2JNM · CTCF_binding_site · 38349421–38349442 · regulatory
ENSR7_9K7ZK · promoter · 38349529–38350029 · regulatory
ENSR7_5C2JR2 · CTCF_binding_site · 38349929–38349950 · regulatory
ENSR7_B9LHC · enhancer · 38350030–38350543 · regulatory
ENSR7_5C2JRP · CTCF_binding_site · 38350080–38350101 · regulatory
· motif · 38341497–38341513 · motif
· motif · 38345606–38345622 · motif
· motif · 38345757–38345773 · motif
· motif · 38349423–38349439 · motif
· motif · 38349495–38349508 · motif
· motif · 38349495–38349508 · motif
· motif · 38349905–38349916 · motif
· motif · 38349905–38349916 · motif
· motif · 38349931–38349947 · motif
· motif · 38350082–38350098 · motif
· motif · 38350200–38350212 · motif
· motif · 38350202–38350224 · motif
· motif · 38350202–38350224 · motif
基因座與轉錄註解
TRGV5P 依 HGNC／Ensembl 分類為 T cell receptor pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000419915 ★ | TR_V_pseudogene | 354 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
ATGCGGTGAGCCCTAGCGGTGCTTCTAGCTTTCCTGTATC40CTGCCAGTCAGAAATCTTCCAACTTGGAAGGGAGAATGAA80GTCAGTCACCAGGCCGACTGGGTCATCTGCTGAAATCACT120TGTGACCTTACTGTAATAAATGCCGTCTACATCCACTGGT160ACCTACAGCAGGAGGGGAAGACCCCACAGCATCTTCTGCA200CTATGATGTCTCCAACTCAAGGGATGTGTTGGAATCAGGT240CTCAGTCTTGGAAAGTATTATACTCATACACCGAGGAGGT280GGAGCTGGAATTTGAGACTGCAAAATCTAATTGAAAATGA320TTCTGGGGTCTATTACTGTGCCACCTGGGGCAGG354cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。