基因總覽
TRGV3 的正式名稱為 T cell receptor gamma variable 3,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其歸類為 T 細胞受體基因,但未提供其 RNA 或蛋白質產物的詳細性質、結構特色或家族構成資訊。資料所列的基因位置為染色體 7 的 7p14.1;這是基因定位資訊,並不代表產物的細胞內位置。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390346 ★ | 38,358,512–38,359,162 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料以預測性描述指出,TRGV3 可能具有 MHC protein binding activity 與 peptide antigen binding activity,並可能參與免疫反應。這些註記提出其可能涉及的分子作用與生物過程,但未提供實驗細節或進一步機制,因此不宜視為已確立的功能結論。
資料另預測,TRGV3 可能位於質膜,並可能是 T 細胞受體複合體的一部分。此定位與複合體歸屬同樣屬於預測;來源未說明產物如何與 MHC protein 或 peptide antigen 作用,也未交代這些可能的結合活動如何影響免疫反應。
Promoter 與基因調控
>TRGV3 ENST00000390346 GRCh38 chr7:38359062-38360162 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGCCTCATGTCCTGCATGTGTGCTCCAGAGGCAGAGGGAGACCAACCAGAGCCCCCTCCCTTTCTCATTC CCAGCTGTGATGACAGCAGAAACTGAACTCTCTGAGCTAGCCCAACACAACAACTGAGAGGGACACTGTT CTCCATCTCATTATGCATATTTCAAACATGTGTCTCTATATACTTCTTACAGAGGTGGTGATAATCTGTG AATGCCTTACTGAATTTTCACAATAATATTACTGTACTTGATTTGTCCCCTTATTTTCATCTGTGAAGCC AGGTGCACTGCAGATATTAGTCTGCTTTCTGAGGGTAGGGATGACAAATAAAATATACAATACCGGGGGA ATTGGAAGTTCAGATAAATAACAAGTTTTTAGTTTAAGTATGTTCCAAATATTGCATGACATGGCACCCA GTTCTACTTTAAAAACAAACAAGCAAACAAACAAATTCACACTCCTACTTTAATGAACAAAAATCTTCTA ATAAGGAGGTCACACACACAGGATTACAGGCACAACCCCCACACACAAACACACACACACATTTACCTTA GAGCAGAGTCCAGGACACACCAACACACATGATCCTCAGTCCTTTTAATTTAAAGCACGTTCAACCCTTC TCAGAGTGGCCTTGAGTGGTTGCCTCCATGAGTCTGCAGATGCGAAAAGGAAGTTGGTTCCGGGCCCTAA TCAGAGGCTTCCTGTCAGGACAAGGTTCTGGCATCAGCATTACCTGCTGCAACTCTGAAGGGCAGGGTGG GAGCCTGCTATGGGACTGCCCCCTCCAAGGTGTGAGCCTGTTAATTCCAGGGTCAGCTTACCCAACATCT GCAGTCCCTCAGCTGGAGGCCTGAGCTCTTAATGCCCCTGCCTCCCTTCTGCCCTGGGCCTGCTCTCAGC TGCCACAAGAGGGCGCCGAAGAAAGGGCCTGAGGAGATGCAGGAGCTCCTCTGCAGGTCCTCCCAGGCAC CACCCCTTCTGGGAGGAAGGCTTGGGAGTCCCCTAAGACACATCTTCAGTCACTTCTCTCTGCCTGTGTC TCAGGAAACCAGCTCCTCCTACTGTCTTCTGTGCTAGGGATCACTTCCTTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_C5RQG · enhancer · 38353267–38354715 · regulatory
ENSR7_5C2KJ7 · CTCF_binding_site · 38354288–38354309 · regulatory
ENSR7_5C2KJX · CTCF_binding_site · 38354446–38354467 · regulatory
ENSR7_5C2KL6 · CTCF_binding_site · 38354710–38354731 · regulatory
ENSR7_C5RQR · enhancer · 38358020–38359702 · regulatory
ENSR7_5C2L93 · CTCF_binding_site · 38358578–38358599 · regulatory
ENSR7_5C2LCD · CTCF_binding_site · 38359084–38359105 · regulatory
ENSR7_5C2LD4 · CTCF_binding_site · 38359234–38359255 · regulatory
ENSR7_835G75 · enhancer · 38360006–38360235 · regulatory
ENSR7_C5RR4 · enhancer · 38362367–38363856 · regulatory
ENSR7_5C2M2R · CTCF_binding_site · 38363055–38363076 · regulatory
ENSR7_5C2M4J · CTCF_binding_site · 38363433–38363454 · regulatory
ENSR7_5C2M59 · CTCF_binding_site · 38363590–38363611 · regulatory
ENSR7_5C2M6H · CTCF_binding_site · 38363854–38363875 · regulatory
· motif · 38354290–38354306 · motif
· motif · 38354448–38354464 · motif
· motif · 38354712–38354728 · motif
· motif · 38358580–38358596 · motif
· motif · 38358652–38358665 · motif
· motif · 38358652–38358665 · motif
· motif · 38359060–38359071 · motif
· motif · 38359060–38359071 · motif
· motif · 38359086–38359102 · motif
· motif · 38359236–38359252 · motif
· motif · 38359354–38359366 · motif
· motif · 38359356–38359378 · motif
· motif · 38359356–38359378 · motif
· motif · 38363057–38363073 · motif
· motif · 38363435–38363451 · motif
· motif · 38363592–38363608 · motif
· motif · 38363856–38363872 · motif
基因座與轉錄註解
TRGV3 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390346 ★ | TR_V_gene | 537 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 TRGV3 可能具有 MHC protein 結合與 peptide antigen 結合活性,可能參與免疫反應,也可能位於質膜並構成 T 細胞受體複合體的一部分;這些都是預測性註記,未提供實驗條件或作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable MHC protein binding activity and peptide antigen binding activity. Predicted to be involved in immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
CTTGGGAGTCCCCTAAGACACATCTTCAGTCACTTCTCTC40TGCCTGTGTCTCAGGAAACCAGCTCCTCCTACTGTCTTCT80GTGCTAGGGATCACTTCCTTGTTGAGTGGGGCCTGAGTTT120TAAGAGGATCTTCTGCTCCTCTTCATCTGGTCCGTTTCCT160TCCAAGGCCCCCGAGAGGAAGGCATGCGGTGGGCCCTACT200GGTGCTTCTAGCTTTCCTGTCTCCTGCCAGTCAGAAATCT240TCCAACTTGGAAGGGAGAACGAAGTCAGTCACCAGGCAGA280CTGGGTCATCTGCTGAAATCACTTGCGATCTTACTGTAAC320AAATACCTTCTACATCCACTGGTACCTACACCAGGAGGGG360AAGGCCCCACAGCGTCTTCTGTACTATGACGTCTCCACCG400CAAGGGATGTGTTGGAATCAGGACTCAGTCCAGGAAAGTA440TTATACTCATACACCCAGGAGGTGGAGCTGGATATTGAGA480CTGCAAAATCTAATTGAAAATGATTCTGGGGTCTATTACT520GTGCCACCTGGGACAGG537cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。