基因總覽
TRGV2 的正式名稱為 T cell receptor gamma variable 2,屬於 T cell receptor gene。此基因的名稱指出它與 T cell receptor 的 gamma variable 類別相關;現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的詳細性質、序列與結構特色,因此不進一步推定其分子組成。資料庫摘要將其與免疫反應及 T cell receptor 複合體相關聯,但這些描述均屬預測。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000426402 ★ | 38,362,864–38,363,518 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註解預測 TRGV2 可能參與適應性免疫反應與先天免疫反應。這項描述同時涵蓋兩類免疫反應,但資料沒有進一步說明其作用於哪些細胞、辨識何種訊號,或在兩類反應中各自扮演什麼角色,因此不能據此推定更具體的免疫機制。
來源也預測 TRGV2 可能位於細胞膜,並可能是 T cell receptor 複合體的一部分。這提供了其可能所在位置及複合體關聯的線索,但尚未指出它與複合體中其他成分的具體關係,也未描述分子作用方式或受體訊號傳遞的結果。由於這些註解明確屬於預測,不能視為已確認的定位或複合體組成。
因此,目前可支持的功能範圍僅限於其可能與適應性及先天免疫反應相關,並可能位於細胞膜、參與 T cell receptor 複合體。來源未提供實驗系統、擾動方式、讀出指標或結果,也沒有更細的生物學過程說明;其在免疫反應中的確切功能與作用條件仍無法由現有資料判定。
Promoter 與基因調控
>TRGV2 ENST00000426402 GRCh38 chr7:38363418-38364518 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACTCCTACTTCAGTGAACAAAAATCCTCTAATAAAGAGATCACACCCACAGGATCACACACACACAAACA CACACACACACACACACCCCACATACACCCATTTATCTTAGAGCAGAGTCCAAGACCCACCAACACACAT GATCCTCAGTCCTTTCATTTTTATTATTTATTTATTTATTTATATTTATTATACTTTAAGTGCTAGGGTA CATATGCACAACGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTTTGTTGCACCCATCAACT TGTCATCTACATTAGGTATATCTCTTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACTACAGGCCCCAG TGTGTGATGTTCCCCCACTCTGTGTCCAAGTGTTCTCCTTGTTCAATTCCCACCTACGAGTGAGAACATG CACTGTTTGGATTTCTGTCCTTGGAATAGTTTGCTCGGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCTTA CAAAGGACATGAACGCATCCCTTTTTATGGCCGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTCTT AATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTCTGCTATCGTGAATAGTGCCACAATA AACATATGCTTTGCGTGGTGCCTCCAAGTGTCCTCGCAGATGCCAAAAGGAAGGTGGTTCAGTTCCCTAA TCAGAGACTTCCTGGCAGGACAAGGTCCTGGCATCAGCATTAGCTGCTGCAACTCTGAAGGGCAGGGTGT GAGCCTGCTGTGGGACTGCCCCCTCCTAGGGCTGGGCCTGCTGACTCCAGGGTCTGCTTCCCCCACCTCT GCACTCCCTCTGCTGCAGGCCTGAGCTCTCCTTGCCCCTGGCTCTCTTCTGCAGAGGGCCTGCTCTCAGC TGCCACAAGAGGGCGCCGGAGAACGGACCTGAGCAGAGAGGCAGGGGCTCCTCTGCAGGTCCTCCCAGGC ACCAACCCTTCTGGGAGGGAGGAAGGCTTGGGAGTCCTCTTAGACAGATCCTCAGTCACTTCCCTCTGCT TGTGTCTCAGGAAGACCACCTCCTCCTACTGTCTTCTGTGCTAGGGATCAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_C5RQR · enhancer · 38358020–38359702 · regulatory
ENSR7_5C2L93 · CTCF_binding_site · 38358578–38358599 · regulatory
ENSR7_5C2LCD · CTCF_binding_site · 38359084–38359105 · regulatory
ENSR7_5C2LD4 · CTCF_binding_site · 38359234–38359255 · regulatory
ENSR7_835G75 · enhancer · 38360006–38360235 · regulatory
ENSR7_C5RR4 · enhancer · 38362367–38363856 · regulatory
ENSR7_5C2M2R · CTCF_binding_site · 38363055–38363076 · regulatory
ENSR7_5C2M4J · CTCF_binding_site · 38363433–38363454 · regulatory
ENSR7_5C2M59 · CTCF_binding_site · 38363590–38363611 · regulatory
ENSR7_5C2M6H · CTCF_binding_site · 38363854–38363875 · regulatory
ENSR7_C5RRG · enhancer · 38367135–38368647 · regulatory
ENSR7_5C2MX5 · CTCF_binding_site · 38368313–38368334 · regulatory
· motif · 38358580–38358596 · motif
· motif · 38358652–38358665 · motif
· motif · 38358652–38358665 · motif
· motif · 38359060–38359071 · motif
· motif · 38359060–38359071 · motif
· motif · 38359086–38359102 · motif
· motif · 38359236–38359252 · motif
· motif · 38359354–38359366 · motif
· motif · 38359356–38359378 · motif
· motif · 38359356–38359378 · motif
· motif · 38363057–38363073 · motif
· motif · 38363435–38363451 · motif
· motif · 38363592–38363608 · motif
· motif · 38363856–38363872 · motif
· motif · 38367437–38367452 · motif
· motif · 38367437–38367452 · motif
· motif · 38368136–38368147 · motif
· motif · 38368136–38368147 · motif
· motif · 38368315–38368331 · motif
基因座與轉錄註解
TRGV2 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000426402 ★ | TR_V_gene | 544 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRGV2 預測可能參與適應性免疫反應與先天免疫反應,也預測可能位於細胞膜並成為 T cell receptor 複合體的一部分;來源未提供更具體的作用機制或實驗確認資訊。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in adaptive immune response and innate immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
GGAAGGCTTGGGAGTCCTCTTAGACAGATCCTCAGTCACT40TCCCTCTGCTTGTGTCTCAGGAAGACCACCTCCTCCTACT80GTCTTCTGTGCTAGGGATCACTTCCTTGTTGAGTGGAACC120TGAGTTTTAAGAGGATCTTCTGCTCCTCTTCATCTGGTCC160CTTTCCTTCCAAGGCCCCAGAGAGGAAGGCATGCAGTGGG200CCCTAGCGGTGCTTCTAGCTTTCCTGTCTCCTGCCAGTCA240GAAATCTTCCAACTTGGAAGGGAGAACGAAGTCAGTCATC280AGGCAGACTGGGTCATCTGCTGAAATCACTTGTGATCTTG320CTGAAGGAAGTAACGGCTACATCCACTGGTACCTACACCA360GGAGGGGAAGGCCCCACAGCGTCTTCAGTACTATGACTCC400TACAACTCCAAGGTTGTGTTGGAATCAGGAGTCAGTCCAG440GGAAGTATTATACTTACGCAAGCACAAGGAACAACTTGAG480ATTGATACTGCGAAATCTAATTGAAAATGACTTTGGGGTC520TATTACTGTGCCACCTGGGACGGG544cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。